Koło 1
1.Narysuj związek,z którego pochodzi czapeczka znajdująca się na końcu 5'mRNA Eukariota.Podaj nazwy dwóch enzymów,które biorą udział w jej powstawaniu.
2.Wymień proces,w którym uczestniczy oraz podaj reakcję jaką katalizuje niżej podany enzym:
a)syntetaza aminoacylo-tRNA
b)peptydylotransferaza zależna od DNA
c)polimeraza RNA III
d)ligaza DNA
3.Narysuj antykodon 5'...IAU...Podaj trzy kodony ,z którymi może się on łączyć oraz nazwij wiązania,którymi antykodon łączy się z kodonem
4.Narysuj wzór i podaj nazwę :
a)związku ,który jest dawcą grupy metylowej
b)koenzymu aminotransferaz
5.Napisz ogólną reakcję katalizowaną przez hydratazę i hydroksylazę.Podaj klasę,do której należą oba
enzymy.
6.Przedstaw graficznie wpływ na kinetykę enzymatyczną
a)inhibitora niekompetycyjnego
b)inhibitora typu V
7.Narysuj i podaj nazwę nietypową nukleotydu wchodzącą w skład tRNA
8.Narysuj antykodon tRNA inicjujący proces translacji
9.Rysując wzory łańcuchów bocznych dowolnego aminokwasu ,narysuj 2 różne reakcje modyfikacji posttranslacyjnych i podaj klasę i nazwę enzymu uczestniczącego w każdej modyfikacji.
10.Podaj co to jest i gdzie występuje operon i promotor.
11.Podaj o czym mówi reguła tolerancji.Na jej podstawie napisz antykodon tRNA ,które mogą łączyć
się z z kodonem 5'...CGU...3'.
12.Narysuj jednonukleotydowy fragment cząsteczki mRNA Eukariota od 5'.
13.Podaj nazwę enzymu:
a)odpowiedzialnego za syntezę wiązań warunkujących I-rzędową strukturę białka
b)uczestniczącego w modyfikacji 3'-końca eukariotycznego mRNA
c)syntetyzującego startery RNA w procesie replikacji DNA
d)uczestniczącego w usuwaniu starterów w procesie replikacji DNA
14.Opisz jakim zmianom ulega Eukariotyczny pre-tRNA,podczas jego przemiany w tRNA.
15.Napisz reakcję ogólną dla klasy 6 enzymów i podaj nazwę znanego ci enzymu należącego do tej
klasy.
16.Wyjaśnij w jaki sposób polimeraza DNA zapewnia dokładność procesu replikacji.
17.Napisz jaką rolę pełni eukariotyczna polimeraza RNA I. Przedstaw przy pomocy wzorów struktu-
ralnych równanie reakcji katalizowanej przez ten enzym ,jeżeli substratami są :GTP i UTP oraz
przedstaw symbolami sekwencję odpowiedniej nici DNA (zaznaczając koniec 5' i 3' zarówno RNA
jak i DNA)
18.Podaj klasę enzymów oraz funkcję,jaką pełni telomeraza w organizmach eukariotycznych.
19.Podaj klasę enzymów oraz funkcję ,jaką pełni endonukleaza restrykcyjna w organizmach prokario-
tycznych.
20.Wymień wszystkie enzymy uczestniczące w procesie replikacji u procariota.
21.Narysuj wzorami strukturalnymi produkt reakcji katalizowanej przez primazę ,jeśli nić
matrycowa ma sekwencję 3' ...TG...5'
22.Podaj jednym zdaniem jaka jest funkcja niżej wymienionych koenzymów :
a)FAD
b)biotyny
c)CoA
d)S-adenozylometionina
23.Podaj do jakiej klasy enzymów należą:
a)fosfataza nukleotydowa
b)telomeraza
i podaj ogólny schemat reakcji katalizowanych przez enzymy należące do tych klas.
24.Przy pomocy wzorów strukturalnych przedstaw fragment mRNA łączący się z inicjatorowym tRNA
25.Wymień
a)dwie zasadnicze różnice w budowie mRNA procariota i eucariota.
b)enzymy uczestniczące w modyfikacjach 5'-końca mRNA
26.Podaj definicje:intron,replikon,egzon,cistron,primer,operon.
8.laboratoria: inwertaza to hydrolaza
9.laboratoria: stała michaelisa - pomiar szybkości (...)
