Odpowiedź na pytanie nr 8
Mechanizm fotosyntezy u sinic, glonów i roslin wyższych
Fotosynteza jest zjawiskiem złożonym, w którym można wyróżnić szereg procesów jednostkowych, takich jak:
fotoliza wody
fotoredukcja fosforanu NAD+, czyli NADP+
fotofosforylacja niecykliczna i cykliczna
wiązanie CO2 z wytwarzaniem prostych węglowodanów
Trzy pierwsze procesy - faza jasna ( wymaga obecności światła ) , proces ostatni - ciemna faza ( może zchodzić w ciemności ).
Układy fotosyntetyzujące w które wyposażone są chloroplasty sinic, glonów oraz roślin wyższych:
układ fotosyntetyzujący I - pochłaniający światło o mniejszej energii i długości fali, λ = 700nm ( zawiera dużo chlorofilu a i znikomo chlorofilu b oraz chlorofil P-700 )
układ fotosyntetyzujący II - pochłaniający światło o większej energii i długości fali λ = 670nm ( zawiera ponad 30% chlorofilu a i 70% chlorofilu b)
Składniki układu fotosyntetyzującego:
chlorofil a i chlorofil b
barwniki: karotenoidy, ksantofile (żółte), fikocyjanina (niebieski), fikoerytryna (czerwony)
Przebieg procesu: I - Faza jasna
1) Fotoliza wody
Absorbcja kwantów światła - kwanty światła padając na cząst. chlorofilu b przekazują mu swoją energię i wybijają z niego elektron, chlorofil b przechodzi w stan pobudzenia. (Potencjał oksydoredukcyjny układu fotosyntetyzującego II zmnienia się z +1,0 V i po pobudzeniu wynosi ok. 0 V). Akceptorem dla pobudzonego elektronu jest tzw. plastichon (PQ), jednocześnie w cząstkach utlenionego chlorofilu b pojawia się niedobór elektronów, który uzupełniony zostaje elektronami z cząsteczki wody utlenionej do tlenu atm.
H2O - 2e → ½O2 + 2H+
2) Fotoredukcja fosforanu NAD+ czyli NADP+
W tym czasie w układzie fotosyntetyzującym I chlorofil a również ulega temu samemu procesowi jw. Nośnikiem elektronu będącego w staniem podwyższonym jest substancja o symbolu FRS, będąca pochodną petryny, która przenosi go na białko zwane ferrodoksyną. FRS nabywając elektron przechodzi z formy utlenionej w zredukowaną.. Dzięki niskiemu potencjałowi oksydoredukcyjnemu (-0,43 V) ferrodoksyna może redukować fosforan NAD+, czyli NADP+.
Przekazywanie elektronów z ferrodoksyny na NADP+ odbywa się za pomocą flawoproteidu (Fp), potrzebne do tego procesu jony wodorowe pochodzą z procesu katalizy wody.
NADP+ + 2e + 2H+ → NADPH + H+
Jest to proces fotoredukcji NADP+, a końcowym produktem jest czynnik redukcyjny, czyli zredukowany fosforan NADP czyli NADPH.
Proces fotoredukcji NADP+ stanowi siłę napędową dla procesu fotolizy wody (zapotrzebowanie na jony wodorowe ).
Źródłem elektronów dla utlenionych cząstek chlorofilu a w układzie fotosyntetyzującym I są elektrony uwalniające się z układu fotosynt. II. Przemieszczanie się elektronów z chlorofilu b na chlorofil a zachodzi dzięki takim związkom jak: plastichinon, cytochrom b, cytochrom f i plastycyjanina.
3) Fotofosforylacja niecykliczna i cykliczna
Proces transportu elektronów między układem f. I i II jest ściśle sprzężony z procesem syntezy ATP.(na każdą przeniesioną parę elektronów przypada jedna cząsteczka ATP , która powstaje w wyniku połączenia się jednej cząsteczki ADP z jedną cząsteczką fosforanu nieorganicznego) ⇒ ADP + P → ATP - jest to proces fosforylacji w tym przypadku nazwanej fotofosforylacją. Proces fotofosforylacji odbywa się kosztem różnicy potencjałów, zachodzi przemiana energii świetlnej wiązań na energię wiązań chemicznych w cząsteczce ATP. (przemiana ma miejsce podczas przemieszczania się elektronów pomiędzy cytochromem b i cytochromem f). Ponieważ wędrówka jednej pary elektronów z chlorofilu a (a właściwie z wody) do chlorofilu b jest możliwa jednokrotnie proces ten nazywamy fotofosforylacją niecykliczną.
