Regulacja i ekspresja genów
zależnych od AHR
Stres oksydacyjny
Paweł Brzuzan
W10: AHR a stres oksydacyjny
W10: AHR a stres oksydacyjny
Rola AhR w fizjologii i toksykologii
• ligandy egzogenne i endogenne
(naturalne; pochodne tryptofanu)
• procesy rozwojowe
• odpowiedź adaptacyjna
• toksyczność (bezpośrednia i pośrednia;
„cross talk”)
Receptor arylowowęglowy (rodzina
cz. tr. bHLH/PAS)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Regulacja ekspresji
genu
W10: AHR a stres oksydacyjny
Regulacja
ekspresji genu
AHR Pathway
TCDD
AIP
AIP
AHR
HSP90
HSP90
HSP90
p23
AHR
ESR
AH
R
AHR
Degradation
AHR
Degradation
AHRR
AHRR
ARNT
?
AHR
ARNT
ARNT
SHP
COUP-TF1
SMRT
BRG1
RelA
SP1
TCDD
RIP140
pRb
ERAP140
p300
pCIP
SRC1
TFII
B
Ac
Ac
BTE
BTE
TATA
Sp1
TI
F2
RNA
Pol II
TBP
PAH,
TCDD
PAH,
TCDD
HSP90
Release
CYP1A1,CYP1B1,CYP1A2 &
AHRR Gene Expression
CYP1A1,CYP1B1,CYP1A2 &
AHRR Gene Expression
c-Myc
Expression
c-Myc
Expression
XRE
XRE
Cath-D
Expression
Cath-D
Expression
PS2 Gene
Expression
PS2 Gene
Expression
PS2 Gene
Expression
PS2 Gene
Expression
Estrogen
Estrogen
ESR
NEDD8
SUMO7
AHR
HSP90
p23
TCDD
2009
ProteinLounge.com
2009
ProteinLounge.com
C
W10: AHR a stres oksydacyjny
Ewolucja genów AHR u ryb (Hahn i in. 2005)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Struktura domen AHR1, AHR2, pRb (Fundulus
heteroclitus
; Hahn i in. 2005)
W10: AHR a stres oksydacyjny
W10: AHR a stres oksydacyjny
Regulacja ekspresji genu ahr:
promotory AHRE/DRE/XRE
Core sequence: 5’-GCGTG-3’
Consensus sequence: 5’-
T/GNGCGTGA/CG/CA-3’
ARNT >> 5’-GTG-3’
AhR >> 5’-TC/TGC-3’
Regulacja ekspresji genu ahr:
promotory AHRE/DRE/XRE
Regulacja ekspresji genów „AhR battery”
(Hahn i in. 2005)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Bateria genów zależnych od AHR
Nebert et al. 1999
W10: AHR a stres oksydacyjny
Nebert et al. 1999
Stres oksydacyjny
stan braku równowagi pomiędzy działaniem RFT a
biologiczną zdolnością do szybkiej detoksykacji
reaktywnych produktów pośrednich lub naprawy
wyrządzonych szkód
W10: AHR a stres oksydacyjny
Bateria genów
zależnych od
AHR i
katalizowane
reakcje
Nebert et al. 1999
W10: AHR a stres oksydacyjny
Stres oksydacyjny
Szlaki odpowiedzi komórki na SO
Nebert et al. 1999
W10: AHR a stres oksydacyjny
Stres oksydacyjny
Szlaki odpowiedzi komórki na SO
Nebert et al. 1999
W10: AHR a stres oksydacyjny
Profil ekspresji wybranych genów gambuzji
pod wpływem antracenu (Peterson i Bain
2003)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Profil ekspresji wybranych genów gambuzji
pod wpływem antracenu (Peterson i Bain
2003)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Profil ekspresji wybranych genów gambuzji
pod wpływem antracenu (Peterson i Bain
2003)
W10: AHR a stres oksydacyjny
Pytania kontrolne
2. Omów etapy regulacji ekspresji baterii genów
zależnych od AHR.
3. Wymień geny ulegające ekspresji na szlaku AHR.
4. P/F. Represor AHR rozpoznaje miejsca promotorowe
baterii genów AHR. Wyjaśnij.
6. Omów zastosowanie makromacierzy cDNA w badaniu
toksyczności wybranych zanieczyszczeń środowiska.
5. Wyjaśnij co to jest stres oksydacyjny.
1. Jaką rolę fizjologiczną spełnia receptor arylowęglowy,
AHR?
W10: AHR a stres oksydacyjny