Które z poniższych sformułowań jest prawdziwe dla kolistego dwuniciowego DNA charakteryzującego pewną bakterię, w przypadku którego określona metodami chemicznymi zawartość adeniny wynosi 21 %
c) zaw. Guaniny wynosi 29 %
Która sekwencja zdań jest prawdziwa w momencie przeniesienia E.Coli z pożywki z glukozą na pożywkę zawierającą inny cukier jako jedyne źródło węgla?
c) w komórce wzrasta poziom cAMP, który wiąże się do CAM, a kompleks CAP-AMP wiążąc się z DNA aktywuje transkrypcję
Która z poniższych zmian w sekwencji może z największym prawdopodobieństwem spowodować mutacje typu utraty funkcji?
d) insercja jednego nukleotydu w części 5' końcowej regionu kodujacego
W pewnej komórce bakterii doszło do mutacji w genie kodującym syntetazę aminoacylo-tRNA, w wyniku której wszystkie cząsteczki tRNA-ser są `ładowane' na ramieniu akceptorowym alaniną. Który z poniższych scenariuszy najlepiej opisuje skutki mutacji?
d) białka syntetyzowane z udziałem tych tRNA będą zawierały alaniny w pozycjach odpowiadających kodonom seryny
5, Która z poniższych cząsteczek DNA będzie służyć jako matryca do syntezy DNA in vitro poprzez polimerazę DNA I - E.coli?
c) jednoniciowa, kolista cząsteczka sparowana na krótkim odcinku z liniowym oligonukleotydem grupą hydroksylową przy węglu 3' deoksyrybozy
Masz do wyboru następujące parametry:
1 - regulacja glukozowa
2- regulacja pozytywna indukowana
3 - regulacja negatywna reprymowalna
4- regulacja negatywna indukowana
5- atenuacja
6- regulacja pozytywna reprymowalna
Które z tych parametrów składjaą się na regulację syntezy tryptofanu u E.coli?
d) 3,5
które z poniższych sformułowań....
b) wiąże się z represorem uniemożliwiając przyłączenie się z...
Gen markerowy X E.coli koduje enzym uczestniczący w biosyntezie związki A. Gen ten znajduje się w supresorze regulowanym negatywnie przez represor w połączeniu z korepresowem, który jest zw. A . Jaki efekt będzie miała mutacja w wyniku której białko regulacyjne utraci powinowactwo do korepresora i czy będzie to mutacja dominujące czy recesywna?
białko X będzie syntetyzowane konstytutywnie. Mutacja recesywna
Jakiego efektu spodziewamy się w przypadku delecji sekwencji GCGCCGACCGCGCTTTTI która zaszła w pewnym genie bakteryjnym ok. 20-30 nukleotydów poniżej kodonu STOP?
d) brak terminacji transkrypcji, powstałe białko będzie prawidłowe
10. Przeprowadzono testy wzrostowe szczepu E. Coli o fenotypie mal - thr - ile - .który zestaw wyników testów wzrostowych ( + wzrost/ - brak wzrostu) jest prawdziwy dla następujących pożywek:
Mg z glukozą i tiaminą
Mg z maltozeitiaminą (?) , izoleucyną
Mg z glukozą, tiamina, izoleucyna
Mg z glukoza i izoleucyna
Mg z glukoza i maltoza
1 - ; 2-, 3 +; 4-; 5 -
Mutacja, której skutkiem jest supresja mutacji typu nonsens zachodzi w :
sekwencji kodującej cząst. TRNA
Skrzyżowano dwa szczepu Drosophili melanogaster. Mutanta ( + w) o oczach brązowych z mutantem (st) o oczach szkarłatnych Geny + w i st są niesprzężne. W F1 wszystkie muchy miały dziką barwę oka. W F2 można oczekiwać następujacego wyniku:
b) 1/ 16 potomstwa będzie miała białe oczy
Na podanej poniżej sekwencji genu podkreślono pierwszy transkrybowany nukleotyd (A)
GCAATTGCATTGACCATAACCTGTTCCATG... 61bp... TAGTAAGATGA
Kodonem start otwartej ramki odczytu (podkreślony) znajduje się w pozycji:
b) od + 11 do + 13
Jeżeli otwarta ramka odczytu omawiana wyżej koduje peptyd o długości ponad 20 aa, a możliwymi kodonami STOP są np. UAA, UAG, UGA , to rolę kodonu stop dla tej ramki pełni trójka:
TGA
Otrzymano samicę Drosophipa heterosygotyczną pod względem sprzężonych z płcią genów. Mutacja y jest recesywna i powoduje wystąpienie żółtej barwy ciała. Mutacja v jest recesywna i powoduje że oczy mają jasnoczerwony kolor. Odległość genów y i w = 20 j.m. W jaki sposób stwierdzić czy układ alleli zmutowanych u tej heterozygoty jest cis czy trans? Zaznacz doświadczenie
b) skrzyżować z samcem yv, jeżeli 40 % całego potomstwa będą stanowić muchy dzikie , to była to heterozygota w układzie cis.
