ODDZIAŁYWANIE BAKTERII Z GRUPY PGPR U ROŚLIN
PGPR
bakterie wspomagające wzrost roślin:
zwiększone kiełkowanie nasion
Lepszy rozwój systemu korzeniowego
Podwyższony wigor roślin
Zwiększona biomasa i plon
Oddziaływanie bezpośrednie:
Fitohormony (IAA, cytokininy)
Polepszenie odżywiania (żelazo, fosfor)
Oddziaływanie pośrednie:
Ograniczenie szkodliwych mikroorganizmów, w tym patogenów
Bakterie:
Azotobacter
Bacallus
Enterobacter
Gluconobacter
Pseudomonas
CO TO SĄ BIONAWOZY
bionawóz: bakterie, które przyczyniają się do zwiększenia dostępności składników pokarmowych dla roślin. Mikroorganizmy te wraz z pozytywnym na stan odżywienia rośliny, mogą jednocześnie wpływać na inne jej właściwości.
bionawóz zawiera więc żywe mikroorganizmy, które zastosowane na nasiona, powierzchnię roślin lub do gleby kolonizują ryzosferę i/lub wewnętrzne tkanki roślin.
Użycie przedrostka „bio” wskazuje, że nawóz taki zawiera organizmy żywe i poprawia status pokarmowy roślin.
Za bionawozowe mogą być uważane także tzw. bakterie pomocnicze, które wspomagają symbiotyczne reakcje innych bakterii i grzybów mikoryzowych z roślinami.
Symbioza rizobiów z roślinami motylkowymi
Wytwarzanie hormonów indukowanie rozwoju korzeni więcej brodawek
Rozpuszczanie związków fosforu, wydzielając przy tym kwasy organiczne, protony i fosfatazy, dzięki czemu rośliny mogą pobierać fosfor
Przemiany związków żelaza
WYJAŚNIJ ZASADĘ ENZYMATYCZNEGO TESTU SEROLOGICZNEGO
ELISA –
Inaczej test immunoenzymatyczny
Reakcja barwna
Służy do wykrycia określonych białek w badanym materiale z użyciem przeciwciał skoniugowanych z odpowiednim enzymem
Wyróżniamy bezpośredni i pośredni
Działanie
Pewna ilość antygenu unieruchomiona jest na powierzchni fazy stałej.
Wprowadzamy materiał biologiczny z przeciwciałami dla unieruchomienia antygenu.
Tworzą razem kompleks immunoenzymatyczny, dzięki któremu przeciwciało zostaje trwale związane z podłożem.
Po przepłukaniu środowiska reakcji i dodaniu odpowiedniego substratu, enzym związany ze specyficznym przeciwciałem katalizuje reakcję.
Barwny produkt oznaczmy spektrofotometrem
MYKORYZA ARBUSKULARNA (co to jest, z czego wynika jej znaczenie)
tworzona jest przez grzyby rzędu Glomales z trawami, większością roślin uprawnych, drzewami i krzewami.
Struktury strzępkowe rozwijają się pomiędzy komórkami gospodarza, tworząc wypełnione materiałem zapasowym rozdęcia – tzw. wehikule.
We wnętrzu komórek korowych korzeni, produkowane są silnie rozgałęzione struktury zwane arbuskulami.
elicytacja
- wywołanie reakcji obronnych przez zastosowanie czynników środowiskowych o nienormalnym natężeniu – elicytoróe, które prowadzi do zmiany poziomu i/lub syntezy nowych metabolitów wtórnych
- proces łączenia się elicytorów z receptorami komórek roślinnych podczas infekcji patogenów; jest elementem systemowej odporności nabytej roślin.
