EGZAMIN TERMIN I
Pytania opisowe, bo testu nie jestem w stanie odtworzyć

1. Synteza fosforanu kreatyny - wzorami, zaznaczyć w jakich organach zachodzą poszczególne etapy i gunkcja ostatecznego produktu.
2. Dwie różne choroby dziedziczne katabolizmu puryn - jaki enzym i napisać reakcję przez niego katalizowaną.
3. Budowa kolagenu. Gdzie występuje.
4. Wykorzystanie acetooctanu w uzyskiwaniu energii - reakcja wzorami i dlaczego proces nie zachodzi w wątrobie.
5. Budowa receptora związanego z białkiem G, działanie + przykład
6. Wypunktować proces elongacji w syntezie białka
7. Szlak 2,3-BPG w erytrocycie i po co jest
8. Regulacja allosteryczna w procesie glikolizy i glikogenezy - wzór związku i dlaczego to jest istotne.
9. Wzór aktywnej wit. D i jej działanie na kości i jelito
10. Transport TAG w osoczu krwi. W jaki sposób zapasy tłuszczu są
zużywane przez organizm w stanie głodu?
Z testu, namiastka pytań ktore udało mi się odtworzyć z obwodów pamięci chwilowej:

- rodzaj immunoglobuliny, która penetruje łożysko
- choroba spichrzeniowa glikogenu o wysokiej zawartości glikogenu w mięśniach i niskim poziomie kwasu mlekowego w osoczu
- sfingolipidozy - dopasować nazwy do enzymu, którego brak
- choroby związane z zaburzeniami budowy receptorów - miastenia, chorba alzheimera, choroba feminizujących jąder etc
- wydajność cyklu mocznikowego warunkowana aktywnością enzymów (wymienione arginaza, transkarbomilaza ornitynowa, cytoplazmatyczna i mitochnodrialna sytetaza karbomilofosforanowa etc)
- enzym którego produkt sprzęga cykl mocznikowy i cykle krebsa - chodziło o argininobursztynazę
- po wypicu dwóch filiżanek kawy, jakie efekty - najprawdopodobniej chodzi o przedłużone działanie glukagonu ?
- składnik surfaktatnu płucnego
- jakie aminokwasy mogą brać pośredni i bezpośredni udział w syntezie porfiryn
- obliczyć Vi przy podanym Vmax Km i S
- Po dodaniu substancji x do enzymu i substartu obserwuje się efekty: zwiększenie Km, Vmax bez zmian, brak znoszenie inhibicji przez zwiększenie steżenia substratu, niskia aktywność przy małym steżeniu substratu - jaki inhibitor
- enzym z syntezy de novo pirymidyn który nie wchodzi w skład kompleksu wieloenzymatycznego - fosforybozylotransferaza orotanowa ?
- sulfonamidy hamują wzrost bakterii bo: wchodzą w kwas foliowy jako analogi PABA
- stop biosyntezy białka - czy czynniki powodujące stopowanie wykazują aktywność hydrolizy ATP GTP, czy współpracują z peptydylotransferazą
- pytanie odnośnie konformacji białka
- wpływ insuliny na biosyntezę białka - czy aktywuje, dezaktywuje odpowiedni czynnik przez fosforylację czy defosforylację
- pytanie odnośnie nieprawidłowych hemoglobin
- jak odróżnić żółtaczkę hemolityczną od spowodowanej zapaleniem wątroby - w odpowiedziach kombinacje o podwyższonej bilirubinie całokiwtej, pośredniej, urobilinogenie
- pytanie o cykl pentozofosforanowy, że dostarcza NADPH i rybozo-5-P, jakieś tam jeszcze
- dalej o etap nieoksydacyjny cyklu pentozowego, o fragmenty węglowe przenoszone przez transaldolazy i transketolazy
- wskaż nieprawdę dotyczącą proteoglikanów: że ma mniej cukru niż w glikoproteinach
- wynikiem działania fospolipazy C na lecytynę bedzie:
- rodzinna hipercholesterolemia spowodowana jest: zaburzenia sytnety receptora dla LDL
- nadmierne spożywanie cholesterolu: chyba chodziło o to, że jest zmniejszona synteza apoB100
- dlaczego brak Boksydacji kwasów tłuszczowych skutkuje hipoglikemią
- nowo powstający HDL w jelitach charakteryzuje się: chyba tym że nie ma apo E i apo C
- niektóre leki mogą powodowac napady porfirii bo: nasilają syntezę syntetazy ALA
- w jakich rekacjach może uczestniczyć sukcynylo-CoA
- podobieństwo w ekspresji genu i eukaryota i prokaryota: że polimeraza RNA przyłącza sie powyżej miejsca startu
- lowastatyna, która jest inhibitorem reduktazy HMG-CoA powoduje obniżenie poziomu LDL bo:
1)w której z reakcji glikolizy powstaje zwiazek z wiazaniem wysokoenergetycznym?
(prawdopodobnie 3-fosfoglicerynian w fosfoenolopirogronian)
2)wskazac błędne zdanie na temat działania hormonów, i tam było cos o prolaktynie ze jest pobudzana przez dopamine i draznienie brodawki sutkowej, czy cos podobnego.
3)której gr zwiazkow mozesz uzyc do syntezy porfiryn, bezposrednio jak i posrednio: I tu były wymienione, i chyba chodzilo o glicyne, metionine i cos tam jeszcze było nie pamietam, ale przeksztalcalo sie w propionylo-CoA.
4)Który z enzymów wymaga miedzi jako kofaktora (chodziło o oksydaze lizylowa)
5)w wyniku nadmiaru żelaza w jakich białkach będzie się gromadziło.
6)struktura białka i które zdanie prawdziwe (prawdopodobnie o budowie zakrętu beta)
7)wskazać brakujący w ciągu składnik łancucha oddechowego
8)albinizm wynika z zaburzenia katabolizmu którego aminokwasu?
9)regulacja hormonów przez duze stezenie insuliny

