Fragmentacja to proces w wyniku, którego pliki znajdujące się na dysku twardym są zapisywane na nie sąsiadujących ze sobą klastrach dysku. Dzieje się tak, ponieważ algorytm zapisujący nowe dane zapisuje je w pierwszym wolnym klastrze dysku, który znajdzie.
Defragmentacja to proces ponownej reorganizacji plików na dysku twardym. Zmierzający do ich scalenia, tak aby dane zawarte w pliku zajmowały sąsiadujące klastry.
Zagrożenia dla danych w dużej mierze związane są z Internetem i możliwością zainfekowania komputera przez wirusy komputerowe. Podstawowymi cechami wirusów są:
Zdolność do samo powielania się czyli replikacji,
Zdolność do „doczepiania” się do innych plików.
Wirusy najczęściej umiejscawiają się w pierwszych sektorach fizycznych dysku twardego. Jednym z podziałów wirusów jest podział według ich lokalizacji czyli miejsca gdzie dopisują się one do pliku. Wyróżniamy wirusy lokujące się na początku pliku, na końcu pliku oraz w nagłówku plików z rozszerzeniem „.exe”. Występują również wirusy lokujące się w dowolnym miejscu pliku lub w dowolnym pustym obszarze dysku. Występują również wirusy specjalizujące się w infekowaniu plików wsadowych (.bat) oraz pliku „.com” i „.exe”.
Oprócz klasycznych wirusów występują programy o działaniu bardzo podobnym do działania wirusa lecz występują one jako osobne pliki. Najbardziej niebezpieczny z nich są konie trojańskie. Uruchamiają się one wraz z aplikacją i nie zauważone przez użytkownika wykonują szkodliwe operacje (przechwytują hasła, dane i adresy, a następnie wysyłają je pod wskazany adres e-mailowy)
Specyficznym rodzajem szkodliwych programów są tzw. boty czyli programy działające na serwerze pocztowym poszywające się pod adresy nadawców. Udają osobę, która już korespondowała z danym użytkownikiem i wysyłają zakażone listy. Mogą one też korzystać z książki adresowej.