WSKAŻ PROCESY WYKORZYSTYWANE W BIOKONTROLI
EPIDEMIA
zespół procesów przyrodniczych, przebiegających w określonym miejscu i czasie, prowadzących do pojawienia się choroby populacji rośliny przy udziale czynnika chorobotwórczego w odpowiednich warunkach środowiska, często przy współudziale człowieka
rozwija się w następstwie zakłócenia równowagi w trójkącie oddziałujących na siebie czynników:
wrażliwej rośliny żywicielkiej
patogena
warunków środowiska
zasięg występowania epidemii:
epidemie wybuchowe – gwałtowny przebieg pierwszej fazy i osiąganie w krótkim czasie szczytowego nasilenia
pandemie – silna tendencja do powiększania obszaru an którym występują
epidemie chroniczne – nasilenie wzrasta stopniowo, zaś tendencja do przenoszenia na nowe obszary jest niewielka
endemia – skrajna postać epidemii chronicznej – długotrwałe utrzymywanie się tego samego nasilenia choroby; brak tendencji do przenoszenia na nowe obszary
wystąpienie i rozprzestrzenianie się epidemii zależy od:
genetycznych cech patogena
warunków środowiska
obecności dużych skupisk roślin żywicielskich
warunki występowania epidemii chorób roślin:
koncentracja na określonym obszarze jednego gatunku lub odmiany roślin o dużej podatności
obecność patogena o dużej wirulencji
warunki atmosferyczne korzystne dla patogena
rola patogena w rozwoju epidemii
infekcyjność, patogeniczność, wirulencja
zasobność źródeł infekcji
sposób przenoszenia się patogena, zdolność reprodukcyjna
cykl rozwojowy
ILOŚCIOWE I JAKOŚCIOWE METODY WYKORZYSTYWANE W EPIDEMIOLOGII
Przyrost liczby chorych roślin w jednostce czasu
Ustalenie wzrostu nasilenia objawów chorobowych na roślinach
Współczynnik korelacji – % wskaźnik dziennego przyrostu choroby rośliny na polu, liczba określająca w jakim stopniu zmienne są współzależne
Współczynnik regresji –przewidywanie wartości na podstawie innych wartości
pomiary patogena:
ilościowe: stężenie zawiesiny zarodników, liczba otoczni/jeden liść, liczba jednostek propagacyjnych patogena/ jednostkę powierzchni gleby
jakościowe: genotyp - rasa
KRYTYCZNE ODLEGŁOŚĆI EKOLOGICZNE
0-10m – zakres najbardziej intensywnych interakcji między szkodnikami a ich wrogami naturalnymi. Na tą odległość mogą być znoszone chemiczne środki ochrony roślin
10-50m – strefa aktywnego oddziaływania parazytoidów i drapieżnych stawonogów, przemieszczających się na powierzchni ziemi, latających i przenoszonych przez podmuchy powietrza z ich naturalnego środowiska na pole uprawne
50-100 m – w strefie tej następuje spadek aktywnego oddziaływania wielu gatunków o mniejszej zdolności do przemieszczania się jak: parazytoidy, drapieżne chrząszcze i drapieżne roztocze unoszone z wiatrem
100-500m – na tych odległościach następuje silny spadek oddziaływania wielu gatunków wrogów naturalnych. Występują jedynie gatunki o sredniej i dużej zdolności lotów jak bzygowate, biedronki, pluskwiaki różnoskrzydłe
>500 m – niewielkie nadlatywanie gatunków o dużej zdolności lotu (bzygowate, złotooki)
BIOLOGICZNA OCHRONA W SZKLARNI
Interakcja między drapieżnikamii parazytoidami
Charakter jednokierunkowy – ofiara: młodociane stadium parazytoidów
Wpływ miała preferencja pokarmowa i zdolność do odróżnienia roślinożerców
Interakcja między parazytoidami (konkurencja międzygatunkowa)
Konkurencja wewn. – więcej niż 1 gatunek zasiedla ofiarę
Konkurencja zewn. – skuteczność w odnajdywaniu i pasożytowaniu gospodarza
Odżywianie się ofiarami spasożytowanymi przez konkurentów
Interakcja parazytoid - ..
Redukcja ich liczebności
KOMÓRKI MACIEZYSTE
Komórki które zaangażowane są w rozwój i budowę struktury żywego organizmu.
