pytania egzamin Genetyka Molekularna, Biotechnologia, Genetyka molekularna


1 Podać przyczyny mutacji u kukurydzy
Zabarwienie ziarniaków kukurydzy powstaje w wyniku produkcji barwnika. Jeśli w sekwencję genu kodującego barwę ziarniaka zostanie wstawiony transpozon, gen zostanie wyłączony. Wycięcie transpozonu przywróci funkcje genu. Transpozycja jest dziedziczona klonalnie, tzn wystąpi w grupie komórek potomnych powstałych na drodze podziałów mitotycznych komórki, w których zdarzenie transpozycji miało miejsce.

2 U kogo występuje najbardziej upakowany genom?
U Prokariota, np. E coli 90% upakowania


3 Jaki rodzaj mutacji jest przyczyną wydłużania się polipeptydu?
Transpozycja, duplikacja,

4 Za co McClintock otrzymała Nobla?
Badała rud czarnej meksykańskiej kukurydzy wykazujący niestabilna mutację zabarwienia ziarniaków i częste pękanie chromosomów.

5 Opisz sekwencje IS

IS to sekwencja inercyjna ( Insertion sequence) transpozonu DNA. Zawiera wyłącznie gen dla transpozazy, gen ten jest otoczony odwróconymi powtórzeniami IR (inverted repeats). IR maja długość 15-25bp, natomiast gen transpozazy ok. 1 000bp.

6 Struktura genomu faga Mu zdolnego do transpozycji replikatywnej
Genom faga Mu zawiera 35 genów. Na końcach genomu znajdują się odwrócone powtórzenia IR. W genomie można wyróżnić dwa geny odpowiedzialne za transpozycję: MuA - koduje transpozazę i MuB - koduje ATPazę kontrolującą wybór sekwencji docelowej.


7 Dlaczego retrowirusy i retrotranspozony są zaliczane do tej samej grupy?
Elementy te na swych końcach zawierają sekwencje LTR , które składają się z unikalnych sekwencji - powtórzeń - unikalnych sekwencji (U - R - U). Elementy te niosą geny integrazy i odwrotnej transkryptazy RT.

8 Co to jest mediator?
Kompleks białek pośredniczących między aktywatorami i represorami a polimerazą, z którą oddziaływuje przez jej domenę CTD. Różne aktywatory łączą się z różnymi podjednostkami mediatora.

9 Co to jest silencer?
Silencer jest to wyciszacz, czyli regulatorowa sekwencja DNA do której przyłącza się represor osłabiając transkrypcję.

10 Enhancer
Enhancer czyli wzmacniacz jest sekwencja regulatorowa DNA, z którą łączy się aktywator przyspieszający transkrypcję.

11 Co to jest izolator?

Izolator (insulator) jest to sekwencja regulatorowa DNA do której przyłączają się białka izolujące aktywator.

12 Represor
Białko regulatorowe wiążące się z wyciszaczami (silencer) osłabiając transkrypcję.

13 Aktywator
Białko regulatorowe wiążące się z wzmacniaczem (enhancer) przyśpieszające transkrypcje.

14Jakie znasz sekwencje powtarzane tandemowo?
- DNA satelitarny
- DNA mikrosatelitarny
- DNA minisatelitarny

15 Powstawanie zmian w liczbie sekwencji powtarzalnych w wyniku.......

16 Co wchodzi w skład pozajądrowego DNA?
- genom mitochondrialny, cząsteczki DNA najczęściej koliste lub liniowe o długości 6-500kb

- genom chloroplastowy, koliste cząsteczki o długości 120-200kb

17 Budowa transpozonu złożonego Tn10 bakterii
Tn10 na swych końcach posiada sekwencje SI zawierające odwrócone powtórzenia IR, w centralnym regionie transpozonu znajduje się gen odporności na tetracyklinę. Sekwencje SI maja długość 1 400bp, a Central region 6 500bp co w całości daje 9 300bp.


