BIOCHEMIA
Biochemia- jest nauką badającą przemiany chemiczne i energetyczne procesów życiowych przebiegających w komórce.
Biochemia jest nauką dotyczącą chemicznych podstaw życia.
Biochemia zajmuje się:
Badaniem mechanizmu reakcji chemicznych w komórce,
Sposobem gromadzenia, magazynowania i użytkowania energii w procesach przebiegających z jej zmianami,
śledzeniem mechanizmów cząsteczkowych dziedziczenia cech, stanowiących podstawę zachowania gatunku i zmian ewolucyjnych,
Badaniem mechanizmu regulacji przemian komórkowych,
Badaniem metabolitów transportowanych przez błonę komórkową i cytoplazmatyczną
Prawidłowo zachowane procesy biochemiczne w organizmie są podstawą zdrowia.
Zdrowie- jest to pełny dobrostan fizyczny, psychiczny i społeczny a nie wyłącznie brak choroby lub niedomaganie.
Choroba- jest manifestacją zaburzeń w cząstkach reakcji chemicznych i procesów zachodzących w organizmie.
Główne czynniki chorobowe:
Fizyczne,
Chemia,
Biologiczne,
Brak tlenu,
Reakcje immunologiczne,
Wady genetyczne,
Zaburzenia w odżywianiu,
Zachwianie równowagi wewnątrz komórkowej.
Biochemia pomaga w diagnozowaniu, prognozowaniu i leczeniu.
Pierwiastki, z jakich zbudowane są organizmy:
Węgiel- C,
Wodór- H,
Tlen- O,
Azot- N,
|
% wagowe |
% w przeliczeniu na suchą masę |
Tlen |
63 |
20 |
Węgiel |
20 |
50 |
Wodór |
10 |
10 |
Azot |
9,1 |
8,5 |
wapń |
1,5 |
4 |
fosfor |
1 |
2,5 |
potas |
0,25 |
1 |
Siarka |
0,2 |
0,8 |
Sód |
0,15 |
0,4 |
Magnez |
0,04 |
0,1 |
żelazo |
0,004 |
0,01 |
Mangan |
0,001 |
0,00005 |
99% C, H, O, N + fosfor, wapń
0,9% potas, sód, siarka, magnez
0,1% to pierwiastki śladowe np. żelazo, miedz, cynk, fluor, selen itp.
Wysokotoksyczne: arsen, bor, beryl, kadm, ołów, rtęć, srebro, tal, tor.
C, H, O, N- Biomolekuły- części stanowe: węgiel, tlen i azot wykazują zdolności tworzenia wiązań wielokrotnie. Związki z nich powstałe są bardzo trwałe.
Fosfor- wchodzi w skład kwasów nukleinowych w formie zjonizowanej w całym organizmie.
Wapń- bierze udział w licznych procesach biologicznych.
Główne komponenty organizmu ludzkiego: organizm składa się:
Człowiek 65 kg
Woda 61,6%- 40 kg
Białko 17%- 11kg
Tłuszcze 13,8%- 9 kg
Węglowodany 1,5%- 1 kg
Składniki mineralne 6,1%- 4 kg
Woda- występuje we wszystkich tkankach naszego organizmu, w różnych ilościach (krew 80%, mięśniowe 73%, tłuszczowa 25%, kości 10%).
2/3 wody to woda wewnątrzkomórkowa.
1/3 wody to woda pozakomórkowa (osocze)
H2O 2H+ + OH-
H2O H3O+ + OH-
Woda występuje w formie słabo zjonizowanej.
Naczynia krwionośne i błona komórkowa- przepuszczają wodę.
Woda- jest bardzo dobrym rozpuszczalnikiem dla większości związków chemicznych:, ponieważ cząsteczka wody wykazuje dipolarny charakter i zdolność tworzenia wiązań wodorowych.
Dipol- cząsteczka, w której ładunek elektryczny jest nierównomiernie rozłożony.
Wiązanki wodorowe- oddziaływanie elektryczne pomiędzy jądrem wodoru jednej cząsteczki a parą elektronów drugiej cząsteczki.
Woda- jest środkiem transportu, rozprowadza wszystkie składniki organiczne i nieorganiczne po całym organizmie do wszystkich komórek na zasadzie transportu biernego ( osmoza, dyfuzja) i aktywnego (pobiera energię ze związku ATP- adenozynotrifosforan).
