CHOROBY CZŁOWIEKA POWODOWANE PRZEZ DROBNOUSTROJE:
- zapalenie jelit: Escherichia coli
- zatrucia, salmonella - Salmonella enteriticlis
- zatrucia pokarmowe - Bacillus cereus, Clostridium perfrigens
- botulizm - Clostridium botulinum
- tężec - Clostridium tetani
- cholera i czerwonka - Vibrio cholerae, Shigella dysynteriae
- rzeżączka i kiła - Neisseria gonorrhoeae, Treponema pallidum
- choroba legionistów - Legionella pneumophila
- ostre zapalenie gardła - Streptococcus pyogenes
- borelioza - Borellia burgdorferi
- wrzody żołądka - Helicobacter pylori
- trąd - Mycobacterium leprae
- dżuma - Yersinia pestis
PROKARYOTA:
- BRAK:
* typowego jądra komórkowego
* organelli związanych z wytwarzaniem energii (chloroplasty, mitochondria, lizosomy)
* złożonych systemów błon wewnętrznych (retikulum endoplazma tyczne, aparat Golgiego związany z syntezą i sortowaniem białek)
* zamiast jądra - nukleoid (nieobłoniony aparat jądrowy zbudowany z dużego, spiralnie zwiniętego chromosomu - genoforu, z DNA)
* podział materiału genetycznego BEZ MITOZY BRAK TYPOWEGO JĄDRA
* transfer informacji genetycznej: koniugacja, transformacja, transdukcja
- rybosomy małych rozmiarów
- mureina w ścianie komórkowej (wrażliwa na działanie lizozymu - muramidaza)
- rzęski u niektórych prokaryota
- niektóre bakterie - zdolność do wytwarzania endospor (przetrwalników) odpornych na temperaturę i niekorzystne warunki/czynniki środowiska
- fotosynteza związana z systemem błon i pęcherzyków występujących w cytoplazmie
- rozmnażanie - bezpłciowe, przez podział
EUKARYOTA:
- komórki podzielone błonami wewnętrznymi na przedziały (błony przenoszą informację, związki pośrednie w metabolizmie oraz produkty końcowe metabolizmu od miejsca ich syntezy do miejsca wykorzystania)
- jądro otoczone błoną jądrową, zawiera DNA, więcej niż jeden chromosom, mitochondria, chloroplasty, organelle błonowe, lizosomy, peroksysomy, cytoszkielet zbudowany z mikrotubul oraz plazmidy (u drożdży i niektórych grzybów)
- wici mają złożoną budowę o układzie mikrotubularnym (9+2)
- komórki dzielą się przez mitozę
- wymiana informacji genetycznej zachodzi podczas rozmnażania płciowego
- mejoza komórki haploidalne mogą się łączyć
MEJOZA - podział komórki diploidalnej, powstanie 4 komórek haploidalnych.
Podział mejotyczny - tylko komórki macierzyste gamet i zarodników.
EUKARYOTA ZAWIERA KRÓLESTWA:
- Protozoa - pierwotniaki
- Chromista - grzybopływki
- Fungi - grzyby
- Algae - glony
- Plantae - rośliny
- Animalia - zwierzęta
WIRUSY:
Pasożyty bezwzględne = wewnątrzkomórkowe. Pasożyty bakterii, roślin i zwierząt (wśród najmniejszych znanych czynników chorobotwórczych) bez własnej przemiany materii.
Zakaźna cząstki nukleoproteidowe NAMNAŻAJĄ SIĘ kosztem substancji żywych komórek, które ulegają dezorganizacji.
