BIOL MOL EGZAMIN 2009
prezent od sajmona - indżoj
Jakie organella posiadają własne DNA?
Które z białek bakteriofaga pełnią funkcje antyterminatorowe?
Jakie mamy rodzaje glikozylacji? (O-glikozydy, N-glikozydy)
Podczas jakiego procesu powstaje struktura Holliday'a?
Jakim końcem mRNA wiaże się z rybosomem?
Która trójka AUG zaczyna translacje:
Pierwsza od końca 3' transkryptu
Pierwsza od końca 5' transkryptu
Pierwsza po domenie wiążącej rybosom od strony 3'
- || - od strony 5'
W jaki sposób białko uzyskuje strukturę natywną?
Jakim procesom ulega tRNA? (składanie genowe, modyfikacja zasad, coś tam jeszcze)
Co się dzieje podczas modyfikacji nukleosomów?
Na co wpływa metylacja histonów?
Co to jest imprinting?
Ile zestawów genów a znajduje się w haploidalnej komórce drożdżowej typu a?
Co robią te geny a? (co hamują, jak wpływają na haploidyzację)
Ile mamy aminokwasów zasadowych (wśród 20 podstawowych)?
Gdzie zachodzi (czy w tej samej kom, czy między dwoma) i co jest produktem transpozycji replikacyjnej?
Co powstaje po replikacji typu toczącego się koła? (liniowe DNA z wieloma chromosomami, z jednym, koliste z wieloma czy koliste z jednym)
Gdzie kończy się replikacja podczas koniugacji?
Ile genów w przybliżeniu ma człowiek?
Mamy 2 organizmy o bardzo podobnym fenotypie ale różne gatunki:
Mają tyle samo chromosomów
Mają podobną ilość chromosomów
Moją bardzo różną liczbę chromosomów
Wszystkie sytuacje są możliwe
Co kodują retrotranspozony wirusa t7?
Skąd bierze się ta charakterystyczna sekwencja CCA na końcu 3' każdego tRNA?
Co decyduje o tym, że białko wiąże się z błoną komórkową i to akurat w taki sposób?
Które polimerazy DNA biorą udział w replikacji chromosomu bakteryjego jak wszystko idzie w porządku? (I i III)
Jaka właściwość korektorską ma polimeraza I DNA? Egzo-/endonukleaza, 3'/5'?
Co się może stać jak widełki replikacyjne napotkają błąd w DNA?
Odpadają, replikacja się zatrzymuje
Indukcja systemu SOS
Snickers! I jadą dalej! - mutacja
Wszystko się może zdarzyć…
Mamy bakterie - mutanta w genie ssb. Co się stanie jak przeniesiemy go do temperatury niepermisywnej:
Od razu liza
Zatrzymanie replikacji
bakteria nie może rozpocząć nowej rundy replikacji
białka Ssp nie mają wpływu na replikację
Jak nazywa się białko (replikacyjne? nie pamiętam) wirusa HIV?
Kompleks U1 i U2 podczas składania genowego:
U1-U2 wiąże się z końcem 3'intronu
Z końcem 5' intronu
U1 wiąże się z 3' a U2 z 5'
odwrotnie
Co robi gRNA?
Policistronowy mRNA
Ma jedno miejsce wiązania do rybosomu
Ma dwa miejsca wiązania do rybosomu
Ma tyle miejsc wiązania do rybosomu ile koduje genów
Różna ilość
Czas półtrwania transkryptów:
Każdy transkrypt ma taki sam
Każdy transkrypt tego samego genu ma taki sam, ale różny od transkryptów innych genów
Każdy ma różny
Jest zależny od rodzaju transkryptu i czynników środowiskowych
Wzór transkrypcji:
Jest taki sam we wszystkich komórkach
Różny w różnych tkankach
Taki sam we wszystkich komórkach tej samej tkanki, ale różny od komórek w innej tkance
Różny, choć podobny w komórkach tej samej tkanki
Jak komórka sobie radzi jak są źle pofałdowane białka?
Degraduje źle utworzone
Zatrzymuje translacje tych co jej nie wychodzą, aż będzie mogła robić dobrze
Zwiększa transkrypcję i translację białek opiekuńczych
Wszystko powyższe
Co to jest replikon?
Kiedy odłącza się podjednostka alfa polimerazy RNA?
