Budowa
chromatyny
Jakub Sokal
Pielęgniarstwo I rok (s1)
Grupa I
Co to jest chromatyna?
Jest to włóknista substancja występująca w
jądrze komórkowym, zbudowana z:
bardzo długich, dwuniciowych cząsteczek
DNA
prawie takiej samej wagowo ilości
histonów
białek niehistonowych (większość z nich
to białka kwaśne i większe niż histony)
małej ilości RNA
DNA
Wielkocząsteczkowy organiczny związek
chemiczny należący do kwasów
nukleinowych, który zbudowany jest z
pojedynczych, powiązanych ze sobą
monomerów (nukleotydów). U eukariontów
zlokalizowany jest przede wszystkim w
jądrach komórek, u prokariontów
bezpośrednio w cytoplazmie, natomiast u
wirusów w kapsydach. Pełni rolę nośnika
informacji genetycznej organizmów żywych.
Histony
Białka zasadowe, które zawierają dużo
aminokwasów zasadowych (lizyny i argininy),
dobrze rozpuszczalne w wodzie. Są
składnikami jąder komórkowych, gdzie
tworzą rdzenie nukleosomów w chromatynie.
Spośród wszystkich histonów najsłabiej
związane z chromatyną są histony H1 i
dlatego są one łatwo usuwane roztworem
soli, w wyniku czego chromatyna staje się
rozpuszczalna.
Białka niehistonowe
Białka te to enzymy, które biorą udział w
replikacji DNA (np. topoizomerazy DNA).
Należą do nich również białka biorące
udział w transkrypcji (np. kompleks
polimerazy DNA).
RNA
Organiczny związek chemiczny z grupy kwasów
nukleinowych, zbudowany z rybonukleotydów
połączonych wiązaniami fosfodiestrowymi. Z
chemicznego punktu widzenia jest polimerem
kondensacyjnymi rybonukleotydów. Występuje w
jądrach komórkowych i cytoplazmie, często wchodząc
w skład nukleoprotein. Znanych jest wiele klas kwasów
rybonukleinowych o zróżnicowanej wielkości i
strukturze, pełniących rozmaite funkcje biologiczne.
Zarówno struktura, jak i funkcja RNA jest silnie
uzależniona od sekwencji nukleotydów, z których
zbudowana jest dana cząsteczka.
Stopnie upakowania
chromatyny
podwójna helisa + oktamer histonowy →
nukleosom + histon łącznikowy (np. H1) →
chromatosom + łącznikowy dna →
nukleofilament (sznur koralików, włókno
10 nm) → solenoid (włókno 30 nm) →
pętla chromosomowa (pętla laemmliego)
→ chromatyna interfazowa → chromosom
metafazowy
Podwójna helisa
Podwójna helisa stanowi
podstawowy element struktury
przestrzennej cząsteczki DNA.
Składa się z dwóch łańcuchów
polinukleotydowych, które biegną
w przeciwnych kierunkach i
owijają się wokół wspólnej osi.
Zasady azotowe nukleotydów
znajdują się wewnątrz podwójnej
helisy i są połączone wiązaniami
wodorowymi w pary
komplementarne. Fragmenty o
strukturze podwójnej helisy
znajdują się także w niektórych
cząsteczkach RNA, np. tRNA.
Nukleosom
Jest jednostką organizacyjną rozpuszczalnej
chromatyny. Wyizolowany rdzeń
nukleosomów zawiera 4 klasy histonów
(nazywanych rdzeniowymi): H2A, H2B, H3 i
H4. Ich struktura zostaje wśród gatunków w
znacznym stopniu zachowana, co świadczy o
tym, że czynność histonów jest identyczna we
wszystkich komórkach eukariotycznych i że
cała cząsteczka uczestniczy w wypełnianiu
swoistej funkcji.
W nukleosomie DNA
jest nawinięty, jako
lewoskrętna helisa,
na powierzchni
podobnego do
dysku oktameru
histonów.
Wcześniej wymienione klasy histonów rdzeniowych
podlegają następującym rodzajom kowalencyjnych
modyfikacji:
acetylacji (H3 i H4- acetylacja związana z z aktywacją
lub deaktywacją transkrypcji genów, ogólnie o
wszystkich histonach rdzeniowych- związana ze
składaniem chromosomów podczas replikacji DNA)
metylacji
fosforylacji (H1- fosforylacja związana z kondensacją
chromosomów podczas replikacj)
ADP- rybozylacji (związana z naprawą DNA)
monoubikwitylacji (związana z aktywacją genu,
represją i heterochromatycznym wyciszaniem genów)
sumoilacji (prowadzi do represji transkrypcji)
Histony rdzeniowe mają zdolność
wzajemnego oddziaływania na siebie:
H3 i H4 tworzą tetramer, który zawiera po
dwie cząsteczki każdego z nich (H3/H4)
2
-
narzuca DNA właściwości nukleosomu
H2A i H2B tworzą dimery (H2A-H2B),
których dodanie stabilizuje pierwotną
cząsteczkę i wiąże silnie dwa dodatkowe
półskręty helisy DNA, uprzednio jedynie
związane z tetramerem (H3/H4)
2
W warunkach fizjologicznych takie oligomery
łączą się w oktamer histonowy o składzie
(H3/H4)
2
-(H2A-H2B)
2
.
W powstawaniu nukleosomów pośredniczą
niektóre czynniki tworzenia chromatyny,
wspomagane przez białka opiekuńcze
histonów. W trakcie tworzenia nukleosomów
histony zostają uwolnione od tych białek.
