Pyt z molek
01 telomery:
są na koñcach chromosomów eukariotycznych
tak
białko potrzebne do odró¿nienia nici zmetylowanej od niezmetylowanej SeqA i DAM - rozró¿nianie nici
moim zdanie to by³o pytanie o odró¿nienie nici potomnej od rodzicielskiej w podwójnej helisie
- ja zaznaczy³em, ze Dam (czy to dobrze - nie wiem)
no wg mnie SeqA odró¿nia zmetylowan± od nie zmetylowanej
07 sekwencja jaka¶ tam przez co jest rozpoznawana
<nie pamiêtam tego pytania w ogóle>
GTAC podaj¿e
09 ATM do czego s³u¿y / na egzaminie siedzia³em i zastanawia³em siê - co to k.... jest ATM?
w odpowiedziach by³y podane chyba ró¿ne etapy cyklu komórkowego (nie przyznam siê wam co zaznaczy³em)
o tym ca³ym ATM, jak ju¿ poszuka³em, to znajdziecie na slajdach 44-45 w pliku replikacja-eukariota.ppt
Second checkpoint
11 do antyterminacji λN potrzebne s±:
no i to jest zagwostka - z naszych prezentacji nie wychwyci³em nic o ¿adnych bia³kach Nus, ale za to w Wêgleñskim jest o nich, a wiec chyba Przemek ma racje -
potrzebne s± bia³ko N, sekwencje nut, bia³ka Nus
Na pewno mam racjê i niech nikt nie zaprzecza r30;
12 termiczna mutacja bia³ka C1 spowoduje:
ja zaznaczy³em to:
uniemo¿liwienie cyklu lizogenicznego (wej¶cie w cykl lityczny ?)
ale pamiêtam ze w odpowiedziach do wyboru by³y tez takie koszmarki jak: PL, PRM, PR - widaæ je na slajdach 17 i 27-29 w pliku bakteriofagi.ppt, byæ mo¿e w³a¶ciwa by³a która¶ odpowied· z nimi
C1 to represor i dzieki Niemu nie ma lizy. Wiêc trzeba by³o wybraæ odpowiedz z naj³agodniejsz± wersj± zdrowotn± dla bakterii J
13 bia³ko Cro za co odpowiada
tak by³o r11; to *brzydki wyraz*ostwo z kolei powoduje, ¿e bakteria zdycha
14 bia³ko RecA
- rekombinacja homologiczna
- naprawa (?)
- <nie pamiêtam, byæ mo¿e cos o SOS>
- wszystko <- poprawne
³±czenie nici
15 transpozony gdzie s±
- u prokariontów i eukariontów (imho)
TAK
19 nie wymaga primerów:
bardzo siê boje wam tutaj namieszaæ, bo nie pamiêtam odpowiedzi do wyboru, ale powinno byæ chyba:
- polimeraza RNA
Tak - dobrze
20 brak opcji korektorskiej, która polimeraza ?
tu by³y chyba podane 4 polimerazy eukariotyczne, zupe³nie nie pamiêtam które,
z eukariotycznych brak aktywno¶ci korektorskiej egzo 3'-5' to (patrzcie na slajd 11 w pliku replikacja-1.ppt):
- α i ß
A to jest kurewskie pytani r11; nie uczcie siê takich pierdo³
22 aktywno¶æ helikazy maj±:
- dnaB
- MCM _ :??? Tam by³o UvrD
- RuvB
- wszystkie <- prawid³owa
25 dlaczego nie mog± byæ dwa plazmidy w komórce
ja zaznaczy³em odp B, ze te dwa plazmidy (nie pamiêtam ju¿ jakie, czy¿by jednym z nich by³ pBR?) nale¿a³y do tego samego typu replikacji, oba by³y niskokopijne, a wiec nie mog³y siê razem utrzymaæ w jednej komórce (odpowiedz
pragnê zaznaczyæ, ze inny u¿ytkownik tego forum, wookee, który dosta³ wiêcej punktów ode mnie, zaznaczy³ tam inna odpowiedz - C (oczywi¶cie nie pamiêtam jej)
Ja nie wiem w koñcu co jest prawid³owe r11; olaæ to.
