Biochemia
Pytania na egzamin:
1.narysuj pierscień pirymidynowy i napisz produkty rozpadu
2.wymień szkielety węglowe
3.wzory aminokwasów
4.wzór 5rybozotrifosforanu pirydyny
5.jaką reakcje katalizuje dehydrogenaza glutaminianowa
6.fenyloketonuria, alkaptonuria
7.co to jest PLP
8.do czego słuzy tetra hydrofolian
9.jakie enzymy stosuje sie w inżynierii genetycznej
10.struktury rzedowe białek
11.wymień aminokwasy egzogenne
12.do czego służy aminotransferaza asparaginowa
13.o czym mówi sekwencja Erdmana
14.produkty ropadu hemu
15.co to jest ramka odczytu
16.rola telomerazy
17.wymien etapy aminocylacji tRNA
18.narysuj pierścien purynowy i produkt rozpadu puryn
19.narysuj wzór 3'rybozomonofosforanu puryny
20/narysuj peptyd zbudowany z aminokwasów aromatycznych,kwaśnych, zasadowych i pierścieniowych
21.wymień białka biorace udział w cyklu komórkowym
DŁUGIE DO OPISANIA DO WYBORU:
1.usuwanie jinów amonowych i cykl mocznikowy
2.splicing wyjaśnij znaczenie tego procesu oraz opisz go
3.operon tryptofanowy
4.zasada tolerancji o oddziaływaniu kodon-antykodon
5.transkrypcja u prokaryota
6.wiązanie azotu
produkcja insuliny przez bakterie
7.onkowirusy, retrowirusy,HIV
8.co to jest struktura ,,cap,,
pytania z czesci dr jakubowicz:
zestaw A
1)wymien aminokwasy egzogenne
2)do czego sluzy aminoransferaza asparaginowa
3)o czym mowi sekwencja Erdmana
4)wymien produkty rozpadu hemu
5)co to jest ramka odczytu
6)uszereguj wiazania wg rosnacej sekwencji
7)wymien etapy aminoacylacji tRNA
8)narysuj pierscien purynowy i napisz produkty rozpadu
9)wymien bialka biorace udzial w cyklu komorkowym
10)narysuj wzor 3'rybozomonofosforanu purynowego
11)narysuj peptyd zbudowany z aminokwasu aromatycznego, kwasnego, zasadowego z pierscieniem
12)co to jest struktura „cap”
13)pytania do wyboru:
transkrypcja i procaryota
mutacje i mutageny DNA
wiazanie azotu
produkcja insuliny bakt.
Molekuły egzamin
Zestaw 3
1. Wyjaśnij inżynieria genetyczna
2. Wyjaśnij: genom, genotyp
3. Jakie końce powstają po cięciu restryktazami II klasy. Podaj 2 przykłady.
1. Dlaczego wielkość genomu nie wpływa na stopień zaawansowania ewolucyjnego.
2. Czy istnieje RNA niezależne od DNA. Uzasadnij
3. Wymień obróbki potranslacyjne białka
1. po co u eukariontów zachodzi replikacja? jakich wymaga substratów?
2.jaki charakter ma genom u Eukariontów kołowy czy liniowy?
3.polisom
1.metody mutagenezy ukierunkowanej
2.co to jest his-tag, chromatografia powinowactwa i co znaczy stępić końce?
3.cechy dobrego wektora do nadekspresji
Zestaw 10
1. Opisać translacje u eukariota
2. Definicja genomu i genotypu i czym się różnią te dwa pojęcia
3. Co to za skróty: Lys, 5S rRNA, Z-DNA
1. Opisz enzym stosowany w PCR. Z jakiego gatunku pochodzi.
2. Jakiej wielkości insert możemy wprowadzić do wektora lambda?
3. Zagrożenia i nadzieje współczesnej biotechnologii
12
1.Co to są polimerazy Rna zależne od DNA, wymienić?
2. Jak na funkcje białek wpływają poszczególne typy obróbek potranslacyjnych?
3. W której fazie cyklu kom. zachodzi replikacja?
1. Co to jest termocykler i do czego służy?
2. Skład mieszaniny ligacyjnej.
3. Które końce łatwiej ulegają ligacji: lepkie czy tępe?
11
1. Za co odpowiada sfałdowanie białka.
2. Budowa tRNA na poziomie strukturalnym.
3. Kierunek replikacji... (chciałem mu napisać 5'->3' i skończyć...).
1. nBr, cos, lambda, t-DNa, Ti.
2. Co musi posiadać standardowy wektor do klonowania.
3. Terapia genowa in vivo i ex vivo
od Wojtaszka:
1.Inicjacja translacji u Eucaryota i Prokaryota - porównaj.
2.Do czego służą helikazy
3.Etapy splicingu
od Rurka:
1.Na czym polega alfa-komplementacja
2.Mapowanie restrykcyjne i do czego służy częściowe trawienie
3.Co to jest test krzyżowy dwuantybiotykowy i na czym polega
zestaw 1
1.Reakcje zachodzące podczas dojrzewania RNA. (czy jakoś tak)
2.Omów wyjątki aminoacylacji
3. Wyjaśnij skróty: Trp, kb, miRNA
od Rurka:
1.Opisz PCR. Czemu ta metoda służy?
