ANALIZA FILOGENETYCZNA

Ćwiczenie 1
filogeneza
filogenetyka
anageneza
drzewo filogenetyczne
kladogeneza
kladogram
filogram
apomorfia, plejomorfia
taksony naturalne i sztuczne

Ćwiczenie 2
metody dystansowe: UPGMA, NJ, ME
Jacknife
bootstrap

Ćwiczenie 3
Maksymalna parsymonia
Indeks Bremena
procedury: branch-and-bound; heurystyczna
optymalizacja drzew: ACCTRAN, DELTRAN
total evidance
metoda konsensusowa

Ćwiczenie 6
metody wiarygodnościowe
wnioskowanie bayesowskie
ML
MCMC