Historia Czarodziejek rozpoczyna się po 6 miesiącach od śmierci babci sióstr Halliwell - Prue, Piper i Phoebe. Do rodzinnego domu w San Francisco, wraca najmłodsza z nich, Phoebe. Odkrywa starą książkę - Księgę Cieni - na dotąd zamkniętym, zaniedbanym strychu. Czytawszy z niej inkantacje, bezwiednie uruchomiła ciąg wydarzeń, które wypełniły prastarą przepowiednie. Dziwne wydarzenia rozpoczęły się. Miały na celu wskazać siostrom, że są one czarodziejkami.
Odkrywają one, że nie tylko posiadały nadnaturalne dary, ale i należą do rodu czarownic. Pierwsza w kolejności, Melinda Warren, została spalona na stosie, podczas procesów czarownic z Salem. Jednakże, zanim umarła, przepowiedziała, że moc z każdym pokoleniem Warrenów będzie rosła, będzie silniejsza i mocniejsza, aż do przybycia trzech sióstr - najsilniejszych dobrych czarownic, jakie świat kiedykolwiek widział; Trzy siostry ukształtują Moc Trzech, prawdopodobnie największą magiczną siłę dobra.
Prue Halliwell, najstarsza z nich, ma moc telekinezy i może za pomocą oczu lub ręki przenosić przedmioty. Później zyskuje dar projekcji astralnej, który sprawia, że podczas snu jej dusza może przenieść się, gdziekolwiek chce. Piper, średnia siostra, otrzymuje moc spowalniania molekułów. Ta moc wraz z ewaluacją zmienia się także w przyspieszanie molekuł. Phoebe, najmłodsza, zostaje obdarowana bierną mocą - przeczuciem, co pozwala jej widzieć przyszłość (a następnie przeszłość). W późniejszych sezonach dostaje aktywną moc lewitacji, która przydaje się w kombinacji ze sztukami walki. Będąc złą otrzymuje moc ognia, pozwalające używać kul ognia pojawiających się, czy też wypływających z rąk. Po koronacji na Królową Podziemia może przenosić się inne miejsce. Jej dwuznaczne siły rozwijają się później w serialu, i Phoebe zyskuje moc empatii, która pozwala jej odbierać emocje innych i wpływać na nadnaturalne siły istot, których moce są związane z odczuciami, dając jej szanse wykorzystywania chwili słabości podczas ataku demonów, tak jak to widzi Walkirie w "Valhalley of the Dolls".
Po tragicznej i niespodziewanej śmierci Prue, jest ujawnione że Wybrane mają przyrodnią siostrę o imieniu Paige, córkę Patty i Sama, jej ducha światłości, anioła stróża wiedźm. Jako, że ten typ relacji był zakazany i niespotykany w tym czasie, oddali dziecko Siostrze Agnieszce, zakonnicy, a następnie rodzina Matthews zaadoptowała ją. Jej biologiczni rodzice poprosili jedynie, aby jej imię zaczynało się na 'P', aby kontynuować tradycję. Po ojcu, duchu światłości, Paige odziedziczyła moc "orbitowania" - przenoszenia się. Po odrodzeniu mocy trzech Paige otrzymuje moc telekinezy orbitalnej, czyli jest zdolna do teleportowania dowolnego przedmiotu w miejsce, które sobie wyobrazi, najczęściej są to jej ręce. Choć jednak moc ta wymaga używania werbalnych komend, może to robić bardzo cicho w obliczu większej siły, ale również w kilku innych przypadkach. Ta siła nazwana jest orbingiem telekinetycznym. W sezonie 5, Paige ujawnia, że ma także inne moce duchów światłości, jak np. zmiana wyglądu (glamouring). Przez połowę sezonu 8 Paige ujawnia więcej i więcej ze swej "światło duchowej" strony, będąc zdolną do uzdrawiania i umiejscawiania ataków poprzez widzenie ich.
Jednym z głównych wątków to próba balansowania i utrzymania w zgodzie zwykłego życia i władania ponadnaturalnymi zdolnościami. Brzemię zatrzymania tajemnicy w otaczającym świecie powoduje niejednokrotnie konflikty w przyjaźniach, pracy i romansach. Tylko niewielu zna ten sekret i przez to im pomaga. Najważniejszym z nich jest Leo Wyatt, duch światłości wyznaczony przez Starszych do prowadzenia i ochrony sióstr. Leo "ubił dobry interes" z siostrami zawodowo i osobiście: trzyma je przy zdrowiu, radzi wszystkim i każdej z osobna, a także mediuje pomiędzy nimi, a enigmatycznymi Starszymi. Staje się również miłością życia Piper, jej mężem i ojcem jej dzieci. Inni, którzy trzymali w ukryciu sekret sióstr to policjant Andy Trudeau i Darryl Morris, torturowany pół-demon Cole Turner, zagadkowy podróżnik w czasie Chris Perry, który okazuje się być synem Piper i Leo, siostry Christy i Billie Jenkins, mąż Paige, Henry Mitchell i wiele, wiele innych stworzeń z magicznego świata.