- wybrać prawidłowy konstrukt białka, które oddziałuje N-terminalną częścią z sekwencją DNA, dlaczego tak uważamy?
- mamy konkretny plazmid, jakiego represora operonu użyć i w jakiej ilości - podane w jakim stężeniu powinien być, ile zrobić buforu i stężenia dostępnych rep resorów,
- zadanie na obliczanie, ile czego dodać, by otrzymać określoną ilość buforu z konkretną zawartością różnych substancji,
- opisać, jakie elementy powinien zawierać szczep/plazmid i warunki prowadzenia doświadczenia, gdy mamy podany opis konstruktu - chcemy mieć ekspresję genu kodującego toksyczne białko, mamy gen reporterowy beta-galaktozydazę,
- dopisać do fragmentu sekwencji resztę palindromową i zaznaczyć, jakie produkty powstaną przy cięciu enzymem pozostawiającym 4-nukleotydowe lepkie końce 5`,
- mamy enzym restrykcyjny i tniemy nim coś, ale okazuje się, że nie tnie w jednym miejscu, w którym powinien - podać 2 wyjaśnienia i jak można to sprawdzić?
- zadanie na opisanie krótkiej procedury oczyszczenia funkcjonalnego enzymu (czyli z 2 podjednostek alfa i 2 beta), mamy 2 ligacje ze szczepów: jeden produkuje części alfa, a drugi beta,
- co powinien mieć wektor ekspresyjny?
- opis izolacji białka i schematy żeli barwionych Coomassie, i immunodetekcja - napisać, dlaczego mamy taki a nie inny obraz i co mogło ewentualnie pójść nie tak?
Jaka jest różnica między BLASTEM, a formatem FASTA?
Format FASTA - tekstowy format zapisu sekwencji kwasów nukleinowych lub białek, w którym zasady lub aminokwasy przedstawiane są w postaci jednoliterowego kodu - format zapisu.
BLAST - program, który znajduje sekwencje podobne do zadanej, łączy sekwencje nukleotydowe lub aminokwasowe z tymi, które są już w bazie, i wylicza statystyczne znaczenie parowania - serwer, do BLASTa wprowadzasz zapytanie w formacie FASTA.