Woda jest niezbędna do procesów przemiany materii, usuwa z organizmu produkty toksyczne, uczestniczy w trawieniu, przesuwanie masy kałowej, reguluje ciepłotę ciała.
Organizmy wielokomórkowe pobierają wodę z pożywieniem oraz z utleniania biologicznego, którego końcowym produktem jest woda.
Nadmiar wody usuwany jest z organizmu z moczem przez nerki, oddychanie, pocenie się.
Niedobór wody na skutek nadmiernego wydalenia.
Białka- są zbudowane z aminokwasówAminokwasy mogą jeszcze zawierać grupę hydroksylową, siarkowodorową, pierścień cykliczny lub heterocykliczny.
Węgiel hilarny- ma cztery podstawki.
C*- (węgiel asymetryczny) wtedy aminokwas może posiadać dwa izomery optyczne: L- D.
Ludzki organizm jest zbudowany wyłącznie z L- α aminokwasów.
Organizm zbudowany jest wyłącznie z 20 aminokwasów, ( z czego 10 jest niezbędnych) organizm wykazuje zdolności syntezowania pozostałych.
Duża rozpuszczalność aminokwasów w wodzie, a mała w rozpuszczalnikach organicznych niepolornych świadczy o tym, że aminokwasy są o strukturze jonowej
I w środowisku kwasowym występuje jako formy zasadowe (kationowe)
II w środowisku zasadowym występuje w formie kwasowej (anionowej)
III forma jonu obojętnego.
Punkt izoelektryczny- wartości pH, przy której istnieje równowaga między I i II formą i roztwór jest wysycony jonem obojnaczym.
Jednoczesna oboczność kwasowej grupy karboksylowej, a zasadowej grupy aminowej sprawia, że aminokwasy są zawiązkami: AMFOTERYCZNYMI.
Aminokwasy alifetycznya łańcucha bocznymi:
Glicyna
Alanina
Walina
Leucytna
Izolentycyna.
Aminokwasy z łańcuchem bocznym zwana gr. Hydroksylowe:
Seryna
Treonina
Tyrozyna
Aminokwasy z łańcuchem bocznym zwane octem siarki
Cystenia
Metionina
Aminokwasy łańcuchem bocznym zwane grupy kwaśne lub i odmiany:
Kwas asferginowy aswargina
Kwas gluteinowy glutanina
Aminokwasy z łańcuchem bocznym zwane grupy zasadowe
Arganina
Lizyna
Histydyna
Aminokwasy z łańcuchem bocznym pierścień aromatyczny
Histydyna
Fetyloalanina
Tyrozyna
Tryptofan
Aminokwasy
Prolina
Znaczenia biomedyczne:
Aminokwasy dzieli się na:
Egzogenne: to takie, które muszą być dostarczane do organizmu wraz z pożywieniem, ponieważ organizm nie jest w stanie syntezować tycz aminokwasów, np.: walina, lecytyna, izolecytyna, treonina, nefionina, lizyna.
Egrodenne (gotowe w organizmie).
W utworzonych białkach aminokwasy pełnią funkcję: strukturalne, hormonalne, katalitarne, biosynteza mocznika, przenoszą impulsy, wzrost komórek.
Pedyty- (2 lub więcej aminokwasów)
W organizmie znajdują się związki o charakterze peptydów spełniają różnorodne funkcje m.in. hormonów, koenzymów (insulina).
Białka- są zbudowane z wielu aminokwasów, są wielocząsteczkowe o dużej masie cząsteczkowej.
Zbudowane z węgla, siarki, azotu, tlenu, wodoru, żelaza, fosforu, cyny, miedzi, magnezu, jodu.
Podział:
Budowa,
Kształt cząsteczki,
Funkcja biologiczna,
Klasyfikacja białek według funkcji biologicznych:
Strukturalne (kolagen, elastyna)
Enzymy
Ochronne (immunoglobina)
Transportowe (hemoglobina- tlen, transferyna- żelazo, lipoproteiny- lipidy)
Białka biorące udział w skurczu mięśni (ektyna, miozyna)
Białka hormony (insulina, glukagon)
Białka błony komórkowej (glikoproteidy)
Białka hemowe- Mioglobina i Hemoglobina.
Białka hemowe- biorą udział w transporcie i magazynowaniu tlenu, transportują również elektrony, biorą udział w fotosyntezie.
Główny element budowy mioglobiny i hemoglobiny jest hem- cykliczny.
