WYKŁAD I - BIAŁKA

1. Budowa białek

2. Właściwości aminokwasów

3. Struktura aminokwasów

4. Klasyfikacja aminokwasów

5. Wiązanie peptydowe - omówić, jak powstaje

6. Struktura przestrzenna białek

7. Klasyfikacja białek

8. Funkcje białek

9. Rzędowość białek

10. Kąty rotacji - wiązania

11. Pętle i obroty

12. Trzeciorzędowa struktura - motywy i domeny

13. Czwartorzędowa struktura

14. Denaturacja białek

15. Zwijanie/ fałdowanie białek - enzymy, białko opiekuńcze, wiązania disiarczkowe - ich rola w fałdowaniu białek

16. Mechanizmy regulujące nieprawidłowe ufałdowanie białek

17. Mechanizmy obronne komórek, które mają źle ufałdowane białka

WYKŁAD II - BIOFIZYCZNA ANALIZA BIAŁEK

1. Dlaczego białko oczyszczamy?

2. Etapy oczyszczania białka

3. Na czym polega wirowanie

4. Chromatografia, kolumnowa, co jest złożem, jakie cząsteczki się wiążą

5. Chromatografia powinowactwa

6. Filtracja żelowa

7. Co wpływa na wzrost rozdzielczość w trakcie chromatografii

8. Elektroforeza żelowa - zasada rozdziału białek

9. Co to jest ogniskowanie izoelektryczne

10. Elektroforeza dwukierunkowa

WYKŁAD III - KRYSTALOGRAFIA

1. Co to jest krystalografia rentgenowska i do czego służy

2. Jakie zjawisko wykorzystuje krystalografia - dyfrakcja na krysztale

3. Zasady krystalografii

4. Jaki jest cel badań strukturalnych? - struktury i oddziaływania międzycząsteczkowe

5. Podstawowe pojęcia w krystalografii

6. Etapy badań w krystalografii

7. Jak przygotować białko do krystalografii - coś tam z separacją

8. Metody oczyszczania białek

9. Jak przebiega krystalizacja - istotne etapy

10. Budowanie modelu białek - od siatki dyfrakcyjnego aż po strukturę przestrzenną

11. Co to jest spektroskopia rezonansu magnetycznego?

12. Co to jest proteomika?

13. Co to jest spektroskopia masowa i do czego ją wykorzystujemy

WYKŁAD IV - PLAZMONOWY REZONANS POWIERZCHNIOWY BIAcore

1. Plazmonowy rezonans powierzchniowy - jaki cel BIAcore

2. Cechy BIAcore

3. Jakie informacje zawiera sensogram

4. Co to jest sensor

5. Definicja ligandu i analitu

6. Jakie oddziaływania analizujemy przy użyciu BIAcore

7. BIAcore w proteomice

8. Zalety i wady BIAcore

WYKŁAD V - MIKROSKOP

1. Co to jest mikroskop optyczny i do czego służy

2. Z czego zbudowany jest mikroskop

3. Funkcje: okularu, obiektywu i kondensora

4. Co to jest numeryczna apertura

5. Głębokość obrazu, Pole widzenia, Powiększenie, Rozdzielczość

6. Jakość obrazu - od czego zależy

7. Absorpcja, refrakcja,Dyspersja,Dyfrakcja

8. Mikroskop kontrastowa - fazowy

9. Mikroskop polaryzujący - zjawisko i do czego służy

10. Mikroskop elektronowy

11. Mikroskop fluorescencyjny: chromofory, wzbudzenie, emisja

WYKŁAD VI - CYTOMETRIA PRZEPŁYWOWA

1. Co to jest cytometria przepływowa?

2. Do czego służy cytometr przepływowy

3. Zasada pomiaru - jakie zjawiska wykorzystuje

4. Budowa cytometru

5. Ogniskowanie hydrodynamiczne

6. Co robi sorter w cytometrze?

7. Co to jest FSC i SSC

8. Analiza fluorescencyjna w cytometrze - wykorzystanie barwników

9. Preparaty wymagane do badania cytometrycznego: ilość komórek, zawieszenie w buforze

10. Zastosowanie cytometrii przepływowej

WYKŁAD VII - BŁONY KOMÓRKOWE

1. Struktura błony biologicznej

2. Co to jest model płynnej mozaiki?

3. Wymień główne fosfolipidy w błonach

4. Co to znaczy, że błona jest płynna? Jak to wpływa na jej funkcje?

5. Co wpływa na płynność błony

6. Cholesterol - jak wpływa na płynność błony biologicznej

7. Ruch lipidów w błonie

8. Białka błonowe + funkcje

9. Białka integralne i peryferyczne

10. Badanie białek błonowych

11. Co to są wyspy lipidowe

WYKŁAD VIII - TRANSPORT

1. Podział transportu

2. Rola antybiotyku w błonie (duża karuzela i mała)

3. Dyfuzja prosta i ułatwiona

4. Kinetyka transportu biernego

5. Kanał sodowy - budowa i mechanizm działania

6. Kanał potasowy - budowa i mechanizm działania

7. Kanał receptora acetylocholinowego

8. Co to są szczeliny i do czego służą?

9. Transport aktywny

10. Pompa sodowo-potasowa - budowa i działanie

11. Budowa i działanie pompy zależnej od jonów wapnia

12. Transport bez ATP - coś tam z antyportem

13. Endocytoza i egzocytoza

WYKŁAD IX - POBUDLIWOŚĆ KOMÓRKI NERWOWEJ

1. Budowa komórki nerwowej

2. Co to jest potencjał spoczynkowy? Jak się go bada? Czego dotyczy?

3. Potencjał dyfuzyjny - równowaga jonowa

4. Potencjał czynnościowy

5. Fazy potencjału iglicowego

6. Mechanizm powstawania potencjału czynnościowego

7. Jak się zmienia przepuszczalność dla kationów komórki pobudzonej

8. Co to jest kanał zależny od napięcia - budowa i działanie

9. Bramkowanie bezpośrednie i pośrednie

10. Synapsy aktywujące i hamujące

WYKŁAD X - ULTRASONOGRAFIA

1. Na czym polega odwrotny efekt piezoelektryczny

2. Na czym polega efekt Dopplera

3. Na czym polega prezentacja typu A?

4. Ograniczenia ultrasonografii, co to jest cień akustyczny i efekt powtórzenia echa

WYKŁAD XI - TOMOGRAFIA KOMPUTEROWA

1. Sposoby otrzymywania promieniowania rentgenowskiego, widmo charakterystyczne i ciągłe

2. Pochłanianie promieni X przez materię - prawo Lamberta

3. Jednostka Hounsfielda

4. Co to jest rozdzielczość TK i od czego zależy?

---