Budowa chemiczna białek:
- 20 l- izomerów aminokwasów- monomery białek jako biomolekuł
- proteiny- Jons. J. Berzelius
- łańcuch główny i łańcuchy boczne
- wiązania peptydowe: pojedyncze i podwójne
- reakcja biuretowa i ksantoproteinowa
- 1953r.- Federick Sanger- insulina
- >10 000 białek
Białka:
- są najbardziej uniwersalnymi makrocząsteczkami w układach żywych i odgrywają decydująca rolę w wielu procesach biologicznych,
- pełnią funkcję katalizatorów, transportują i magazynują cząsteczki, pełnia funkcje mechaniczno-strukturalne, uczestniczą w obronie immunologicznej, są generatorami ruchu, przenoszą impulsy nerwowe, kontrolują wzrost.
Jedną z głównych przyczyn tak szerokiego zakresu funkcji białek jest ich budowa.
Klasyfiakcja białek wg. Kształtu, połączeń z innymi cząsteczkami i lokalizacji
Rodzaj i występowania
- B. globularne- cytozol, błony biologiczne, płyn zewnątrz tkankowy,
-b. fibrylarne- cytozol, macierz zewnątrzkomórkowa,
- glikoproteiny i protoglikany- krew, błony biologiczne, macierz zewnątrzkomórkowa,
- lipoproteiny- krew, chłonka,
- nukleoproteiny- cytozol, jądro,
-metaloproteiny- cytozol, jądro, pływn zewnątrzkomórkowy
Czynniki wpływające na charakter białka:
- typ wiązania pomiędzy aminokwasami- cis lub trans,
- wzajemne oddziaływania pomiędzy łańcuchami białka:
a) wiązania wodorowe,
b) wiązania jonowe,
c) jony metalu,
d) oddziaływania hydrofobowe
e) wiązania kowalencyjne
Struktura I rzędowa:
- wiązania peptydowe- Sekwencja aminokwasów
- uwarunkowana genetycznie- determinacja struktur wtórnych
Peptydy- nazewnictwo:
- od N-końcowego aminokwasu dodając- ylo i pozostawiając C-końcowy aminokwas bez zmian,
- przykład: tri peptyd Ala-Ser-Gly,
- Aloanyloseryloglicyna,
- Skrótowa jednoliterowa:
Budowa i nomenklatura peptydów,
- najistotniejsza rekacja chemiczna aminokwasów jako cząsteczek dwufunkcyjnych jest ich zdolność do łączenia w związki o charakterze polimerycznym tzw. Peptydy za pomocą wiązania amidowego -CO-NH- tzw. Wiązania peptydowego.
Wiązanie peptydowe powstaje z wykorzystaniem grupy karboksylowej sąsiadującej z grupą aminową jednego i alfa-aminowej drugiego aminokwasu.
Budowa i nomenklatura peptydów:
Produkt powstający w rekacji łaczenia się dwóch aminokwasów nazywamy di peptydów, np. alanina- seryna (Ala-Ser).
Ponieważ w cząsteczce di peptydu pozostaje wolna grupa aminowa i karboksylowa, istnieje możliwość dalszego łączenia się z jeszcze innym aminokwasem i wówczas powstaje tri peptyd, tetra peptyd, itd.
Funkcje peptydów:
- hormony tarczycy,
- h. przysadki,
-h. przewodu pokarmowego,
- regulatory funkcji mózgu,
-regulatory układu erdoks
- efektory enzymów
Struktura II-rzędowa
Struktura drugorzędowa- są to typy regularnego ułożenia głównego łańcucha polipeptydowego stabilizowane wiązaniami wodorowymi.
Struktura alfa-helisy- odkryta jako pierwsza ma kształt cylindra. Ciasno spleciony łańcuch główny polipeptydu twory centralną część ceylidnra, natomiast boczne łańcuchy reszt aminokwasowych wystają na zewnątrz w ułożeniu heliakalnym.
