Biochemia jest obszernym przedmiotem, dlatego od początku potrzebny jest dobry system nauki, aby uporządkować cały ten wykładowy chaos.

Żeby zdać biochemię, trzeba wryć na pamięć wszystkie slajdy z wykładów. (około 2500 slajdów)

Trzeba umieć slajdy bardzo dokładnie, dlatego od początku trzeba mieć dobry system nauki.

A teraz do rzeczy.

Pytania z biochemii są w stylu :

-„Napisz wzorami reakcję katalizowaną przez enzym klasy 4, którego inhibitorem kompetycyjnym jest (nazwa inhibitora), którego kofaktorem jest (pochodna witaminy lub jakiś metal), którego niedobór jest przyczyną choroby (nazwa choroby)”

-Zwracajcie uwagę na to, czy reakcja przebiega tylko w jedną, czy może w obie strony.

-Na jednym wykresie przedstaw: wykres stężenia produktu w zależności od czasu, dla enzymu, którego inhibitorem jest (nazwa inhibitora) a) w obecności aktywatora/ inhibitora b) w nieobecności aktywatora/inhibitora.

Pytanie może być o KAŻDY WYKRES z wykładu lub z seminarium (nawet najgłupszy) np. Narysuj wykres rocznej umieralności na raka płuc palaczy papierosów w zależności od wieku.

To samo ze schematami i reakcjami np. napisz reakcję polimerazy DNA delta (Wykład replikacja, slajd 37). Szczególnie dużo tych, na pierwszy rzut oka niewinnie wyglądających reakcji, jest do nauczenia na I koło.

Jest 5 kół (tutaj nazywa się to repetycja bo piszecie na salach seminaryjnych)

I- kwasy nukleinowe, białka, enzymy (najtrudniejsze)

II- węglowodany

III- lipidy

IV- Azoty i bioenergetyka

V- regulacje

Każde koło to 6 pytań otwartych o

-1 wzór strukturalny

-2 reakcje symbolami

-1 wykres

-2 schematy

Oraz pytania zamknięte jednokrotnego wyboru i pytania zamknięte wielokrotnego wyboru.

System oceniania jest punktowy.

Z każdej repetycji trzeba mieć minimum 60% aby dostać 3 pkty. Mniej niż 60%=0 pkt! Minimum 10 pkt jest potrzebne, żeby być dopuszczonym do egzaminu. (Uwierzcie, jest to naprawdę dużo!)

Warto chodzić na wykłady, szczególnie na początku. Potem najlepiej wysłać 1 osobę, żeby nagrała, bo profesor przerabia wykłady w swoim tempie. I tak np. wykłady do koła IV są wtedy, kiedy musicie się uczyć do repetycji II.

Część wykładów jest nagrana i są na 4shared, ale jest to tylko parę pierwszych wykładów, także poślijcie przynajmniej 1 osobę, która to nagra i udostępni reszcie. Seminarki też sobie nagrywajcie, bo to na nich głównie oparte są pytania z repetycji.

Zanim zaczniesz się uczyć biochemii, musisz ogarnąć system klasyfikacji enzymów (wykład Enzymy I, slajd 48).

Obowiązkowo naucz się (najlepiej już na drugie koło) witamin z grupy B, dlatego że prawie każdy enzym z czymś tam działa a o to szczególnie lubią pytać!

Do nauki szlaków proponuję użyć dużych kartek A3 (najlepiej kupić cały arkusz za 30 zł i mieć spokój). Dobrze też kupić sobie arkusz papieru A4 do powtarzania wzorów. (Nie kupujcie tablic z mazakami- nie opłaca się!). Obowiązkowo zaopatrzyć się w cały zestaw różnokolorowych pisaków. Będziemy ich używać do grupowania według systemu klasyfikacji.

Najlepszym sposobem na zapamiętanie wielu różnych enzymów jest pogrupowanie ich na kolory według systemu klasyfikacji enzymów.

Mamy 6 klas enzymów. (Slajd 48, wykład Enzymy I)

Do sprawdzania do jakiej klasy należy enzym najlepiej użyć angielską wersję wikipedii. Można znaleźć praktycznie każdy enzym. Z boku po prawej stronie wikipedii zapisany jest numer klasy enzymu (E.C.) np. dla dehydrogenazy alkoholowej jest to E.C.1.1.1.1 z czego najistotniejszy jest numer pierwszy, gdyż mówi on nam, co robi dany enzym. Gdy wiemy, co robi enzym, możemy wymyślić dla niego prawie całą reakcję znając np. tylko produkt.

Oto moje proponowane kolory (dla tych, którzy nie mają jeszcze żadnych skojarzeń z kolorami). Możesz oczywiście użyć kolorów, jakie wolisz.

Klasa 1- oksydoreduktazy-działają z NAD lub NADP (pochodne witaminy B3)

-Oksydazy

-Dehydrogenazy (działają z NAD)

- reduktazy (działają z NADP)

-hydroksylazy działające z tetrahydrobiopteryną (BH4),

- hydroksylazy nie działające z BH4

- peroksydazy np. peroksydaza glutationu- ważna selenoproteina.

-synteza tlenku azotu (jedyna syntaza działająca z BH4)

- dejodaza

-katalaza

-dehydrogenaza bursztynionowa oraz dehydrogenaza 3-fosfoglicerolowa działają z FAD

Klasa 2- transferazy

-aminotransferazy (np. aminotransferaza alaninowa-ALAT, aminotransferaza asparaginowa-ASPAT)- wszystkie aminotransferazy działają z PLP(fosforan pirydoksalu- pochodna witaminy B6)

-kinazy (przeprowadzają reakcję fosforylacji)

-metylotransferazy

-tiolazy

-fosforylazy

-większość syntaz np. syntaza metioniny- enzym ten działa z witaminą B12 (kobalaminą)

Klasa 3- Hydrolazy

-egzonukleazy

-deaminazy

-esterazy

- lipazy

-glikozydazy (np. laktaza)

-fosfatazy (odłączają fosforan a przyłączają H2O)

-nukleotydazy (rNaza H1,Fen1)

Klasa 4- Liazy

-dekarboksylazy (działają z TPP-tiaminą-pochodną witaminy B1) lub z PLP (fosforanem pirydoksalu-B6), gdy zachodzi transfer azotu- (podobnie jak aminotransferazy)

-hydratazy

-Dehydratazy np. fumaraza

-enolaza

-syntaza porfobilinogenu

Klasa 5- Izomerazy

-mutazy np. Mutza R-metylomalonyloCoa (drugi enzym oprócz syntazy metioniny działający z kobalaminą)

-epimerazy

Klasa 6- Ligazy (inna nazwa to syntetazy. NIE MYLIĆ Z SYNTAZAMI). Syntetazy używają zawsze ATP czasem w reakcji z użyciem ATP powstaje AMP i o te reakcje lubią pytać. Syntazy natomiast to najczęściej kompleksy wieloenzymowe zawierające enzymy różnych klas. Dla ułatwienia najlepiej przyjąć, że większość syntaz klasyfikowana jest do klasy 2.

-karboksylazy (działają z biotyną- wit. B7)

- syntaza GMP

---