Pawet Mackiewicz, Jolanta Zakrzewska-Czerwińska, Stanisław Cebrat

Rys. 4. Związek między liczbą gromadzonych sekwencji w bazie GenBank a rozwojem technologii komputerowych mierzonych częstotliwością procesora. Zaznaczono również ważne daty dla bioinfor-matyki: wprowadzenie języka programowania Perlą i systemu Linux oraz początek powszechnego działania sieci www.

2. Zróżnicowanie filogenetyczne sekwencjonowanych genomów prokariotycznych

Najwięcej poznanych genomów należy do organizmów prokariotycznych, co po­zwala przyjrzeć się ich zróżnicowaniu filogenetycznemu. Jednak pomimo dużej licz­by genomów już zsekwencjonowanych lub będących w trakcie sekwencjonowania (w sumie 751), nie reprezentują one równomiernie większych grup filogenetycznych (tab.). Najsłabiej są reprezentowane grupy królestwa Archaea (47 projektów ukoń­czonych i nie ukończonych). Projektów dotyczących genomów z królestwa Bacteńa jest aż 704. Wśród nich dominują trzy grupy bakterii: Proteobacteria, stanowiących prawie potowe wszystkich poznawanych genomów, Firmicutes - ponad 1/4 projek­tów i Actinobacteria - prawie 10% (rys. 5A). Wśród projektów proteobakterii domi­nują gamma-proteobakterie - 25°o wszystkich projektów. Kolejnymi grupami wy­bieranymi do analiz genomowych są bakterie z grupy Bacteroidetes/Chlorobi, sini­ce, chlamydie i krętki.

12 PRACE PRZEGLĄDOWE