Pytania z koła z biochemii: (pytania nie są zbyt składnie napisane ,ale mam nadzieje, że pomogą wam choć trochę w nauce)
DNA składa się z nukleotydów
Między adenina i tyminą występuje wiązanie podwójne
opisz i narysuj transkrypcje RNA
na czym polega splicing
wymień aminokwasy posiadające pierścienie aromatyczne (fenyloalanina, tryptofan, tyrozyna)
wymień aminokwasy posiadające gr hydroksylowe (seryna, cysteina, metionina, treonina)
na czym polega elektroforez dwustopniowa - ogniskowanie izoelektryczne(ustala się gradient pH elektroforezy, nakłada próbkę i przykłada napięcie, białka migrują do pH=pI) + elektroforeza
dlaczego niepolarna cząsteczka ulega w wodzie agregacji - z powodu wzrostu entropii wody, - 4 typ oddziaływań słabych w ukł. biologicznych
ile wynosi energia wiązania Van der Walsa - 2-4kJ/mol
wodorowe- 5-30kJ/mol
elektrostatyczne - 5,9kJ/mol
w Ph =12 która z gr w glicynie jest obdarzona ładunkiem - COO-
III-rzędowa struktura DNA u eukariota (narysować) - chromatyna:]
bialka
pierwszorzędowa-określa sekwencję aminokwasów
drugorzędowa- opisuje wzajemne przestrzenne ułożenie reszt aminokwasowych, sąsiadujących ze sobą w sekwencji liniowej
trzeciorzędowa- odnosi się do powiązań przestrzennych i wzajemnego ułożenia reszt aminokwasowych oddalonych od siebie w sekwencji liniowej oraz lokalizacji mostków dwusiarczkowych.
cechy wiązania peptydowego - jest płaskie, 4 cząst. leżą w jednej płaszczyźnie (OCNH), - ma charakter wiązania podwójnego
jakie są odpowiedzi komórki na zmiany w środowisku zewnętrznym
podaj dwa przykłady przyczyn ewolucji - zmienność gatunkowa czyli organizmy się różnią, mutują się, - dobór naturalny, przeżywają i się rozmnażają tylko organizmy najsilniejsze
Zasada działania testu ELISA polega na tym, że przeciwciało związane z określonym enzymem może specyficznie rozpoznawać dane białko (zawarte w materiale biologicznym), które wcześniej zostało unieruchomione na podłożu. Po dodaniu przeciwciał następuje utworzenie kompleksów immunologicznych, zatem przeciwciało także zostaje unieruchomione. Po wypłukaniu niezwiązanego przeciwciała i dodaniu substratu dla enzymu związanego z przeciwciałem zajdzie reakcja enzymatyczna, czemu z kolei będzie towarzyszyło pojawienie się produktu. Wykrycie jego obecności (może to być np. produkt barwny powstający z bezbarwnego substratu) świadczy o obecności danego białka w badanym materiale. Mierząc z kolei ilość powstającego produktu można także przeprowadzić analizę ilościową.
jaka cząsteczka może być antygenem - może być każda substancja, która wykazuje dwie cechy: immunogenność, czyli zdolność wzbudzenia przeciwko sobie odpowiedzi odpornościowej swoistej, oraz antygenowość, czyli zdolność do reagowania z przeciwciałami oraz TCR(receptor obecny na powierzchni limfocytu T)
w jaki sposób białko tworzy swoja prawdziwa konformacje - poprzez fałdowanie kooperatywne, oraz stopniową stabilizację struktur przejściowych
jak się wykrywa biało enzymatyczne?
co to jest chromosom? Jak powstaje?