26 cyklina potrzebna, aby wej¶æ w fazê S
ja zaznaczylem, ze cyklina E, ale spójrzcie do pliku replikacja-eukariota.ppt na slajd 25 - imho z tego obrazka (siedzia³em na egzaminie i stara³em sobie przypomnieæ jak to by³o narysowane - która cyklina do której fazy styka) to wcale nie jest takie jasne
spójrzcie tak¿e na nastêpny slajd - mo¿e to chodzi jednak o cyklinê D? (tylko co to do cholery jest ten punkt R?)
R- checkpoint r11; punkt krytyczny
Ale spójrz Tomku która strza³ka zahacza o fazê S heh
Cyklina E jest ok. Cykliny D musza byæ 4 i 6, a tam by³a tylko jedna
31 supresory to:
<nie pamiêtam tego pytania, czy to by³o cos o supresorach nowotworów?>
To by³o pytanie o geny r11; tak o tworz±ce bia³ka supresorowe
37 zinaktywowany chromosom X u ssaczych samic to:
heterochromatyna fakultatywna
Czy oby na pewno r11; mo¿e ulec ponownej aktywacji ???
Wojtasik w tym momencie by mnie uwali³a, ale wydajê mi siê , ¿e konstytuwna
Zawsze na najprostszych siê przeje¿dzam
38 mutacja w deacytelacja
?
kurcze, pamiêtam to pytanie ale nie pamiêtam ani struktury odpowiedzi ani samego pytania
dlatego to co jest napisane poni¿ej jest odtworzone po omacku z zakamarków pamiêci (i nie zgadza siê z tym co napisa³ Przemek, co znacznie zmniejsza wiarygodno¶æ mojej pamiêci):
deacetylacja histonow powoduje:
- wyciszenie genu
(albo odwrotnie, wyciszenie genu nastêpuje, gdy: - deacetylacja histonów)
Tj ok
39 która z podanych cz±steczek wyciszaj±cych geny robi to na skutek ciecia mRNA?
- sRNA
- siRNA <- POPRAWNA ODPOWIEDZ
- miRNA
- wszystkie (taki chyba by³ zestaw odpowiedzi)
Tak
40 nukleotyd nie zawiera: <moje ulubione pytanie z tego testu>
- zasady
- cukru
- grupy fosforanowe
- antykodonu <- poprawne :]
Herman zb³a·ni³a siê
42 brak w³a¶ciwo¶ci katalitycznych wystêpuje u
to by³o chyba tak:
które z poni¿szych <co¶ tam (struktur?)> nie maja zdolno¶ci autokatalitycznych
- intron grupy I
- intron grupy II
- SL RNA <<<<<--- to nie ma takiej zdolno¶ci
- struktura g³owy od m³otka (hammerhead) / albo w tym miejscu by³a wpisana rybonukleaza P
niestety nie pamiêtam jaka by³a podana struktura która tych w³a¶ciwo¶ci nie ma, nie mam pewno¶ci czy to na pewno by³o to co napisa³em powy¿ej
olaæ to
45 miejsce, w którym zaczyna siê transkrypcja to
- promotor
(w tej chwili nie pamiêtam, co tam jeszcze by³o do wyboru, ale ta odpowiedz wydawa³a siê byæ najbardziej pasuj±c±) to chyba o to chodzi³o Luthien, gdy napisa³a o inicjacji replikacji, a Przemek stwierdzi³, ze tego w ogóle nie by³o
i dalej podtrzymuje swoje s³owa
46 RuvAB za co odpowiada
- za przesuwanie splecenia (?) nici w c-o / strukturze hollidaya
tak
47 bakteria Agrobacterium tumefaciens przekazuje do genomu ro¶liny-gospodarza
- T-DNA (czyli fragment T plazmidu Ti)
tak
00 dwa origin replikacji s± na:
- mtDNA
01 telomery:
(?) czy¿by tam by³a do wyboru odpowiedz, ze:
- s± na koñcach chromosomów eukariotycznych
