Drugie kolokwium z Biochemii II
1
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących degradacji aminokwasów w komórkach są PRAWDZIWE:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Seryna i asparaginian ulegają bezpośredniej deaminacji.
b. Zwiększenie potencjału energetycznego komórki prowadzi do przyspieszenia degradacji aminokwasów.
c. Reakcje transaminacji katalizowane przez aminotransferazy są nieodwracalne.
d. Grupy α-aminowe są przekształcane w jony amonowe w procesie deaminacji oksydacyjnej glutaminianu.
e. Grupa α-aminowa wielu aminokwasów jest przenoszona na α-ketoglutaran w wyniku czego powstaje glutaminian.
2
Z listy umieszczonej poniżej proszę wybrać tylko te procesy, które ZACHODZĄ podczas mechanizmu prowadzącego do suwu motoru miozynowego i w konsekwencji do skurczu mięśnia. Uporządkuj je w kolejności w jakiej następują.
A. Uwolniony zostaje ADP.
B. Przyłączony ATP jest hydrolizowany przez wolną głowę S1 miozyny powodując zmianę konformacyjną pozwalającą jej na następną interakcję z filamentem cienkim.
C. Uwolnienie PPi prowadzi do zmian konformacyjnych subfragmentów S1 w stosunku do aktyny.
D. Głowa S1 miozyny, w kompleksie z ADP i Pi, nie jest związana z aktyną.
E. ATP wiąże się do głowy S1 miozyny, co prowadzi do szybkiego uwolnienia aktyny.
F. Cienki filament zostaje gwałtownie pociągnięty na odległość wynoszącą około 110 Å.
G. Uwolnienie Pi prowadzi do zmian konformacyjnych subfragmentów S1 w stosunku do aktyny.
H. ATP wiąże się do głowy S1 miozyny, co prowadzi do zwiększenia powinowactwa do aktyny.
I. Utworzenie przejściowego kompleksu miozyna-aktyna prowadzi do uwolnienia Pi .
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. H ® D ® F ® B ® I ® A ® E
b. D ® F ® B ® I ® A ® E ® G
c. E ® B ® D ® I ® G ® F ® A
d. H ® G ® E ® B ® I ® A ® F
e. D ® E ® C ® G ® A ® I ® B
3
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących triacylogliceroli przechowywanych w tkance tłuszczowej są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Są hydrolizowane do kwasów tłuszczowych i glicerolu.
b. Mogą być prekursorami glukozy.
c. Ich zapasy są uwalniane przez insulinę, adrenalinę, noradrenalinę, adrenokortykotropinę i glukagon.
d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
e. Proces lipolizy inicjuje zależna od hormonów lipaza, która jest aktywowana w wyniku modyfikacji kowalencyjnej - adenylacji.
4
Regulacja syntezy cholesterolu przez sprzężenie zwrotne jest kontrolowana na etapie katalizowanym przez:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. reduktazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA
b. transferazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA
c. kinazę mewalonianu
d. syntetazę pirofosforanu izopentylu
e. oksydazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA
5
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń o białkach motorycznych są PRAWDZIWE:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Kinezyny odpowiadają za transport białek, pęcherzyków i organelli wzdłuż mikortubul, a także segregację chromosomów.
b. Systemy motoryczne składają się zawsze z tandemu białek: kinezyna-aktyna, miozyna-mikrotubule.
c. Aktyna m.in. napędzają ruch rzęsek i wici.
d. Miozyny odpowiadają za skurcz mięśni oraz szereg innych procesów..
e. Białka motoryczne w komórce eukariotycznej: miozyny, kinezyny, i dyneiny są podobne do AAA NTPaz typu K.
6
Proszę wskazać, które odpowiedzi zawierają TYLKO prawidłowo przyporządkowane pary intermediatu szlaku metabolicznego i pochodzącego z niego aminokwasu?
