2740390242

BI Ol N FORMATY KA

Kod przedmiotu: 11.9-WK-liE-SD-B Typ przedmiotu: wybieralny Język nauczania: polski

Odpowiedzialny za przedmiot: dr inż. Andrzej Kasperski Prowadzący: dr inż. Andrzej Kasperski

Forma zajęć	Liczba godzin w semestrze	Liczba godzin w tygodniu	Semestr	Forma zaliczenia	Punkty ECTS
Studia stacjonarne
Wykład	15	1		Zaliczenie na ocenę	4
Projekt	30	2		Zaliczenie na ocenę

CEL PRZEDMIOTU:

Przedstawienie wybranych zagadnień związanych z wykorzystaniem informatyki w zastosowaniach genetycznych. Przedmiot obejmuje wprowadzenie podstawowych pojęć związanych z bioinformatyką, genomiką i proteomiką oraz charakterystykę podstawowych internetowych baz bioinformatycznych. W ramach przedmiotu przedstawione są programy i metody informatyczne używane do modelowania struktury 3D białek i modelowania struktury 2D RNA. Zaprezentowane zostają także wybrane programy komputerowe służące do porównywania sekwencji.

WYMAGANIA WSTĘPNE:

Podstawowa znajomość programowania.

ZAKRES TEMATYCZNY PRZEDMIOTU:

Wykład

1.    Wstęp do bioinformatyki oraz omówienie wybranych zastosowań informatyki w biosystemach.

2.    Serwisy i programy bioinformatyczne.

3.    Kod DNA, transkrypcja, translacja i modelowanie struktury 3D białek.

4.    Konformacje i wizualizacja struktury przestrzennej białek.

5.    Modelowanie struktury RNA.

6.    Rodzaje dopasowań i porównywanie sekwencji.

7.    Prezentacja i omówienie wybranych programów komputerowych służących do porównywania sekwencji.

Projekt

W ramach zajęć projektowych należy opracować jeden projekt oraz dokumentację do tego projektu. Opracowywany projekt dotyczy zastosowania wybranych programów i metod informatycznych do modelowania struktury 3D białek oraz modelowania struktury 2D RNA.

METODY KSZTAŁCENIA:

Wykład: wykład konwencjonalny.

Projekt: samodzielna praca przy komputerze. Opracowanie projektu według instrukcji, które każdy student dostaje na początku semestru. Dyskusje prowadzące do pogłębienia wiedzy i lepszego zrozumienia przerabianego materiału.

Wydział Matematyki, Informatyki i Ekonometrii Kierunek: Informatyka i ekonometria 11