omgbiochemia4vn4

WITAM NA EGZAMINIE Z BIOCHEMII DLA STUDENTÓW FIZYKI MEDYCZNEJ AGH 2002/03 W DNIU 29. 05. 2003 (proszę: podpisać pracę, lokować odpowiedzi w miejscach zaplanowanych, numerować punkty, pcfdpunkty odpowiedzi, zaznaczać - o ile odpowiedź jest kontynuowana)

i. B

inlka. A..Narysuj dowolny trójpeptyd w pH 7 (wartości pK są podane na kartce dodatkowej). Jakie ładunki bedzie zawierał i jaki będzie miał. ładunek wypadkowy^ W którą stronę będzie wędrował w

polu elektrycznym? B. Co to jest elektroforeza? Czy może być stosowana do rozdziału takiej C mieszaniny białek, jaką jest surowica krwi? Jaki obraz powstanie po tym rozdziale w pK 8.6 na bibule?

C. Jon żelaza może wiązać się z białkami. Jakimi wiązaniami może się wiązać? Omów jego ulokowanie i rolę biologiczna \y mioglobinie, hemoglobinie, w cytochromach i białkach żelazo-siarkowych. Na jakim jest tam stopniu utlenienia i czy go zmienia?

Enzymy. A. Czy enzym bierze udział, w jeąkcji_kątąlizowanej? Jak może wiązać się z substratami? Jak

CYT    Ol    ___obniżenie___erjereii......aktywacji... reakcjL.. katalizowapej w porównaniu_ z reakcją

jf \J ńiekzralizowana? Jest kilka przvczvn._ B. Narysuj jak początkowe stężenie, substratu wpł)*wa na ptebfyo U 20    początkową prędkość reakcji kaTalizowanejy^A jak wphwa stężenie enzymu V*J?.ka krzy\a wysycenia    * tu byt

substratu ma enzym wykazujący kooperację dodatnia wiązania substratu? Czy wiesz ze jegó substrat    ⁱ

jest aktywatorem homotropowym? Spróbuj wytłumaczyć to zdanie. c£ Dla reakcji enzymatycznej. przy stężeniu enzymu 1 nM (czyli ló'⁹ M). oznaczono prędkości początkowe reakcji v_v. przy różnych stężeniach substratu. Wyznacz graficznie lub oblicz (oszacuj nawet tylko) stałą Michaelisa K_;TV szybkość maksymalną \^,łWiX, stalą katalityczną (liczbę obrotów; k-_KJl (k^, = V_nu,_v [EJ,.) oraz skuteczność (kWKJ dla poniższych danych w tnbeliTJ

/• Kwasy nukleinowe. A. Naiysuj dowolny rrójnukleoiyd. Zaznacz miejsca działania egzonukleaz. endonukleaz, polimeraz DN.VR.NA. B. Jeśli podczas eksperymentu na ten sam zei agarozowy nałożysz próbki: DNA. RN A oraz produkty działania nukleaz (ryber.ukleaz i deoksyiybonukleaz) na nie. to naszkicuj obraz po elektroforezie, jeśli były to próbki, odpowiednio:!.DNA, 2. 2S S rRNA. 3. IS S rRN.A, 4. produkt działania DN.A-zy na DNA., 5. produkt działania RNA-zy na RN.A. C. Naiysuj widmo DNA w L*V. Przy jakiej długości fali ma maksimum? Jakie elementy jego budowy absorbują światło UY? Naiysuj widmo rej samej próbki DNA po podgrzaniu (na tym samym wykresie). Co to jest erekt hipocliromowy.^iperchromowy? Jak wyznaczysz temperaturę topnienia DNA? Spróbuj narysować też widmo białka w UY.

Utlenianie biologiczne. A. W którym miejscu łańcucha oddechowego swoich elektronów/ dostarcza jabłezan, a w którym bursztynian? Jakie związki z nich powstaną? Jakie koenzymy temu towarzyszą?

B. Co dzieje się z ymi elektronami w łańcuchu? Jak one wędrują na tlen? Czy znajdujemy je w - cząsteczce wody? Napisz 4-elektronową reakcję redukcji tlenu. A co z protonami pochodzącymi z substratów? C-. Jakie związki powstaną w- 1-elektronowych reakcjach redukcji tlenu? Dlaczego są tak niebezpieczne dla lipidów, białek i DNA komórki? Jak możemy się ochronić?

($. 'Metabolizm. A. Pokaż jak spalany jest acetyl w cyklu Krebsa. Jaki jest los jego atomów węgła oraz *—^ atomów wodoru? Co musi się zdarzyć potem, aby powstały cząsteczki wody? B. Czy glukoza może zamienić się węybozę, w pirogroniai/ w alaninę, w acetyl, wtłuszcz (jeśli wiesz ze powstaje~on z

Stężenie substratu fMI	l/[SJo -...... rM-’i	Prędkość początkowa reakcji, vu fMs’1	l/v. f M"^1 s]
1 x 10’^1 ■k *	10	27	0.0370
1x10-	100	26.5	0.0377
1 x 10°	1000	26	0.0385
1x10^-’	10000	19.3	0.05 i 8
5x10’^5	20000	ló	0.0666
1 x 10'^5	100000	5.4	0.1S52
5x10^45	200000	J	0.3333
‘ 1 x 10^-6	1000.000	0 66	1.5151

E + S

ES

k.,

E + P

(1.1)

(cot[

l\J 4H-#¹

vo =

Równanie

CM

V mas • |		rsjo kt.. • |	:ej	o-|	;s]o
[S]	|uń-	Km ^_ K,	.+1	[S]o .

r, -    •    Vinzx-[S]S

Równanie Hula: Vq =

Michaelisa-Menten:

h

(A'o.5)¹' ■ tS)o