background image

Zagadnienie- wyznaczenie masy cząsteczkowej białka na podstawie wyniku elektroforezy 

Problem- na podstawie poniższego wykresu wyznaczyć masę  badanego białka 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

background image

Rozwiązanie 

Krok 1 LINIJKA (należy zmierzyć odległości pasków elektroforetycznych markera i naszego białka): 

 

Masa białka  „dalekość paska” 
150kDa 

1,75cm 

120kDa 

2,25cm 

100kDa 

3,25cm 

70kDa 

5cm 

50kDa 

6,6cm 

8,75cm 

 

 

 

 

 

 

 

 

background image

Krok 2 Obliczenie logarytmów z masy białek: 

Masa białka  Log masy białka  „dalekość paska” 

150kDa 

2,176091 

1,75cm 

120kDa 

2,079181 

2,25cm 

100kDa 

3,25cm 

70kDa 

1,845098 

5cm 

50kDa 

1,69897 

8,75cm 

6,6cm 

 

Krok 3 utworzenie wykresu Log masy białka=f(dalekość paska) 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

0

0,5

1

1,5

2

2,5

0

2

4

6

8

10

log Masy białka 

[bez jednostki] 

dalekość paska [cm] 

background image

Krok 4 poprowadzenie linii x=6,6 czyli argumentu dla badanego białka i zrzutowanie jej na osi Y 

 

(TO SĄ DANE Z GŁOWY TAKŻE WIELE NIE NALEŻY OCZEKIWAĆ CHOCIAŻ KORELACJA I TAK CAŁKIEM 
NIEZŁA) 

Odczyt: log masy badanego białka (?) wynosi mniej więcej 1,8  (nie robie tego tak dokładnie jak na 
kolokwium się powinno bo robię na szybko)  

Krok 4 przeliczenie na masę białka: 

10

1,8

= 63,1 𝑘𝐷𝑎 

Krok 5 SPRAWDZENIE=POMYŚLENIE CZY TO JEST POPRAWNE 

Na pierwszej ilustracji pokazany jest  wykres elektroforezy- jak widać pasek z badanego białka jest 
między paskami z markeru na 50kDa i 70kDa co znaczy ze nasz wynik musi znajdować się w tym 
zakresie (50kDa;70kDa) Przy okazji jedna ważna uwaga dla mało spostrzegawczych- pasek jest ciut 
przed połową (w odległości paska w cm) a 63 to więcej niż połowa między 50 i 70. TAK MA BYĆ 
ponieważ masa białka nie jest funkcją liniową dalekości paska. Funkcją liniową jest logarytm masy 
białka