zestaw 1 Ania Piecuch, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowanie pytań egzaminacyjnych


Zestaw I

  1. Struktury i funkcje białek

W budowie białka wyróżnia się 4 zasadnicze poziomy organizacji łańcucha polipeptydowego:

- struktura I rzędowa - jest określona przez sekwencję (kolejność) aa połączonych wiązaniami peptydowymi w łańcuchu polipeptydowym. Sekwencja pierwszorzędowa determinuje wyższe struktury.

- struktura II rzędowa - przestrzenne ułożenie reszt aa sąsiadujących ze sobą w sekwencji liniowej (wiązania wodorowe, jonowe, disiarczkowe, oddziaływania hydrofobowe, wiązania van der Waalsa, estrowe, O, N - glikozydowe).

Najbardziej stabilnymi rodzajami struktury drugorzędowej białek są alfa-helisa i kartka beta.

- struktura III rzędowa - określa przestrzenny kształt całego łańcucha polipeptydowego, powiązania przestrzenne i wzajemne ułożenie reszt aa oddalonych od siebie w sekwencji liniowej oraz lokalizację mostków disiarczkowych. Określa przestrzenne ułożenie łańcucha polipeptydowego. Trzeciorzędowa struktura białka jest utrzymywana głównie przez wiązania jonowe, oddziaływania hydrofobowe oraz przez mostki disiarczkowe.

- struktura IV rzędowa - w białkach zbudowanych z więcej niż jednego łańcucha polipeptydowego. Określa wzajemne ułożenie przestrzenne podjednostek i rodzaj ich kontaktu (hemoglobina, kolagen, wirus polio, Rynowirus 14).

Rola białek, funkcje:

- enzymatyczna - prawie wszystkie enzymy są białkami, zwiększają szybkość reakcji o około 1 mln razy. Istnieje kilka tysięcy enzymów, z których każdy katalizuje swoistą dla siebie reakcję chemiczną np.: trypsyna, pepsyna, rybonukleaza, dehydrogenaza alkoholowa, katalaza, fosfofruktokinaza.

- budulcowa, strukturalna:

α - keratyna - włosy, paznokcie

kolagen

elastyna - białko tkanki łącznej, odpowiedzialnym za zdolność tkanek do rozciągania i powrotu do uprzedniego kształtu. Nie jest tak rozpowszechniona jak kolagen, ale występuje w dużych ilościach w tkankach, które wymagają takich właściwości fizycznych, a więc np.: w płucach, dużych tętnicach i niektórych więzadłach sprężystych

białka błonowe - białka strukturalne

przyleganie komórek - np. katcheryny

- magazynowa:

ceruloplazmina - białko magazynujące Cu

ferrytyna - białko magazynujące Fe3+

mioglobina - magazynuje O2 w mięśniach

- transportowa:

hemoglobina - transport O2 we krwi

transferyna - transport Fe2+

albumina - transport np. leków

- regulacyjna - regulacja przebiegu procesów biochemicznych

hormony: peptydowe, białkowe np. GH, PRL

białka represorowe - hamują transkrypcję genów,

kontrola przenikalności błon - regulacja stężenia metabolitów w komórce,

- ochronna:

immunoglobuliny - układ odpornościowy

trombina, fibrynogen - ochrona przed utratą krwi

- ruch uporządkowany:

aktyna, miozyna - skurcz mięśnia

tubulina - białko mikrotubul biorące udział w podziałach komórkowych

- rola buforowa:

we krwi - albuminy

- wytwarzanie i przekazywanie impulsów nerwowych:

białka receptorowe - rodopsyna (białko fotoreceptorowe, występujące w siatkówce oka).

2. Biosynteza kwasów tłuszczowych - przebieg, regulacja.

Biosynteza kwasów tłuszczowych odbywa się przede wszystkim w wątrobie, w cytoplazmie komórek tłuszczowych (adipocyty, lipocyty), w nerce i gruczole mlekowym. Do procesu potrzebny jest acetyloS-CoA i NADPH+H+, a dawcą energii jest ATP. Acetylo-S-CoA powstaje w oksydacyjnej dekarboksylacji pirogronianu lub w beta-oksydacji kwasów tłuszczowych, rozpadzie ciał ketonowych i szkieletów węglowodorowych niektórych aminokwasów. Żródłem NADPH+H+ jest szlak pentozofosforanowy i dekarboksylacja jabłczanu przez enzym jabłczanowy.

W biosyntezie kwasów tłuszczowych wyróżnić można kilka etapów:

1. Aktywacja acetylokoenzmu A przez karboksylazę do malonylo-koenzymu A w obecności ATP i biotyny. Zatem acetylokoenzym A ulega karboksylacji do malonylokoenzymu A (malonylo-CoA).