12.który enzym znajduje się po wew. błonie mitochondrium
13.kompleks dehydrogenazy
Kolokwium nr 1
inhibicja kompetycyjna gdzie się przyłącza co zmienia
2. inhibicja niekompetycyjna gdzie się przyłącza co zmienia
3 enzymy wyznacznikowe na zawał serca
4. Polimeraza to jaka klasa enzymu
5. syrop klonowy- mutacja czego
6. antybiotyki działające na 50S
7. wrodzony niedobrór odporności- co go powoduje mutacja czego
8. redagowanie mRNA
9. mi RNA
10. kinazy
11. wzór NADP
12. witamina b2 z czego się składa
13. biotyna- odpowiada za karboksylacje
14. czynnik którego mutacja wywołuje recesje transkrypcji
15. kodon inicjujący u eucariota
16. zdolność do 3' 5' syntezy albo
17. Kolejność działania enzymów w polimeryzacji nici opóźnionej.
18. Co to metoda Sangera
19. Chaperon co to za białka (jakiej klasy)
20. Sekwencja sygnałowa białek błonowych.
21. Pytania prawda/fałsz zagadnień z laboratoriów (jedno pytanie)
głównie o izolowanie DNA
Uszeregować enzymu według kolejności działania u prokarionta:
1.prymaza 2. polimeraza I 3. Polimeraza III 4. ligaza
Jaką reakcje przeprowadzają kinazy?
Narysowany wzór NADPH i rozpoznać.
Helikazy są to ATPazy
Mocz chorego ma zapach syropu klonowego ponieważ zawiera aminokwasy rozgałęzione.
Topoizomerazy i wybrać funkcję np. mogą przecinać DNA, zmieniają liczbę skrętów itd.
Miejsce inicjacji replikacji u prokarionta(chyba E. coli nawet było podane) posiada dwa charakterystyczne fragmenty.
O polimerazę y (gamma) czy jest syntezowana przez genom mitochondrialny (powiela genom mitochondrialny)
Fosforylacja którego czynnika spowoduje terminalny koniec translacji? były podane różne eIF(cyferka).
O białka opiekuńcze jaki to typ enzymów.
BIOCHEMIA
1.Narysuj reakcję,w której zachodzi powstawanie pochodnej pirolowej.
2.Napisz reakcję,w której inhibitorem dla tego enzymu jest jon fluorkowy (F-)
3.Zysk moli ATP,który powstaje z rozłożenia do CO2 i H2O 0,2 mmoli tripalmitynianu glicerolu.
4.Ile mmoli nukleozydotrifosforanów jest potrzebnych do wytworzenia 0,2 mmola glukozy z asparagi-
nianu.
5.Ile mmoli acetyloCoA potrzeba do wytworzenia 0,2 mmoli cholesterolu
6.Narysuj reakcję podając enzymy utworzenia fosfatydyloinozytolu z DAG i IP.
7.Napisz reakcję otrzymywania glukozy z UDP-glukozy.
8.Narysuj koenzym,który bierze udział w glikolizie tlenowej i podaj nazwe tego enzymu.
9.Przez jakie związki są wiązane jony Fe3+,Cu2+,Hb i bilirubina
10.Wyjaśnij dlaczego podczas pracy mięśnia szkieletowego nie zachodzi rozpad acetonu.
11.Dlaczego kortyzol podnosi stężenie glukozy we krwi
12.Dlaczego witamina K hamuje syntezę osteokalcyny.
13.Przedstaw graficznie wpływ inhibitora kompetycyjnego i inhibitora typu K
14.Narysuj reakcję,w której jednym z produktów jest karnityna
15.Napisz reakcję,w której efektorem allosterycznym jest acetyloCoA
16.Wymień 4 enzymy,które biorą udział w kalcyfikacji płytki nazębnej
17.Napisz reakcję otrzymywania asparaginianu z cyklu mocznikowego.
Kolokwium I
1. Narysować wzór strukturalny i nazwać
witaminy występującej w FADzie
dawcy grupy metylowej
2. Wyjaśnić pojęcia: intron, międzynarodowa jednostka aktywności enzymatycznej,
3. Opisz inhibicje typu K
4. Wyznacz w sposób doświadczalny stałą Michaelisa
5. Narysuj wzorami strukturalnymi poczatek translacji gdy nić matrycowa ma postać 5'.....AC3'
6. Napisz nazwy enzymów katalizujących dane reakcje i napisz do jakiej klasy należą
a)
b)
c)
d)