Nukleosomy wykazują preferencje do pewnych
regionów na specyficznych cząsteczkach DNA
(fazowanie), jednak przyczyna tego dokładnie
nie jest znana. Prawdopodobnie ma to związek
ze względną fizyczną giętkością pewnych
sekwencji nukleotydowych oraz z obecnością
innych czynników związanych z DNA, które
ograniczają liczbę miejsc lokalizacji
nukleosomów.
Histon łącznikowy
Należy do rodziny małych, zasadowych białek
histonowych, do których zalicza się histon H1 i
jego odmianę histon H5. W porównaniu z innymi
histonami cechuje go względnie duża
heterogenność. Jest zlokalizowany w obrębie
nukleosomu w miejscu, w którym DNA schodzi i
wchodzi do nukleosomu, tworząc swego rodzaju
klamrę spinającą całość. Histony łącznikowe
zbudowane są z trzech domen: globularnej
domeny głównej oraz dwóch małych domen- N-
końcowej i C- końcowej.
Chromatosom
Jednostka strukturalna chromatyny
składająca się z 166 par zasad, oktameru
oraz histonu H1. Chromatosomy
połączone łącznikowym DNA tworzą
nukleofilament.
Łącznikowy DNA
Odcinek DNA
łączący
chromatosomy w
nukleofilament.
Pojedynczy
łącznikowy DNA ma
długość od kilku do
ponad 100 par
zasad.
Włókienko grubości 10 nm
(nukleofilament)
Składa się z nukleosomów, które są
ułożone w taki sposób, że ich brzegi są od
siebie nieco oddzielone, a ich płaskie
powierzchnie leżą równolegle do osi
włókienka. Włókienko grubości 10 nm jest
prawdopodobnie dodatkowo skręcone (6-
7 nukleosomów na jeden skręt) i tworzy
włókno chromatynowe grubości 30 nm,
które stabilizują histony H1.
Włókno chromatynowe
grubości 30 nm (solenoid)
Jednostka strukturalna chromatyny
składająca się ze zwiniętego w
lewoskrętną helisę nukleofilamentu o
średnicy 30 nm. Na każdy skręt solenoidu
przypada 6 chromatosomów. Zwinięty
solenoid wraz z macierzą jądrową tworzy
pętlę chromosomową.
Pętla chromosomowa
Tworzy rozluźniony fragment
chromosomu. Ma długość 300 nm.
Chromatyna
Jest to interfazowa postać chromosomów, złożona z DNA, białek
histonowych i niehistonowych oraz małej ilości RNA.
Podział chromatyny pod względem aktywności transkrypcyjnej:
heterochromatyna- nieaktywna transkrypcyjnie, w interfazie gęsto
upakowana, możemy rozróżnić heterochromatynę:
konstytutywną- zawsze upakowana, nieaktywna, znajduje się w regionach w
pobliżu centromera i w końcach chromosomów (w telomerach)
fakultatywną- niekiedy skondensowana, a niekiedy nieskondensowana i
mająca wygląd euchromatyny (przykładem może być jeden z chromosomów
żeńskich X u ssaków, który jest skondensowany i prawie całkowicie
nieaktywny transkrypcyjnie, jednak w okresie gametogenezy ulega
dekondensacji i staje się aktywny transkrypcyjnie we wczesnej
embriogenezie)
euchromatyna- aktywna transkrypcyjnie, wybarwia się jako substancja
mniej gęsta, replikuje się w cyklu komórkowym ssaków zwykle wcześniej
niż heterochromatyna
Chromosom
Wybarwiająca się
struktura
zbudowana z silnie
skręconej
chromatyny,
pojawiająca się w
komórce w związku
z jej podziałem.
Budowa chromosomu
Chromatyda- jedna z dwóch identycznych
cząsteczek DNA budujących ramiona
chromosomu.
Centromer- miejsce połączenia dwóch
chromatyd siostrzanych, jest regionem
bogatym w pary zasad (A-T).
Kinetochor- białkowa struktura leżąca na
powierzchni centromeru, która jest miejscem
przyczepu włókien wrzeciona podziałowego.
Przewężenie wtórne- sekwencja DNA służąca
jako tzw. organizator jąderkotwórczy (NOR)
do syntezy rRNA.
Trabant (satelita)- fragment ramienia
chromosomu za przewężeniem wtórnym.
Telomery- zakończenia ramion
chromosomów, które składają się z krótkich
powtarzających się sekwencji bogatych w
pary T-G (u człowieka sekwencja: 5’-TTAGGG-
3’).
Rodzaje chromosomów
(położenie centromerów)
Metacentryczny- centromer
w połowie długości
chromosomu.
Submetacentryczny-
centromer dzieli ramiona
chromosomu na odcinki
nierównej długości.
Akrocentryczny- centromer
tuż przy jednym z końców
ramion chromosomu.
Telocentryczny- centromer
na końcu ramion
chromosomu.
DZIĘKUJĘ
Inne typy chromosomów
Autosomy- chromosomy ciała,
czyli wszystkie z wyjątkiem
chromosomów płci.
Allosomy
(heterochromosomy)-
chromosomy płci.
Chromosomy homologiczne-
chromosomy podobne do
siebie pod względem składu
genetycznego, przy czym
jeden z nich pochodzi od
jednego organizmu
rodzicielskiego, a drugi od
drugiego.
Chromosomy niehomologiczne-
chromosomy różne pod
względem zawartości
genetycznej.
Chromosomy politeniczne
(olbrzymie)- powstające w wyniku
nierozchodzenia się chromatyd po
kilkukrotnej replikacji. Występują
np. w komórkach gruczołów
ślinowych larw muchówek.
Chromosomy szczoteczkowe-
zawierają dużo pętli bocznych,
służących intensywnej syntezie
RNA. Występują w oocytach
kręgowców.