Uzupełnienie niedoboru elektronów w układzie fotosyntetyzującym odbywa się za pośrednictwem FMN. (elektrony z ferrodoksyny dostają się na układ cytochromowy i powracają z powrotem na chlorofil a). W trakcie tej wędrówki dochodzi do przemiany energii świetlnej w energię chemiczną oraz do fotofosforylacji ADP i wytworzenia cząstek ATP - w tym przypadku proces ten zachodzi za pośrednictwem składników wyłącznie układu f. II i nosi nazwę fotofosforylacji cyklicznej (wybite elektrony z chlorofilu a wracają do niego ponownie i proces może zajść wielokrotnie)
Ogólnie faza jasna da się opisać równaniem:
NADP+ + H2O + ADP + P → NADPH + H+ + 1/2O2 + ATP
Końcowymi produktami fazy jasnej są:
NADPH - zredukowany fosforan NAD czyli czynnik redukcyjny
ATP
Tlen atmosferyczny ( ok. 2/3 jego objętości zużyte jest na procesy oddychania w cytoplazmie i mitochondriach w tych samych komórkach które go wyprodukowały, a pozostała część jest uwalniana do atmosfery)
II - Faza ciemna
Komórki korzystając z CO2 oraz energii i substancji wytworzonych w fazie jasnej, syntetyzują swoiste węglowodany i inne związki organiczne - jest to tzw. cykl Calvina.
Związkiem który zapoczątkowuje cykl Calvina jest ryboluzo -1,5 - dwufosforan, jest on cukrem prostym do którego przyłacza się CO2 i powstaje enzym - karboksylaza ryboluzodwufos - foranowa, rozpadająca się natychmiast na dwie cząsteczki kwasu 3 - fosfo - glicerynowego.
Następnie pod wpływem enzymu - dehydrogenaza fosfotriozowa - kwas reaguje z ATP przekształcając się po fosforylacji w kwas 1,3 - dwufosfoglicerynowy. Kwas ten w obecności NADPH ulega redukcjido aldehydu 3 - fosfoglicerynowego. Substancja ta stanowi podstawowy substrat do produkcji różnych węglowodanów oraz stanowi wyjściowąsubstancję z której powstaje ryboluzo - 1,5 - dwufosforan potrzebny do wiązania następnych cząsteczek CO2.
Bilans cyklu Calvina: z 6 czasteczek aldehydu 3 - fosfoglicerynowego, jedna jest wykorzystana do syntezy węglowodanów a 5 pozostałych do regeneracji ryboluzo - 1,5 - dwufosforanu. 6 cząsteczek „aldehydu” powstaje w wyniku przyłączenia się 3 cząsteczek CO2 do 3 cząsteczek rybulozo - 1,5 - dwufosforanu, w reakcji tej udział biorą także 6 cząsteczek ATP i 6 cząsteczek NADPH + H+.
Z cząsteczek „aldehydu” nie wykorzystanych do regeneracji „rybulozy” powstaje pod wpływem izomerazy
fosfotriozowej fosfodwuhydroksyaceton. Związek ten reaguje z nieprzekształoconymi cząsteczkami „aldehydu” i powstaje fruktozo - 1,6 - dwufosforan. Z uzyskanego związku komórki są w stanie uzyskać inne cukry sześciowęglowe: glukozę, fraktozę, mannozę i galaktozę.
Większość z tych cukrów przedostaje się do cytoplazmy, mogą być wykorzystane do budowy różnych strukturalnych el. kom. i dostarczania energii w wyniku własnego rozpadu.
Chemosynteza
Chemosynteza - wytwarzanie przez komórki bakterii chemolitotroficznych różnych substancji organicznych z dwutlenku węgla, przy wykorzystaniu energii, która powstaje na drodze utleniania prostych związków nieorganicznych (amoniak, siarkowodór). Te same związki służą takżr jako źródło elektronów. Proces wiązania CO2 odbywa się zgodnie z cyklem Calvina.
