kolo sciaga


24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

Prokariotyczne polimerazy DNA

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES translacji

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.

24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

Prokariotyczne polimerazy DNA

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES translacji

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.

24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

Prokariotyczne polimerazy DNA

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES translacji

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.

24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

Prokariotyczne polimerazy DNA

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES translacji

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.

24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.

24) RYBOSOMY BUDOWA I FUNKCJĘ BIOCHEMICZNE:

-zasadochłonne cząsteczki o kształcie przybliżonym do kulistego

-przytwierdzone do zew.. Powierzchni siateczki śródplazmatycznej

-licznie występują w kom aktywnie syntetyzujących i rakowych

-zbudowane z 2 podjednostek

-mała podj. Ma jedną cząst. r RNA

-duża podj.(prokariota) dwie rózne cząst.r RNA

-duża podj.(eukariota) trzy różne cząst. r RNA

-struktura rybosomowa utrzymuje się dzięki oddziaływaniami jonowymi i występowaniem wiązań między białkami a kw. Rybonukleinowymi.

-Mg 2+- niezbędne do wzajemnego łączenia podj.

-udział w formowaniu się łańcucha polipeptydowego z zaktywowanych aminokwasów w obecności m RNA który kieruje kolejnością ich przyłączania

25) BUDOWA I WŁAŚCIWOŚCI DNA RODZAJE W KOM.:

-zaw. Inf. Genetyczną, podstawowy nośnik inf. Genetycznej

-chemiczna podstawa dziedziczności

-struk. Linowa , zbudowany z długich łańcuch. Polipeptydowych

-łańcuch skł. Się z ułożonych na przemian cząst. deoksyrybozy i fosforanu, zasady organiczne na zewnątrz łańcucha.

-jest polarny

-2 prawoskretne łańcuchy komplementarne

- wiązania wodorowe miedzy zas. Azotowymi

- cukier - deoksyrybozy

-reszta fosforanowa

-zas.azotowe- adeina tymina guazyna cytozyna

Rodzaje dna

-jądrowe, liniowe, dwuniciowe, jednoniciowe, koliste, cytoplazmatyczne.

26) RODZAJ. KW. RNA-BUDOWA I FUNKCJE

- jądrowy RNA (n RNA) mieszanina wielu kw. Rybonukleinowych

-olbrzymie RNA

-rybosomalne RNA:

Mniejsza i większa podj, element budujący rybosom, rozbudowana struk, przestrzenna, liczne białka rybosomalne, powstaje w procesie transkrypcji DNA, produkuje biaka

- transportujący RNA(t RNA) jednolicowy łańcuch polipeptydowy, przyłączenie wolnych aminokwasów w cytoplazmie, transport do rybosomów

-informacyjny RNA( m RNA) powst. W jądrze kom, kolejność zasad w m RNA określa kolejność aminokwasów w białkach, kieruje synteza białek, przekazuje inf. Genetyczną.

27) MECHANIZM REPLIKACJI DNA-CECHY PROCESU.CO TO JEST REPLIKON:

-rozdzielenie nici DNA i zabezpieczenie jednej nici

-komplemenrarne nici, które biegną w przeciwnych kierunkach muszą być syntetyzowanie w tym samym kierunku

-zabezpieczenie przed błędami w replikacji, przez sparowanie czy do łańcucha polipeptydowego przyłączona jest odpowiednia zasada

-cząst potomne sia tylko w połowie nowe, w połowie zbudowanie ze starej nici macierzystej

- zachodzi w fazie S cyklu komórkowego

- nić wiodąca jest tworzona od 5' DO 3' w widełkach replikacyjnych na 3' do 5' nici matrycy

-nić opóźniona- formowana w sposób nieciągł w małych fragmentach. Fragmenty nici opóźnionej łączone są enzymatycznie przezligazę DNA.

Replikon- cząst DNA zdolne do samodzielnego replikowania w kom. Zawiara miejsce startu, może zawierać miejsce kończące replikację. Genetyczna jednostka replikacji.

28) SCHARAKTERYZUJ BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W REPLIKACJI

1) polimeraza I- naprawa DNA

2) polimeraza II- polimeryzacja nowozsyntetyzowanego łańcucha DNA usuwa niewłaściwe nukleotydy w trakcje replikacji i zastępuje właściwymi.

3) gyraza DNA- przerywa i spaja DNA przed tworzącymi się widełkami replikacyjnymi, zmniejsza napiecie nici.

4) helikaza DNA- rozplata heliksalna struk. DNA

5)prupnaza- syntetyzuje krótkie odcinki DNA

6)ligaza- końcowe połączenie końcowych nici

7) telomeraza- umożliwia replikację końcowych dcinkóa kopiowanych nici DNA.