02 telomeraza to:
- enzym katalizuj±cy syntezê telomerów, w centrum aktywnym zawiera matryce RNA, na ktorej budowane jest DNA
03 genom cz³owieka ile par zasad
- ok. 3 x 10^9
04 represor systemu SOS
- LexA
05 komórki zró¿nicowane, nie przechodz±ce podzia³ów s± w fazie:
- faza G0
06 bia³ko potrzebne do odró¿nienia nici zmetylowanej od niezmetylowanej SeqA i DAM - rozró¿nianie nici
moim zdanie to by³o pytanie o odró¿nienie nici potomnej od rodzicielskiej w podwójnej helisie
- ja zaznaczy³em, ze Dam (czy to dobrze - nie wiem)
07 sekwencja jaka¶ tam przez co jest rozpoznawana
<nie pamiêtam tego pytania w ogóle>
08 GMO zmodyfikowane
by³y podane takie do wyboru:
- homologiczna rekombinacja genów myszy
- nadprodukcja insuliny przez bakterie
- kukurydza wytwarzaj±ca bia³ko szkodliwe dla niektórych owadów
- wszystko powy¿ej
Ja wybra³em ostatnia opcje, ale nie jestem jej pewien, no bo niby dlaczego homologiczna rekombinacja mia³aby byæ modyfikacj±, skoro takie cos zachodzi normalnie w przyrodzie (podczas mejozy)?
09 ATM do czego s³u¿y / na egzaminie siedzia³em i zastanawia³em siê - co to k.... jest ATM?
w odpowiedziach by³y podane chyba ró¿ne etapy cyklu komórkowego (nie przyznam siê wam co zaznaczy³em)
o tym ca³ym ATM, jak ju¿ poszuka³em, to znajdziecie na slajdach 44-45 w pliku replikacja-eukariota.ppt
10 bia³ka Cre i Int
s³u¿± do rekombinacji miejscowo specyficznej (Cre pochodzi od P1 a Int od λ)
11 do antyterminacji λN potrzebne s±:
no i to jest zagwostka - z naszych prezentacji nie wychwyci³em nic o ¿adnych bia³kach Nus, ale za to w Wêgleñskim jest o nich, a wiec chyba Przemek ma racje -
potrzebne s± bia³ko N, sekwencje nut, bia³ka Nus
12 termiczna mutacja bia³ka C1 spowoduje:
ja zaznaczy³em to:
uniemo¿liwienie cyklu lizogenicznego (wej¶cie w cykl lityczny ?)
ale pamiêtam ze w odpowiedziach do wyboru by³y tez takie koszmarki jak: PL, PRM, PR - widaæ je na slajdach 17 i 27-29 w pliku bakteriofagi.ppt, byæ mo¿e w³a¶ciwa by³a która¶ odpowied· z nimi
13 bia³ko Cro za co odpowiada
by³o takie cos w ogóle? ja nie pamiêtam
no ale szukajcie odpowiedzi tez w podobnych okolicach prezentacji o fagach, co w poprzednim pytaniu
14 bia³ko RecA
- rekombinacja homologiczna
- naprawa (?)
- <nie pamiêtam, byæ mo¿e cos o SOS>
- wszystko <- poprawne
15 transpozony gdzie s±
- u prokariontów i eukariontów (imho)
16 transpozony które wymagaj± odwrotnej transkrypcji
- to retrotranspozony
17 absorbancja - czysto¶æ
podana by³a warto¶æ 0,3 albo 0,8, nie pamiêtam dok³adnie
w ka¿dym razie by³a to warto¶æ ni¿sza od 1,7 a wiec próbka by³a zanieczyszczona bia³kami
18 absorbancja
to by³o chyba tak: na skutek denaturacji nici, absorbancja bêdzie:
- wzrastaæ
19 nie wymaga primerów:
bardzo siê boje wam tutaj namieszaæ, bo nie pamiêtam odpowiedzi do wyboru, ale powinno byæ chyba:
- polimeraza RNA
20 brak opcji korektorskiej, która polimeraza ?