2. Wydłużanie łańcucha kwasów tłuszczowych przebiega na kompleksie enzymatycznym - syntetazie kwasów tłuszczowych (enzym o strukturze dimerycznej). W skład syntetazy wchodzi białko przenoszące acyl ACP (Acyl Carrier Protein). ACP przenosi acyle, czyli produkty pośrednie. ACP zawiera z kolei kwas pantotenowy w formie 4'fosforanu panteteiny. Na początku inicjująca cząsteczka acetylo-CoA łączy się z grupą -SH cysteiny (r. katalizowana przez transacylazę acetylową). Malonylo-coA łączy się z sąsiadującą grupą -SH 4'fosfopanteteiny należącej do ACP drugiego monomeru, co jest katalizowane przez transacylazę malonylową i wytwarza się acetylo(acylo)malonyloenzym. Następnie wydzielony jest CO2 i w wyniku działania syntazy 3-ketoacylowej i powstaje 3-ketoacyloenzym, co uwalnia grupę SH cysteiny związana przez grupę acetylową.

3. Etap redukcji odbywa się przy udziale NADPH+H+ i reduktazy 3-ketoacylowej. Dochodzi do redukcji, odwodnienia i ponownej redukcji grupy 3-ketoacylowej, dzięki czemu powstaje odpowiedni 2,3-nienasycony acylo-S-enzym. Nowa cząsteczka malonylo-CoA łączy się z grupą -SH 4'fosfopanteteiny, wypierając nasyconą resztę acylową na wolną grupę -SH cysteiny.

4. Powyższa sekwencja reakcji powtarza się jeszcze 6 razy, aż do powstania palmitylowego rodnika. Jest on uwalniany z kompleksu enzymatycznego z udziałem tioesterazy. Wolny palmitynian musi zostac zaktywowany do acyloCoA, zanim będzie mógł wejść do innego szlaku netabolicznego. Zazwyczaj ulega estryfikacji do acylogliceroli.

CH3CO ~ S-CoA + 7HOOC-CH2CO~S-CoA + 14 NADPH + 14 H+ à CH3(CH2)14CO~S-CoA + 7 CO2 + 7 HS-CoA + 14 NADP+ + 6H2O

(wydaje mi się, że lepiej przejrzeć ten cykl z rysunkiem z Harpera)

Regulacja lipogenezy

3. Katabolizm nukleotydów pirymidynowych.

Rozpad cytozyny i uracylu odbywa się wspólnym szlakiem metabolicznym. Wolna cytozyna zostaje przeniesiona do uracylu w wyniku deaminacji zachodzącej pod działaniem deaminazy cytozynowej. Podwójne wiązanie w pierścieniu uracylu zostaje wysycone dwoma atomami wodoru, pochodzącymi z NADPH+H+. reakcje katalizuje dehydrogenaza dihydrouracylowa. Powstaje dihydrouracyl. Działanie dihydropirymidynazy powoduje otwarcie pierścienia dihydrouracylu. Powstaje beta-ureidopropionian, który pod wpływem ureidopropionazy rozpada się do końcowych produktów przemiany zasad pirymidynowych: beta-alaniny, NH3 i CO2. Beta-alanina powstała w tym procesie jest wykorzystywana jako substrat do biosyntezy CoA-SH.

Rozpad tyminy (metylouracylu) przebiega tym samym szlakiem, ale produktem końcowym jest metylowa pochodna beta-alaniny (beta-aminoizomaślan).



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
ZESTAW 5 Ania Piecuch, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowani
Zestaw 2 Ania Piecuch, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowani
Zestaw 88 Kasia Goszczyńska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 54 Hanka Cywińska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracow
Zestaw 51 Hanka Cywińska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracow
zestaw 97 Przemek Pepliński, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
zestaw 96 Przemek Pepliński, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 94 Przemek Pepliński, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 90 Kasia Goszczyńska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 91 Kasia Goszczyńska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
ZESTAW 47 Kasia Gawęda, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowan
Zestaw 89 Kasia Goszczyńska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 93 Przemek Pepliński, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
Zestaw 50 Hanka Cywińska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracow
zestaw 87 Kasia Goszczyńska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra
ZESTAW 39 Kasia Gaweda, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowan
ZESTAW 40 Kasia Gaweda, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracowan
Zestaw 52 Hanka Cywińska, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opracow
zestaw 95 Przemek Pepliński, materiały farmacja, Materiały 3 rok, Od Ani, biochemia, biochemia, opra

więcej podobnych podstron