29) POLIMERAZA DNA U PROKARIOTA I EUKARIOTA

a) eukariotyczne polimerazy DNA

- 5 rodzajów polimeraz

-głów enzym replikacyjny „polimeraza delta”

-poli, alfa i delta replikacja chromosowego DNA(jądro kom)

- poli beta i epsilon naprawa DNA(jądro kom)

- poli gamma replik mitochondrialnego DNA

-DNA w widełkach replikacyjnych przed skopiowaniem musi zostać odwinięty z nukleosamów.

-weryfikacja nukleotydów w przypadku błędów, cofają się usuwając niewłaściwy nukleotyd zastępują go prawidłowym

- trzy rodzaje polimeraz

- główny enzym replikacyjny „polimerazaIII”

*polimeraza I-replikacja i naprawa DNA

*polimeraza II - naprawa DNA

*polimeraza III- ok. 10 podj.- głów enzyn replikacyjny.

- do syntezy konieczne są d ATP, d STP, d CTP, d TRP

-synteza napędzona jest energią z hydrolizy

30) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces endoenergetyczny(rys)

-transk rozpocz holoenzyn polimerazyRNA który przyłącza się do DNA

-podj sigma rozpoznaje promotora- sekwencji DNA która sygnalizuję początek transkrypcji RNA(rys4)

Wszystkie kw. rybonukleinowe są syntetyzowane na matrycy DNA, a enzymem który katalizuje ten proces jest zależna od DNA polimeraza RNA. Do reakcji niezbędne są wszystkie cztery trifosfory rybonukleinowe(ATP,GTP,UTP,CTP)

Oraz jony Mg2+. Translacja posiada 3 etapy: fazę inicjacji, fazę elongacji i fazę terminacji .Proces jest rozpoczynany przez hloloenzym który powstaje po połączeniu się polimerazy ze startem Translacja jest rozpoczynana przy końcu 5' DNA przez usunięcie czynnika białkowego oraz dołączenie nukleotydów. Cały proces przesuwa się ku kierunkowi 3'. Po zainicjowaniu procesu następuje faza elongacji czyli wydłużanie się łańcucha mRNA poprzez przyłączenie się kolejnych nukleotydów które przyłączają się zgodnie z zasadami komplementarności. Po przejściu polimerazy przez łańcuch DNA powraca ona do swego naturalnego ułożenia i podwójnej helisy.

31) BUDOWA I FUNKCJĘ POLIMERAZY RNA

Polimeraza1- zlokalizowana jest w jąderku i jej głównym produktem jest rRNA. Jest nie wrażliwa na α-amanitynę.

-Polimeraza2- występuje w nukleoplaźmie i syntetyzuje Mrna. Jest wrażliwa na małe stężenie α-amanitynę.

-Polimeraza3- występuje w nukleoplaźmie i jej głównym produktem jest tRNA i wrażliwa jest na duże stężenia α-amanityny.

32) ZMIANY POTRANSKRYPCYJNE RNA U PROKARIOTÓW I EUKARIOTÓW

-Eukariotyczny informacyjny RNA jest modyfikowany na końcach 5` i 3' a kodujące części(eksony) większości genów są poprzedzielane intronami.

-U prokariotów cząstki Mrna podlegają niewielkiej modyfikacji lub nie ulegają wcale.

Prawie wszystkie eukariotyczne mRNA kodują pojedyncze białka lub polipeptydy. Cząsteczki RNA zanim staną się cząsteczkami aktywującymi czynnościowo często musż być przekształcane. Bakteryjny Mrna ulega translacji jeszcze w trakcje syntezy bez poprzedzającej obróbki.

34) OPISZ PROCES TRANSKRYPCJI

-proces biosyntezy białka na matrycy m RNA i zachodzi na terenie cytoplazmy

-proces endoenergetycznym źródłem energii są aa-t RNA (aminoacylo-t RNA-> transportujące RNA z przyłączeniem do niego odpow. Aminokwasu)

-jest końcowym etapem ekspresji informacji genetycznej zawartej w sekwencji nukleotydów DNA

- Inicjacja - polega na połączeniu podjednostek rybosomowych i i dołączeniu do nich mRNA w taki sposób ze trójka startowa znajduje się w miejscu Prybosomu. Do tych elementów trójki doącza się Trna czyli Trna transportujący aminokwas startowy mationię, całość tworzy kompleks translacyjny.