Żelazo, jeżeli przejdzie z 2 do 3 stopni utlenienia (Fe2+ Fe3+)to mioglobina i hemoglobina tracą aktywność biologiczną.
Mioglobina- to funkcja magazynowania tlenu w mięśniach. W wypadku braku tlenu. Podczas reakcji utleniania tlen wiąże się z Fe i zajmuje 6 pozycji wiązaniem koordynującym. Ilość przyłączonego tlenu do mioglobiny zależy od jego stężenia w najbliższym otoczeniu żelaza hemowego.
Hemoglobina- zawarta w erytrocytach spełnia dwie funkie: przenosi tlen z płuc do komórek i przenosi, CO2 z komórek do płuc w celu wydalenia. 2H2CO3 = 2CO2+2H2O
W powstających tkankach, CO2 łączy się z H2O tworząc kwas węglowy. Nie utlenowana hemoglobina wiąże protony i transportuje je do płuc. W płucach w wyniku przyłączania tlenu następuje zwalnianie protonów, które łączą się z jonem wodorotlenowym tworząc kwas wodorotlenowy. Przekształcony przez dedytorozę węglową, do CO2 usuwanego w procesie oddychania. Stąd wiązanie tlenu zwiększa wydalanie, CO2 z powietrza wydychanego. To odwrotne zjawisko nosi nazwę Efektu Borha.
Lipidy- są heterogenną grupą związku. Charakteryzują się względną nierospuszczalnością w wodzie, rozpuszczają się w rozpuszczalnikach polarnych.
Lipidy proste:
Tłuszcze- właściwie są to estry glicerol i kwas tłuszczowy
Wosk- estry kwasów tłuszczowych długo łańcuchowym alkoholem monhydroksylowym.
Lipidy złożone:
Fosfolipidy- złożony z glicerolu, kwasu tłuszczowego(nasycony, nienasycony), reszta kwasu fosforowego H3PO4
Synteza fosfolipidów zachodzi w komórkach wątroby. Z wątroby przechodzi do krwi jako składnik glikoprotein i do żółci jako składnik kwasu żółciowego. Fosfolipidy są głównym elementem błony komórkowej, bardzo dużo w tkance mózgowej, szarej substancji mózgu 30% (1,2- 4 mmol/l)
Glikolipidy- są zbudowane z kwasu tłuszczowego, fingozyny, węglowodanów, są składnikami tkanki nerwowej i błony komórkowej.
Lipoproteiny- to kompleksy białkowo- lipidowe, transportują nierozpuszczalne w wodzie lipidy.
Funkcje:
Chilomikony- występują po zjedzeniu tłustych potraw, transportują triglicerydy.
Lipoproteiny- o bardzo niskiej gęstości VLDL- powstają w wątrobie transportują triglicerydy z wątroby do nerek.
Lipoproteiny- o niskiej gęstości LDL- powstają w osoczu, transportują cholesterol z wątroby do komórek (funkcja miażdżycowa).
Lipoproteiny- o wysokiej gęstości HDL- powstają w wątrobie w ścianie jelita cienkiego, w osoczu, transportują cholesterol z tkanek do wątroby (funkcja oczyszczająca).
Prekursor i pochodzenie lipidów:
Kwas tłuszczowy
Glicerol
Sterole
Witaminy rozpuszczalne w tłuszczach
Hormony
Przykładowym sterolem jest cholesterol- występuje w tkankach lub lipoproteinach osocza, jako cholesterol wolny albo w połączeniu z kwasem tłuszczowym jako ostry cholesterol.
Najwięcej cholesterolu znajduje się w: wątrobie, skórze, obwodowym układzie nerwowym.
W naszym organizmie cholesterol jest syntezowany z acetylokoenzymem, ostatecznie usuwany, wydalany z żółcią lub w solach kwasu żółciowego.
Cholesterol - jest prekursorem kwasu żółciowego, hormonów sterydalnych, witaminy D, a ponadto jest bardzo ważnym środowiskiem błony komórkowej.
Stężenie cholesterolu w organizmie jest różne.
Kwasy Tłuszczowe - występują w pokarmie w formie estryfikowanej a w organizmie jako wolne kwasy tłuszczowe w formie nie estryfikowanej.
Nasycony kwas octowy CH3C-CH2-OH
Nasycone spożywane w większych ilościach przyczyniają się do rozwoju miażdżycy i chorób nowotworowych gruczołu piersiowego i prostaty.