EGZAMIN TERMIN II

karnityna
ortoacydurie
biochemia skurczu mięśnia
synteza laktozy przy niespożywaniu galaktozy
nieprawidłowe hemoglobiny
choroba aminokwasów rozgałęzionych
biosynteza melatoniny z serotoniny
biosynteza jednego lipidu azotowego i jednego bezazotowego z udzialem CDP
wplyw adrenaliny na glikogen w miesniach
splicing
była jeszcze synteza melatoniny z serotoniny + funkcje,
wpływ adrenaliny na przemiany glikogenu w mięśniach i ogólnie funkcje tego hormonu,
synteza lipidu złożonego zawierającego azot i bezazotowego + funkcje tych powstałych lipidów ( i te reakcje trzeba było przedstawić PEŁNYMI wzorami więc troche syf bo to zajęło dużo czasu i miejca zresztą też tak że póniej nawet nie zostało wolnej kartki na napisanie funkcji)
choroba moczu o zapachu syropu klonowego ( to już przegieli...)
splicing (też syf)

EGZAMINA TERMIN III
1/ Synteza dopaminy z tyrozyny+ 3 związki pochodne tyrozyny i ich funkcja
2/ Zespół Lesch-Nyhana- napisać wzorami reakcję, której zaburzenie powoduje ten zespół i jakie są jego objawy
3/ Synteza dowolnego aminoacylo t-RNA. Wyjaśnić łączenie się aminokwasów z t-RNA
4/ Reakcja syntezy sfingozyny, w której uczestniczy NADPH+H+. Gdzie ona zachodzi
5/ 2 choroby związane z aminokwasem zawierającym siarkę [czy jakoś tak]
6/ Osteopetroza [nie osteoporoza!!!]- wyjaśnić jej przyczyny na podłożu molekularnym
7/ Wpływ insuliny na syntazę glikogenową
8/ Reakcje glukoneogenezy od glicerolu do fruktozo-1,6-bisfosforanu
9/ 2,3-BPG i jego wpływ na hemoglobinę
10/Wymienić aktywności enzymatyczne syntazy kwasów tłuszczowych i napisać wzorami reakcję ograniczającą ich tworzenie.


pytania z biochemii z 14 czerwca 2007 spisane przez jednego ze studentów.

OTWARTE

1. Biosynteza kreatyny - wzory, gdzie zachodzi.
2. Wzór hemu. Kooperatywne wiązanie tlenu - definicja.
3. Reakcja karboksykinazy fosfoenolopirogronianowej. Rola, regulacja
aktywności.
4. Etapy elongacji łańcucha polipeptydowego u Eucaryota. Inhibitory
poszczególnych etapów, mechanizm ich działania.
5. Dwa inhibitory łańcucha oddechowego - mechanizm działania.
6. Choroba nieprawidłowego katabolizmu aminokwasów o łańcuchu
rozgałęzionym.
7. Transport TAG w osoczu krwi. W jaki sposób zapasy tłuszczu są
zużywane przez organizm w stanie głodu?
8. Transportery glukozy - rola, lokalizacja, mechanizmy działania.
9. Katabolizm GTP. Defekt jakiego enzymu powoduje ksantynurię?
10. Reakcje CTP w biosyntezie fosfoglicerolu zawierającego i nie
zawierającego atomu azotu. Rola biologiczna produktów tych syntez.