Charakteryzują się nieograniczoną zdolnością do samo odnawiania co zapewnia im trwanie często przez cały czas życia organizmu
Mają możliwość różnicowania się w wyspecjalizowane typy komórek potomnych
Występują w merystemach wierzchołkowych (korzeń/pęd) i w kambium
Podział ze względu na stopień …….. do danego różnicowania
TOTIPOTENCJALNE- Możliwość przekształcenia się we wszelkie możliwe tkanki.np. zapłodniona komórka jajowa (zygota) zdolna do wytworzenia wszystkich komórek organizmu i łożyska.
PLURIPOTENCJALNE- przekształcają się w poszczególne tkanki i narządy. Dają początek wszystkim, poza rozrodczymi, komórką tkanek i narządów.
WŁOŚNIKI
Zwiększają powierzchnię chłonną
Zakotwiczenie rośliny w podłożu
Synteza i wydzielanie substancji aktywnych biologicznie
U ogórka stwierdzono w nich obecność ryboflawiny
ZALETY KULTUR WŁOŚNIKOWYCH
inne spektrum metabolitów lub inne ścieżki met w porównaniu z rosliną donorową,
bardziej wydajna jest synteza metabolitów, kw.lupinus polyptyllusil i lupinus hartweigii produkuje wiecej izoflawiny
przykłady metabolizmu kultur włośnikowych: skopolamina, serotonina, szikonina,serpentyna, kataranina, kw rozmarynowy
ZALECENIA DO OGRODÓW DLA OSÓB NIEDOWIDZĄCYCH I NIEWIDOMYCH
czytelny układ ścieżek, najlepiej krzyżujących się pod kątem prostym
szerokość ścieżki min. 1 m
zróżnicowane nawierzchnie
elementy wolnostojące powinny znajdować się poza ścieżkami, powinny mieć zaokrąglone brzegi
meble powinny mieć kolory kontrastujące z podłożem i otoczeniem
wzdłuż alejek można umieścić poręcze ułatwiające poruszanie się
umieszczenie w centralnej części ogrodu charakterystycznego punktu (fontanna, dzwoneczki)
narzędzia ogrodnicze powinny być bezpieczne i łatwe w obsłudze oraz w jaskrawych kolorach
SOCJOOGRODNICTWO
zajmuje się zależnościami między roślinami i ogrodnictwem a człowiekiem i całymi społecznościami
kierowane do osób z zaburzeniami i problemami: psychicznymi, umysłowymi, fizycznymi (udar, paraliż), sensorycznymi, geriatrycznymi, uzależnienie od alkoholu i narkotyków, wykluczenie społeczne (bezdomni, bezrobotni, mniejszości narodowe)
korzyści: nauka samodzielności i dokładności, poprawa kondycji fizycznej, większa koordynacja ruchowa i równowaga, poprawa koncentracji, zwiększenie pewności siebie i poprawa poczucia własnej wartości, umiejętność współpracy z innymi, obniżenie stresu oraz napięcia i agresji, podnoszenie kwalifikacji zawodowych
TERAPIA OGRODNICZA / HORITERAPIA
jest wsparciem tradycyjnej terapii i rehabilitacji,
służy poprawie stanu zdrowia i samopoczucia ludzi
ŚMIERĆ KOMÓRKI
Jest naturalnym procesem fizjologicznym, zachodzącym w każdym żywym organizmie. Jest częścią programu rozwojowego każdego żywego organizmu.
Jest to proces niezbędny podczas występujących etapów ontogenezy (Następuje w trakcie określonego etapu ontogenezy w ściśle zdefiniowanym miejscu-jest kontrolowana genetycznie)
Jest procesem pasywnym bądź zachodzi w wyniku biochemicznej aktywności komórek.
Definiowana jest jako całkowite zaprzestanie czynności biochemicznych, które zachodzą w komórce, a w konsekwencji prowadzą do jej unicestwienia
Selektywna śmierć komórki jest często niezbędna do prawidłowego rozwoju rośliny (usuwanie komórek zainfekowanych przez mikroorganizmy patogenne, powstawanie aerenchymy w reakcji roślin na hipoksję, eliminacja komórek pręcików w jednopłciowych kwiatach żeńskich)
ETAPY PROGRAMOWEJ ŚMIERCI KOMÓRKI
sygnalizacyjny, w którym następuje odbieranie i przekształcanie sygnałów ze środowiska
wykonawczy (egzekutorowy), gdzie reakcje biochemiczne przyczyniają się do uśmiercenia danej komórki
oczyszczający, podczas którego usuwane są pozostałości komórki
APOPTOZA
Proces fizjologiczny, prowadzący do eliminacji zużytych lub uszkodzonych komórek z organizmu, niezbędny przy zachowaniu odpowiedniej homeostazy tkankowej.