Wirusy zawierające DNA : poxwirusy (ospa), herpeswirusy (opryszczka), adenowirusy (guzy)
NAMNAŻANIE SIĘ WIRUSÓW:
Kwas nukleinowy = genom wirusów
Kod genetyczny wirusa = informacja genetyczna struktura wirusa
Informacja genetyczna = kilka lub kilkadziesiąt genów
Kwas nukleinowy otoczony płaszczem białkowym = kapsydem (wiele identycznych podjednostek białkowych = kapsomerów)
Białka kaprysu = specyficzne enzymy, tzw. Replikazy (niezbędne do utworzenia wirusa)
NAMNAŻANIE SIĘ WIRUSÓW:
- replikacja wirusowego kwasu nukleinowego (transkrypcja)
- biosynteza białka kapsydu (translacja)
- montaż wirionów
KAPSYD - czasem otoczony bezkształtną lub ściśle przylegającą osłonką glikoproteinowo-lipidową. Osłonka może zawierać peplomery - wypustki tworzące frędzle wokół cząstki wirusa.
Kompletna nukleoproteidowa cząstka wirusa - WIRION BIAŁKA
ZADANIA KAPSYDU:
- ochrona kwasu nukleinowego
- rozpoznanie właściwego gospodarza
- andorpcja i wprowadzenie wirusa do wnętrza komórki żywiciela
- indukowanie wytwarzania przeciwciał w organizmach zwierząt stałocieplnych
PRZENOSZENIE I PRZEMIESZCZANIE SIĘ WIRUSÓW ROŚLINNYCH:
w sposób BIERNY:
- mechanicznie - drobne rany, uszkodzenia, np. ocieranie się liści, zabiegi pielęgnacyjne, powierzchnia ciała zwierząt
- przeniesienie wirusa z pyłkiem - przenika do zalążni, następnie do zarodka
- w glebie - zrosty korzeni, owady, nicienie, grzyby
przez WEKTORY
- owady z kłująco-ssącym aparatem gębowym (mszyce, rzadziej piewiki i czerwce)
- owady z gryzącym aparatem gębowym (rzędy: Homoptera, Heteroptera - pluskwiaki równoskrzydłe i różnoskrzydłe, Orthoptera - prostoskrzydłe, Coleoptera - chrząszcze, Diptera - dwuskrzydłe, Thysaneptera - przylżeńce i Lepidoptera - motyle)
SPOSOBY PRZENOSZENIA WIRUSÓW:
- nietrwały - infekowana tylko jedna roślina, wirusy przenoszone na kłujce
- trwały - infekowane wiele roślin, wirusy krążeniowe przewód pokarmowy mszycy przez ścianki jelit do hemolimfy gruczoł ślinowy i kłujka ze ścianą do rośliny zdrowej
Niektóre wirusy krążeniowe namnażają się w ciele wektora: wirusy krążeniowo-rozmnożeniowe.
OBJAWY CHORÓB WIRUSOWYCH (WIROZ) NA ROŚLINACH:
- zniekształcenia: zahamowanie wzrostu, skarłowacenie, nitkowatość liści, bąblowatość i In.
- przebarwienia - mozaiki, staśmienie nerwów, chloroza nerwów
Zmienność wirusów: Wiriony jednego gatunku mogą różnić się genetycznie (mutacja, rzadziej rekombinacja genetyczna, pseudorekombinacja, maskowanie genomu).
MUTACJA - zmiany w strukturze kwasu nukleinowego; brak (wypadnięcie) jednego lub kilku nukleotydów, obecność (włącznie się w nić kwasu nukleinowego) dodatkowych nukleotydów
IDENTYFIKACJA WIRUSÓW:
METODA BIOLOGICZNA: rośliny testowe, rośliny wskaźnikowe; reakcja na zakażenie określonym gatunkiem wirusa:
- wyraźne i charakterystyczne (specyficzne) objawy chorobowe
METODA WŁAŚCIWOŚCI FIZYCZNYCH: rośliny testowe, rośliny wskaźnikowe; właściwości fizyczne wirusa w soku rośliny, bez struktury komórkowej:
- punkt termicznej inaktywacji - najniższa temperatura, w której wirus traci infekcyjność w ciągu 10 min (40-90 st.)