Nr IntermediaAminokwas
1 fosfoenolopirogronianasparaginian
2 bursztynylo-CoAmetionina
3 α-ketoglutaranasparaginian
4 pirogroniantyrozyna
5 fumaranfenyloalanina
6 acetylo-CoAleucyna
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. 1, 3, 5
b. 2, 3, 4
c. 1, 2, 3
d. 1, 4, 6
e. 2, 5, 6
7
Aktyna jest białkiem, które:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. w roztworach występuje jako dimer o masie 84 kDa, zwany aktyną F lub polimeryzuje do formy fibrylarnej zwanej aktyną G.
b. w formie fibrylarnej (F) wiąże się w sposób ukierunkowany z globularnymi głowami miozyny.
c. stanowi główny składnik cienkich filamentów w mięśniu.
d. jest ATPazą; cykl ATP-ADP aktyny bierze udział w polimeryzacji i depolimeryzacji filamentu.
e. oddziaływuje silnie z miozyną, gdy ADP jest przyłączony do miozyny lub gdy miejsce wiązania nukleotydu w miozynie jest puste.
8
Proszę wskazać, które z następujących stwierdzeń dotyczących tworzenia się mikrotubul są PRAWDZIWE:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Mikrotubule stają się dłuższe, gdy szybkość przyłączania kompleksów GTP-tubulina do końca dodatniego jest mniejsza niż szybkość hydrolizy związanego GTP.
b. a-tubuliny i b-tubuliny są ATPazami i jednocześnie GTPazami wrażliwymi na stężenie jonów Ca2+.
c. GTP-tubulina przyłącza się do dodatniego końca mikrotubul chętniej niż GDP-tubulina.
d. Po hydrolizie GTP jednostka GDP-tubuliny, znajdująca się w obrębie mikrotubuli, pozostaje tam, natomiast inna jednostka GDP-tubuliny, umiejscowiona na wyeksponowanym końcu, oddysocjowuje od filamentu.
e. a-tubuliny i b-tubuliny polimeryzują tworząc między sobą oddziaływania kowalencyjne.
9
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących wbudowywania jonu amonowego do aminokwasów są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Reakcja syntezy glutaminianu katalizowana przez dehydrogenazę glutaminianową wymaga NAD(P)H oraz ATP.
b. Organizmy prokariotyczne wykorzystują dodatkowy enzym umożliwiający asymilację amoniaku występującego w niskich stężeniach.
c. Mikroorganizmy wykorzystują ATP, elektrony ze zredukowanej ferredoksyny oraz kompleks nitrogenazy składający się z reduktazy i nitrogenazy, aby zredukować azot atmosferyczny do postaci amonowej.
d. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
e. Glutamina jest ważnym donorem azotu w biosyntezie tryptofanu i histydyny. (Tryptofan tak, histydyna nie wiem)
f. Grupy α-aminowe większości aminokwasów pochodzą z glutaminianu powstałego w reakcji syntezy amoniaku ze szczawiooctanem.
10
Ile cząsteczek ATP NETTO powstanie w wyniku całkowitego utlenienia lauroilo-CoA (12:0)?
Odpowiedź:
78
11
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących regulacji syntezy aminokwasów są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Jednym ze sposobów regulacji enzymu/enzymów uczestniczących w reakcjach biosyntezy aminokwasów jest kaskada enzymatyczna co zapewnia wzmocnienie sygnału i zwiększa możliwość kontroli allosterycznej.
b. Transferaza adenylowa oddziałuje z białkami regulatorowymi PA i PD, które decydują o sposobie modyfikacji syntetazy glutaminowej.
c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
d. Skumulowane sprzężenie zwrotne polega na całkowitym zahamowaniu aktywności enzymu katalizującego kluczowy etap przez dowolny z produktów końcowych rozgałęzionego szlaku.
e. Aktywność bakteryjnej syntetazy glutaminowej jest zmniejszona w wyniku fosforylacj jednej reszty tyrozylowej każdej z 12 podjednostek tego enzymu.
f. Enzym katalizujący kluczowy etap w szlaku syntezy aminokwasu może być hamowany przez produkt końcowy tego szlaku.
12
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących degradacji białek w komórkach są PRAWDZIWE:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Jedna cząsteczka białka rekrutuje minimum cztery cząsteczki ubikwityny.
b. O okresie półtrwania białek w dużej mierze decydują reszty aminokwasowe występujące na końcu aminowym białka.
c. W przyłączaniu ubikwityny do białek biorą udział dwa enzymy: enzym aktywujący ubikwitynę oraz i koniugaza ubikwitynowo-białkowa.
d. Ubikwityna przyłącza się kowalencyjnie do reszty histydyny białka przeznaczonego do degradacji za pomocą wiązania peptydowego.
e. Funkcję znacznika białek przeznaczonych do degradacji w komórkach prokariotycznych pełni białko ThiS.