2008/06/03 14:02:25
1. Jakie organella posiadają własne DNA?
2. Które z białek bakteriofaga pełnią funkcje antyterminatorowe?
3. Jakie mamy rodzaje glikozylacji? (O-glikozydy, N-glikozydy)
4. Podczas jakiego procesu powstaje struktura Hollidaya?
5. Jakim końcem mRNA wiaże się z rybosomem?
6. Która trójka AUG zaczyna translacje:
a. Pierwsza od końca 3 transkryptu
b. Pierwsza od końca 5 transkryptu
c. Pierwsza po domenie wiążącej rybosom od strony 3
d. - || - od strony 5
7. W jaki sposób białko uzyskuje strukturę natywną?
8. Jakim procesom ulega tRNA? (składanie genowe, modyfikacja zasad, coś tam jeszcze)
9. Co się dzieje podczas modyfikacji nukleosomów?
10. Na co wpływa metylacja histonów?
11. Co to jest imprinting?
12. Ile zestawów genów a znajduje się w haploidalnej komórce drożdżowej typu a?
13. Co robią te geny a? (co hamują, jak wpływają na haploidyzację)
14. Ile mamy aminokwasów zasadowych (wśród 20 podstawowych)?
15. Gdzie zachodzi (czy w tej samej kom, czy między dwoma) i co jest produktem transpozycji replikacyjnej?
16. Co powstaje po replikacji typu toczącego się koła? (liniowe DNA z wieloma chromosomami, z jednym, koliste z wieloma czy koliste z jednym)
17. Gdzie kończy się replikacja podczas koniugacji?
18. Ile genów w przybliżeniu ma człowiek?
19. Mamy 2 organizmy o bardzo podobnym fenotypie ale różne gatunki:
a. Mają tyle samo chromosomów
b. Mają podobną ilość chromosomów
c. Moją bardzo różną liczbę chromosomów
d. Wszystkie sytuacje są możliwe 20. Co kodują retrotranspozony wirusa t7?
21. Skąd bierze się ta charakterystyczna sekwencja CCA na końcu 3 każdego tRNA?
22. Co decyduje o tym, że białko wiąże się z błoną komórkową i to akurat w taki sposób?
23. Które polimerazy DNA biorą udział w replikacji chromosomu bakteryjego jak wszystko idzie w porządku? (I i III)
24. Jaka właściwość korektorską ma polimeraza I DNA? Egzo-/endonukleaza, 3/5?
25. Co się może stać jak widełki replikacyjne napotkają błąd w DNA?
a. Odpadają, replikacja się zatrzymuje
b. Indukcja systemu SOS
c. Snickers! I jadą dalej! mutacja
d. Wszystko się może zdarzyć
26. Mamy bakterie - mutanta w genie ssp. Co się stanie jak przeniesiemy go do temperatury niepermisywnej:
a. Od razu liza
b. Zatrzymanie replikacji
c. bakteria nie może rozpocząć nowej rundy replikacji
d. białka Ssp nie mają wpływu na replikację
27. Jak nazywa się białko (replikacyjne? nie pamiętam) wirusa HIV?
-
2008/06/03 14:04:14
28. Kompleks U1 i U2 podczas składania genowego:
a. U1-U2 wiąże się z końcem 3intronu
b. Z końcem 5 intronu
c. U1 wiąże się z 3 a U2 z 5
d. odwrotnie 29. Co robi gRNA?
30. Policistronowy mRNA
a. Ma jedno miejsce wiązania do rybosomu
b. Ma dwa miejsca wiązania do rybosomu
c. Ma tyle miejsc wiązania do rybosomu ile koduje genów
d. Różna ilość
31. Czas półtrwania transkryptów:
a. Każdy transkrypt ma taki sam
b. Każdy transkrypt tego samego genu ma taki sam, ale różny od transkryptów innych genów
c. Każdy ma różny
d. Jest zależny od rodzaju transkryptu i czynników środowiskowych
32. Wzór transkrypcji:
a. Jest taki sam we wszystkich komórkach
b. Różny w różnych tkankach
c. Taki sam we wszystkich komórkach tej samej tkanki, ale różny od komórek w innej tkance
d. Różny, choć podobny w komórkach tej samej tkanki
33. Jak komórka sobie radzi jak są źle pofałdowane białka?
a. Degraduje źle utworzone
b. Zatrzymuje translacje tych co jej nie wychodzą, aż będzie mogła robić dobrze
c. Zwiększa transkrypcję i translację białek opiekuńczych
d. Wszystko powyższe
34. Co to jest replikon?
35. Kiedy odłącza się podjednostka alfa polimerazy RNA?
-
2008/06/03 14:05:30
nie pamiętam wszystkich 60, przepraszam..
ale mam nadzieje ze chociaz to wystarczy wam wyczuć o co chodzi Obuchowi
-
2008/06/03 14:05:48
:OOOOOO szymon, zadziwiasz mnie :D
-
2008/06/03 16:43:26
Do 27. - chyba chodzilo o bialko Tat :p
Do 35 - nie chodzilo o jednostke sigma?
