ODDZIAŁYWANIE BAKTERII Z GRUPY PGPR U ROŚLIN

PGPR

• bakterie wspomagające wzrost roślin:

  • zwiększone kiełkowanie nasion

  • Lepszy rozwój systemu korzeniowego

  • Podwyższony wigor roślin

  • Zwiększona biomasa i plon

• Oddziaływanie bezpośrednie:

  • Fitohormony (IAA, cytokininy)

  • Polepszenie odżywiania (żelazo, fosfor)

• Oddziaływanie pośrednie:

  • Ograniczenie szkodliwych mikroorganizmów, w tym patogenów

• Bakterie:

  • Azotobacter

  • Bacallus

  • Enterobacter

  • Gluconobacter

  • Pseudomonas

CO TO SĄ BIONAWOZY

• bionawóz: bakterie, które przyczyniają się do zwiększenia dostępności składników pokarmowych dla roślin. Mikroorganizmy te wraz z pozytywnym na stan odżywienia rośliny, mogą jednocześnie wpływać na inne jej właściwości.

• bionawóz zawiera więc żywe mikroorganizmy, które zastosowane na nasiona, powierzchnię roślin lub do gleby kolonizują ryzosferę i/lub wewnętrzne tkanki roślin.

• Użycie przedrostka „bio” wskazuje, że nawóz taki zawiera organizmy żywe i poprawia status pokarmowy roślin.

• Za bionawozowe mogą być uważane także tzw. bakterie pomocnicze, które wspomagają symbiotyczne reakcje innych bakterii i grzybów mikoryzowych z roślinami.

• Symbioza rizobiów z roślinami motylkowymi

• Wytwarzanie hormonów indukowanie rozwoju korzeni więcej brodawek

• Rozpuszczanie związków fosforu, wydzielając przy tym kwasy organiczne, protony i fosfatazy, dzięki czemu rośliny mogą pobierać fosfor

• Przemiany związków żelaza

WYJAŚNIJ ZASADĘ ENZYMATYCZNEGO TESTU SEROLOGICZNEGO

ELISA –

• Inaczej test immunoenzymatyczny

• Reakcja barwna

• Służy do wykrycia określonych białek w badanym materiale z użyciem przeciwciał skoniugowanych z odpowiednim enzymem

• Wyróżniamy bezpośredni i pośredni

Działanie

• Pewna ilość antygenu unieruchomiona jest na powierzchni fazy stałej.

• Wprowadzamy materiał biologiczny z przeciwciałami dla unieruchomienia antygenu.

• Tworzą razem kompleks immunoenzymatyczny, dzięki któremu przeciwciało zostaje trwale związane z podłożem.

• Po przepłukaniu środowiska reakcji i dodaniu odpowiedniego substratu, enzym związany ze specyficznym przeciwciałem katalizuje reakcję.

• Barwny produkt oznaczmy spektrofotometrem

MYKORYZA ARBUSKULARNA (co to jest, z czego wynika jej znaczenie)

• tworzona jest przez grzyby rzędu Glomales z trawami, większością roślin uprawnych, drzewami i krzewami.

• Struktury strzępkowe rozwijają się pomiędzy komórkami gospodarza, tworząc wypełnione materiałem zapasowym rozdęcia – tzw. wehikule.

• We wnętrzu komórek korowych korzeni, produkowane są silnie rozgałęzione struktury zwane arbuskulami.

elicytacja

- wywołanie reakcji obronnych przez zastosowanie czynników środowiskowych o nienormalnym natężeniu – elicytoróe, które prowadzi do zmiany poziomu i/lub syntezy nowych metabolitów wtórnych

- proces łączenia się elicytorów z receptorami komórek roślinnych podczas infekcji patogenów; jest elementem systemowej odporności nabytej roślin.