Do badania ekspresji genów stosuje się:
odwrotną transkrypcję i PCR
geny reporterowe
analizę Southern
wszystko
Które z poniższych stwierdzeń jest fałszywe w przypadku cechy dominującej, sprzężonej z płcią
wszyscy synowie chorych kobiet są chorzy
Chcesz sklonować gen kodujący SSrRNA z A. Nidulans. Jaką strategię klonowania zastosujesz?
transformacja dzikiego szczepu E.coli bankiem genomowym z A. Nidulans, poszukiwanie pożądanej kolonii metodą hybrydyzacji kolonijnej przy użyciu wyznakowanego SSRNA
Metody Northern, Southern, Western mają wspólne elementy . jakie?
doświadczenie przebiega według schematu ; rozdział preparatu w żelach transfer na membranę wykrywanie badanych cząsteczek związanych z membraną
Wskaż zestaw elementów, które posiadają typowy wektor ekspresyjny służący do .... ludzkich w kom. drożdży są...
promotor drożdżowy, terminator drożdżowy, ori bakteryjny, drożdżowy marker selekcyjny, bakteryjny marker selekcyjny
21, Wyizolowałeś mutanta drożdży niezdolnego do syntezy lizyny. Mutacja okazała się recesywna. Chcesz ustalić w jakim genie zaszła mutacja. Wskaż właściwy sposób postępowania:
transformacja mutanta bankiem genów z dzikiego szczepu i selekcjonujesz który zdolny do syntezy lizyny
Para zdrowych klinicznie ludzi ma 3 dzieci: 2 synów i córkę. Jeden z synów i córka chorują na rzadką , jednogenową chorobę dziedziczną - leukodyotrofię. Jaki jest typ dziedziczenia tej choroby.
recesywny autosomalny
Metody Southern nie możemy zastosować do
tkankowo specyficznej ekspresji genu
Wskaż prawdziwe stwierdzenie
niekomplementarność startera na końcu 3' w reakcji PCR uniemożlwia przeprowadzenie reakcji
Polimeraza TAQ używana w reakcji PCR z małą częstotliwością generuje błędy podczas powielania odcinka DNA. Aby sprawdzić, czy drożdżowy gen sklonowany przy użyciu techniki PCR nie zawiera mutacji punktowych należy:
zsekwencjonować gen i porównać otrzymaną sekwencję z sekwencją z bazy danych przy użyciu odpowiedniego programu komputerowego np. BLAST
Elektroforetyczny rozdział białek pod względem wielkości możliwy jest:
ponieważ użyty detergent nadaje białkom ładunek ujemny
zazwyczaj przy klonowaniu produktów reakcji PCR do wektora bakteryjnego wykonuje się kolejno:
cięcie enzymami restrykcyjnymi; ligację; transformację bakterii
Które startery umożliwiają namnożenie się techniką PCR sekwencji:
5' TATCATGATGAGCATTTATTTTACTGCGTTATCGTATTGACGGGGGCTGTTTAAGTACAGTCTGTTTTATAATCTATATTCATTTATATTTTATATTTCTTACCGAGGAAATTGACTCTTAACAGATTTGCTGAAA 3'
CATTTATTTTACTGCGTTAT i TCAATTTCTCGGTAAGAAA
W celu zbadania funkcji genu niezbędnego do życia.....
