Witaminy

Witamina	Pochodny koenzym
Tiamina (Wit. B1)	Pirofosforan tiaminy
Ryboflawina (Wit B2)	FAD dinukleotyd flawinoadeninowy, FMN i mononukleotydy
Kwas nikotynowy (niacyna)	Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy NAD
Pirydoksyna, pirydoksal, pirydoksamina (B6)	Fosforan pirydoksalu
Kwas pantotenowy	Koenzym A

Odgrywają role prekursorów koenzymów

KWASY NUKLEINOWE

DNA:

Struktura alfa-helis

Składa się z:

Cukier deoksyryboza

Zasady: puryny (AG) lub pirymidyny (CT)

Nukleozyd = cukier + zasada azotowa wiązanie miedzy zasada a cukrem to wiązanie N-glikozydowe

Jeżeli przy 6 węglu cukry będzie fosforylacja to powstanie nukleotyd bo dołączane są reszty fosforanowe

Ułożenie zasad nie jest przypadkowe

Końce 5' leżą na przeciwległych końcach

Kwas DNA w wyższe temperaturze ulega topnieniu i następuje rozpad II rzędowej struktury DNA (mostki wodorowe zaczynają się rozpadać)

Replikacja - podwojenie ilości DNA w komórce

Transkrypcja

Translacja - tłumaczenie (przepisywanie na białko)

Enzym odwrotna transkryptaza (RNA-DNA polimeraza) u niektórych wirusów Np. zarażenie wirusem HIV

Replikacja DNA

Polimeraza DNA1 - enzym

Pojedynczy łańcuch polipeptydowy 103 kDa

Katalizuje krok po kroku dodawanie jednostek deoksyrybonukleotydowych do łańcuch DNA

Do syntezy łańcucha DNA potrzeba:

1. Wszystkich 4 aktywowanych prekursorów 5'trifosforanow deoksyrybonukleozydow dATP, dGTP, dTTP, dCTP

2. Odcinek starterowy (primer) gdyż polimeraza DNA1 dołącza deoksyrybonukloezydy do wolnej grupy 3'-hydroksylowej już istniejącego odcinka DNA

3. Matryce DNA - może być 1 lub 2 niciowy DNA

kz - tysiące par zasad lub w mikrometrach

Wydłużanie zawsze zachodzi od 5' 3'

!!! ACG TO NIE JEST TO SAMO CO GCA !!!

TRANSKRYPCJA z DNA na RNA

RNA rybonukleinowy

Cukier ryboza niepozbawiony grupy hydroksylowej

Zamiast tyminy uracyl

RNA ma strukturę łańcuchową - jedna nic

DNA jest jeden

RNA jest kilka

• rRNA - rybosomowy

• tRNA - transportujący

• mRNA - informacyjny (Messenger)

Różnią się od siebie masa i wielkością (najdłuższy rybosomalny)

Synteza RNA

Polimeraza RNA zależna od DNA

Polimeraza RNA katalizuje inicjacje syntezy i stopniowe wydłużanie łańcuchów RNA

Wszystkie 3 rodzaje komórkowego RNA tj. mRNA, tRNA i rRNA syntetyzowane są u E.Coli przez ta sama polimerze DNA, zgodnie z w matrycy DNA

Do syntezy łańcucha RNA potrzeba

1. Wszystkich 4 aktywnych prekursorów 5'-fosforanow rybonukleozydow ATP, GTP, UTP, CTP

2. Dwuwartościowego jonu metalu Mg2+ lub Mn2+

3. Matrycy - optymalna matryca jest dwuniciowy DNA

Różnice w syntezie DNA i RNA

• Polimeraza RNA nie wymaga odcinka starterowego (primera)

• Synteza RNA na matrycy DNA jest w pełni konserwatywna, synteza RNA jest semikonserwatywna

• Polimeraza RNA nie ma aktywności nukleazowej, która polimeraza DNA wykorzystuje do usuwania błędów

Biochemia wykład 5

2