Dojrzewanie insuliny
proinsulina
funkcjonalna
forma insuliny
preproinsulina
sekwencj
a
sygnalna
łańcuch
A
łańcuch B
odcięty peptyd C
KOLAGEN
Hydroksylacja
• dotyczy głównie prolin i lizyn
• katalizowana jest przez hydroksylazy
protein activity
Asn, Ser, Thr
Glycosylation
various
Lys
C-terminus
Tyr
Lys, N-terminus
N-terminus
Cys
Cys
Tyr
Pro, Lys, Asn, Asp
Arg, Lys, His, Glu
Ser, Thr, Tyr
target site
activation
degradation/other
bioactive peptides
protein-protein intera’n
gene expression
membrane association
membrane association
signalling, oncogenesis
protein-protein intera’n
collagen structure
prot. repair, chemotaxis
signalling, activation
cellular process
Ubiquitylation
Truncation
Amidation
Sulfation
Acetylation
Myristoylation
Palmitoylation
Prenylation
Sulfation
Hydroxylation
Methylation
Phosphorylation
modification
The Cell – a molecular approach
MIRYSTYLACJA
PRENYLACJA
• Prenylacja polega na przyłączaniu do białek pochodnych
izoprenowych, takich jak np. jednostka farnezylowa (C15) –
farnezylacja – przyłączanie wiązaniem tioeterowym grup
farnezylowych do reszt cysteiny, znajdujących się przy C-końcu
polipeptydu
Acetylowana lizyna
Lizyna
Acetylacja
R.G.Kornberg (1999) Eukaryotic
transcription control) TCB 9; M46-M49
Acetylacja
Deacetylowane
ogony histonowe
Acetylowane
ogony
histonowe
B.R.Cairns (2001) Trends in Cell Biology 11;
S15-S21
Acetylacja - metylacja
Aktywna chromatyna
Heterochromatyna
A.J.Bannister, P.Zegerman, J.F.Partridge, E.A.Misca,
J.O.Thomas, R.C.Alshire, T.Kouzarides (2001) Nature 410;
120-124
Metylacja
Metylacja
Metylacja
T.Jenuwein (2001) Trends in
Cell Biology 11; 266-273
Metylacja
T.Jenuwein (2001) Trends in Cell
Biology 11; 266-273
Metylacja
T.Jenuwein (2001) Trends in
Cell Biology 11; 266-273
Konstytutywna
heterochromatyna –
transkrypcyjnie nieaktywna
(sekwencje satelitarne,
powtórzenia)
Fakultatywna
heterochromatyna
Euchromatyna –
transkrypcyjnie aktywna
H3 – K9, K14, K23
H4 – K5 i K12
Modyfikacje histonów
-
podsumowanie
B.D.Strahl, C.D.Allis
(2000) Nature, 403; 41-
45
Modyfikacje białek
-
fosforylacja
Kinaza białkowa
Fosfataza białkowa
Alain Israël (1997) Nature 388;
519-521
Modyfikacje czynnika transkrypcyjnego NF-κB
Fosforylacja
P
Ufosforylowany
NF-ATc
Kompleks kalmoduliny z
kalcyneuryną A i B
Kompleks
CyPA z CsA
Fosfolipaza C γ 1
Ca
2+
Jądro
komórki
NF-ATn
Oct-1
Gen dla interleukiny IL-2
AP-1
NF χB
Fosforylacja
Domena CTD
(YSPTSPS)n
Ess1
(CPR1)
Kinaza
CTD
DNA
+1
TFIIH
TAFs
pol RNA II
TFIIB
TFIIA
TATA
TFIIF
TFIIE
TBP
CPDF
P
P
P
P
P
DNA
mRNA
+1
CstF
pol RNA II
TFIIF
TFIIE
TFIIH
AATAAA
Ufosforylowana
domena CTD
Fosforylacja -
regulacja metabolizmu
glukozy
Glikogen
Fosforylacja -
regulacja metabolizmu
glukozy
Syntaza glikogenu
Fosforylaza glikogenu
Fosforylacja -
regulacja metabolizmu
glukozy
przykład
przykład
Glikozylacja białek N-glikozydowo
Typ oligosacharyd wysoko-mannozowy - tylko reszty mannozy i glukozy
związane N-glikozydowo
Typ oligosacharyd złożony – reszty mannozy, N-acetyloklukozoaminy
i galaktozy
Glikozylacja białek –
struktura dolicholu
• nienasycony lipid
• zbudowany z 17 – 20 reszt izoprenu
• wielokrotnie przechodzi przez błonę RE
• jest miejscem zakotwiczenia oligosacharydów
Kontrola jakości w ER
Randal J. Kaufman i wsp. (2002) NATURE REVIEWS| MOLECULAR
CELL BIOLOGY, 3;
411 - 421
Kontrola jakości
UPR
Randal J. Kaufman i wsp. (2002) NATURE
REVIEWS| MOLECULAR
CELL BIOLOGY, 3; 411
- 421
UPR
Chris Patil and Peter Walter Intracellular signaling from the endoplasmic reticulum to the
nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals
HAC - intron
252 nt
Rowan Chapman, Carmela Sidrauski, and Peter Walter INTRACELLULAR SIGNALING FROM THE
ENDOPLASMIC RETICULUM TO THE NUCLEUS Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1998. 14:459–85
UPR
Rowan Chapman, Carmela Sidrauski, and Peter Walter INTRACELLULAR SIGNALING FROM THE ENDOPLASMIC
RETICULUM TO THE NUCLEUS Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1998. 14:459–85
Z. Kostova, D.H.Wolf
(2003) EMBO, 22 p. 2309-
2317
26S Proteasom
Ubikwityna
Ubikwitynacja
Zdenaturowane białko
Prawidłowo pofałdowane
białko
Ubikwitynacja
26S
Proteasom
Ubikwityn
a
Z. Kostova, D.H.Wolf (2003)
EMBO, 22 p. 2309-2317