WSKAŻ PROCESY WYKORZYSTYWANE W BIOKONTROLI

EPIDEMIA

• zespół procesów przyrodniczych, przebiegających w określonym miejscu i czasie, prowadzących do pojawienia się choroby populacji rośliny przy udziale czynnika chorobotwórczego w odpowiednich warunkach środowiska, często przy współudziale człowieka

• rozwija się w następstwie zakłócenia równowagi w trójkącie oddziałujących na siebie czynników:

  • wrażliwej rośliny żywicielkiej

  • patogena

  • warunków środowiska

• zasięg występowania epidemii:

  • epidemie wybuchowe – gwałtowny przebieg pierwszej fazy i osiąganie w krótkim czasie szczytowego nasilenia

  • pandemie – silna tendencja do powiększania obszaru an którym występują

  • epidemie chroniczne – nasilenie wzrasta stopniowo, zaś tendencja do przenoszenia na nowe obszary jest niewielka

  • endemia – skrajna postać epidemii chronicznej – długotrwałe utrzymywanie się tego samego nasilenia choroby; brak tendencji do przenoszenia na nowe obszary

• wystąpienie i rozprzestrzenianie się epidemii zależy od:

  • genetycznych cech patogena

  • warunków środowiska

  • obecności dużych skupisk roślin żywicielskich

• warunki występowania epidemii chorób roślin:

  • koncentracja na określonym obszarze jednego gatunku lub odmiany roślin o dużej podatności

  • obecność patogena o dużej wirulencji

  • warunki atmosferyczne korzystne dla patogena

• rola patogena w rozwoju epidemii

  • infekcyjność, patogeniczność, wirulencja

  • zasobność źródeł infekcji

  • sposób przenoszenia się patogena, zdolność reprodukcyjna

  • cykl rozwojowy

ILOŚCIOWE I JAKOŚCIOWE METODY WYKORZYSTYWANE W EPIDEMIOLOGII

• Przyrost liczby chorych roślin w jednostce czasu

• Ustalenie wzrostu nasilenia objawów chorobowych na roślinach

• Współczynnik korelacji – % wskaźnik dziennego przyrostu choroby rośliny na polu, liczba określająca w jakim stopniu zmienne są współzależne

• Współczynnik regresji –przewidywanie wartości na podstawie innych wartości

pomiary patogena:

1. ilościowe: stężenie zawiesiny zarodników, liczba otoczni/jeden liść, liczba jednostek propagacyjnych patogena/ jednostkę powierzchni gleby

2. jakościowe: genotyp - rasa

KRYTYCZNE ODLEGŁOŚĆI EKOLOGICZNE

• 0-10m – zakres najbardziej intensywnych interakcji między szkodnikami a ich wrogami naturalnymi. Na tą odległość mogą być znoszone chemiczne środki ochrony roślin

• 10-50m – strefa aktywnego oddziaływania parazytoidów i drapieżnych stawonogów, przemieszczających się na powierzchni ziemi, latających i przenoszonych przez podmuchy powietrza z ich naturalnego środowiska na pole uprawne

• 50-100 m – w strefie tej następuje spadek aktywnego oddziaływania wielu gatunków o mniejszej zdolności do przemieszczania się jak: parazytoidy, drapieżne chrząszcze i drapieżne roztocze unoszone z wiatrem

• 100-500m – na tych odległościach następuje silny spadek oddziaływania wielu gatunków wrogów naturalnych. Występują jedynie gatunki o sredniej i dużej zdolności lotów jak bzygowate, biedronki, pluskwiaki różnoskrzydłe

• >500 m – niewielkie nadlatywanie gatunków o dużej zdolności lotu (bzygowate, złotooki)

BIOLOGICZNA OCHRONA W SZKLARNI

• Interakcja między drapieżnikamii parazytoidami

  • Charakter jednokierunkowy – ofiara: młodociane stadium parazytoidów

  • Wpływ miała preferencja pokarmowa i zdolność do odróżnienia roślinożerców

• Interakcja między parazytoidami (konkurencja międzygatunkowa)

  • Konkurencja wewn. – więcej niż 1 gatunek zasiedla ofiarę

  • Konkurencja zewn. – skuteczność w odnajdywaniu i pasożytowaniu gospodarza

• Odżywianie się ofiarami spasożytowanymi przez konkurentów

  • Interakcja parazytoid - ..

  • Redukcja ich liczebności

KOMÓRKI MACIEZYSTE

• Komórki które zaangażowane są w rozwój i budowę struktury żywego organizmu.