tu by³y chyba podane 4 polimerazy eukariotyczne, zupe³nie nie pamiêtam które,
z eukariotycznych brak aktywno¶ci korektorskiej egzo 3'-5' to (patrzcie na slajd 11 w pliku replikacja-1.ppt):
- α i ß
21 replikon
to by³o chyba: jednostka posiadaj±c± w³asne ori replikacji to
- replikon
22 aktywno¶æ helikazy maj±:
- dnaB
- MCM
- RuvB
- wszystkie <- prawid³owa
23 jakie¶ tam bia³ko w jakim¶ narz±dzie jest takie a takie, a w innym narz±dzie jest krótsze, jaka jest tego przyczyna (to chyba by³o opisane to co jest na slajdzie 42 w pliku ekspresja genow-2.ppt)
- edycja mRNA
24 imprinting / to by³o chyba tak:
cz³owiek (by³a chyba podana p³eæ, ale ja nie pamiêtam jaka ;), szkoda, bo to by³o raczej istotne) ma w swoich komórkach niezmetylowany chromosom (a mo¿e gen?) od ojca oraz taki sam zmetylowany od matki. w trakcie mejozy chromosom pochodz±cy od ojca bêdzie:
- zmetylowany
- <nie pamietam>
- <nie pamietam>
- nic siê nie bêdzie z nim dzia³o a¿ do zap³odnienia
imho ostatnia odp jest si
25 dlaczego nie mog± byæ dwa plazmidy w komórce
ja zaznaczy³em odp B, ze te dwa plazmidy (nie pamiêtam ju¿ jakie, czy¿by jednym z nich by³ pBR?) nale¿a³y do tego samego typu replikacji, oba by³y niskokopijne, a wiec nie mog³y siê razem utrzymaæ w jednej komórce (odpowiedz B)
pragnê zaznaczyæ, ze inny u¿ytkownik tego forum, wookee, który dosta³ wiêcej punktów ode mnie, zaznaczy³ tam inna odpowiedz - C (oczywi¶cie nie pamiêtam jej)
26 cyklina potrzebna, aby wej¶æ w fazê S
ja zaznaczylem, ze cyklina E, ale spójrzcie do pliku replikacja-eukariota.ppt na slajd 25 - imho z tego obrazka (siedzia³em na egzaminie i stara³em sobie przypomnieæ jak to by³o narysowane - która cyklina do której fazy styka) to wcale nie jest takie jasne
spójrzcie tak¿e na nastêpny slajd - mo¿e to chodzi jednak o cyklinê D? (tylko co to do cholery jest ten punkt R?)
27 deaminacja cytozyny to mutacja
- tranzycja
dlaczego? bo po deaminacji cytozyna stanie siê tymina (inna pirymidyna)
28 które z poni¿szych substancji interkaluj± miedzy zasady DNA
- akryflawiny
29 bioaktywacja i oddzia³ywanie na DNA - addukty
wielopier¶cieniowe wêglowodory aromatyczne:
- wymagaj± bioaktywacji i ³±cza siê do DNA
(kluczowy okazal sie byc rysunek na slajdzie 21 w pliku mutageneza,naprawa, onkogeneza.ppt)
bledne opowiedzi:
- nie wymaga aktywacji i ³±czy siê z DNA
- wymaga aktywacji i ³±czy siê z bia³kami
- nie wymaga aktywacji i ³±czy siê z bia³kami
30 fotoliaza to:
- mechanizm bezpo¶redni naprawy
31 supresory to:
<nie pamiêtam tego pytania, czy to by³o cos o supresorach nowotworów?>
32 jak kontrolowane s± cykliny
- fosforylacja / defosforylacja
- hamowane przez inne bia³ka
- zmiany stê¿enia
- wszystko powy¿ej <- imho poprawna
33 polimeraza RNA I gdzie i co syntezuje
- j±derko/nukleoplazma - rRNA
34 czynniki bia³kowe wi±¿±ce siê do DNA
- palce cynkowe
35 naprawa po alkilizacji - jakie czynniki
naprawde bylo takie pytanie?
a czy to czasem nie by³o ze alkilizacja DNA mo¿e prowadziæ do:
- miejsca AP (apurynowe/apirymidowe)
?