- punkt ograniczonego rozcieńczenia - największe rozcieńczenie soku roślinnego, w którym wirus zachowuje infekcyjność
- trwałość in vitro - największa liczba godzin, po której wirus w soku roślinnym zachowuje infekcyjność (kilka godzin do kilku tygodni)
METODA BEZPOŚREDNIEJ OBSERWACJI: mikroskop elektronowy
- mikroskopia immunoelektronowa
- kriomikroskopia elektronowa (szybkie zamrażanie wirusów w płynnym etanie przed umieszczeniem obiektu na siatce węglowej)
- badanie ultrastruktury - technika dyfrakcji promieni x
METODA SEROLOGICZNA: kapsyd = antygen; po wprowadzeniu bezpośrednio do krwi zwierzęcia stałocieplnego tworzenie specyficznych białek we krwi
Przeciwciała pobierane z osocza krwi - surowica do testów serologicznych.
Przeciwciało + określony wirus białko surowicy + białko otoczki wirusa reakcja specyficzna.
Nieoczyszczony sok zawirusowanej rośliny + przeciwciała reakcja aglutynacji (zlepianie)
Oczyszczony sok zawirusowanej rośliny + przeciwciała reakcja precypitacji (zmętnienie)
Przeciwciała z surowicy łączą się tylko z białkiem jednego kapsydu.
METODA HYBRYDYZACJI: hybrydyzacja z sondami molekularnymi cDNA lub cRNA znakowanymi radioaktywnym P (lub biotyną albo fotobiotyną)
METODA MOLEKULARNA: budowa kwasów nukleinowych rdzenia:
- ekstrakcja - obecność DNA (RNA) metodą elektroforezy na żelu poliakrylamidowym
- amplifikacja kwasów nukleinowych - łańcuchowa reakcja polimerazy
- porównanie sekwencji nukleotydów ze wzorem
BAKTERIOFAGI - wirusy bytujące w komórkach bakteryjnych
BAKTERIE:
- BRAK:
* typowego jądra komórkowego
* organelli związanych z wytwarzaniem energii (chloroplasty, mitochondria, lizosomy)
* złożonych systemów błon wewnętrznych (retikulum endoplazma tyczne, aparat Golgiego związany z syntezą i sortowaniem białek)
* zamiast jądra - nukleoid (nieobłoniony aparat jądrowy zbudowany z dużego, spiralnie zwiniętego chromosomu - genoforu, z DNA)
* podział materiału genetycznego BEZ MITOZY BRAK TYPOWEGO JĄDRA
* transfer informacji genetycznej: koniugacja, transformacja, transdukcja
- rybosomy małych rozmiarów
- mureina w ścianie komórkowej (wrażliwa na działanie lizozymu - muramidaza)
- rzęski u niektórych prokaryota
- niektóre bakterie - zdolność do wytwarzania endospor (przetrwalników) odpornych na temperaturę i niekorzystne warunki/czynniki środowiska
- fotosynteza związana z systemem błon i pęcherzyków występujących w cytoplazmie
- rozmnażanie - bezpłciowe, przez podział
IV kategorie:
- bakterie gramujemne
- bakterie gramdodatnie
- bakterie bez ściany komórkowej
- archebakterie
I i II kategoria - BUDOWA:
- otoczka śluzowa
- rzęski
- fimbrie
- ściana komórkowa
- błona cytoplazmatyczna
- cytoplazma
KSZTAŁT - bakterie właściwe:
- kulisty (ziarniaki)
- pałeczkowaty (Bacterium) i laseczkowaty (Bacillus - endospory tlenowe, Clostridium - endospory beztlenowe)
- przecinkowaty (Vibrio)
- krętki (Spirillum)
TYPY URZĘSIENIA BAKTERII:
- JEDNORZĘSKOWE - monotrychalne
- WIĄZKORZĘSKOWE - fototrychalne
- DWURZĘSKOWE - ditrychalne/amfitrychalne
- OKOŁORZĘSKOWE - perytrychalne
Identyfikacja bakterii - kryteria : morfologiczne, biochemiczne, serologiczne, genetyczne.