Wymaga dostarczenia energii w postaci ATP
RODZAJE BLOKAD W PĘDACH
emboliom
blokada mikrobiologiczna
blokada fizjologiczna
wcistki
balonikowa te twory przeciskające się do naczyń przez ich perforację
BIOTRANSFORMACJA
katalizowane przez enzymy reakcje chemiczne, w których następuje przekształcenie określonego(nych) fragmentu(ów) substratu.
Biotransformacje u mikroorganizmów można porównać do "biokatalizatorów", które przeprowadzają przemiany prowadzące do otrzymania pożądanego produktu.
Są to procesy wykorzystujące najczęściej tylko jeden enzym i nie dostarczają komórce energii ani potrzebnych związków.
Biotransformacje zachodzą też w formach przetrwalnikowych mikroorganizmów dzięki braku zaangażowania jakichkolwiek szklaków metabolicznych w proces.
Jednym z ważniejszych problemów przy stosowaniu biotransformacji jest występujące ograniczenie przepuszczalności substratów i produktów przez błony cytoplazmatyczne lub też wydzielenie odpowiedniego enzymu z komórki.
Dlatego też opracowanie specyficzne sposoby postępowania zależą od charakteru mikroorganizmu (np. środki powierzchniowo czynne).
POSTANOWIENIA III ANEKSU
Aneks III Dyrektywy 91/414
O konieczności przeprowadzenia badań decyduje ocena eksperta
Ocena kompletności dokumentacji staje się substytutem eksperta
Dyrektywa ustanawia ramy wspólnotowego działania na rzecz zrównoważonego stosowania pestycydów (dobra praktyka ochrony roślin)
JADALNE SZCZEPIONKI
szczepionki produkowane w roślinie do bezpośredniego spożycia,
przetworzone części roślin lub ekstrakcja białek antygenowych.
rośliny produkujące białko rozpoznawane jako antygen muszą być akceptowane jako żywność oraz powszechnie dostępne,
okres od zbioru części roślin nie powinien być długi,
białko antygenowe nie może ulegać całkowitej degradacji w przewodzie pokarmowym,
nie może być toksyczne dla roślin
rośliny na jadalne szczepionki
ziemniak-(biegunka, cholera, cukrzyca);
banan- (biegunka i cholera);
sałata-(żółtaczka, odra);
marchew- (żółtaczka B, owrzodzenia żołądka i dwunastnicy);
soja-biegunka;
kukurydza-(biegunka i cholera);
pomidory- cholera
INTEGROWANA PRODUKCJA (czym jest)
Integrowana produkcja roślin oznacza produkcję roślin, z zastosowaniem integrowanej ochrony roślin oraz z wykorzystaniem postępu technicznego i biologicznego w uprawie i nawożeniu, ze szczególnym uwzględnieniem zdrowia ludzi i zwierząt oraz ochrony środowiska.
WPŁYW INFRASTRUKTURY EKOLOGICZNEJ I UPRAW MONOKULTUROWYCH NA OGRANICZANIE POPULACJI SZKODNIKÓW
uprawy wielogatunkowe stanowią barierę fizyczną dla szkodników i mogą dawać siedlisko i pożywienie dla owadów pożytecznych
korytarze ekologiczne, żywopłoty, zadrzewiane śródpolne dają siedlisko dla ptactwa, ssaków i owadów polujących na szkodniki.
IPM – integrowana ochrona roślin
zwalczanie szkodników i chorób przy użyciu wszystkich met.