13
HMG-CoA jest syntetyzowany z:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. acetoacetylo-CoA
b. α-ketoglutaranu
c. acetylo-CoA
d. acyloacetylo-CoA
e. acetooctano-CoA
14
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących pochodnych aminokwasów są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Hem powstający w wyniku chelatacji jonu Fe2+ przez porfobilinogen jest grupą prostetyczną takich białek jak hemoglobina lub cytochrom c.
b. Aminokwasy mogą być prekursorami zasad azotowych wchodzących w skład DNA.
c. Tyrozyna jest prekursorem adrenaliny.
d. Bilirubina i biliwerdyna to związki pośrednie w szlaku biosyntezy hemu.
e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Tlenek azotu będący ubocznym produktem przekształcenia cytruliny w argininę jest cząsteczką sygnałową o długotrwałym czasie działania.
15
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących karboksylazy koenzymu A, uczestniczącej w syntezie kwasów tłuszczowych są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Karboksylaza acetylo-CoA jest aktywna w formie nieufosforylowanej.
b. Karboksylaza acetylo-CoA jest fosforylowana przez kinazę białkową zależną od cAMP.
c. Karboksylaza acetylo-CoA jest aktywowana w wyniku działania glukagonu.
d. Karboksylaza acetylo-CoA jest częściowo aktywna w formie ufosforylowanej w obecności cytrynianu.
e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Karboksylaza acetylo-CoA jest stymulowana przez niski ładunek energetyczny komórki
16
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących działania hormonów są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
b. W efekcie działania zarówno glukagonu jak i adrenaliny pośredniczy cAMP.
c. Glukagon i insulina to hormony polipeptydowe, natomiast adrenalina jest pochodną katecholaminy.
d. Głównym efektem wywoływanym przez adrenalinę jest stymulacja glukoneogenezy w wątrobie.
e. Głównym organem odpowiadającym na glukagon są mięśnie.
f. Insulina jest wydzielana w okresie głodu powodując zwiększenie transportu glukozy obecnej w niskich stężeniach z krwi do tkanek.
17
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących proteasomu 26S są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Degraduje substrat białkowy wraz z dołączoną do niego ubikwityną.
b. W wyniku jego działania uwalniane są jedynie wolne aminokwasy.
c. Miejsce aktywne znajduje się na zewnętrznej powierzchni proteasomu, aby dostęp do potencjalnych substratów był ułatwiony.
d. Proteasom 26S składa się z podjednostki katalitycznej 20S oraz podjednostki regulacyjnej 19S.
e. Podjednostka 19S zawiera sześć różnych ATPaz.
18
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących głównych szlaków metabolicznych i sposobów ich regulacji są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Głównym celem szlaku pentozofosforanowego jest wytworzenie NADPH oraz ATP niezbędnych w procesach biosyntez.
b. Fruktozo-2,6-bisfosforan jest aktywatorem fruktozo-1,6-bisfosfatazy będącej kluczowym enzymem glukoneogenezy.
c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
d. Jednym z mechanizmów kontroli oddechowej odpowiedzialnej za regulację aktywności cyklu kwasów trójkarboksylowych jest hamowanie aktywności dehydrogenazy izocytrynianowej i dehydrogenazy α-ketoglutaranowej przez wysokie stężenie AMP.
e. Głównym punktem kontroli glikolizy jest regulacja fosfofruktokinazy między innymi przez ATP i cytrynian, które są jej inhibitorami.
f. Malonylo-CoA jest inhibitorem acylotransferazy karnitynowej I zaangażowanej w transport kwasów tłuszczowych z cytozolu do mitochondrium.
19
Proszę wskazać, które z poniższych cząsteczek są intermediatami syntezy fosfatydyloetanoloaminy u ssaków?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. glicerolo-3-fosforan
b. CDP-diacyloglicerol
c. acylo-CoA
d. CDP-etanoloamina
e. kwas fosfatydowy
f. diacyloglicerol
20
Proszę narysować wzór testosteronu.