FITOPLAZMY - CHOROBY ROŚLIN:
Objawy: żółtaczki czerwienne, drobnienie liści, zahamowanie wzrostu, proliferacja pędów, czarcie miotły, sterylność kwiatów
Budowa: brak ściany komórkowej, 3-warstwowa błona, rybosomy, nić DNA
Kształt: pleomorficzne, kuliste, jajowate, rurkowate do nitkowatych
Wymiary: średnica 175-250 nm
Rozmnażanie: pączkowanie, podział
Infekcja: jedynie naturalna, wektory=skoczki
SPIROPLAZMY:
Objawy: drobnienie liści, zahamowanie wzrostu
Budowa: brak ściany komórkowej, rybosomy, nić DNA
Kształt: spiralne, nitkowate rozgałęzione, kuliste, owalne
Wymiary: średnica spiralnych: 100-200 nm, średnica kulistych: ok. 300 nm
Rozmnażanie: podział (po przewężeniu komórki)
Infekcja: jedynie naturalna, wektory=owady
PROCESY PARASEKSUALNE:
TRANSFORMACJA - pobranie wolnego DNA ze środowiska, włączenie do genomu bakterii
KONIUGACJA - przekazywanie materiału genetycznego z komórki dawcy do komórki biorcy
TRANSDUKCJA - przeniesienie DNA przez bakteriofaga z jednej komórki bakteryjnej do drugiej
TRANSFEKCJA - wprowadzenie DNA bakteriofaga do komórki bakterii i włączenie do genomu bakterii
GRZYBY:
Budowa:
- grzybnia
- ściana komórkowa - chityna
- wnętrze komórki
- ergosterol w błonie komórkowej
Odżywianie się grzybów: heterotrofy, sapotrofy, pasożyty względne/bezwzględne
Rozmnażanie się: zarodniki płciowe/bezpłciowe.
Grzyby właściwe:
Plecha strzępki
Grzybnia mycelium
Zarodnik spora
Przetrwalnik sklerota = sklerocium
Proces płciowy - 3 etapy:
Zespolenie plazmy - plazmogamia
Zespolenie jąder - kariogamia
Podział redukcyjny jądra
Mikoryza - grzybokorzeń; obligatoryjne symbionty mikoryzowe, brak rozmnażania płciowego, plecha wielojądrowa
Mikoroza arbuskularna - współżycie korzeni roślin z grzybami z gromady Glomeromycota, które są obligatoryjnymi symbiontami mikoryzowymi. Strzępki wnikają międzykomórkowo do środkowej i wewnętrznej kory korzenia, a następnie tworzą arbuskule, tj. krzaczasto rozgałęzione strzępki grzyba wewnątrz komórek, występuje u większości znanych roślin.
GAMETANGIOGAMIA - proces płciowy polegający na połączeniu się gametangiów
GAMETOGAMIA - proces płciowy polegający na połączeniu się gamet
GAMETANGIUM - wielojądrowa komórka zawierająca gamety lub jądra haploidalne, które funkcjonują jako gamety.
GRZYBY:
Organizmy cudzożywne, których ciało tworzy plechę. Środowisko życia - teren wilgotny.
Celuloza w ścianie komórkowej
Budowa:
Grzybnia zbudowana ze strzępek jedno- lub wielokomórkowych.
