Analiza struktury genu prokariotycznego, Genetyka(1)


ANALIZA STRUKTURY GENU PROKARIOTYCZNEGO

Gen jest to odcinek kwasu nukleinowego odpowiedzialny za powstanie funkcjonalnego produktu. Pierwszym etapem ekspresji każdego genu jest transkrypcja, której produktem jest RNA. Drugiemu etapowi ekspresji - translacji - podlegają wyłącznie transkrypty genów kodujących białka (mRNA).

Inicjacja i terminacja procesów transkrypcji i translacji jest warunkowana obecnością określonych sekwencji w kwasie nukleinowym. U Prokariota można wyróżnić następujące elementy:

  1. TRANSKRYPCJA

A) PROMOTOR - ODCINEK ODPOWIEDZIALNY ZA INICJACJĘ TRANSKRYPCJI

OPERON RAMKA PRIBNOWA MIEJSCE INICJACJI

REGION -35 REGION -10 +1

lac ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGT..........GGAATTGTGA

lacI CCATCGAATGGCGCAAAACCTTTCGCGGTATGGCATGATAGC....GCCCGGAAGAGA

galP2 ATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTTTGTTATGCTATG........GTTATTTCATAC

araBAD GGATCCTACCTGAGGCTTTTTATCGCAACTCTCTACTGTTTC....TCCATACCCGTTTT

araC GCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGC.......TTTGGTCCCGCTT

trp AAATGAGCTGTTGACAATTAATCATCGAACTAGTTAACTAGTA...CGCAAGTTCACGT

bioA TTCCAAAACGTGTTTTTTGT…..TGTTAATTCGGTGTAGACTTGT...........AAACCTAAATC

bioB CATAATCGACTTGTAAACCAAATTGAAAAGATTTAGGTTTACAA...GTCTACACCGAA

tRNATyr CAACGTAACACTTTACAGCGGCGCGTCATTTGATATGATGCG….CCCCGCTTCCCGA

rrnD1 CAAAAAAATACTTGTGCAAAAAATTGGGATCCCTATAATGCGCCT...CCGTTGAGACG

rrnE1 CAATTTTTCTATTGCGGCCTGCGGAGAACTCCCTATAATGCGC..CTCCATCGACACG

rrnA1 AAAATAAATGCTTGACTCTGTAGCGGGAAGGCGTATTATGCACACCCCGCGCCGCTG

rrnX1 GCATTTTCCGCTTGTCTTCCTGAGCCGACTCCCTATAATGC...GCCTCCATCGACACG

λ PR CCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGTGATAATGG.........TTGCATGTACTAA

λ PL CTGGCGGTGTTGACATAAATACCACTGGCGGTGATACTGAG...…..CACATCAGCAGG

T7 A3 CAAAACGGTTGACAACATGAAGTAAACACGGTACGATGTAC......CACATGAAACGA

T7 A1 AAAGAGTATTGACTTAAAGTCTAACCTATAGGATACTTACA.......GCCATCGAGAGG

T7 A2 AACAGGTATTGACAACATGAAGTAACATGCAGTAAGATACA......AATCGCTAGGTAA

konsensus T C T T G A C A T.......11-15 pz.........T A T A A T....5-8 pz....A, C, T, G

sekwencji 42 38 82 84 79 64 53 45 41 79 95 44 59 51 96 81 55 48 42

0x08 graphic
B) TERMINATOR TRANSKRYPCJI

0x08 graphic

  1. TRANSLACJA

MIEJSCE WIĄZANIA RYBOSOMÓW (sekwencja Shine-Dalgarno) I KODON INICJUJĄCY (AUG)

0x08 graphic

5' koniec 16S rRNA

|

3'OH koniec 16S rRNA G

| A

A U

Prokarityczny mRNA U C

z konsenusową UCCUCCA

sekwencją SD (5') GAUUCCUAGGAGGUUUGACCUAUGCGAGCUUUU (3')

  1. KODONY DLA POSZCZEGÓLNYCH AMINOKWASÓW I KODONY TERMINACYJNE

druga pozycja

U

C

A

G

U

UUU Phe

UUC

UUA Leu

UUG

UCU

UCC Ser

UCA

UCG

UAU Tyr

UAC

UAA Stop

UAG Stop

UGU Cys

UGC

UGA Stop

UGG Trp

U

C

A

G

0x08 graphic

C

0x08 graphic
CUU

CUC Leu

CUA

CUG

CCU

CCC Pro

CCA

CCG

CAU His

CAC

CAA Gln

CAG

CGU

CGC Arg

CGA

CGG

U

0x08 graphic
C

A

G

A

AUU

AUC Ile

AUA

AUG Met

ACU

ACC Thr

ACA

ACG

AAU Asn

AAC

AAA Lys

AAG

AGU Ser

AGC

AGA Arg

AGG

U

C

A

G

G

GUU

GUC Val

GUA

GUG

GCU

GCC Ala

GCA

GCG

GAU Asp

GAC

GAA Glu

GAG

GGU

GGC Gly

GGA

GGG

U

C

A

G

0x08 graphic

2

5'...NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCUUUUUU-OH 3' transkrypt RNA

5'...NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCTTTTTTNNN...3' matryca

3'...NNTTCGCGGCNNNNGGCCGCGAAAAAANNN...5' DNA

N

GC-bogate

regiony

AT-bogate

regiony

N

N

C

N

G • C

C • G

C • G

G • C

C • G

A • U

A • U

...NNNN UUUU-OH 3'

araB UUUGGAUGGAGUGAAACGAUGGCGUUU

galE AGCCUAAUGGAGCGAAUUAUGAGAGUU

LacI CAAUUCAGGGUGGUGAUUGUGAAACCA

lacZ UUCACACAGGAAACAGCUAUGACCAUG

Replikaza faga Qß UAACUAAGGAUGAAAUGCAUGUCUAAG

Białko A faga ÖX174 AAUCUUGGAGGCUUUUUUAUGGUUCGU

Białko płaszcza faga R17 UCAACCGGGGUUUGAAGCAUGGCUUCU

Rybosomalne S12 AAAACCAGGAGCUAUUUAAUGGCAACA

Rybosomalne L10 CUACCAGGAGCAAAGCUAAUGGCUUUA

trpE CAAAAUUAGAGAAUAACAAUGCAAACA

Lider trp GUAAAAAGGGUAUCGACAAUGAAAGCA

kodon

inicjujący

sekwencja

SD

pierwsza pozycja (5'koniec)

trzecia pozycja (3'koniec)

trzecia pozycja (3'koniec)



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Struktura genu prokariotycznego
ESTYMACJA STATYSTYCZNA duża próba i analiza struktury, Semestr II, Statystyka matematyczna
ESTYMACJA STATYSTYCZNA2 duża próba i analiza struktury(2), Semestr II, Statystyka matematyczna
Analiza struktury id 61534 Nieznany (2)
zadanie o analizie struktury, statystyka i demografia-Hnatyszyn-Dzikowska ćwiczenia
Analiza struktury i dynamiki
Analiza struktury 2
analiza struktury odp
statystytka analiza struktury, A Egzamin zawodowy TECHNIK EKONOMISTA!
sprawozdanie (Grzesiek Gazda) analiza struktury odlewów żeliwnych
Analiza struktury i dynamiki
Analiza Struktury wzory
WSEI Statystyka Analiza.struktury.zadania
Konspekt analiza struktury podsumowanie
Kompleksowa analiza struktury wzory i wskazowki

więcej podobnych podstron