2. system replikacji DNA, jakie enzymy biorą w niej udział. Schemat
3. Co to są przeciwciała monoklonalne. Jak powstają?
4. Jaki test immunologiczny jest najlepszy do wykrycia jakiegos białka w komórce?
5. Dlaczego struktura białka samoistnie dąży do uporządkowania, pomimo spadającej entropii?
6. Co to są białka poryny?
7. Skład aminokwasowy i znaczenie biologiczne oksytocyny i glutationu
8. W przypadku enzymu aby wykryc go poddajemy go testowi na:
9. 2 dowody molekularne na istnienie ewolucji
dlaczego replikacja DNA jest semikonserwatywna
narysować i opisać III-rzędową strukturę DNA eukariota
opisać na czym polega i do czego służy test ELISA
jak komórka reaguje na zmiany środowiska (ewolucja)
wymień i krótko opisz 5 metod analizy białek
co to są priony, dlaczego choroba prionowa uważana była za zakaźną
jakie aminokwasy występują na powierzchni białka jeśli znajduje się ono w środowisku wodnym
w jaki sposób białka przyjmują konformacje, co jest diagram Ramahandrama (czy jakos tak)
podaj przyczyny ewolucji
jakie cząsteczki mogą być antygenami
dlaczego czasteczki niepolarne ulegaja agregacji w wodzie
1. molekularne dowody istnienia ewolucji
2. co to jest chromosom, jego struktura, schemat
3. replikacja DNA, enzymy, schemat
4. Co to jest poryna
5. Glutation - skład aminokwasowy i funkcje w komórce
6. przeciwciała monoklonalne - schemat powstawania i co to jest
7. jak zlokalizować wiązania siarczkowe w łańcuchu peptydowym
8. jaka jest energia wiązania wodorowego
9. co oznacza, że replikacja jest semikonserwatywna
10. jak wykryć enzym, chodziło chyba o metodę western blotting
1. chodziło o budowę DNA
2. do poryny jeszcze było jakie funkcje pełnią aminokwasy, które ją budują
3. początek syntezy białka u bakterii
4. aminokwasy w bialkach jaka mają konformacje L i podać wyjątek ( ale ten wyjątek nie pamiętam czy był do tego pytania:P)
5. glicyna w pH=7
6. dlaczego następuje uporządkowanie struktury bialka, mimo, że entropia rosnie jakoś tak - chodziło tu chyba o oddzialywania hydrofobowe
7. co to jest diagram Ramachandrana
8. był podany peptyd i trzeba było napisac aminokwas, ktory jest na N- końcu
Sygnał start dla bakterii - narysować (chyba? nie pamiętam)
Ile jest wiązań wodorowych pomiędzy G i C?
Z jakich powtarzających się elementów składa się DNA
1. Przyczyny ewolucji
2. Transkrypcja RNA, schemat, enzym, etapy
3. Test ELISA
4. Dlaczego cząsteczki niepolarne ulegają agregacji?
5. 3rzędowa struktura DNA - schemat i opis
6. Jak komórka reaguje na zmiany środowiska?
7. Co to są priony?
8. W jaki sposób białka przyjmują konformację
9. Cechy wiązania peptydowego
10. Jakie cząsteczki mogą byc antygenami
11. Na czym polega splicing?\
12. Energia wiązania van der Waalsa
13. Glicyna w pH=13
14. aminokwasy aromatyczne - 2 przyklady
15. aminokwasy z grupą OH - 2 przyklady
1. co to jest chromosom? Jak powstaje?
2. system replikacji DNA, jakie enzymy biorą w niej udział. Schemat
3. Co to są przeciwciała monoklonalne. Jak powstają?
4. Jaki test immunologiczny jest najlepszy do wykrycia jakiegos białka w komórce?
5. Dlaczego struktura białka samoistnie dąży do uporządkowania, pomimo rosnacej entropii?
6. Co to są białka poryny?
7. Skład aminokwasowy i znaczenie biologiczne oksytocyny i glutationu
8. W przypadku enzymu aby wykryc go poddajemy go testowi na:
9. 2 dowody molekularne na istnienie ewolucji
10. dlaczego replikacja DNA jest semikonserwatywna
1. narysować i opisać III-rzędową strukturę DNA eukariota
2. opisać na czym polega i do czego służy test ELISA
3. jak komórka reaguje na zmiany środowiska (ewolucja)
4. wymień i krótko opisz 5 metod analizy białek
5. co to są priony, dlaczego choroba prionowa uważana była za zakaźną
6. jakie aminokwasy występują na powierzchni białka jeśli znajduje się ono w środowisku wodnym
7. w jaki sposób białka przyjmują konformacje, co jest diagram Ramahandrama (czy jakos tak)
8. podaj przyczyny ewolucji
9. jakie cząsteczki mogą być antygenami
10. dlaczego czasteczki niepolarne ulegaja agregacji w wodzie
Pytania z biochemii
bialko natywne
chromosom, jak powstaje jakis rysunek
wiazanie peptydowe jakiego typu - trans i ze w prolinie cis
diagram ramachandrana
transkrypcja z rysunkiem i enzymy
ultrawirowanie w gradiencie stężeń
liza Komorek szpiczaka
przeciwciała monoklonalane
aminokwasy zasadowe?
test elisa
podstawowa jednostka dna- co tworzy rdzen
12, kinetyka i termodynamika dzialania enzymu
13. reakcje spontaniczne
14.konformacje aminkowasow - L
15. glutation oksytocyna
16. w jakim miejscu antygen wiaze się z przzeciwcialem
17dlaczego struktur abialaka samoistnie dazy do uporządkowania mimo ze entropia rosnie