Kwasy nienasycone:
jednonienasycone
wielonienasycone
Kwas olejowy C18:1n-9 (w profilaktyce miażdżycy jest dobry)
Kwas ten powoduje zmniejszenie frakcji lipidów LDL a podnosi stężenie frakcji HDL.
Wielonasycone:
Kwas linolowy C18:2n-6 Kwas α- linoleinowy C18:3n-3
Kwas gama lindenowy C18:3n-6 Kwas ekozapentaynowy C20:5n-3
Kwas arachidowy C20:4n-6 Kwas dokozeheksaenowy
Kwas kozapentaenowy C22:5n-6
Wielonienasycone kwasy tłuszczowe z grupy n-6 obniżają stężenie cholesterolu całkowitego i frakcji NEDE.
Natomiast kwasy tłuszczowe z grupy n-3 obniżają stężenie tryjglicerydów, hamują powstawanie zakrzepów w naczyniach krwionośnych, obniżają ciśnienie krwi, zapobiegają arytmii.
Z wielu nienasyconych kwasów powstają biologiczne związki - eikozanoidy, w skład których wchodzą: prostaglandyny, prosta cykliny, tomboksynt, leukotrigeny.
Biorą udział w regulacji czynników układu sercowo-naczyniowego, w regulacji krzepnięcia krwi, ciśnienia tętniczego w funkcjach ośrodkowego i obwodowego układu nerwowego, układu pokarmowego, oddechowego i narządów rozrodczych.
Kwasy tłuszczowe mogą występować w 2 kombinacjach:
Związki biologiczne czynne. Źródła energii.
Węglowodany - zwane cukrami, sacharydami są zbudowane z węgla, wody i tlenu.
Dzielą się na:
monosaharydy - cukry proste w wyniku hydrolizy nie rozpadają się na prostsze związki (glukoza, fruktoza, ryboza)
disaharydy - w wyniku hydrolizy rozpadają się na dwa cukry proste (sacharoza, maltoza)
oligosaharydy - w wyniku hydrolizy rozpadają się na 2 -10 cząsteczek monosaharozy
poli sacharydy - które w wyniku hydrolizy rozpadają się na więcej niż 10 cukrów prostych
Źródła glukozy:
węglowodany pożywienia
wewnątrz komórkowa synteza glukozy
rozpad glikogenu wątrobowego
Hormony:
nor adrenalina
adrenalina
glukogen
hormon wzrostu - wpływa za zwiększenie glukozy we krwi
insulina - działa obniżając na glukozę
Insulina zwiększa odkładanie glikogenu wątrobowego i zwiększa szybkość przenikania glukozy z płynu zewnątrz komórkowego do wnętrza komórki, ponadto zwiększa biosyntezę białek a hamuje ketogenezę i glukoneogeneze .
Poziom glukozy we krwi (na czczo) 70 - 110 mg%
Składniki Mineralne - należą do związków niezbędnych, egzogennych, stanowią one od 4 do 6% masy ciała.
Dzielą się:
makro elementy - kationy sodowe, potasowe, wapniowe, magnezowe, wodorowe
mikro elementy (pierwiastki śladowe) - aniony fosforowe, wodorowęglowe, jodowe, magnezowe, kobaltowe, cynkowe, molibdenowe, selenowe, chromowe, żelazowe, miedziowe
Witaminy - są to niskocząsteczkowe, substancje niezbędne w ilościach katalitycznych do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Pełnią najczęściej rolę koenzymów w różnych procesach biochemicznych lub modulatorów informacji genetycznej kodującej syntezę białek ustrojowych.
Podstawowe przemiany związków w organizmie.
Szlaki metaboliczne w organizmie:
anaboliczne - synteza związków tworzących strukturę ciała (synteza białek)
kataboliczne - dotyczą procesów oksydacyjnych, które uwalniają energię swobodną w postaci fosforanu
amfiboliczne - wykorzystują więcej niż jedną funkcję i biegną na skrzyżowaniu dróg metabolizmu (działają jako łącznik szlaków 1, 2 )
Schemat przemian katabolicznych.
Białka Lipidy Polisacharydy
L-aminokwasy Kwasy Tłuszczowe Monosacharydy (glukoza ) glikoliza
(deaminacja) (β-okzygacja) (likoliza)
Ketokwasy A cylo- koenzym A (CoA) Kwas pirogronowy
(utlenianie) (dekarboksylacja)
CYKL KLEPSA
(łańcuch oddechowy)
CO2 H2O
1