Helisa, podobnie jak każda śruba, może być prawo i lewokrętna.
W białkach występuje głównie struktura helisy prawoskrętnej, alfa-helisa charakteryzuje się również polarnością.
Jej budowa sugeruje ,że jest dipolem- wewnętrzny niepolarny rdzeń oraz polarne reszty aminokwasowe wystawione na zewnątrz cząsteczki.
Struktura B-harmonijki (B-kartki)- w odróżnieniu od cylindrycznej struktury a-helisy, cząsteczka polipeptydu, przyjmuje kształt prawie całkowicie rozciągnięty w uformowaniu struktury B-harmonijki, może brać udział więcej niż jeden łańcuch polipeptydowe.
Harmonijkę B stabilizuje wiązanie wodorowe pomiędzy grupami CO i NH, leżacymi w jednej płaszczyźnie obok siebie i niekoniecznie pochodzących ze wspólnego łańcucha polipeptydowego.
Struktura IIIrzędowa
Struktura trzeciorzędowa powstaje w wyniku oddziaływania poszczególnych reszt aminokwasowych pomiędzy sobą.
Czynniki stabilizujące strukturę trzeciorzedowa:
- oddziaływanie hydrofobowe i hydrofilowe,
- wiązanie wodorowe- sparowanie się grup NH i CO ,
-siły van der Waalsa,
- bardzo charakterystycznym przykładem wiązań stabilizujących trzeciorzędową strukturę białek są tzw. Mostki dwusiarczkowe powstające pomiędzy dwiema resztami cysteinowymi
Struktura czwartorzędowa: łańcuchy polipeptydowe mogą składać się w struktury złożone z wielu podjednostek.
Podział białek wg. Ich struktury i funkcjonowania:
- strukturalne,
-kurczliwe,
-enzymy,
-magazynujące,
-odżywcze,
-regulatorowe,
-transportujące
-odpornościowe
Znaczenie biologiczne
- kataliza enzymatyczne (trypsyna)(
- transport i magazynowanie (hemoglobina, mioglobina, transferryna, ferrytyna)
- ruch uporządkowany (mięśnie, chromosomy, plemniki-aktyna)
- funkcje Mec paniczno-strukturalne (kolagen)
- odporność- immunoglobuliny,
- kontrola wzrostu- hormony
Kształt białek:
- fibrylarne (włókniste): aertyna, miozyna, aktyna, kolagen, elastyny
- globularne: albuminy, globuliny, histony
Glutation:
- trój peptyd,
-ma grupą hydrosulfidową,
- ochrania erytrocyty przed utlenieniem,
- odtruwa organizm
Aktyna:
- buduje fi lamenty cienkie w mięśniach,
- stymuluje hydrolizę ATP przez miozynę
- posiada 2 formy:
Aktyna G
Aktyna F
Kolagen:
- stanowi ok. 25% wszystkich białek ssaków,
- występuje w skórze, kościach, ścięgnach, chrząstkach, zebach, rogówce oka,
- ma b. dużą wytrzymałość mechaniczną i odporność na działanie enzymów,
- budują go 3 helikalne łańcuchy i ma dużo wiązań wodorowych,\
- nierozpuszczalny w wodzie, ale w zasadach,\
- produktem jego denaturacji jest żalatyna
Elastyna:
- występuje w tk. Łącznej (płuca, tętnice, sprężyste powiezie, skóra)
- nierozpuszczalne w wodzie, kw. I zas.
- wyjątkowa
Kazeina:
- fosfoproteina- białko mleka krowy,
- łatwo hydrolizuje,
- uczulenia- nietolerancja
Hemoglobina
- związek kompleksowy,
- hemoproteina z 4 łańcuhcami polipeptydowymi i z grupą hemową
- wiąże tlen, CO2, wodór,
- Erytropoetyna wpływa na jej syntezę