20090912045[1]

1.    Co to jest i do czego służy lista Verleta? Jaki wpływ na czas obliczeń ma wprowadzenie dwóch promieni Verleta (wewnętrznego i zewnętrznego)?

2.    Co to są poprawki dalekozasięgowe? Kiedy je trzeba liczyć? Podać wyrażenie na poprawkę dalekozasięgowądla energii potencjalnej dla oddziaływań dwuciałowych.

3.    Jak w symulacjach MD obliczamy średnie przemieszczenie kwadratowe? Jaki charakter musi mieć jego zależność od czasu, aby współczynik dyfuzji nie zależał od czasu?

4.    Na jakiej zasadzie działają termostaty i barostaty należące do klasy układów rozszerzonych (o dodatkowe stopnie swobody, ESM)? Omów Wybrany przez siebie przykład barostatu. -

5.    Czym różnią się symulacje układów atomowych i molekularnych?

6.    Omów algorytm Monte Carlo symulacji strukturalnych,materiałów w zespole (NpT).