-Elongacja - rozpoczyna się gdy wolne miejsce A na rybosomie wsunie się odpowiemy aa+Trna . warunkiem dalszych wydarzeń jest komplementarność kodonu z antykodonem. Ukształtowanie powierzchni rybosomy oraz forma przestrzenna t RNA powodują ze aminokwas Met i Glu znajdują się bardzo blisko siebie. Ich gr. Funkcyjne i karboksylowa pierwszego aminokwasu i aminowa drugiego które reagują za sobą tworząc wiązanie peptydowe. Wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr. Aminową wprowadzonego aminocylo-Trna. w translokacji nie naładowany Trna jest uwalniany z miejsca P i peptydylo-trna przesuwa się z miejsca A do miejsca P a Mrna przesuwa się o długość trzech nukleotydów (DALEJ TAK SAMO JAK W TRANSLOKACJI)

-Terminacja- Sygnałami terminacyjnymi są kedony terminacyjne(nonsensowne) UAA, UAG, UGA. Z dekodonem wiąze się bezpośrednio białkowy czynnik uwalniający oraz GTP, który jest związany z trzecim czynnikiem uwalniającym RF-3. RF-1 wiąze się z UAA i UAG podczas gdy RF-2 wiąże się z UAA, UGA. RF-3 nie łączy się z żadnym kodonem, lecz ułatwia aktywność pozostałych dwóch czynników uwalniających. Zarówno RF-1 jak i RF-2 wiążą się w okolicach miejsca A rybosomy gdy pojawi się w nim jeden z kodonów terminacyjnych. Czynnik uwalniający nie tylko blokuje wiązanie się nowego aminocylo-trna ale również upływa na aktywność tonsfrazy peptydowej, co powoduję hydrolize wiązania pomiędzy peptydem a trna zajmującym miejsce P. Po odhydrolizowaniu łańcucha peptydowego od trna również rybosom dysocjuje na podjednostki które są dalej

wykorzystywane w następnym cyklu syntezy białka.

35) MECHANIZM AKTYWACJI AA W PROC. BIOSYNTEZY BIAŁEK.

-zanim aminokwas zostanie włączony do formującego się łańcucha polipeptydowego musi zostać aktywatorem

-w procesie bierze udział w t RNA i synteza aa-t RNA(enzymu)

-aktywacja aminokwasu i utworzenie aa-t RNA odbywa się w drodze się dwustopniowej reakcji, która jest katalizowana przez syntezę aa-t RNA.

-synteraz aa- t RNA rozpoznaje łańcuch boczny aminokwasu i struk. Odpow t RNA.

- aktywacja aminokwasu - przeniesienie aminokw. Na wyższy poznam energetyczny

- dokonuje się z udziałem ATP jako źródła energii oraz odpowiedniej syntezy aa- t RNA.

-synteaz aa-t RNA przyłącza aminokwas do gr. Karboksylowej aminokwasu pochodzącego z cząś. ATP i odłączenie difosforanu

-aktywny aminokw zostaje związany z cząst syntetazy

-w drugim reakcji syntetaza katalizuje przemienienie gr, aminodcylowej z aminoacylo AMP na odpow rodzaj t RNA.

36) INICAJACJA PROCESU TRANSLACJI.ROLA CZYNNIKÓW BIŁKOWYCH

-zapoczątkowanie syntezy polipeptydu rozpoczyna się od utworzenia kompleksu inicjującego( rybosom, m RNA, inicjatorowi t RNA -> f MET -+ t RNA)

-przy powstaniu kompleksu biora udział białkowe czynniki inicjujące

* IF- 1-> stymuluje dysocjacje rybosomową

*IF-2-> stymuluje wiązanie się inicjatorowego t RNA z miejscem P

* IF-3-> zapobiega połączeniu małej podj. Rybosomy z dużą.

- pierwszą rekcją jest dysocjacja rybosomy na dwie podj, stymulowana przez IF-1 przyłączający się do małej podj.

-mała podj. Stymulowana przez przyłączenie IF-3

-tworzy się kompleks podwójny- inicjatorowi t RNA oddziałuje i IF-2.

-kompleks IF-2 , iniacjatorowe t RNA i mRNA zostaja przyłączone do małej podj. Rybosomy , kodon inicjujący AUG to cząst mRNA jest w środku miejca P

- przyłączenie dużej podj

-odłączenie wszystkich czynników inicjujących

-uwolnieniu IF-2 towarzyszy hydroliza GTP.

37)PROCES ELONGACJI. ROLA CZYNNIKÓW ELONGACJI.

