3870137223

30 A EJCHAKT

PRZESUNIĘCIA CHEMICZNE W BIAŁKACH

W badaniach NMR białek oprócz przesunięć chemicznych protonów¹H istotną rolę odgrywają również przesunięcia izotopów ^1SN i ^I3C. Położenia sygnałów w krótkich łańcuchach peptydowych, nie posiadających struktury drugorzędowej, są mało zróżnicowane. Natomiast w białkach posiadających strukturę trzecio- lub czwartorzędową zróżnicowanie jest znacznie większe i często charakterystyczne dla lokalnej struktury drugorzędowej. Typowe przedziały przesunięć chemicznych w białkach zostały zebrane w Tab. 1. Bardziej szczegółowe dane dotyczące przesunięć chemicznych *H i ^,3C oparte na analizie danych NMR otrzymanych dla 13 białek zostały opublikowane przez Kraulisa [15 J.

Tabela 1. Charakterystyczne przedziały wartości przesunięć chemicznych izotopów *11, ^,3N i ¹³C

w białkach diamagnetycznych

Jądro	Przedział [ppm]
Hn	7,0-10,0
Harom	6,0-9,0
H„(W)	9,5-10,5
H„, H|j(S, T)	3,5~S,5
	0,3-4,0
N szkieletu, N& (N), (Q)	105-130
C	170-182
	85-140
Ca,Cj5(S,T),C*(P)	48-72
C*(G)	40-48
Cp, Cy...	10-45

me obejmuje meobserwowanych w widmach korelacyjnych ⁿC/*H czwartorzędowych atomów węgla

Systematyczne odchylenia przesunięć chemicznych jąder H_a i C_a od przyjmowanych za punkt odniesienia przesunięć chemicznych tych jąder w odpowiednich resztach aminokwasowych znajdujących się łańcuchu nie mającym określonej struktury (stopiona globula) są wykorzystywane w metodzie CSI (ang. Chemical shifi in-dex) do identyfikacji helis i struktur (3 [16, 17J. Również bazująca na wartościach przesunięć chemicznych metoda TALOS pozwala na przewidywanie lokalnej konformacji szkieletu białka [18],

Analizując podane w Tab. 1 wartości przesunięć chemicznych należy zwrócić uwagę na dwie ich cechy. Przedział przesunięć chemicznych szkieletowych proto-