Dla wektorów z miejscem polilinkerowym :

1. gdy mamy mieć dodatkowy peptyd fuzyjny na N końcu

FP :5` NNN[miejsce restrykcyjne] ATG [sekwencja peptydu fuzyjnego] sekwencja kodująca

RP : 5` NNN[miejsce restrykcyjne]—odwrócona sekwencja komplementarna do nici antysensownej

bez odwróconego kodonu stop

2. gdy mamy mieć dodatkowy peptyd fuzyjny na C-końcu

FP : 5` NNN[miejsce restrykcyjne]ATG sekwencja kodująca

RP: 5` NNN [miejsce restrykcyjne] STOP [odwrócona sekwencja peptydu fuzyjnego] odwrócona sekwencja komplementarna do nici antysensownej

3. gdy znaczniki maja być w wektorze

FP : 5` NNN[miejsce restrykcjne] ATG sekwencja kodująca

miejsce restrykcyjne za znacznikiem w wektorze

RP: 5` NNN[miejsce restrykcyjne][odwrócona sekwencja komplementarna do nici antysensownej]

miejsce restrykcyjne przed znacznikiem

4. gdy po ekspresji do wektora białko nie ma mieć znaczników

FP 5` NNN[miejsce cięcia] ATG sekwencja kodująca

miejsce cięcia znajdujące się jako pierwsze przy końcu 5` przed znacznikiem

RP 5` NNN[miejsce restrykcyjne][odwrócony kodon STOP] odwrócona sekwencja komplementarna do nici antysensownej

miejsce cięcia za znacznikiem

5. gdy znacznik mamy na N- końcu już w wektorze

FP : 5` NNN [ MIEJSCE CIĘCIA] ATG ---SEKWENCJA KODUJĄCA

miejce cięcia jest za znacznikiem

RP : 5` NNN [ CIĘCIE] [ODWRÓCONY STOP] odwrócona sekwencja komplementarna do nici antyrównoległej

miejsce cięcia jest za znacznikiem

6. gdy znacznik mamy na C - końcu juz w wektorze

FP : 5` NNN[ CIĘCIE] ATG -SEKWENCJA KODUJĄCA

miejsce cięcia znajduje się przed znacznikiem

RP : 5` NNN [ CIĘCIE] -odwrócona sekwencja komplementarna do nici antyrównoległej

bez odwróconego kodonu STOP w odwróconej sekwencji

miejsce restrykcyjne jest przed znacznikiem

Do wektorów typu TOPO TA :

tutaj terminalna transferaza dorabia tyminy w wektorze a polimeraza Taq zostawia adeniny na końcach sekwencji , w ten sposób fragmenty się ligują , więc nie używamy restryktaz

1. gdy chcemy mieć znacznik na N - końcu dodatkowy

FP : 5` ATG [sekwencja peptydu fuzyjnego] -sekwencja kodująca

RP 5` odwrócony stop -odwrócona sekwencja komplementarna

2. gdy chcemy mieć znacznik na C - końcu dodatkowy

FP : 5` ATG ---sekwencja kodująca

RP : 5` [odwrócony stop] ( odwrócona sekwencja peptydu fuzyjnego] -odwrócona sekwencja komplementarna

3. gdy mamy znacznik na C- końcu a na N końcu dodatkowy

FP : 5` ATG [ znacznik ]—sekwencja kodująca

RP : 5` odwrócona sekwencja komplementarna bez kododnu STOP

4. gdy znacznik mamy już na C-końcu

FP : 5` ATG -sekwencja kodująca

RP : 5` odwrócona sekwencja komplementarna bez STOP