2.Omów klasy enzymów restrykcyjnych wykorzystywanych w inżynierii genetycznej.
3.Zdefiniuj wektor genetyczny.
opiny i T-RNA
enzymy klasy I
do czego fosforan wapnia
wielkosc genomu a ewolucja
do czego reszty lipidowe w białku
polimerazy rna zalezne od dna
od wojtaszka:
1. Które organelle posiadają swoje genomy i dlaczego?
2. Dlaczego w widełkach replikacyjnych nici tworzone są w różnej kolejności (czy jakos tak ;p)
3. Co to jest ubikwitynacja i na czym polega ten proces.
od Rurka:
1. Co to jest cDNA?
2. Etapy tworzenia biblioteki genomowej człowieka.
3. Co to jest metoda shot gun?
1. Na jakich rybosomach syntetyzowane są białka jąderkowe.
2. Jak zbudowany jest DNA i czy ma jakieś inne formy
3. Formy strukturalne białek
1. Jakie są enzymatyczne właściwości odwrotnej transkryptazy
2. Jak można oznaczyć końce 5'
3. Opisz system restrykcji- modyfikacji komórek bakteryjnych.
24A
70. W jaki sposób zachodzi replikacja wektora genetycznego w kom. gospodarza
71. Podaj podział wektorów pod względem ilości kopii. przyporządkuj do niego pBluescript (+) czy jakoś tak
72. Podaj znane ci przykłady wektorów genetycznych
1. RNA po transkrypcji musi zwykle przejść proces "dojrzewania" Na czym on polega i jakie mogą byc jego typy i konsekwencje
2. Dlaczego genomy organellowe mają tak niewielkie rozmiary w porównaniu z genomem jądrowym.odp uzasadni.
3. Jakie znasz typy konformacyjne DNA
6
1. Porównaj inicjację translacji u Pro- i Eucaryota.
2. Różne struktury DNA- wymień i krótko opisz.
3. Podaj definicję promotora genu.
Zestaw 8
1. opisz wiązania słabe
2. jakie RNA i w jakim momencie występują w translacji
3. co to jest operon
1. opisac cykl faga M13
2. co to są lepkie i tępe końce
3. dlaczego wirusy są bezwzględnymi pasożytami. jakie kwasy nukleinowe występuja w genomie wirusa
6A
16. Porównaj plazmid i wektor- podaj różnice.
17. Porównaj bibliotekę genomową i cDNA- podaj różnice.
18. Definicja biotechnologii.
1.cechy kodu genetycznego,
2.czym roznia sie białka hsp70 i hsp60,
3.wyjasnij skroty:arg,ori, miRNA
12:
1. Polimeraza RNA zależna od DNA. Jakie są jej cechy i przykład?
2. Do czego służy modyfikacja potranslacyjna białka?
3. W jakiej fazie cyklu komórkowego zachodzi replikacja?
12A:
1. Termocykler co to jest i do czego służy?
2. Z czego składa się mieszanina ligacyjna?
3. Które końce łatwiej ulegają ligacji lepkie czy tępe?
1.czy plazmid moze sie integrowac z genomem gosp.,
2.czego dotyczy cykl lizogenny i lityczny i opisac je,
3.przyklady roslin transgenicznych stosowanych w szczepionkach.
Zestaw 15
1. Budowa tRNA
2. Kosmidy
3. Wymień 5 roślin transgenicznych. Scharakteryzuj transgen
4. Jak białka są rozpoznawane i transportowane z miejsca ich syntezy do miejsca przeznaczenia.
5. replikacja semikonserwatywna
6. ? Jak przypomnę sobie, to dopiszę
18, 18A
1.cechy kodu genetycznego,
2.czym roznia sie białka hsp70 i hsp60,
3.wyjasnij skroty:arg,ori, miRNA
1. Etapy tworzenia biblioteki cDNA
2. Etapy transgenezy
3. Co to jest Flavr Savr?
4, 4a
1. Porównaj inicjacje transkrypcji u Prokaryota i Eukaryota
2. Co to są rybosomy, z czego zbudowane i do czego służą?
3. Do czego służy ubikwityna?
1. Wypisz i krótko scharakteryzuj do czego są wykorzystywane enzymy restrykcyjne w biotechnologii i inżynierii genetycznej
2. Na czym polega metoda Southern blot?
3. Co jest przedmiotem biotechnologii białej?
17
1.Porównaj inicjacje translacji u Proc. i Euc.
2.Dlaczego pary A-T i A-U są słabsze energetycznie
3.Powstawanie insuliny
17A
1.GMO
2.Czy organizm żywy można opatentować
3.Metody wprowadzania DNA do komórki zwierzęcej
1. Dlaczego pierwszym aminokwasem wprowadzanym w translacji u prokaryota jest formylometionina-jakie to ma znaczenie?
2.Dlaczego wielkość genomu nie świadczy o pozycji ewolucyjnej(czy coś w tym stylu)
3.W jaką stronę zachodzi synteza DNA i dlaczego.
4. Biotechnologia czerwona.
5.Co to metoda replik mikrobiologicznych i do czego służy.
6. Łysinka fagowa.