Zgodnie z wymogami ekonomicznymi i ekologicznymi i toksykologicznymi, dających pierwszeństwo naturalnym czynnikom ograniczającym i ekonomicznym progom zagrożenia
ROŚLINNE BIOREAKTORY
Bioreaktor – komórka roślinna
MIKROSKOP ODWRÓCONY
Lampa zwykła lub ksenonowa
Przystawka fluorescencyjna
Światło wchodzi przez obiektyw
Oświetlona substancja absorbuje energię i emituje ją w innej długości (obiekt sam staje się źródłem światła
1. Elicytacja to:
Elicytacja to wywołanie reakcji obronnych przez zastosowanie czynników środowiskowych o nienormalnym natężeniu – elicytorów, które prowadzi do zmiany poziomu i/lub syntezy nowych metabolitów wtornych
2. Biotransformacja to:
Biotransformacja(biokonwersja)to enzymatyczne różnorodnych substratów w bardziej wartościowe produkty, substratami mogą być zarówno związki naturalne występujące w roślinie jaki i senobiotyki
3. Kultury włośnikowa te:
Pozyskuje się z tkanek transformowalnych Agrobecterium tumefaciens, a ich najważniejszą możliwośc uzyskania innego spektrum i/lub wyższego poziomu syntezy metabolitów w porównaniu z rośliną donorową i innymi typami kultur in vitro
Pozyskuje się z włośnikowej strefy korzeni a ich najważniejszą zaletą jest możliwość… procesów elicytacji w kulturach zawiesinowych
Pozyskuje się z tkanek transformowalnych z Agrobecterium rhizogenes a ich najważniejszą możliwość uzyskania innego spektrum lub/i wyższego poziomu syntezy metabolitów w porównaniu z rośliną donorową i innymi typami kultur in vitro
4. Jadalne szczepionki mobilizujące układ odpornościowy to:
Ekstrakty białkowe uzyskane z roślin transgenicznych posiadających….
Jadalne części roślin (przetworzone, spożywane na surowo lub po ugotowaniu) do których wprowadzono geny kodujące białka antygenowe
Tabletki sporządzone ze sproszkowanych roślin w których ekspresja trans genów kodują immunoglobuliny ma charakter przejściowy
5. Z płynnej kultury agregatów merystematycznych Solanum lycopersicum mogą powstać
Zarodki somatyczne
Syntetyczne siewki
Korzenie
Pędy
Zarodki somatyczne lub syntetyczne siewki
Syntetyczne siewki lub korzenie
6. Wskaz które z poniższych twierdzeń jest fałszywe
We flawinowym modelu somatycznej embriogenezy egzogenne auksyny lub/i cytokininy nie są konieczne do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki
Źródłem emisji zielonej autofluorescencji w proliferującej tkance embriogenicznej ogórka jest witamina
we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy endogenny IAA jest niezbędny do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki
we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy przejscie z fazy wzrostu proliferacyjnego do wymaga w każdym przypadku zmiany składu pożywki
1. Z płynnej kultury agregatów merystematycznych Solanum lycopersicoides Dun. w procesie regeneracji mogą powstawać (wybierz poprawną odp.)
b) syntetyczne siewki
2. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń jest fałszywe
c) we flawinowym modelu somatycznej embriogenezy endogenny IAA jest niezbędny do podtrzymywania wzrostu proliferacyjnego tkanki (w cytokinowym)
3. Która z metod analitycznych stosowanych do wykrywania GMO w żywności i paszach daje wynik najszybciej
c) Paski z przepływem bocznym Lateral flow strip
4. Jaka zawartość GMO w przeliczeniu na składnik jest dopuszczana w krajach do obrotu
d) do 0,9%
5. Podaj właściwą kolejność etapów w procesie sekwencjonowania i składania genomu
b) odczyty z sekwenatora, składania kontigów sekwencyjnych, tworzenie skafoldów, nanoszenie sekwencji na chromosomy
6. Trudności rekonstrukcji sekwencji genomu zależą od:
d) składu genomu, wielkości genomu, gęstości mapy ???
