How the ABI Prism 310 Genetic Analyzer Works 

The  ABI  PRISM®  310  Genetic  Analyzer  is  a  system  composed  of  instrument 
hardware, 
a Macintosh® computer, several types of software, and consumables. 
This  overview  will  help  you  identify  parts  of  the  ABI  PRISM® 310  Genetic  Analyzer 
and 
understand how it works. 

DNA sequencing experiments determine the order of the bases in a DNA sample. 
Fluorescently labeled dyes are attached to ACGT extension products in DNA 
sequencing  reactions.  Dye  labels  are  incorporated  using  either  5´-dye  labeled 
primers 
or 

3´-dye 

labeled 

dideoxynucleotide 

terminators. 

Polymerases 

such 

as 

AmpliTaq® FS 
are used for primer extension. 
The sequencing reaction sample 
tubes  are  placed  in  a  tray  in  the 
instrument’s 
autosampler.  The  autosampler 
successively brings each sample 
into contact with the 
cathode  electrode  and  one  end 
of  a  glass  capillary  filled  with 
polymer. An anode 
electrode at the other end of the 
capillary is immersed in buffer. 
A  portion  of  the  sample  enters 
the  capillary  as  current  flows 
from the cathode to the 
anode.  This  is  called  electrokinetic  injection.  The  end  of  the  capillary  near  the 
cathode 
is then placed in buffer. Current is applied again to continue electrophoresis. 
When  the  nucleotides  reach  a  detector  window  in  the  capillary  coating,  a  laser 
excites 
the fluorescent dye labels. Emitted fluorescence from the dyes is collected by a CCD 
camera. The software interprets the result, calling the bases from the fluorescence 
intensity at each data point.