Biochemia 2-Lista 9

Biosynteza nukleotydów.

1. Opisz fizjologiczne role/zadania nukleotydów.

2. Która z następujących odpowiedzi uzupełnia poprawnie zdanie?

Cytozyna jest

1. Zasadą purynową

2. Zasadą pirymidynową

3. Nukleozydem purynowym

4. Nuklezydem pirymidynowym

3. Które z następujących są nukleotydami?

1. Deoksyadenozyna

2. Cytydyna

3. Deoksyguanylan

4. Urydylan

4. Które z następujących stwierdzeń odnośnie syntetazy karbamoilofosforanowej u ssaków, która jest wykorzystywana do biosyntezy pirymidyn, są prawdziwe?

1. Jest zlokalizowana w miochondriach.

2. Jest zlokalizowana w cytozolu.

3. Wykorzystuje NH₄⁺ jako źródło azotu.

4. Wykorzystuje glutaminę jako źródło azotu.

5. Wymaga N-acetyloglutaminianu jako pozytywnego efektora.

5. Które z następujących stwierdzeń odnośnie 5-fosforybulozo-1-pirofosforanu (PRPP) są prawdziwe?

1. Jest aktywowaną formą rybozo-5-fosforanu.

2. Jest tworzony z rybozo-1-fosforanu i ATP.

3. Posiada pirofosforanową grupę przyłączoną do atomu C-1 rybozy w konfiguracji a.

4. Jest tworzony w reakcji, w której uwalniany jest PPi.

6. W jaki sposób orotan, wolna pirymidyna, jest przekształcany do nukletydu? Czy reakcja ta jest uważana za reakcję rezerwową czy biosyntetyczną?

7. Które z następujących enzymów są włączone w przekształcenie nukleozydo-5'-monofosforanowych (NMP) produktów biosyntetycznych szlaków puryn i pirymidyn w ich 5'-trifosforanowe (NTP) pochodne?

1. Nukleotydaza purynowa

2. Kinaza nukleozydodifosforanowa

3. Kinazy nukleozydomonofosforanowe

4. Fosforylaza nukleozydowa

8. W jaki sposób egzocykliczna grupa aminowa jest tworzona w pozycji N-4 cytozyny?

9. Które z następujących związków bezpośrednio dostarczają atomów do tworzenia pierścienia purynowego?

1. Asparaginian

2. Karbamoilofosforan

3. Glutamina

4. Glicyna

5. CO₂

6. N⁵,N¹⁰-metylenotetrahydrofolian

7. N¹⁰-formylotetrahydrofolian

8. NH₄⁺

10. Która z następujących odpowiedzi poprawnie uzupełnia zdanie?

Pierwszym produktem biosyntezy nukleotydu purynowego, który zawiera kompletny pierścień purynowy (hipoksantyna) jest

1. AMP

2. GMP

3. IMP

4. Ksantylan (XMP)

11. Przekształcenie IMP do AMP wymaga, którego/-ych z następujących?

1. ATP

2. GTP

3. Asparaginian

4. Glutamina

5. NAD⁺

12. Przekształcenie IMP do GMP wymaga, którego/-ych z następujących?

1. ATP

2. GTP

3. Asparaginian

4. Glutamina

5. NAD⁺

13. Opisz ogólny mechanizm wykorzystywany przez komórki do zamiany grupy karbonylowej na grupę aminową w biosyntezie nukleotydów.

14. Które z następujących reagentów oraz produktów są włączane w rezerwową reakcję biosyntezy puryn?

1. IMP AMP

2. IMP GMP

3. Adenina AMP

4. Guanina GMP

15. Podczas rezerwowej reakcji puryn, co jest źródłem energii wymaganej do tworzenia wiązania C-N glikozydowego pomiędzy zasadą a rybozą?

16. Wskaż, które z następujących nukleotydów w kolumnie prawej regulują każde z przekształceń z kolumny lewej.

a) rybozo-5-fosforan PRPP	1) AMP
b) PRPP fosforybozyloamina	2) GMP
c) fosforybozyloamina IMP	3) IMP
d) IMP adenylobursztynian
e) IMP ksantylan (XMP)

17. Które z następujących stwierdzeń odnośnie reduktazy rybonukleotydowej są prawdziwe?

1. Przekształca rybonukleozydodifosforany w 2'-deoksyrybonukleozydodifosforany u ludzi.

2. Katalizuje rozszczepienie homolityczne wiązania.

3. Akceptuje/ przyjmuje elektrony bezpośrednio z FADH₂.

4. Odbiera elektrony bezpośrednio od tioredoksyny.

5. Zawiera dwa rodzaje allosterycznych miejsc regulatorowych/miejsc allosterycznie regulujacych- jedno do kontrolowania aktywności całkowitej oraz drugie do kontrolowania specyficzności substratowej.

18. Wybierz spośród następujących te związki, które są prekursorami u 2'-deoksytymidyno-5-trifosforanu u ssaków oraz uporządkuj je w ich poprawnej biosyntetycznej kolejności.

1. OMP

2. UMP

3. UDP

4. UTP

5. dUMP

6. dUDP

7. dUTP

8. dTMP

9. dTDP

10. dTTP

19. Zdefiniuj pojęcie inhibitora nieodwracalnego (samobójczego) oraz podaj przykład z biosyntezy pirymidyn.

20. Za równo metotreksat, jak i trymetoprym są inhibitorami reduktazy dihydrofolianowej. Dlaczego trymetoprym jest lekiem wyboru w leczeniu ludzkich infekcji bakteryjnych?

21. Co jest etapem kluczowym w biosyntezie puryn i które z następujących związków są zaangażowane w kontrolowanie szlaku biosyntezy puryn?

1. IMP

2. AMP

3. OMP

4. GMP

5. PRPP

22. Które z następujących mogą służyć jako prekursor NAD⁺ u ludzi?

1. Ryboflawina

2. Pantotenian

3. Tyrozyna

4. Tryptofan

5. Niacyna

23. Które z następujących związków mogłyby powodować powstanie/wzrost moczanu, gdyby były całkowicie katabolizowane u ludzi?

1. ADP-glukoza

2. GDP-mannoza

3. CDP-cholina

4. UDP-galaktoza

5. CoA

6. FAD

7. UMP

24. Co jest korzyścią wysokiego stężenia moczanu w surowicy ludzkiej, biorąc pod uwagę, że zbyt duża ilość moczanu prowadzi do dny (podagry, skazy moczanowej)?

25. Metotreksat, antagonista folianu, interferuje z biosyntezą kwasów nukleinowych. Czy oczekiwałabyś, że będzie on inhibitorem biosyntezy puryn lub pirymidyn czy obu procesów? Wyjaśnij.

26. Udowodniono, że hydroksymocznik, silny chelator jonów żelaza, koliduje z syntezą DNA i jest wykorzystywany jako czynnik/ środek przeciwnowotworowy/ antynowotworowy. Jaki jest prawdopodobny enzym docelowy dla hydroksymocznika?

27. Klinicyści, którzy używają F-dUMP oraz metotreksatu razem w leczeniu raka odkryli, że kombinowane/wspólne efekty/wpływy na komórki rakowe nie są synergistyczne. Zasugeruj, w jaki sposób zarządzanie metotreksatem może inteferować z działaniem F-dUMP.

---