- grzybnia wytwarzać może owocniki - twory służące do reprodukcji (kapelusz, miseczka, kula)
- ściana zbudowana z chityny
- komórki zawierają jądro, mitochondria, retikulum endoplazma tyczne, rybosomy, lizosomy, aparat Golgiego
- w komórkach barwniki nieczynne fotosyntetycznie - nadają grzybni charakterystyczne zabarwienie
Odżywianie:
- organizmy heterotroficzne - nie potrafią syntezować związków organicznych
*saprobionty - odżywiają się martwą materią organiczną: saprofity (szczątki roślinne), saprofagi (szczątki zwierzęce)
* pasożyty - czerpią związki organiczne z ciała gospodarza, mogą wywoływać choroby
* symbionty - wchodzą we współżycie z obopólną korzyścią (symbioza z korzeniami drzew - mikoryza)
Oddychanie:
- tlenowe - u większości. Cząsteczka pokarmowa zostaje rozłożona na H2O i CO2 z wytworzeniem energii w postaci ATP.
- beztlenowe - z cząsteczki glukozy powstaje etanol, CO2 i ATP. Jest to proces fermentacji alkoholowej.
Rozmnażanie:
- BEZPŁCIOWE - przez zarodniki (spory), wytworzone w zarodniach
- WEGETATYWNE - podział organizmów jednokomórkowych/fragmentacja wielokomórkowej grzybni
- PŁCIOWE - koniugacja dwóch strzępek o odmiennym genetycznie typie płciowym. Strzępki stykają się, zrastają, a ich jądra zlewają się tworząc haploidalna zygotę.
Znaczenie:
- rozkład martwych szczątków organicznych - uwolnienie pierwiastków wbudowanych w związki organiczne, możliwość ponownego ich wykorzystania przez organizmy żywe
- użyźnianie gleby
- wchodzą w symbiozę z korzeniami (90% drzew wymaga obecności grzyba do prawidłowego rozwoju i funkcjonowania)
- pasożyty - hamowanie wzrostu, śmierć
- pasożyty zwierząt i ludzi
OWOCNIKI:
Ascomycetes
- otocznia zamknięta - kleistotecjum: Aby zarodniki się wydostały kleistotecjum musi zostać uszkodzone, bo otocznia nie posiada własnego otworu.
- otocznia otwarta: Worki dojrzewają nierównomiernie. Ten, który dojrzeje wyrzuca zarodniki, obumiera i jest poddawany trawieniu.
- miseczka: Miseczka może się zamykać i otwierać, w zależności od warunków. Jest to najbardziej wyrafinowany sposobów wytwarzania i uwalniania zarodników, ponieważ uwalniane są tylko w dobrych warunkach
*stojąca
*siedząca
- pseudotecjum: W jednej wspólnej podkładce występuje dużo małych zarodników - komór otwartych.
- owocniki gymnokarpiczne: Owocniki otwarte. Za młodu mają zamknięte kapelusze, co chroni zarodniki. Dopiero po otwarciu się wysypują.
- owocniki angiokarpiczne: Owocniki zamknięte. Muszą zostać zniszczone, by zarodniki się wydostały.
HISTORIA MIKROBIOLOGII:
- Starożytność/średniowiecze: brak rozwoju
Arystoteles: Teoria samorództwa. Powstawanie organizmów żywych z materii nieożywionej.
Odrodzenie: XV w. wynalezienie druku, odkrycie Ameryki, towarzystwa naukowe
XVI w. - gwałtowny rozwój nauk przyrodniczych
Antonie van Leeouwenhoek (1632-1723) - wynalazca mikroskopu
Ernest Abbe i Carl Friedrich Zeiss - współczesny mikroskop z oświetleniem
Ludwik Pasteur: Definitywnie obalił teorię samorództwa. Każdy osobnik istoty żywej może powstać jedynie z innego osobnika.
POSTULATY KOCHA:
Kryteria wymagane dla niezbitego udowodnienia, że określony mikroorganizm wywołuje określoną chorobę zakaźną.
Stałe występowanie drobnoustroju w organizmie dotkniętym chorobą = związek
mikroba z objawami.
Wyosobnienie tego drobnoustroju z chorego organizmu i jego hodowla w czystej
kulturze.