36. W jakim miejscu nastepuje rozwiazanie polaczonych chromosomow (DIF)
37.Co bialko musi miec, by trafic na blone (sekwencje sygnalowa/trafia tam po translacji...)
38.Co jest motorem odlaczania sie receptora od transportowanej substancji (pH/sila jonowa/...)
39.W pecherzykach transportowych wzgledem RE i Golgiego stezenie substancji jest... (wyzsze)
40.Jak sie maja do siebie genomy mit u czlowieka i drozdza (podobne/wieksze/mniejsze...)
41.Jesli metodami inzynieryjnymi wydluzymy komorce telomery, co sie stanie..? (umrze/po czasie i podzialach wroci do siebie/nic sie nie zmieni...)
42.Remodelowanie nukleosomow (odsuniecie,przysuniecie,rozluznienie chromatyny,wszystko)
43.Mechanizm dzialania cAMP-CAP (zmienia powinowactwo polimerazy, popycha ja, nieznany...)
44.Jak wyglada motyw palca cynkowego? (2 beta i heliska, 1 beta i 2 helisy...)
45.Ile jest bialek w kompleksie inicjacyjnym (10,25,100,250)
Powrzucam troche ze schematow:
1.slajdzik z podjednostkami rybosomow: trzeba bylo opisac wskazane: duza podjednostke bakteryjnego, 5 rRNA, 5,8 rRNA.
2.wskazanie TATA box i TBP.
3.slajdzik z LDL-em - strzalki na apolipoproteine B i jeszcze cos... :p
4.duzo bylo ze slajdu z transpozonami i ich wstawianiem sie do sekwencji, czyli opisywalismy m.in. transpozon, retrotranspozon, transkrypcje, odwrotna transkrypcje...
5.byl slajdzik z DnaA - trzeba bylo opisac wlasnie DnaA + strzalka obok do petelki (czyzby chodzilo o jakas sekwencje?)
6.replikacja u drozdzy - zaznaczone ORC, fazy i kompleksy bananow.
7.Byla narysowana polimeraza i strzalka do jej ogonka.
8.Slajd z telomeraza - strzalka do matrycy RNA i miejsca kat. telomerazy (chyba)
9.Slajd z alfa-helisa (chyba chcial mala i duza bruzde zobaczyc opisane)
10.Slajd z translacji bialka miedzyblonowego - do opisania 2 sekwencje: kotwiczaca i stop transfer.
11.Slajd z operonem lac. Do opisania cAMP-CAP i polimeraza
12.Cos co wygladalo jak stopione bialko (...:P)
-
2008/06/03 16:46:56
Errata:
10 - tam nie było acetylacji?
13 - co robią alfa
17 - miejsce rozdziału zreplikowanych chromosomów (dif)
20 - nie kojarzę, ale było co robią LTRy
26 - ssb a nie ssp przetrwalnikowy zboczeńcu :) Chodziło o to że mutacje w ssb są letalne
27 - analog N u lambdy (chodziło o Tat)
35 - sigma a nie alfa, alfa się nie odłącza :)
a i jeszcze:
36.Jak białka są transportowane do mitochondriów itp. (tylko zwinięte, tylko nie zwinięte, różnie i wszystkie prawidłowe)?
37.Kiedy przyłącza się ORC u drożdży, w jakiej fazie?
38.Jak zachodzi poliadenylacja (szybko, wolno, wolno na początku i potem przyspiesza, nie zbadano... czy jakoś tak)?
39.Jak jest zbudowana polimeraza fagaT7 (pojedynczy peptyd, nie wiadomo, więcej grzechów nie pamiętam)?
40.Czyje mitochondria mają więcej genów: ludzi czy drożdży?
41.Doświadczenie opóźnienia w żelu, co powoduje przyłączenie białka? (idzie wolniej, szybciej, przeszkadza sąsiednim pasom)?
42.Co to rybozym?
43.Jak wpływa poliadenylacja na okres półtrwania mRNA?