Elongacja dzieli się na 3 etapy

-wiązania aminoacylo-t RNA

-tworzenie wiąz peptydowego

-translokacja

- wydłużanie łańcucha polipeptydowego

-do miejsca P zostaje przyłączona formylometionylo-t RNA

-3 zasad z t RNA tworzy wiązania wodorowe z tryplem zasad m RNA

-do związania cząst aminoacylo-t RNA konieczny jest GTP i 2 białkowe czynniki elongacyjne

-FF-Tu umieszcza aminoacylo-t RNA w miejscu A rybosomu

- GTP ulega hydrolizie

-EF-Tu związany z GTP jest gotowy do przyłączenia kolejnego aa- tRNA i dostarczenia do miejsca A rybosomu

-wydłużający się łańcuch peptydowy jest przenoszony na gr aminowa

-po utworzeniu wiązania peptydowego w miejscu A znajduje się dipeptydylo-t RNA , miejsce P jest puste

- translokacja- peptydylo- t RNA przesuwany jest z miejsca A do P, a m RNA przesuwa się o długość 3 nukleotydów

-translokacja wymaga obecnośći trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G

-Wszystkie etapy są powtarzane Az do wystąpienie sygnału zakończenia

38) TRANSLOKACJA ZNACZENIE REAKCJI W SYNTEZIE ŁAŃCUCHA

- w tym procesie nie naładowany t RNA jest uwalniany z miejsca P ,a peptydylo- t RNA przesuwa się z miejsca A do miejsca P, a mRNA przesuwa się o długość trzech nukleotydów. Translokacja wymaga obecności trzeciego czynnika elongacyjnego EF-G który jest również białkiem i jeszcze raz GTP jest hydrolizowane do GDI i Pi. Po translokacji miejsce A jest puste, gotowe do wiązania nowego aminoacylo- Trna i rozpoczęcia kolejnego cyklu elongacyjengo.

39) TERMINACJA ROLA CZYNNIKÓW UWALNIAJĄCYCH

-do zakończenia syntezy białek potrzebny jest sygnał termonacji( UAA, UAG, UGA)

- z kodonem wiąze się białkowy czynnik uwalniający RF-1 i RF-2 i GTP.

-RF-1 I RF-2 wiąże się w okolicach miejsca A rybosomy, gdy pojawi się sygnał terminacji

- czynnik uwalniający blokuje wiązanie się aa- t RNA wpływa na aktywność transferazy peptydowej , powoduje hydrolizę wiązania pomiędzy peptydami t RNA zajmujące miejsce P

-z miejsca P uwalnia się łańcuch peptydowy i t RNA

- rybosom dysocjuje na podjednostki

- rozpad całego kompleksu translacyjnego RF-1-> rozpoznaje kodony UAA, UAG

RF-2-> rozpoznaje kodony UAA,UGA

RF-3-> ułatwia aktywność pozostałych czynników

40) MODYFIKACJA POTRANSLACYJNE BIAŁEK

-zsyntetyzowane polipeptydy ulegają obróbce potranslacyjne aby osiągnąć formę w której wykazują aktyw. Biologiczną

-powstały łańcuch ulega modyfikacjom gr formylowa z formylometioniny usuwa deformylaza, a aminopeptydaza metioninowa może odłączyć z łańcucha peptydowego końcową cząst metioniny

-dalsze modyfikacje prowadzą do wytworzenia z pobiałka swoistego-białka kom.

44) BIOSYNTEZAPURYN I PIRYDIMIN

- zw wyjściowym w biosyntezie jest 5-fosforybozylo-1-pirofosforan powstający z β-D- rybozy przy wkładzie energetycznym dwu cząs. ATP.

W biosyntezie nukleotydów purynowych uczestniczą:

- 5-fosorybozylo-1-pirofosforan

-glutamina- 2 cząst.

-glicyna

- formy-2 cząst

-kw.asparagionowy. 45) 45)FUNNKCJE WOLNYCH NUKLEOTYDÓW

- mogą magazynować energię- ATP,GTP,UTP,CTP

-sąskładnikami koenzymów( NAD, NADP, FAD)

-energia wykorzystywana jest w procesach chemicznych wymagających energi- proces fosforylacji, aktywacji związków

-c AMP czy c GMP są wtórnymi przekaźnikami inf hormonalnej w działaniu hormonów białkowych.



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
2 koło ściąga z mięsa?łość
fizjoterapia ogolna III kolo - sciaga
Koło sciaga
fizyka kolo sciaga
kolo 6 sciaga, AGH, Semestr 5, TOU, ćwiczenia Łabędź
Ochrona środ pytania na koło sciaga
KOLO - Sciaga1, Elektrotechnika I stopień PWSZ Leszno, SEMESTR III, inżyneria materiałowa, ściagi
karto kolo 1, sciaga-karto, Cechy obrazu kartograficznego
Koło, ściąga całość trp, 1
pytania na kolo sciaga
Patofiz koło 3 ściąga
automatyka 2 koło ściąga druk
kolo 2 ściąga
chemia kolo 3 sciaga
Ekonomia Koło Ściąga, socjologia, ekonomia
ściągi na II koło, ściąga na II koło - cz. 1

więcej podobnych podstron