Egzamin z Bioinformatyka 2012 - Biologia
1. Sieci komputerowe możemy podzielić na:
a. Sieci lokalne (LAN), sieci rozległe (WAN)
b. Sieci otwarte, sieci zamknięte
c. Sieci o konfiguracji: pierścienia, magistrali, gwiazdy lub połączenie nieregularne
d. Wszystkie odpowiedzi są prawidłowe
2. Wśród warstw oprogramowania Internetu wyróżniamy:
a. 1. Warstwę aplikacji, 2. Warstwę transportu, 3. Warstwę sieci, 4. Warstwę łączową lub kanałową
b. 1. Warstwę transportu, 2. Warstwę aplikacji, 3. Warstwę sieci, 4. Warstwę łączową lub kanałową
c. 1. Warstwę łączową lub kanałową, 2. Warstwę transportu, 3. Warstwę aplikacji, 4. Warstwę sieci
d. 1. Warstwę sieci, 2. Warstwę łączową lub kanałową, 3. Warstwę aplikacji, 4. Warstwę transportu
3. Podstawowe sposoby zapisu algorytmów obejmują:
a. Zapis słowny
b. Listę kroków
c. Zapis graficzny ( schematy blokowe i grafy)
d. Wszystkie odpowiedzi są prawidłowe
4. Bazy danych sekwencji nukleotydowych obejmują:
a. EMBL, GenBank, DDBJ
b. EMBL, PIR, GenBank
c. EMBL, GenBank, TrEMBL
d. Żadna odpowiedź nie jest prawidłowa
5. Plik GenBank można podzielić na następujące części:
a. Nagłówek i właściwą sekwencję nukleotydową
b. Nagłówek, cechy i właściwą sekwencję nukleotydową
c. Cechy i właściwą sekwencję nukleotydową
d. Żadna odpowiedź nie jest prawidłowa
6. Swiss-Prot to:
a. Baza danych rodzin białek
b. Baza danych struktur białek
c. Baza danych sekwencji białek
d. Baza danych oddziaływań międzycząsteczkowych
7. Metody optymalnego dopasowywania par sekwencji to:
a. Algorytm dopasowania globalnego Needlemana-Wunscha
b. Algorytm dopasowania lokalnego Smitha-Watermana
c. Prawidłowe odpowiedzi a i b
d. Żadna odpowiedź nie jest prawidłowa
8. Do map genomowych (ułożonych wg poziomu rozdzielczości od najmniejszej do największej) zaliczamy:
a.1. Mapa cytologiczna, 2. Mapa genetyczna, 3. Mapa fizyczna
b.1. Mapa genetyczna, 2. Mapa fizyczna, 3. Mapa cytologiczna
c.1. Mapa fizyczna, 2. Mapa genetyczna, 3. Mapa cytologiczna
d.1. Mapa fizyczna, 2. Mapa cytologiczna, 3. Mapa genetyczna
9. Horyzontalny transfer genów obejmuje takie mechanizmy jak:
a. Tylko transformację i koniugację
b. Tylko transformację i transdukcję
c. Transformację, koniugację i transdukcję
d. Tylko koniugację i transdukcję
10. 10. Mechanizmy genetyczne wspomagające oszczędność genomową to:
a. Tylko alternatywny splicing
b. Alternatywny splicing, tasowanie egzonów, trans-splicing, „gen wewnątrz genu”
c. Tylko alternatywny splicing, tasowanie egzonów, trans-splicing
d. ...
11. Poszukiwanie minimalnego genomu:
a. Ma na celu określenie najmniejszego zestawu genów niezbędnego do utrzymania przy życiu wolno żyjącego organizmu
b. Jest jednym z zadań genomiki porównawczej
c. Umożliwia poznanie genów stanowiących o kluczowych ścieżkach metabolicznych
d. Wszystkie odpowiedzi są prawidłowe
12. Syntenia to:
a. Zjawisko konserwacji kolejności kilku genów w różnych genomach
b. Inne określenie genomiki porównawczej
c. Inne określenie genomiki funkcjonalnej
d. Inne określenie genomiki strukturalnej
13. W skład struktury drzewa filogenetycznego wchodzą:
a. Tylko korzeń, gałęzie i węzły zewnętrzne
b. Tylko korzeń i węzły zewnętrzne
c. Tylko korzeń, gałęzie, węzły wewnętrzne i zewnętrzne
d. Korzeń, gałęzie, konary, węzły wewnętrzne i zewnętrzne
14. Metody ukorzenienia drzew nieukorzenionych obejmują:
a. Wykorzystanie tzw. grupy zewnętrznej
b. Metodę ukorzenienia w środkowym punkcie
c. Metodę „zegara” molekularnego
d. Prawidłowe odpowiedzi a i b
15. Różnica pomiędzy filogramem a kladogramem polega na tym, że:
a. Filogram jest drzewem wyskalowanym, a kladogram nie
b. Kladogram jest drzewem wyskalowanym, a filogram nie
c. Oba drzewa są wyskalowane ale różnią się skalą
d. Żadna odpowiedź nie jest prawidłowa
16. Format Newick to:
a. Format zapisu drzew filogenetycznych
b. Format zapisu przyrównań wielu sekwencji
c. Format zapisu pojedynczych sekwencji
d. Format zapisu struktury białek
17. Dla danej liczby nukleotydów
a. Liczba topologii drzew nieukorzenionych jest większa niż ukorzenionych
b. Liczba topologii drzew ukorzenionych jest większa niż nieukorzenionych
c. Liczby są równe
d. Nie ma bezpośredniego sposobu oszacowania liczby możliwych topologii
18. Model Jukesa-Cantora to:
a. Inna nazwa ukrytego modelu Markowa
b. Jeden z modeli substytucji nukleotydów
c. Model wykorzystywany przy przeszukiwaniu baz danych sekwencji nukleotydowych
d. Model wykorzystywany przy przeszukiwaniu baz danych sekwencji białek
19. Metody odległościowe budowy drzew filogenetycznych obejmują:
a. Tylko metody oparte na klasteryzacji
b. Tylko metody oparte na kryterium optymalności
c. Tylko metody oparte na klasteryzacji i na kryterium optymalności
d. Metody oparte na klasteryzacji, kryterium optymalności i znakach
20. BLAST to:
a. Grupa programów do przeszukiwania baz danych sekwencji
b. Program do przyrównywania struktur białkowych
c. Program do wizualizacji makromolekuł
d. Baza danych makromolekuł