Pierwszymi akceptorami elektronów nie mogą być takie związki jak NAD, FAD ze względu na niską wartość potencjału oksydoredukcyjnego.
Podział chemolitotrofów:
bakterie nitryfikacyjne
Dzielą się na dwie grupy, bakterie nitryfikacyjne I fazy ( utleniają jony amonowe do azotynów) i bakterie nitryfikacyjne II fazy (utleniają azotyny do azotanów)
Do pierwszej grupy zalicza się gram- Nitrosomonas. Zachodzący w ich komórkach proces chemosyntezy opisuje równanie:
NH4+ + 3/2O2 → NO2- + 2H+ + H2O ( + 276kJ )
Metabolity pośrednie w tym procesie:
hydroksyloamina o wzorze NH2OH,
nitrosyl, NOH
nitrohydroksyloamina , NO2 - NH - OH
Inne bakterie I fazy to: Nitrosolobus,, Nitrosococus
Do drugiej grupy zalicza się bakterie gram- z grupy Nitrobacter a w szczególności Nitrobacter winogradskyi.
W komórkach zachodzi:
NO2- + 1/2O2 → NO3- (+ 71kJ)
Bakterie nitryfikacyjne II fazy są bardzo wrażliwe na działanie amoniaku i jonów amonowych, są więc zależne od obecności w środowisku bakterii z I fazy. Obie podgrupy bakterii ściśle ze sobą współdziałają. Temperatura optymalna do ich wzrostu wynosi 28 - 30C a pH od 7 do 8,0.
bakterie siarkawe
Dzielimy je na:
nitkowate bakterie siarkowe
gram- pałeczki tionowe
Wśród I grupy na uwagę zasługują bakterie z gatunku Beggiatoa albai Thiotrix nivea, utleniają one siarkę do siarki elementarnej na zerowym stopniu utlenienia, która wytrąca wewnątrz komórek charakterystyczne ziarnistości. Proces zachodzi następująco:
H2S + 1/2O2 → S0 + H2O (+ 172kJ)
Bakterie nitkowate bytują w wodach zanieczyszczonych o dużym stężeniu H2S.
Wśród drugiej grupy wyróżniamy 6 rodzajów bakterii m.in. Thiobacillus thiooxidans.Są to tlenowce bytujące w środowisku kwaśnym. Mogą one utleniać nie tylko H2S ale także siarkę elementarną, tiosiarczany, tioniany. Proces utleniania ma charakter wieloetapowy a końcowymi produktami są siarczany i kwas siarkowy, według równania: H2S + 1/2O2 → S0 + H2O (+ 172kJ)
S0 + H2O + 3/2O2 → H2SO4 (+ 494kJ)
Kluczowym momentem w procesie utleniania jest etap końcowy czyli utlenianie siarczynów do siarczanów, proces ten może przebiegać na dwa sposoby:
enzym zwany oksydazą siarczanową przerzuca elektrony z siarczynu na zawierające atom żelaa (III) cytochromy, skąd elektrony są transportowane na tlen atmosferyczny. Jednocześnie jon żelazawy ulega redukcji do żelazowego a siarczyny do siarczanów. Z jednej cząsteczki ADP powstaje jedna cząsteczka ATP.
pod wpływem enzymu - reduktaza - siarczyny łączą się z AMP tworząc APS (adezynofosfosiarczan). Następnie pod wpływem transferazy adenylowej i kinazy adenylanowej APS rozpada się - uwalniane są cząsteczki ATP i AMP oraz siarczan.
bakterie żelazowe
Bakterie które utleniają związki żelaza i czerpią z tego energię to: Thiobacillus ferrooxidans - oprócz siarki utlenia także żelazo. Najczęściej substratami są węglany żelazawe, proces zachodzi zgodnie z reakcją:
4FeCO3 + O2 + 6H2O = 4Fe(OH)3 + 4CO2 (+46kJ)
Wśród innych bakterii żelazawych na uwagę zasługują jeszcze bakterie z rodzaju Gallionella. Mają one nerkowty kształt i wytwarzają śluzowate wypustki zabarwione na brązowo warstwą Fe(OH)3. Wspólną cechą wszystkich bakterii żelazawych jest zdolność do utleniania nieorganicznych związków manganu.