• Charakteryzują się nieograniczoną zdolnością do samo odnawiania co zapewnia im trwanie często przez cały czas życia organizmu

• Mają możliwość różnicowania się w wyspecjalizowane typy komórek potomnych

• Występują w merystemach wierzchołkowych (korzeń/pęd) i w kambium

• Podział ze względu na stopień …….. do danego różnicowania

  • TOTIPOTENCJALNE- Możliwość przekształcenia się we wszelkie możliwe tkanki.np. zapłodniona komórka jajowa (zygota) zdolna do wytworzenia wszystkich komórek organizmu i łożyska.

  • PLURIPOTENCJALNE- przekształcają się w poszczególne tkanki i narządy. Dają początek wszystkim, poza rozrodczymi, komórką tkanek i narządów.

WŁOŚNIKI

• Zwiększają powierzchnię chłonną

• Zakotwiczenie rośliny w podłożu

• Synteza i wydzielanie substancji aktywnych biologicznie

• U ogórka stwierdzono w nich obecność ryboflawiny

ZALETY KULTUR WŁOŚNIKOWYCH

• inne spektrum metabolitów lub inne ścieżki met w porównaniu z rosliną donorową,

• bardziej wydajna jest synteza metabolitów, kw.lupinus polyptyllusil i lupinus hartweigii produkuje wiecej izoflawiny

• przykłady metabolizmu kultur włośnikowych: skopolamina, serotonina, szikonina,serpentyna, kataranina, kw rozmarynowy

ZALECENIA DO OGRODÓW DLA OSÓB NIEDOWIDZĄCYCH I NIEWIDOMYCH

• czytelny układ ścieżek, najlepiej krzyżujących się pod kątem prostym

• szerokość ścieżki min. 1 m

• zróżnicowane nawierzchnie

• elementy wolnostojące powinny znajdować się poza ścieżkami, powinny mieć zaokrąglone brzegi

• meble powinny mieć kolory kontrastujące z podłożem i otoczeniem

• wzdłuż alejek można umieścić poręcze ułatwiające poruszanie się

• umieszczenie w centralnej części ogrodu charakterystycznego punktu (fontanna, dzwoneczki)

• narzędzia ogrodnicze powinny być bezpieczne i łatwe w obsłudze oraz w jaskrawych kolorach

SOCJOOGRODNICTWO

• zajmuje się zależnościami między roślinami i ogrodnictwem a człowiekiem i całymi społecznościami

• kierowane do osób z zaburzeniami i problemami: psychicznymi, umysłowymi, fizycznymi (udar, paraliż), sensorycznymi, geriatrycznymi, uzależnienie od alkoholu i narkotyków, wykluczenie społeczne (bezdomni, bezrobotni, mniejszości narodowe)

• korzyści: nauka samodzielności i dokładności, poprawa kondycji fizycznej, większa koordynacja ruchowa i równowaga, poprawa koncentracji, zwiększenie pewności siebie i poprawa poczucia własnej wartości, umiejętność współpracy z innymi, obniżenie stresu oraz napięcia i agresji, podnoszenie kwalifikacji zawodowych

TERAPIA OGRODNICZA / HORITERAPIA

• jest wsparciem tradycyjnej terapii i rehabilitacji,

• służy poprawie stanu zdrowia i samopoczucia ludzi

ŚMIERĆ KOMÓRKI

• Jest naturalnym procesem fizjologicznym, zachodzącym w każdym żywym organizmie. Jest częścią programu rozwojowego każdego żywego organizmu.

• Jest to proces niezbędny podczas występujących etapów ontogenezy (Następuje w trakcie określonego etapu ontogenezy w ściśle zdefiniowanym miejscu-jest kontrolowana genetycznie)

• Jest procesem pasywnym bądź zachodzi w wyniku biochemicznej aktywności komórek.

• Definiowana jest jako całkowite zaprzestanie czynności biochemicznych, które zachodzą w komórce, a w konsekwencji prowadzą do jej unicestwienia

• Selektywna śmierć komórki jest często niezbędna do prawidłowego rozwoju rośliny (usuwanie komórek zainfekowanych przez mikroorganizmy patogenne, powstawanie aerenchymy w reakcji roślin na hipoksję, eliminacja komórek pręcików w jednopłciowych kwiatach żeńskich)

ETAPY PROGRAMOWEJ ŚMIERCI KOMÓRKI

• sygnalizacyjny, w którym następuje odbieranie i przekształcanie sygnałów ze środowiska

• wykonawczy (egzekutorowy), gdzie reakcje biochemiczne przyczyniają się do uśmiercenia danej komórki

• oczyszczający, podczas którego usuwane są pozostałości komórki

APOPTOZA

• Proces fizjologiczny, prowadzący do eliminacji zużytych lub uszkodzonych komórek z organizmu, niezbędny przy zachowaniu odpowiedniej homeostazy tkankowej.