36 co NIE jest bezpo¶rednio zwi±zane ze splicingiem
- snurps / snRNP
- bialka U
- <nie pamietam>
- "branch migration" <- poprawna (bo to jest zwi±zane z c-o, a nie ze splicingiem)
37 zinaktywowany chromosom X u ssaczych samic to:
heterochromatyna fakultatywna
38 mutacja w deacytelacja
?
kurcze, pamiêtam to pytanie ale nie pamiêtam ani struktury odpowiedzi ani samego pytania
dlatego to co jest napisane poni¿ej jest odtworzone po omacku z zakamarków pamiêci (i nie zgadza siê z tym co napisa³ Przemek, co znacznie zmniejsza wiarygodno¶æ mojej pamiêci):
deacetylacja histonow powoduje:
- wyciszenie genu
(albo odwrotnie, wyciszenie genu nastêpuje, gdy: - deacetylacja histonów)
39 która z podanych cz±steczek wyciszaj±cych geny robi to na skutek ciecia mRNA?
- sRNA
- siRNA <- POPRAWNA ODPOWIEDZ
- miRNA
- wszystkie (taki chyba by³ zestaw odpowiedzi)
40 nukleotyd nie zawiera: <moje ulubione pytanie z tego testu>
- zasady
- cukru
- grupy fosforanowe
- antykodonu <- poprawne :]
41 rozró¿nianie DNA miedzy lud·mi na podst. ró¿nic w DNA w³a¶nie <w oryginale to oczywi¶cie nie by³o tak niesk³adnie> to:
- fingerprinting
42 brak w³a¶ciwo¶ci katalitycznych wystêpuje u
to by³o chyba tak:
które z poni¿szych <co¶ tam (struktur?)> nie maja zdolno¶ci autokatalitycznych
- intron grupy I
- intron grupy II
- SL RNA <<<<<--- to nie ma takiej zdolno¶ci
- struktura g³owy od m³otka (hammerhead) / albo w tym miejscu by³a wpisana rybonukleaza P
niestety nie pamiêtam jaka by³a podana struktura która tych w³a¶ciwo¶ci nie ma, nie mam pewno¶ci czy to na pewno by³o to co napisa³em powy¿ej
43 ligaza faga T4 potrzebuje:
- ATP
44 egzony - ile ich w % ???
- ok 1%
45 miejsce, w którym zaczyna siê transkrypcja to
- promotor
(w tej chwili nie pamiêtam, co tam jeszcze by³o do wyboru, ale ta odpowiedz wydawa³a siê byæ najbardziej pasuj±c±) to chyba o to chodzi³o Luthien, gdy napisa³a o inicjacji replikacji, a Przemek stwierdzi³, ze tego w ogóle nie by³o
46 RuvAB za co odpowiada
- za przesuwanie splecenia (?) nici w c-o / strukturze hollidaya
47 bakteria Agrobacterium tumefaciens przekazuje do genomu ro¶liny-gospodarza
- T-DNA (czyli fragment T plazmidu Ti)
48 fosforylacja CTD
je¿eli to pytanie tak brzmia³o, to wiem ze mia³em te odpowiedz ·le
patrzcie do pliku ekspresja genow-1.ppt na slajdy 24 i 25 - wynika z nich ze fosforylacja CTD umo¿liwia polimerazie start transkrypcji (tylko czy tam by³a taka odpowiedz do wyboru?)
49 p53 za co odpowiada ???