Ponowne zakażenie organizmy tym drobnoustrojem i wywołanie tej samej choroby z
właściwymi jej objawami.
Ponowne wyosobnienie tego drobnoustroju z chorego organizmy i jego hodowla w
czystej kulturze oraz stwierdzenie jego identyczności z pierwotnie wyizolowanym i
użytym do sztucznej infekcji.
HIPOTEZY NA TEMAT POCHODZENIA WIRUSÓW I ICH MIEJSCA W ŚWIECIE:
HIPOTEZA 1: Prymitywne istoty żywe, powstałe w początkach formowania się życia na Ziemi, które przetrwały do naszych czasów, chroniąc się w komórkach innych organizmów.
HIPOTEZA 2: Uproszczone formy pasożytnicze, powstałe w wyniku ewolucji z form bardziej skomplikowanych.
HIPOTEZA 3: Fragmenty genoforu gospodarza, który uległ autonomizacji, czyli wyodrębnił się w osobną strukturę, zdolną do powielania i rozprzestrzeniania.
ZMIENNOŚĆ WIRUSÓW:
rekombinacja genetyczna - w komórce, w której namnażały się różne szczepy wirusa utworzenie nici kwasu nukleinowego z elementów wchodzących w skład kwasów różnych szczepów
pseudorekombinacja - u wirusów o podzielonym genomie: wymiana homologicznych komponentów różnych szczepów wirusa całym kapsydem innego szczepu
maskowanie genomu - całkowita zmiana kapsydu otaczanie się kwasu nukleinowego jednego szczepu wirusa całym kapsydem innego szczepu
mieszańce fenotypowe - otaczanie się kwasu nukleinowego wirusa kapsydem złożonym z elementów białkowych różnych szczepów
ODDYCHANIE TLENOWE I BEZTLENOWE:
TLENOWE:
proces utleniania (głównie cukrów, białek i tłuszczów) pod wpływem enzymów, podczas którego powstają produkty finalne: dwutlenek węgla i woda oraz uwalniana jest energia. Oddychanie tlenowe jest wielostopniowym procesem redoks, w którym wodór jest przenoszony z glukozy na tlen. Glukoza jest utleniana, natomiast tlen ulega redukcji. Uproszczona reakcja ma następujący przebieg: C6H12O6 + 6O2 + 6H2O
6CO2 + 12H2O +energia (ATP). Energia potencjalna elektronów atomów wodoru jest wykorzystywana do syntezy ATP. Proces utleniania glukozy jest jednak bardzo złożony i wyróżnia się cztery jej etapy w procesie oddychania tlenowego: glikoliza (rozkład glukozy na dwie cząsteczki pirogronianu i powstanie NADH i ATP; każda reakcja w procesie glikolizy jest katalizowana przez specyficzny enzym), tworzenie acetylo-CoA (utlenienie pirogranianu do dwuwęglowej cząsteczki octanu, który łączy się z koenzymem A i tworzy acetyl-CoA, a przy tym zostaje uwolniony dwutlenek węgla i NADH), cykl kwasu cytrynowego (ciąg reakcji, podczas których grupa acetylowa z acetylu-CoA jest degradowana do CO2 i uwalnia się wodór), system transportu elektronów i chemiosmoza.
BEZTLENOWE:
Oddychanie beztlenowe jest to proces utleniania związków organicznych odbywające się w warunkach beztlenowych. Najczęściej utlenianiu ulega glukoza, natomiast pierwszym etapem jest glikoliza (podobnie jak w oddychaniu tlenowym). Następnie ma miejsce utlenianie dinukleotydów zredukowanych podczas glikolizy. Jest ona jedynym źródłem energii w tym procesie. W warunkach braku dostępu tlenu nie odbywa się łańcuch oddechowy. Utlenianie dinukleotydów zachodzi przy udziale innych związków organicznych niż w oddychaniu tlenowym.