Linkage Zadanie 1

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0

0x08 graphic

Linkage Zadanie 2

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta) =0,05, 0.1, 0,2. Jakie wnioski na temat lokalizacji genu wywołującego chorobę można wyciągnąć z obliczeń?

0x01 graphic

Linkage Zadanie 3

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0. Zakładając, że w powyższych rodowodach występuje ta sama choroba jaki jest łączny LOD score?

0x08 graphic
0x08 graphic

Linkage Zadanie 1 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0

0x08 graphic
0x01 graphic

LR 2 LOD 0,301030

Linkage Zadanie 2 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta) =0,05, 0.1, 0,2. Jakie wnioski na temat lokalizacji genu wywołującego chorobę można wyciągnąć z obliczeń?

0x01 graphic

LR 32,2687697779, 39,6718580736 27,4877906944

LOD 1,50878 1,59848 1,4391398

Linkage Zadanie 3 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0. Zakładając, że w powyższych rodowodach występuje ta sama choroba jaki jest łączny LOD score?

0x08 graphic
0x08 graphic

16:1, 1,204 LR 8 LOD 0.903089

Razem 128:1 2,107

11

23

13

11

12

13

34

12

23

23

33

13

23

13

11

12

13

11

23

13

11

12

13

34

12

13

23

13

11

12

13

12

2 3

2 3

3 3

1 2