- PO¦REDNIO odpowiada za ochronê przed nowotworami bo wytwarza inne czynniki (looknijacie na slajd 74 w pliku mutageneza,naprawa, onkogeneza.ppt)
bonusowo
na 100% w tre¶ci którego¶ pytania albo odpowiedzi by³o cos o helix-turn-helix (czy¿by w pytaniu o palce cynkowe? albo w pytaniu 07, którego nie pamiêtam?)
+
telomery
telomeraza to
genom cz³owieka ile par zasad
SOS - represor
faza G0
SeqA i DAM - rozró¿nianie nici
sekwencja jakas tam przez co jest rozpoznawana
GMO zmodyfikowane
ATM do czego s³u¿y
bia³ka Cre i Int
antyterminacja - jakie bia³ka
dwa originy s± na mtDNA
bia³ko C1 i jego mutacja
bia³ko Cro za co odpowiada
bia³ko RecA
transpozony gdzie s±
transpozony które wymagaj± odwrotnej transkrypcji
absorbancja - czysto¶æ ze wzrasta i ze zanieczyszczone bialkami
absorbancja
nie wymaga primerów
brak opcji korektorskiej, która polimeraza ?
replikon
helikazy to
edycja mRNA
imprinting
dlaczego nie mog± byæ dwa plazmidy w komórce
cyklina za wej¶cie do S
deaminacja cytozyny to mutacja ?
akryflawiny
bioaktywacja i oddzia³ywanie na DNA - addukty
fotoliaza to mechanizm bezpo¶redni
supresory to
jak kontrolowane s± cykliny
polimeraza I gdzie i co syntezuje
czynniki bia³kowe - palce cynkowe
naprawa po alkilizacji - jakie czynniki
bezpo¶rednio ze splicingiem co jest zwi±zane
heterochromatyna konstytutwna
mutacja w deacytelacja
siRNA
nukleotyd
fingerprinting
brak w³a¶ciwo¶ci katalitycznych wystêpuje u
fag T4 sk±d energia
egzony ile ich w % ???
promotor
RuvAB za co odpowiada
plazmid T
fosforylacja CTD ???
p53 za co odpowiada ???
+ (wiekszosz to to samo jest jw.)
Transkrybuje rRNA, j±derko r11;pol. I
polimeraza I gdzie i co syntezuje
Fosforylacja polimerazy umo¿liwia- nie pamiêtam wszystkich odp. ale by³o co¶ o tworzeniu czapeczki i chyba o przesuwaniu siê polimerazy.
fosforylacja CTD ???
Antyterminator N co jest potrzebne: bia³ko N i sekwencja nut
antyterminacja - jakie bia³ka: NUS
Miejsce startu replikacji: chyba nie muszê wymieniaæ odp. :]
TAKIE CZEGO¶ NIE BY³O
BY³O PYTANIE O REPLIKON
Co nie nale¿y do struktury DNA (albo jako¶ tak): antykodon ;P
nukleotyd
Efekt hiperchromowy
Absorbancja
MODYFIKACJA mRNA
introny nie s± wycinane po kolei - to zale¿y od konformacji
transestryfikacja - przecinanie wi±zania (struktura lassa) teoretycznie nie potrzebuje energii, 2'OH atakuje 5'fosforan
je¶li dobrze rozumiem to choroba - toczeñ rumieñcowy - zwi±zana jest z jakim¶ problemem w splicingu i U1
ZAPAMIÊTAJ: U1 rozpoznaje 5' miejsce splicingu
ATP nie jest potrzebne do energii, tylko do zmian konformacyjnych w kompleksie
jedyne co trzeba wiedziec w budowie spiliceosomu: centrum katalityczne tworzone jest przez U6-U2
Splicing tRNA - za pierwszym nukleotydem w antykodonie jest intron
edycja RNA: g³ównie wymieniane, wstawiane s± U, te zmiany mog± zachodziæ na poziomie mRNA
U s± zawsze dodawane pojedynczo, nawet gdy s± obok siebie
hammerhead - strukt. g³owy od m³otka: dolna czê¶æ jest rybozymem i odcina górn±