Podstawy Biologii Molekularnej

Ćwiczenia III dla kierunku Kosmetologia

I rok studia II stopnia

3.10.12

10.10.12

TEMAT: Zasady pracy w pracowni biologii molekularnej. Prezentacja pracowni i aparatury stosowanej w analizie kwasów nukleinowych zlokalizowanych w Katedrze i Zakładzie Biologii Molekularnej.

Cel: Zapoznanie studenta z zasadami pracy w pracowni biologii molekularnej i aparaturą stosowaną w analizie kwasów nukleinowych.

1. Przedstawienie założeń i programu przedmiotu `Biologia molekularna'.

2. Zapoznanie studentów z regulaminem pracowni biologii molekularnej.

3. Zapoznanie z zasadami bezpiecznego postępowania z substancjami szkodliwymi.

4. Prezentacja sprzętu i tematyki badań naukowych realizowanych w Katedrze i Zakładzie Biologii Molekularnej

• Zestaw aparatury do homogenizacji tkanek

• Zestaw aparatury do ekstrakcji kwasów nukleinowych oraz oceny jakościowej i ilościowej ekstraktów DNA i RNA

• Zestaw aparatury do amplifikacji kwasów nukleinowych in situ i in vitro

• Zestaw aparatury do rozdziału kwasów nukleinowych i białek

• Zestaw aparatury do wyznaczania transkryptomu (Affymetrix)

• Zestaw aparatury do sekwencjonowania kwasów nukleinowychestaw aparatury do hybrydyzacji kwasów nukleinowych

5. Prawidłowe posługiwanie się pipetą automatyczną

6. Test wagowy dokładności pipetowania

Zalecana literatura

Słomski R., Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu 2008 (str. 27 Najważniejsze odkrycia w diagnostyce molekularnej)

Podstawy Biologii Molekularnej

Ćwiczenia II dla kierunku Kosmetologia

I rok studia II stopnia

17.10.12

24.10.12

Pozyskiwanie kwasów nukleinowych z tkanek

Cel: Zapoznanie studenta z metodami ekstrakcji kwasów nukleinowych do analiz metodami biologii molekularnej.

Zadania do wykonania

1. Ekstrakcja kwasów nukleinowych:

1. metody ekstrakcji DNA i RNA,

2. celowość zastosowania określonych odczynników w ekstrakcji,

3. postępowanie z odczynnikami szkodliwymi,

4. zasady przechowywania ekstraktów RNA i DNA

5. rozwiązywanie problemów związanych z uzyskaniem dobrej jakości ekstraktów kwasów nukleinowych.

2. Ekstrakcja DNA z komórek z zastosowaniem kolumienek, zgodnie z instrukcją.

3. Zasady zabezpieczania materiału do badań molekularnych.

4. Zasady przechowywania ekstraktów RNA i DNA.

5. Rozwiązywanie problemów związanych z uzyskaniem dobrej jakości ekstraktów kwasów nukleinowych.

6. Inne metody ekstrakcji kwasów nukleinowych

Literatura

Słomski R., Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu 2008. Nazewnictwo wariantów sekwencji DNA RNA i białek str 30-40

Izolacja DNA i RNA str 40-60

Podstawy biologii molekularnej

Ćwiczenia III dla kierunku Kosmetologia

I rok studia II stopnia

31.10.12

7.11.12

DNA w kosmetykach i kosmeceutykach

Zadania do wykonania

1. Metody oceny zawartości DNA w badanym materiale

2. Ocena ilościowa ekstraktów RNA i DNA:

1. zasady obliczania stężeń kwasów nukleinowych na podstawie wartości absorbancji

2. współczynnik czystości kwasów nukleinowych.

2. Ocena ilościowa uzyskanego RNA i DNA

3. Interpretacja wyników oceny ilościowej

Literatura

Słomski R., Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu 2008 Ilościowa i jakościowa ocena preparatów DNA i RNA str. 60-84.

Podstawy Biologii Molekularnej

Ćwiczenia V dla kierunku Kosmetologia

I rok studia II stopnia

14.11.12

21.11.12

Polimorfizm genów kodujących białka uczestniczących w metabolizmie kosmeceutyków

Zadania do wykonania

1. Postępowanie z odczynnikami szkodliwymi wykorzystywanymi do oceny jakościowej kwasów nukleinowych.

2. Ocena jakościowa uzyskanych ekstraktów RNA i DNA

3. Interpretacja uzyskanych wyników oceny jakościowej - przykładowe elektroforegramy

Literatura

Słomski R., Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu 2008 Ilościowa i jakościowa ocena preparatów DNA i RNA str. 60-84.

-

Podstawy Biologii Molekularnej

Ćwiczenia VII dla kierunku Kosmetologia

I rok studia II stopnia

28.11.12

5.12.12

Ekspresja genów pod wpływem kosmeceutyków

Zadania do wykonania

1. Technika PCR

2. Rodzaje technik PCR

3. Zastosowanie techniki PCR do oceny ekspresji genów pod wpływem kosmeceutyków

4. Interpretacja wyników reakcji PCR

5. Real- time PCR

6. Bazy danych DNA i RNA

Poszukiwanie w bazie danych http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/ geny kodujące ludzkie białka macierzy pozakomórkowej (np. agrekan, kolagen)

Sprawdzenie podobieństwa i poszukiwanie sekwencji wspólnej w przypadku wielu sekwencji kodujących ten sam gen w bazie danych http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Literatura

Słomski R., Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu 2008