grudzień 2013
Tematy VII kolokwium z biochemii dla studentów Wydz. Weterynaryjnego
Przypomnienie budowy i nazewnictwa podstawowych elementów budujących kwasy nukleinowe (typowe i nietypowe zasady azotowe, nukleozydy, nukleotydy) oraz przypomnienie wiadomości o strukturze kwasów nukleinowych.
Replikacja: Czy replikacja DNA jest konserwatywna czy semikonserwatywna? Czym charakteryzują sie miejsca inicjacji replikacji? Co to są widełki replikacyjne, a co nazywamy „oczkiem replikacyjnym”? Jak przebiega proces replikacji nici wiodącej? Jak przebiega proces replikacji nici opóźnionej? Co to są fragmenty Okazaki? Polimerazy DNA zależne od DNA w komórkach prokariotycznych. Rola prymazy podczas replikacji. Omów budowę replisomu. Inicjacja i terminacja replikacji u E. coli. Polimerazy DNA występujące w komórkach eukariotycznych. Wymień grupy związków hamujące replikację DNA. Rodzaje mutacji. Czynniki mutagenne. Podstawowy szlak naprawy DNA. Naprawa przez wycięcie. Bezpośrednia naprawa.
Transkrypcja RNA: Podstawowe etapy transkrypcji u prokariota. Polimeraza RNA u E.coli. Sekwencje promotorowe u prokariota i eukariota. Przebieg inicjacji transkrypcji u E.coli. Budowa bąbla transkrypcyjnego. Mechanizmy terminacji transkrypcji u E.coli. Różnice w przebiegu transkrypcji RNA pomiędzy prokariota a eukariota. Polimerazy RNA w komórkach eukariotycznych. Przebieg inicjacji transkrypcji w komórkach eukariotycznych. Obróbka mRNA. Cięcie i składanie (splicing) RNA. Przebieg splicingu przy udziale spliceosomu. Co to jest alternatywny splicing mRNA? Redagowanie mRNA. Synteza i obróbka pre-rybosomalnego RNA. Obróbka pre-tRNA.
Translacja białka. Struktura i funkcja transportującego RNA. Co to jest zjawisko toleracji (wobble)? Rybosomy u prokariota i eukariota. Przebieg procesu inicjacji translacji u prokariota. Powstawanie kompleksu preinicjującego i inicjującego. Sekwencja Shine-Delgarno. Omów etapy elongacji w komórkach prokariotycznych. Terminacja translacji u prokariota. Różnice pomiędzy translacją u prokariota i eukariota.
Kierowanie białek i ich degradacja. Co są sekwencje sygnałowe i czemu one służą? Sekwencje sygnałowe kierujące białka do różnych przedziałów komórkowych. Kierowanie białek do światła cystern szorstkiej siateczki śródplazmatycznej. Co to jest cząsteczka SRP? Jak przebiega „wędrówka” białek błonowych, wydzielniczych i lizosomalnych do miejsc ich przeznaczenia? Białka opiekuńcze (szaperony). Rodzaje modyfikacji potranslacyjnych ważnych dla fałdowania białek. Przebieg degradacji białek w lizosomach. Degradacja białek przy udziale ubikwityny. Co to jest proteasom?