8490742886

Nazwa przedmiotu: BADANIE GENOMU ZWIERZĄT METODAMI ANALIZY

SPRZĘŻEŃ

Kod przedmiotu:

Typ przedmiotu: fakultatywny na kierunku BIOLOGIA

Prowadzący: dr hab. Heliodor Wierzbicki; [e-mail]

Semestr: 6

Wymiar godzinowy: 15 godz. wykładów; 30 godz. ćwiczeń

Efekty kształcenia: Student w czasie kursu zapoznawany jest z teoretycznymi i praktycznymi aspektami badania genomu zwierząt metodami analizy sprzężeń. Szczególny nacisk kładziony jest na poznanie metod analizy statystycznej i programów komputerowych stosowanych do badania nierównowagi sprzężeń markerów genetycznych i genów cech ilościowych (QTL), i wykorzystania tej wiedzy do określania udziału genów o dużych efektach w kształtowaniu się zmienności fenotypowej badanych cech.

Wymagania wstępne: biochemia, genetyka, biologia komórki, technologia informacyjna

Treści kształcenia: rodzaje markerów genetycznych, nierównowaga sprzężeń i sposoby jej oceny, mapowanie genów cech ilościowych (QTL) z wykorzystaniem nierównowagi sprzężeń, kształtowanie struktury genetycznej populacji zwierząt metodą selekcji z wykorzystaniem markerów genetycznych (MAS - Marker Assisted Selection), czynniki wpływające na dokładność analizy sprzężeń i selekcji genomowej.

Szczegółowa tematyka wykładów (15 x 1 godz.)

1.    Badanie genomu zwierząt - cele i metody.

2.    Rodzaje markerów genetycznych wykorzystywanych w analizie sprzężeń.

3.    Nierównowaga sprzężeń (LD - Linkage Diseąuilibrium) i sposoby jej oceny.

4.    Przyczyny nierównowagi sprzężeń w populacjach zwierząt.

5.    Zakres i częstość nierównowagi sprzężeń wewnątrz populacji i rasy oraz pomiędzy populacjami i rasami zwierząt.

6.    Bloki haplotypowe i „gorące miejsca”(ńo/ spots) rekombinacji.

7.    Mapowanie genów cech ilościowych (QTL) z wykorzystaniem nierównowagi sprzężeń.

8.    Analiza sprzężeń z wykorzystaniem pojedynczych markerów genetycznych.

9.    Analiza sprzężeń z wykorzystaniem bloków haplotypowych.

10.    Kształtowanie struktury genetycznej populacji zwierząt metodą selekcji z wykorzystaniem markerów genetycznych (MAS - Marker Assisted Selection).

11.    Wykorzystanie markerów LD w selekcji zwierząt.

12.    Zastosowanie markerowych bloków haplotypowych w selekcji zwierząt.

13.    Selekcja genomowa {genomie selection) - nowe narzędzie kształtowania struktury genetycznej populacji zwierząt.

14.    Metody analizy genomu stosowane w selekcji genomowej.

15.    Czynniki wpływające na dokładność analizy sprzężeń i selekcji genomowej.