Odpowiedź:
21
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących profilu metabolicznego organów są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Tkanka tłuszczowa jest głównym miejscem syntezy kwasów tłuszczowych.
b. W wyniku podwyższonej aktywności glikolizy mięśnie mogą uwalniać do krwi ciała ketonowe i glicynę, które w wątrobie są wykorzystywane jako substraty w procesie glukoneogenezy.
c. Rozkład aminokwasów w mięśniach powoduje powstawanie dużej ilości amoniaku, który w postaci mocznika jest następnie uwalniany do krwi.
d. W stanie sytości mózg wykorzystuje glukozę jako wyłączne źródło energii.
e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Wątroba wykorzystuje α-ketokwasy, powstałe w wyniku degradacji aminokwasów, jako ważne źródło „własnej” energii.
22
Proszę wskazać, która z poniższych odpowiedzi zawiera JEDYNIE hormony steroidowe (lub ich klasy):
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. aldosteron, glukokortykoidy, kortyzol, estradiol;
b. glukagon, insulina, glukokortykoidy, androgeny, estrogeny;
c. adrenalina, tromboksany, androgeny, estrogeny, arachidonian;
d. witamina D3 , progesteron, arachidonian, sfingozyna, tromboksany;
e. mineralokortykoidy, glukozokortykoidy, androgeny, estrogeny;
23
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących cyklu mocznikowego są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Bezpośrednim prekursorem mocznika jest arginina.
b. Synteza karbamoilofosforanu jest praktycznie nieodwracalna, ponieważ w jej przebiegu wykorzystywane są dwie cząsteczki ATP.
c. Cykl mocznikowy „zazębia się” z cyklem kwasu cytrynowego poprzez fumaran tworzony podczas reakcji katalizowanej przez karbamoilotransferazę ornitynową.
d. Nośnikiem atomów węgla i azotu wchodzących w cykl mocznikowy jest ornityna.
e. Reakcje, w których powstaje karbamoilofosforan i ornityna zachodzą w matriks mitochondrialnej, natomiast następne reakcje, prowadzące do syntezy mocznika przebiegają w cytozolu.
24
Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących biosyntezy lipidów i steroidów błon komórkowych są PRAWDZIWE:
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Kwas fosfatydowy jest wykorzystywany do syntezy fosfolipidów, triacylogliceroli i sfingolipidów.
b. Najważniejszymi pochodnymi cholesterolu są sole żółciowe, hormony steroidowe oraz bilirubina.
c. Triacyloglicerole są cząsteczkami o dużej wydajności energetycznej.
d. Cząsteczka pięciowęglowa- pirofosforan izopentenylu jest prekursorem rozmaitych biocząsteczek.
e. Enzymy biorące udział w szlaku syntezy cholesterolu podlegają regulacji między innymi na skutek: modyfikacji kowalencyjnej, sprzężenia zwrotnego oraz zmian tempa translacji ich mRNA.
25
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących metabolizmu są PRAWDZIWE?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Stan sytości sprzyja magazynowaniu energii między innymi na skutek wnikania glukozy do tkanki tłuszczowej, gdzie cukier ten jest w procesie glikolizy przekształcany do glicerolo-3-fosforanu wchodzącego w skład trójacylogliceroli.
b. W stanie głodu następuje inhibicja lipaz rozkładających w tkance tłuszczowej trójacyloglicerole.
c. Głównym efektem wywoływanym przez adrenalinę jest stymulacja glukoneogenezy w wątrobie.
d. Działanie isuliny wywołuje kaskadę prowadzącą do aktywacji syntazy glikogenowej zaangażowanej w syntezę glikogenu i jednoczesnej inhibicji fosforylazy odpowiedzialnej za rozkład glikogenu.
e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Wątroba zawierają glukozo-6-fosfatazę, która defosforyluje glukozę pochodzącą z rozkładu glikogenu, umożliwiając uwolnienie glukozy do krwi w celu dostarczenia jej do mózgu.
By Kalit i ja:
7. czemu nie e) ?
9.+ e) [ale f) nie!!] jest poprawna, aczkolwiek według innych źródeł niż Stryer
12. Kalit twierdzi, ze tak - ja nie wiem, na dwoje babka wróżyła... +a) ??
16. nie wiem co z d) są w sumie dwa główne efekty - rozkład glikogenu i wzmaganie glukoneogenezy... pytanie które jest główniejsze ;/
19. nie wiem co z odpowiedzią b) ja jej nie zaznaczyłam i z tego co pamiętam była to opcja poprawna szczególnie że Kalit mówi, że zaznaczył wszystkie i było źle... w Stryerze jest tak na dwoje babka wróżyła...
23. +d)