• Wymaga dostarczenia energii w postaci ATP

RODZAJE BLOKAD W PĘDACH

• emboliom

• blokada mikrobiologiczna

• blokada fizjologiczna

  • wcistki

  • balonikowa te twory przeciskające się do naczyń przez ich perforację

BIOTRANSFORMACJA

• katalizowane przez enzymy reakcje chemiczne, w których następuje przekształcenie określonego(nych) fragmentu(ów) substratu.

• Biotransformacje u mikroorganizmów można porównać do "biokatalizatorów", które przeprowadzają przemiany prowadzące do otrzymania pożądanego produktu.

• Są to procesy wykorzystujące najczęściej tylko jeden enzym i nie dostarczają komórce energii ani potrzebnych związków.

• Biotransformacje zachodzą też w formach przetrwalnikowych mikroorganizmów dzięki braku zaangażowania jakichkolwiek szklaków metabolicznych w proces.

• Jednym z ważniejszych problemów przy stosowaniu biotransformacji jest występujące ograniczenie przepuszczalności substratów i produktów przez błony cytoplazmatyczne lub też wydzielenie odpowiedniego enzymu z komórki.

• Dlatego też opracowanie specyficzne sposoby postępowania zależą od charakteru mikroorganizmu (np. środki powierzchniowo czynne).

POSTANOWIENIA III ANEKSU

Aneks III Dyrektywy 91/414

O konieczności przeprowadzenia badań decyduje ocena eksperta

Ocena kompletności dokumentacji staje się substytutem eksperta

Dyrektywa ustanawia ramy wspólnotowego działania na rzecz zrównoważonego stosowania pestycydów (dobra praktyka ochrony roślin)

JADALNE SZCZEPIONKI

• szczepionki produkowane w roślinie do bezpośredniego spożycia,

• przetworzone części roślin lub ekstrakcja białek antygenowych.

• rośliny produkujące białko rozpoznawane jako antygen muszą być akceptowane jako żywność oraz powszechnie dostępne,

• okres od zbioru części roślin nie powinien być długi,

• białko antygenowe nie może ulegać całkowitej degradacji w przewodzie pokarmowym,

• nie może być toksyczne dla roślin

• rośliny na jadalne szczepionki

  • ziemniak-(biegunka, cholera, cukrzyca);

  • banan- (biegunka i cholera);

  • sałata-(żółtaczka, odra);

  • marchew- (żółtaczka B, owrzodzenia żołądka i dwunastnicy);

  • soja-biegunka;

  • kukurydza-(biegunka i cholera);

  • pomidory- cholera

INTEGROWANA PRODUKCJA (czym jest)

Integrowana produkcja roślin oznacza produkcję roślin, z zastosowaniem integrowanej ochrony roślin oraz z wykorzystaniem postępu technicznego i biologicznego w uprawie i nawożeniu, ze szczególnym uwzględnieniem zdrowia ludzi i zwierząt oraz ochrony środowiska.

WPŁYW INFRASTRUKTURY EKOLOGICZNEJ I UPRAW MONOKULTUROWYCH NA OGRANICZANIE POPULACJI SZKODNIKÓW

• uprawy wielogatunkowe stanowią barierę fizyczną dla szkodników i mogą dawać siedlisko i pożywienie dla owadów pożytecznych

• korytarze ekologiczne, żywopłoty, zadrzewiane śródpolne dają siedlisko dla ptactwa, ssaków i owadów polujących na szkodniki.

IPM – integrowana ochrona roślin

• zwalczanie szkodników i chorób przy użyciu wszystkich met.

