1.Topoizomerazy
Zmienia liczbę poleceń
Wymaga ATP
5` fosforan łączy się z tyrozyną z jej grupą hydroksylową
5`fosforan łączy się z resztą ε aminową
topizomeraza I rozcina 2 nicie, a topizomeraza II jedną nic
2. Deaminacja cytozyny do uracylu
we wszystkich niciach potomnych będzie mutacja
zamiana C-G na A-T
Powoduje ze mamy lepszy mechanizm ochronny, bo w RNA jest Urcyl zamiast Tyminy
Glikozydaza uranylowa naprawia mutację (usuwa uracyl)
Bierze udział w reakcji uzupełniania nici endonukleaza ap, ligaza DNA i polimeraza DNA
3. Odwrotna transkryptaza u retrowirusa
Powstanie hybryd RNA-DNA
dwuniciowe RNA wbuduje się w genom
występuje odwrotna transkryptaza występująca u eukariota, która wykorzystują retrowirusy
użyta polimeraza DNA zależna od RNA
Polimeraza DNA zależna od DNA
4. Co jest niezbędne polimerazie DNA
starter z `3OH
matrycy jedno lub dwu niciowej
Aktywności 3`-5` -ja to zaznaczyłam ale nie wiem czy to jest dobre
wszystkie cztery prekursor TRI deoxyrybonukleotydów
Mg-
5. Kod genetyczny
a) jest prawie uniwersalny
b) 3 nukletydy koduj 1 kodon np. met CAU i CAC coś tu było o synonimach ale ta odp. Jest zła bo Met koduje AUG
c) w różnych org. Różne kodony kodują inne aminokwasy co jest degeneracja
d) ma 64 kodony dla 20 aminokwasów
e) jest bez przecinkowy
6. Holoenzym polimeraza RNA u prokariota
Zawiera po jednej podjednostce α α` β σ
Po utracie jednej podjednostki może oddzaiływac efektywnie z represorem
Uczestniczą w inicjacji, elongacji i terminacji
Wiązie się specyficznie z matryca
7. Splicing
u eukriota zachodzi tak jak u prokariota
splicing autokataliczny (wymaga guanozyny lub guanylany i wieże się do miejsca splicingowego 3`
tworzy się wiązanie 2` 5` fofodiestrowe
u wyższych kręgowców w splcingu uczestniczą wystepuje splajsing przez splajsosom a u niżych kręgowców może występowa splajsing autokatalityczny
8. Transkrypcja u Eukriota
kaseta TATA jest u ekuriota i znajduje się bliżej miejsca startu niż homologiczna kaseta u prokariorta
Kaseta GC i CAAT leżą tylko na nici antysensowej
Związanie TBP do kasety TATA zapoczątkowuje transkrypcje
Jest wymagana poprzez sekwencje wzmacniające
Polimeraza RNA II potrzebuję czynników transkrypcyjnych aby zaszła inicjacja transkrypcji
10. Redagowanie
a) zwiększa różnorodność genomu
b) może zachodzić autokatalitycznie
c) zachodzi po transkrypcji
d)
e)
11. W metodzie di deoksy Sangera w jednej z mieszanin reakcyjne może się znajdować
polimeraza DNA
2`5` dideoxyanalog
(gamma P) ATP
jeden z 4 dNTP
DTP
matryca
12 bakteriofag i rec
W fazie lizogennicznej w bakterii nazywamy profagiem
Przyłancza do ssDNA-recA włącza lize
Koduje represor λ i gen cro
Cro przyłancza się do OR3 hamuje rep λ
Cor przyłancza się do )R1 hamuje rep
Koduje tylko recpresor w fazie lizogenicznej
13. Β-galaktozydaza w opreon laktozowym
Β-galaktozydaza kodowana przez Y
Β-galaktozydaza katalizuje reakcję laktoza-- glukoza +fruktoza
Β-galaktozydaza twozry 1,6 allolaktoza
IPTG induktorem niematabolizowanym przez galktozydaze i transacetylaze
Przyłącza cAMP
14. Histony
W euhromtynie acetyluje N koniec
W heterochromatynie acetyluje N koniec
Mogą by fosforyzowane, metylowane, ubikwitynowane
Tylko lizyna ulega acetylacji
Regulacja dotyczy histonów noszą nazwe kod pistonowy
(reguly rzadzace modyfikacjami hostonow to zw. hipotezą kodu
pistonowego)
(((euchromatyna zaw. reszty lizyny tylko
-heterochromatyna zaw. reszty argininy tylko))) nie wiem co z tym dostaęłm to ale ja tego nie pamietam
15. Represor transkrypcji
Przyłanazca się do regionów cis, a same z casto SA trans
Budowa modułowa
Dwa regiony wiązące
Deacyltalacja N konców
((((moga miec wiecej niz 1 aktywnosc
-reguluja transkr. przez dołączanie jednotek co prowadzi do acetylacji
N-koncow))))))
16. Doswidzcenie w którym immunoprecypitacja
wskazane regiony są aktywne transkrypcyjnie
mają więcej metylowych reszt
17 Doswidzcenie z żelem en. Restrykcyjne
DNA fluoryzuje pod wpływem bromku etylu
Najdłuzsza sekwencja sedymetuje najszybcje
Najkrótsza sekwencje sedymetuje najdłużej
Najdłużejcąłoś genomu wynosi
Ma 5 miejsc cięc
w/w żel można używać w reakcji Sangera
18. Doświadczenie sonda gen XYZ
a.) cDNA watroby jest nadekspresjonowane w kom wątroby
b.) mRNA jest nadekspresjonowane w kom wątroby
c.) analiza wykonana jest na poziomie transkrypcji
19. cechy charatketystczne mRNA eukriota
Zawyczaj powstaje z pre mRNA
Na końcu 3` posiada ogon poli A nie kodowany przez DNA matryce
Na końcu 5` jest rejon w pppG i ppp??
TWÓJ BIOTECHNOLOG https://www.facebook.com/twoj.biotechnolog