Podział enzymów:
Oksydoreduktazy (wymagają kofaktorów: NAD, NADP, FMN, FAD, CoQ, liponian)
Oksydazy (wykorzystują tlen jako akceptor elektronów, lecz go nie wbudowują do substratu; produkt woda lub H2O2) oksydaza cytochromowa
Dehydrogenazy (wykorzystują inne akceptory elektronów)
Tlenowe (produkt H2O2) oksydaza L-aminokwasowa
Beztlenowe (produktem NADPH czy FADH2 itp.) dehydrogenaza bursztynianowa, jabłczanowa, NADH, LDH itp.
Oksygenazy (wbudowują tlen do substratu; monooksygenazy i dioksygenazy) cytochromy P-450
Peroksydazy (H2O2 akceptorem, daje wodę) np. peroksydaza, katalaza
Transferazy (pośredniczą kofaktory) glikozylotransferazy, transketolazy
Metylotransferazy (przenoszenie jednowęglowych jednostek) metylotransferaza guanidynooctowa
Aminotransferazy (grupa aminowa z aa na ketokwas) aminotransferaza alaninowa
Kinazy (Pi z ATP na substrat)
Fosforylazy (nieorganiczna Pi na substrat)
Hydrolazy (rozbijają wiązanie za pomocą wody) estraza cholinowa, amylaza ślinowa
Fosfatazy (usuwanie Pi) fosfataza glukozo-6-fosforanowa
Fosfodiestrazy (rozcinanie wiązania fosfodiestrowego)
Proteazy karboksypeptydazy, chymotrypsyna, pepsyna
Liazy
Dekarboksylazy (wytwarzają CO2 podczas eliminacji) dekarboksylaza pirogronianowa
Aldolazy (powstają aldehydy w reakcji eliminacji)
Syntazy (łączy dwa związki bez ATP)
Izomerazy izomeraza fosfotriozowa
Racemazy (zamiana L w D)
Mutazy (przenoszenie grup w obrębie cząsteczki)
Ligazy (enzymy katalizujące reakcje syntezy, którym towarzyszy odszczepienie reszt kwasu fosforowego od ATP)
Karboksylazy
Syntetazy syntetaza glutaminowa