• Zgodnie z wymogami ekonomicznymi i ekologicznymi i toksykologicznymi, dających pierwszeństwo naturalnym czynnikom ograniczającym i ekonomicznym progom zagrożenia

ROŚLINNE BIOREAKTORY

• Bioreaktor – komórka roślinna

MIKROSKOP ODWRÓCONY

• Lampa zwykła lub ksenonowa

• Przystawka fluorescencyjna

• Światło wchodzi przez obiektyw

• Oświetlona substancja absorbuje energię i emituje ją w innej długości (obiekt sam staje się źródłem światła

1. Elicytacja to:

• Elicytacja to wywołanie reakcji obronnych przez zastosowanie czynników środowiskowych o nienormalnym natężeniu – elicytorów, które prowadzi do zmiany poziomu i/lub syntezy nowych metabolitów wtornych

2. Biotransformacja to:

• Biotransformacja(biokonwersja)to enzymatyczne różnorodnych substratów w bardziej wartościowe produkty, substratami mogą być zarówno związki naturalne występujące w roślinie jaki i senobiotyki

3. Kultury włośnikowa te:

1. Pozyskuje się z tkanek transformowalnych Agrobecterium tumefaciens, a ich najważniejszą możliwośc uzyskania innego spektrum i/lub wyższego poziomu syntezy metabolitów w porównaniu z rośliną donorową i innymi typami kultur in vitro

2. Pozyskuje się z włośnikowej strefy korzeni a ich najważniejszą zaletą jest możliwość… procesów elicytacji w kulturach zawiesinowych

3. Pozyskuje się z tkanek transformowalnych z Agrobecterium rhizogenes a ich najważniejszą możliwość uzyskania innego spektrum lub/i wyższego poziomu syntezy metabolitów w porównaniu z rośliną donorową i innymi typami kultur in vitro

4. Jadalne szczepionki mobilizujące układ odpornościowy to:

1. Ekstrakty białkowe uzyskane z roślin transgenicznych posiadających….

2. Jadalne części roślin (przetworzone, spożywane na surowo lub po ugotowaniu) do których wprowadzono geny kodujące białka antygenowe

3. Tabletki sporządzone ze sproszkowanych roślin w których ekspresja trans genów kodują immunoglobuliny ma charakter przejściowy

5. Z płynnej kultury agregatów merystematycznych Solanum lycopersicum mogą powstać

1. Zarodki somatyczne

2. Syntetyczne siewki

3. Korzenie

4. Pędy

5. Zarodki somatyczne lub syntetyczne siewki

6. Syntetyczne siewki lub korzenie

6. Wskaz które z poniższych twierdzeń jest fałszywe

1. We flawinowym modelu somatycznej embriogenezy egzogenne auksyny lub/i cytokininy nie są konieczne do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki

2. Źródłem emisji zielonej autofluorescencji w proliferującej tkance embriogenicznej ogórka jest witamina

3. we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy endogenny IAA jest niezbędny do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki

4. we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy przejscie z fazy wzrostu proliferacyjnego do wymaga w każdym przypadku zmiany składu pożywki

1. Z płynnej kultury agregatów merystematycznych Solanum lycopersicoides Dun. w procesie regeneracji mogą powstawać (wybierz poprawną odp.)

b) syntetyczne siewki

2. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń jest fałszywe

c) we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy endogenny IAA jest niezbędny do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki (w cytokinowym)

3. Która z metod analitycznych stosowanych do wykrywania GMO w żywności i paszach daje wynik najszybciej

c) Paski z przepływem bocznym Lateral flow strip

4. Jaka zawartość GMO w przeliczeniu na składnik jest dopuszczana w krajach do obrotu

d) do 0,9%

5. Podaj właściwą kolejność etapów w procesie sekwencjonowania i składania genomu

b) odczyty z sekwenatora, składania kontigów sekwencyjnych, tworzenie skafoldów, nanoszenie sekwencji na chromosomy

6. Trudności rekonstrukcji sekwencji genomu zależą od:

d) składu genomu, wielkości genomu, gęstości mapy ???