TESTOWE

Białka:
- przyczyny różnego powinowactwa do tlenu hemoglobiny A i hemoglobiny
płodowej
- efekt Bohra, mechanizm powstawania
- hydroksylacja reszt Pro i Lys w kolagenie, mechanizm
- inhibicja kompetycyjna, niekompetycyjna, akompetycyjna, allosteryczna,
naturalna
- równanie Hilla
- Alfa- i Beta- aminokwasy
- punkt izoelektryczny Asp, jak wyznaczamy
- które aminokwasy nie ulegają transaminacji
- inhibitorem której reakcji cyklu Krebsa jest malonian
- jak odróżnić żółtaczkę hemolityczną od wątrobowej
- porfirynogeny a porfiryny - różnice w absorbcji światła

Kwasy nukleinowe:
- działanie sulfonamidu jako leku przeciwbakteryjnego, mechanizm
- acyduria orotanowa, przyczyna
- powstawanie TMP, reakcja
- niedobór fosforybozylotransferazy hipoksantyno-guaninowej - jaki to
zespół
- jak toksyna błonicy hamuje translację
- ogólne pytania o polimerazy i inne enzymy u Pro- i Eucaryota
(aktywności egzonukleaz!)
- pytania o inhibitory replikacji, transkrypcju i translacji, mechanizmy
działania
- wrażliwość polimeraz na alfa-amanitynę
- rola sekwencji Shine-Dalgarno
- Tata BOX, charakterystyka

Cukry:
- reakcje glukozo-6-fosforanu
- gdzie w glikolize zachodzi fosforylacja substratowa
- koenzymy przejścia pirogronian fosfoenolopirogronian w
glukoneogenezie
- dlaczego przy dziedzicznej nietolerancji Fru występuje hipoglikemia
- regulacja fosforylazy i syntazy glikogenowej
- substrat dla transketolazy
- regulacja glikolizy, glukoneogenezy
- właściwości redukujące cukrów
- glukokinaza a heksokinaza
- glikogenozy (zespół Mc Ardle'a i in.)

Tłuszcze:
- regulacja palmitoilotransferazy karnitynowej I
- biosynteza lipoksyn (pozycje hydroksylacji łańcucha kw.
arachidonowego)
- niedobór LPL, co się wtedy dzieje
- remnanty chylomikronów, charakterystyka
- czy wątroba spala ciała ketonowe
- choroba Gauchera
- biosynteza sfingomieliny
- czy WKT występują w błonach biologicznych
- kolipaza, rola soli kwasów żółciowych w trawieniu tłuszczy,
charakterystyka tego trawienia, szlak monoacyloglicerolowy w jelicie
- fosfolipaza C, reakcja
- fosfolipaza A2, reakcja

Konwersatoria, wykłady:
- S-adenozylometionina, w których reakcjach bierze udział, w których nie
- czy w anemii sierpowatej mamy policytemię
- gdzie w cyklu Krebsa fosforylacja substratowa, którą reakcję hamuje
arsenian, gdzie powstają FADH2 i NADH
- brakujące ogniwo w łańcuchu oddechowym wskazać, w którym kompleksie
tego łańcucha występują jony miedzi
- regulacja syntezy karbamoiloasparaginianu
- połączenie cyklu mocznikowego z cyklem Krebsa
- hydroksyfenylomleczan - w jakiej chorobie podwyższone stężenie w
osoczu
- które kwasy żółciowe powstają w wątrobie
- procesy z udziałem witaminy C
- enzymy syntezy hh. steroidowych (rola 17-hydroksylazy, 4-5 reduktazy),
zaburzenia w hh. płciowych (oporność na androgeny, zespół
policystycznych jajników)
- budowa hormonu wzrostu
- proteoglikany, charakterystyka
- budowa cząsteczek kw. hialuronowego
- i inne Ludzka pamięć jest ograniczona...

28 czerwca 2007 godz 14:45

1. synteza hormonów rdzenia nadnerczy z tyrozyny i ich funkcja
2. orotoacyduria - reakcje i co to jest
3. biochemiczne aspekty skurczu mięśnia
4. immunoglobuliny - miejsce syntezy, budowa, podział na klasy
5. reakcje B - oksydacji w których powstają nad i fadh2
6. terminacja biosyntezy białka
7. coś o regulacji enzymów w stanie głodu przez hormony
8. dwie reakcje powstawania rybozo5P w szlaku pentozofosforanowym
9. wzory 2 androgenów nadnerczy i zespół nadnerczowo-płciowy
10. nie pamiętam