wszystkie odpowiedzi są prawidłowe
29.
genomowy DNA szczura, szczurza linia komórkowa, wektor eukariotyczny. Gen reporterowy
W zakupionym banku ludzkiego cDNA przeszukano klonu odpowiadającego genowi A . Po przeprowadzeniu hybrydyzacji kolonijnej z sondą - oligonukleotydem odpowiadającym części 5'- końcowej sekwencji kodującej nie było sygnału na autoradiogramie. Przyczyną tego było
w hybrydyzacji przeszkadzały introny
Pewne zdrowe małżeństwo ma 4 dzieci: 2 córki i 2 synów. Dwójka z rodzeństwa chłopiec i dziewczynka, chorują na chorobę, która już wcześniej występowała w rodzinach obu małżonków. Dla tej choroby nie zidentyfikowano genu, ale wykorzystano jego sprzężenie z.... polimorficznymi. Wiadomo, że u matki wykrywa się fragmenty polimorficzne 10, 100 bp i 110 bp , a ojca 10 i 100bp a u chorego syna i chorej córki 80 bp, 120 bp i 130 bp. Co można wywnioskować o zdrowych dzieciach jeżeli u syna wykryto fragmenty DNA o wielkości 80 i 100 bp a u córki wykryto polimorfizm 80 bp, 100 bp i 190 bp?
nie można udzielić jednoznacznej odpowiedzi.
Po cięciu plazmidu enzymami restrykcyjnymi B, S, T i X oraz ich kombinacjami otrzymano w żelu prążki o wielkości : X - 10 kb; T - 10 kb, S - 7 i 3 kb, X/B - 7 i 3 kb, B/S - 7,2 i 1 kb, X/T - 8 i 2 kb; T/S - 4 i 3 kb; S/X - 6, 3 i 1 kb
Jak wyglądały miejsca cięcia względem siebie na obrazie?
T, X, S, B, S
33. Jaką techniką.... RNA
Nouthern
Technikę PCR stosuje się do:
wprowadzania miejsc restrykcyjnych
mutagenezy
amplifikacji wybranego fragmentu DNA
wszystko
Pan XY (nie wykazujący objawów choroby) ma zdrowych rodziców i brata chorego na fenyloketonurię- autosomalna, recesywna, występująca w populacji europejskiej z częstością 1/ 1000000. Jakie jest ryzyko , że pan XY będzie miał chore dziecko, jeśli jego partnerka jest niespokrewnioną z nim kobietą z tej samej okolicy?
1/ 300
podjęto próbę stworzenia banku genomowego A. R w E. Coli. Po ligacji trawionego genomowego DNA z wektorem przeprowadzono transformację bakterii z selekcją na szalce... Wskaż sposób postępowiania umożliwiający określenie jakości banku
przeprowadzając jedynie analizę z pt a) ,b) lub c) nie można tego zrobić
37 . Sklonowano cDNA kodujący czynnik transktypcyjny z pomidora (2,5 kb) na plazmidzie bakteryjnym. W obrębie tego fragmentu są dwa miejsca cięcia dla enzymów restrykcyjnych Hic III w odległości 2 kb. Wykonano Southerna całkowitego DNA pomidora... wyznakowanym zrekombinowanym plazmidem. Na autoradiogramie uzyskano 4 prążki odpowiadające fragmentom 1kb, 3,4,5 kb. Obraz taki wynika z:
obecności intronów w genie dla czynnika transkrypcyjnego
Pewna kobieta ma brata chorego na dystrofię. Wskaż prawdziwe stwierdzenie:
c) jej matka jest nosicielką dystrofii.
