Zagadnienie- wyznaczenie masy cząsteczkowej białka na podstawie wyniku elektroforezy

Problem- na podstawie poniższego wykresu wyznaczyć masę badanego białka

Rozwiązanie

Krok 1 LINIJKA (należy zmierzyć odległości pasków elektroforetycznych markera i naszego białka):

Masa białka „dalekość paska”
150kDa

1,75cm

120kDa

2,25cm

100kDa

3,25cm

70kDa

5cm

50kDa

6,6cm

?

8,75cm

Krok 2 Obliczenie logarytmów z masy białek:

Masa białka Log masy białka „dalekość paska”

150kDa

2,176091

1,75cm

120kDa

2,079181

2,25cm

100kDa

2

3,25cm

70kDa

1,845098

5cm

50kDa

1,69897

8,75cm

?

?

6,6cm

Krok 3 utworzenie wykresu Log masy białka=f(dalekość paska)

0

0,5

1

1,5

2

2,5

0

2

4

6

8

10

log Masy białka

[bez jednostki]

dalekość paska [cm]

Krok 4 poprowadzenie linii x=6,6 czyli argumentu dla badanego białka i zrzutowanie jej na osi Y

(TO SĄ DANE Z GŁOWY TAKŻE WIELE NIE NALEŻY OCZEKIWAĆ CHOCIAŻ KORELACJA I TAK CAŁKIEM
NIEZŁA)

Odczyt: log masy badanego białka (?) wynosi mniej więcej 1,8 (nie robie tego tak dokładnie jak na
kolokwium się powinno bo robię na szybko)

Krok 4 przeliczenie na masę białka:

10

1,8

= 63,1 𝑘𝐷𝑎

Krok 5 SPRAWDZENIE=POMYŚLENIE CZY TO JEST POPRAWNE

Na pierwszej ilustracji pokazany jest wykres elektroforezy- jak widać pasek z badanego białka jest
między paskami z markeru na 50kDa i 70kDa co znaczy ze nasz wynik musi znajdować się w tym
zakresie (50kDa;70kDa) Przy okazji jedna ważna uwaga dla mało spostrzegawczych- pasek jest ciut
przed połową (w odległości paska w cm) a 63 to więcej niż połowa między 50 i 70. TAK MA BYĆ
ponieważ masa białka nie jest funkcją liniową dalekości paska. Funkcją liniową jest logarytm masy
białka