1.Wybierz najbardziej trafne stwierdzenie:
c) haploidy to organizmy posiadające jeden zestaw chromosomów
2. Haploidalne zarodki somatyczne można uzyskać:
a) na drodze androgenezy – poprzez kulturę in vitro pylników i/lub mikrospor
3. Podwojenie liczby chromosomów można zaindukować:
a) truciznami mitycznymi ???
b) stosując regenerację z eksplantatów liściowych
4. Haploidy oraz podwojone haploidy znajdują zastosowanie w:
hodowli i badaniach mutacyjnych
badaniach mutacyjnych, mapowaniu i transformacji genetycznej
5. Jakie geny zaangażowane są bezpośrednio w mechanizm kontrolujący tempo proliferacji roślinnych komórek macierzystych w merystemie wierzchołkowym pędu (SAM)
CLAVATA i WUSCHEL
6. Komórki macierzyste znajdujące się w merystemach wierzchołkowych roślin charakteryzują się tym, że:
są silnie zwakuolizowane, szybko się dzielą i ulegają różnicowaniu
7. Komórki macierzyste merystemu korzeniowego (RAM) kompletnej nie uszkodzonej rośliny rosnącej w warunkach normalnych
są pluripotencjalne, ponieważ ich możliwości różnicowania ograniczają się tylko do komórek i tkanek korzenia
8. Mechanizmy kontrolujące proliferację i różnicowanie komórek macierzystych u roślin i zwierząt są:
są zasadniczo bardzo podobne, ponieważ wymagają otoczenia innych komórek tworzących niszę ???
1. Fluorochromy:
są wrażliwe na światło, emitowane światło ma większą długość fali niż wzbudzające.
2. Przy znakowaniu fluorescencyjnym przy wykorzystaniu fragmentu Klenowa w mieszaninie reakcyjnej muszą się znaleźć
Fragment Klenowa, polimeraza, losowe startert, DTP
3. Polimeryzację żelu poliakrylamidowego wywołuje dodanie:
Temedu i APS
4. Poolplexing polega na:
mieszaniu produktów z wielu reakcji PCR i ich równoczesnej elektroforezie
5. Przy znakowaniu fluorescencyjnym produktów PCR metodą „dla ubogich” ilość startera
forward z ogonem M13 powinna być
przynajmniej 4 x mniejsza od ilości każdego z pozostałych starterów
6. Ilość kanałów detekcji fluorescencji w sekwenatorze Beckmann Coulter wynosi:
4
7. Urządzenie LJ-COR 4300 DNA Analysis System jest:
Sekwenatorem płytowym
8. Zastosowanie starterów znakowanych różnymi barwnikami fluorescencyjnymi w przy przeprowadzaniu procedury Tilling z wykorzystaniem urządzeń Li-Corr pozwala na:
Ustalenie miejsca, w którym znajduje się mutacja
9. Elektroforezę markerów SSR w denaturującym żelu poliakrylamidowym prowadzono w następujących warunkach
c. 90 V
10. Spośród poniższych wybierz zestaw zawierający wyłącznie barwniki fluorescencyjne:
FAM, HEX, TaqMan, dNTP, Temed, D1 ????????????????????????
D4, Irdze 800, ROX, bromek etydyny
1. Selekcja klonów ma znaczenie w hodowli
ziemniaka
2. Selekcja masowa jest stosowana w przypadku roślin
obcopłodnych
3. W przypadku selekcji masowej roślin obcopłodnych .. ości recesywnym
zdecydowanie opóźnia sukces hodowlany
4. Zmienność występująca w kulturach in vitro określa się jako
zmienność somaklonalna
5. Selekcję, w której ocenie podlega kilka cech przy poziomach ustaloncyh określa się jako:
selekcję następczą
6. Cechy typowe towarzyszące cząsteczkom sygnałowym
niewielkie rozmiary
powstawanie na drodze prostych szlaków metabolicznych
zdolność do dyfuzji
7. Komórkom, które są objęte reakcją nadwrażliwości towarzyszy:
wzrost poziomu fenoli
wzrost poziomu melanin
wzrost przepuszczalności błon komórkowych
8. Fala oksydacyjna (wybuch oksydacyjny) to:
istotny etap procesu wyciszenia genów
gwałtowne uwolnienie aktywnych form tlenu
rodzaj bardzo skutecznej lecz później odpowiedzi gospodarza na infekcję