Otrzymano białko X u drożdży. Badania aktywności na nim wykazały, że hydrolizuje jednoniciowe RNA....
jest częścią systemu degradacyjnego RNA w mitochondriach
Do PCR potrzebne jest:
matrycowy DNA, dwa oligonukleotydy, polimeraza DNA, mieszanina deoksyrybonukleotydów, bufor + Mg2+
40.W przypadku pewnej recesywnej choroby sprzężonej z płcią mutacja powoduje zanik miejsca cięcia .... Małżeństwo zdrowych klinicznie osób ma chorego syna i córkę, nie wykazującej objawów, która spodziewa się dziecka . Jakie jest p-ństwo, że dziecko będzie chorym synem , jeżeli ojciec dziecka to zdrowy mężczyzna ( z rodziny nie obciążonej chorobą) a wyniki diagnostyki dla kobiety w ciąży przy zastosowaniu metody PCR i trawienia produktów PCR enzymem Sma I są następujące: powstają fragmenty wielkości 50, 130, 210 bp?
0,25
Mutacja w genie drożdży powoduje niezdolność do wzrostu w 37 C. Dysponujesz dziką kopią tego genu sklonowaną na plazmidzie i znasz jego sekwencję. Jak najprędzej poznać miejsce mutacji?
amplifikujesz gen mutanta za pomocą reakcji PCR, klonujesz produkt do wektora bekteryjnego, przeprowadzasz sekwencjonowanie i porównujesz sekwencje.
Chcesz przeprowadzić klonowanie... enzymy
A, CTAGT, 2- C, CTAGG, 3 - CCTAG,G, 4 - GCT, ACC
1 i 3
Który fenotyp szczepu E.coli jest prawidłowy, jeśli szczep ten jest zdolny (+) lub niezdolny (-) do wzrostu na następujacych pożywkach: Mg + glukoza (-), Mg+ arabinoza (-), Mg + maltoza (-) , Mg + glukoza, leucyna i uanamycyna (+). Mg + arabinoza, leucyna (-), Mg + maltoza i leucyna (+)
mal + , ara - , leu - , kau R
Pewien szczep E. Coli o fenotypie Mal (-) , Lac (+) ... posiada mutacje polegającą na delecji w operatorze operonu laktozowego. Na plazmidzie wprowadzono kopię operonu laktozowego z mutacją typu nonsens w... kodonie ramki odczytu genu lacZ. Jaką barwę będą miały kolonie na podłożach
Mg + maltoza + x-gal
Mg + maltoza + X-gal + IPTG
Mg + glukoza + X- gal
niebieskie, niebieskie, białe
Otrzymano 3 mutanty : A. Nidulans Pro1, Pro2 , Pro3 wymagające do wzrostu proliny. Mutanty skrzyżowano ze sobą, otrzymano następujące wyniki. Zaznacz prawidową interpretację wyników
Krzyżówka potomstwo
Pro x pro3 pro - 99,997 % pro+ 0,003%
Pro x pro2 74 % 26 %
Pro3 x pro2 76% 24 %
mutacje pro1 i pro3 znajdują się w jednym genie a mutacja pro2 jst zlokalizowana w innym genie niesprzężonym
Wyizolowano mutanta drożdży w genie Gal Bo . Skutkiem tej mutacji jest brak wiązania glukozy przez białko GAL BO. Zaznacz poprawną odpowiedź:
mutant nie będzie rósł na pożywce z galaktozą jako jedynym źródłem węgla ponieważ domena aktywujaca Gal4 jest zablokowana na stałe
Skrzyżowano 2 szczepy A. Nidulans y x w
( y - żółta barwa konidiów, w - biała barwa konidiów) otrzymano 25% kolonii o zielonych konidiach (fenotyp dziki) 25 % kolonii o żółtych konidiach , 50 % kolonii o białych konidiach. Zaznacz prawidłową interpretację wynikó.
geny y i w kodują enzymy jednego szlaku w biosyntezie barwnika zielonego. Produkt genu w bierze udział we wczęsniejszym etapie syntezy niż produkt genu y. Geny y i w nie są sprzężone
47 Wykonano krzyżówkę szczepu A.nidulans wymagajacego do wzrostu argininy i tryptofanu ze szczepem wymagającym do wzrostu proliny. Badao u dwóch najczęściej występujacych klas potomstwa wzrost na pożywce minimalnej. Jakie jest położenie genów pro, arg, trp?
d) arg, pro, trp