Temat: Wyznaczenie stałej Michaelita-Menten i oznaczanie aktywności enzymów
Cel ćwiczenia:
Celem ćwiczenia jest poznanie kinetyki enzymów (stałej Km i wpływu stężenia enzymu na szybkość reakcji) na przykładzie dwóch enzymów z różnych klas - hydrolazy i oksydoreduktazy.
Metoda:
Aktywność fosfataz oznacza się zazwyczaj używając sztucznych substratów takich jak: 2-glicerofosforan, fenylofosforan, fosforan fenoloftaleiny, 4-nitrofenylofosforan. Aktywność enzymu mierzy się ilością uwolnionego fosforanu lub części organicznej estru po inkubacji enzymu z substratem w ściśle określonych warunkach. Szczególnie dogodny jako substrat jest 4-nitrofenylofosforan, ponieważ jeden z produktów reakcji przechodzi w formę barwną już po zalkalizowaniu środowiska.
Odczynniki:
Wyciąg enzymu
0,0075 - molowy 4-nitrofenylofosforanu
10 % roztwór NaCO3
bufor o pH = 5,3
Szkło i inne pomoce:
1. 1 pipeta chemicznej na 1 i 5 ml oraz serologicznej
2. 8 probówek chemicznych
Wykonanie:
Do 6 ponumerowanych probówek odmierzono kolejno 0,1; 0,2; 0,4; 0,6; 0,8; 1,0 4-nitrofenylofosforanu. Następnie dodano po 1,5 ml buforu o pH = 5,3 i uzupełnić wodą do objętości 4 ml, a do próby kontrolnej odmierzono 1,5 ml buforu i 2,5 ml wody.
Roztwory umieszczono na pięć minut w łaźni wodnej o temp. 38˚C. Następnie do każdej probówki dodano 1,0 ml enzymu, wymieszano i inkubowano przez 10 minut w temp. 38˚C. Po upływie wyznaczonego czasu zahamowano reakcje dodając 5 ml roztworu NaCO3.
Obserwacje:
Po dodaniu do 4-nitrofenylofosforanu buforu o pH=5,3 oraz wody i pierwszej inkubacji nie zaobserwowano żadnej zmiany barwy. Po dodaniu enzymu drugiej inkubacji i dodaniu następnego odczynnika (roztwór NaCO3) można dostrzec jak roztwór zmienia barwę z bezbarwnej na odcień zieleni. W zależności od stężenia substratu barwa jest intensywniejsza (przy większym), bądź mało intensywna (przy mniejszym).
Wyniki:
Po ustawieniu fotometru na próbę zerową uzyskano wyniki dla poszczególnych prób, następnie przedstawiono je w tabelce:
S |
A420 |
A420 / 0,002 [μg] |
V = [μg] / 139 |
1 / V |
[S] |
1 / [s] |
0,1 |
0,142 |
71 |
0,511 |
1,96 |
0,00015 |
6666 |
0,2 |
0,17 |
85 |
0,612 |
1,64 |
0,0003 |
3333 |
0,4 |
0,2 |
100 |
0,719 |
1,39 |
0,0006 |
1666 |
0,6 |
0,216 |
108 |
0,776 |
1,29 |
0,0009 |
1111 |
0,8 |
0,218 |
109 |
0,784 |
1,28 |
0,0012 |
833 |
1,0 |
0,248 |
124 |
0,892 |
1,12 |
0,0015 |
666 |
Schemat rozcieńczeń
A- Absorpcja
0,002 - molowy współczynnik 4-nitrofenylofosforanu
139 - masa molowa produkt
Aktywność Fosfatazy wynosi 41,29
Wyznaczenie Stałej Km
Wnioski :
Wartości stałej Km wahają się w granicach od 10-1 do 10-8 i zależą od rodzaju enzymu, substratu, temperatury, pH. W określonych warunkach stała Km jest wskaźnikiem powinowactwa enzymu do substratu. Wartość 2,16*10-4 jest wartością stosunkowo niską zatem wskazuje na duże powinowactwo i dużą szybkość procesu katalitycznego.