1.Wybierz najbardziej trafne stwierdzenie:

c) haploidy to organizmy posiadające jeden zestaw chromosomów

2. Haploidalne zarodki somatyczne można uzyskać:

a) na drodze androgenezy – poprzez kulturę in vitro pylników i/lub mikrospor

3. Podwojenie liczby chromosomów można zaindukować:

a) truciznami mitycznymi ???

b) stosując regenerację z eksplantatów liściowych

4. Haploidy oraz podwojone haploidy znajdują zastosowanie w:

1. hodowli i badaniach mutacyjnych

2. badaniach mutacyjnych, mapowaniu i transformacji genetycznej

5. Jakie geny zaangażowane są bezpośrednio w mechanizm kontrolujący tempo proliferacji roślinnych komórek macierzystych w merystemie wierzchołkowym pędu (SAM)

2. CLAVATA i WUSCHEL

6. Komórki macierzyste znajdujące się w merystemach wierzchołkowych roślin charakteryzują się tym, że:

2. są silnie zwakuolizowane, szybko się dzielą i ulegają różnicowaniu

7. Komórki macierzyste merystemu korzeniowego (RAM) kompletnej nie uszkodzonej rośliny rosnącej w warunkach normalnych

3. są pluripotencjalne, ponieważ ich możliwości różnicowania ograniczają się tylko do komórek i tkanek korzenia

8. Mechanizmy kontrolujące proliferację i różnicowanie komórek macierzystych u roślin i zwierząt są:

2. są zasadniczo bardzo podobne, ponieważ wymagają otoczenia innych komórek tworzących niszę ???

1. Fluorochromy:

2. są wrażliwe na światło, emitowane światło ma większą długość fali niż wzbudzające.

2. Przy znakowaniu fluorescencyjnym przy wykorzystaniu fragmentu Klenowa w mieszaninie reakcyjnej muszą się znaleźć

3. Fragment Klenowa, polimeraza, losowe startert, DTP

3. Polimeryzację żelu poliakrylamidowego wywołuje dodanie:

3. Temedu i APS

4. Poolplexing polega na:

3. mieszaniu produktów z wielu reakcji PCR i ich równoczesnej elektroforezie

5. Przy znakowaniu fluorescencyjnym produktów PCR metodą „dla ubogich” ilość startera

forward z ogonem M13 powinna być

4. przynajmniej 4 x mniejsza od ilości każdego z pozostałych starterów

6. Ilość kanałów detekcji fluorescencji w sekwenatorze Beckmann Coulter wynosi:

3. 4

7. Urządzenie LJ-COR 4300 DNA Analysis System jest:

3. Sekwenatorem płytowym

8. Zastosowanie starterów znakowanych różnymi barwnikami fluorescencyjnymi w przy przeprowadzaniu procedury Tilling z wykorzystaniem urządzeń Li-Corr pozwala na:

1. Ustalenie miejsca, w którym znajduje się mutacja

9. Elektroforezę markerów SSR w denaturującym żelu poliakrylamidowym prowadzono w następujących warunkach

3. c. 90 V

10. Spośród poniższych wybierz zestaw zawierający wyłącznie barwniki fluorescencyjne:

2. FAM, HEX, TaqMan, dNTP, Temed, D1 ????????????????????????

3. D4, Irdze 800, ROX, bromek etydyny

1. Selekcja klonów ma znaczenie w hodowli

1. ziemniaka

2. Selekcja masowa jest stosowana w przypadku roślin

3. obcopłodnych

3. W przypadku selekcji masowej roślin obcopłodnych .. ości recesywnym

2. zdecydowanie opóźnia sukces hodowlany

4. Zmienność występująca w kulturach in vitro określa się jako

1. zmienność somaklonalna

5. Selekcję, w której ocenie podlega kilka cech przy poziomach ustaloncyh określa się jako:

1. selekcję następczą

6. Cechy typowe towarzyszące cząsteczkom sygnałowym

1. niewielkie rozmiary

2. powstawanie na drodze prostych szlaków metabolicznych

3. zdolność do dyfuzji

7. Komórkom, które są objęte reakcją nadwrażliwości towarzyszy:

1. wzrost poziomu fenoli

2. wzrost poziomu melanin

3. wzrost przepuszczalności błon komórkowych

8. Fala oksydacyjna (wybuch oksydacyjny) to:

1. istotny etap procesu wyciszenia genów

2. gwałtowne uwolnienie aktywnych form tlenu

3. rodzaj bardzo skutecznej lecz później odpowiedzi gospodarza na infekcję