18 Do czego służy elektroforeza?
Elektroforeza jest to metoda rozdziału cząstek naładowanych w polu elektrycznym, polegająca na wędrówce fragmentów DNA o ładunku ujemnym od anody do katody. Krótsze fragmenty DNA w żelu agarozowym wędrują szybciej. Na migrację DNA wpływają także: stężenie agarozy, natężenie pola elektrycznego, skład i siła jonowa buforu, konformacji DNA.

19 Co transkrybuje polimeraza RNA II?
Geny kodujące białka oraz geny kodujące większość małych jądrowych RNA (snRNA).

20 Operon
Operon jest to zbiór wspólnie transkrybowanych i regulowanych genów. W skład operonu wchodzą: promotor (miejsce rozpoznawane przez polimerazę RNA), operator (miejsce gdzie przyłącza się białka regulatorowe operonu), geny kodujące białka i enzymy (geny strukturalne), terminator (odcinek genu kończący transkrypcję). W skład operonu może też wchodzić atenuator, sekwencja położona między promotorem a genami struktury. Po transkrypcji tej sekwencji powstaje fragment RNA, który może tworzyć strukturę przestrzenną - spinka terminacyjna, działającą jako sygnał do terminacji transkrypcji. Operony występują tylko u Prokariota.

21 Czym charakteryzują się sekwencje rozpoznawane przez enzymy restrykcyjne?
Sekwencje rozpoznawane przez enzymy restrykcyjne składają się z 4-8 nukleotydów, miejsce cięcia znajduję się najczęściej w obrębie tej sekwencji lub w ściśle określonej odległości od niej. Sekwencje te mają najczęściej charakter sekwencji palindromowych, czyli odczytywane na każdej z nici w kierunku od 5' do 3' są identyczne. Przecięcie endonukleazą wiązań fosfodiestrowych dwóch nici zachodzi z przesunięciem o jedną lub więcej par zasad (powstaje tzw. lepkie końce) lub bez przesunięcia (powstaje tzw. tępe końce). Częstość występowanie miejsc restrykcyjnych w genomie: (1/4)n.

22 W jaki sposób powstają izoformy?
Izoformy powstają na skutek alternatywnego składania egzonów, np. genu troponiny powstaje alfa troponina i beta troponina. Jeśli pierwotny transkrypt zawiera 5 kolejno ułożonych egzonów to w powstałych białkach troponiny alfa występuje egzon 1,2,3,5, a dla troponiny beta 1,2,4,5. Izoformy nie zawierają jednej z domen białkowych, dlatego maja różne budowy ale pełnia podobne funkcje.

23 Na czym polega rola czynnika SIGMA w regulacji genów u Prokariota?
Przyłączenie czynnika sigma zmienia rdzeń polimerazy RNA w holoenzym. Czynnika sigma bierze udział w rozpoznawaniu promotora, zwiększając powinowactwo rdzenia enzymu do niespecyficznych miejsc DNA i jednocześnie zwiększa jego powinowactwo do promotora. Czynnik nie jest konieczny do elongacji, dlatego gdy łańcuch osiągnie długość 8-9 nukleotydów czynnik jest uwalniany i może łączyć się z następnym rdzeniem polimerazy i ponownie inicjować transkrypcję. Podstawienie do polimerazy różnych podjednostek sigma inicjuje ekspresje różnych genów.


24 Co to kryptoplazmid?


25 Jakie geny znajdują się w transpozonie złożonym?
Transpozon złożony zbudowany jest kolejno z : sekwencji inercyjnej IS zawierającej IR - genu markerowego niosącego odporność na antybiotyki lub stres - sekwencji inercyjnej zawierającej IR.

26 Jak powstają wyspy CpG i dlaczego akurat w genach aktywnych konstytutywnie?
Wyspy CpG zazwyczaj maja długość ok. 2 000bp i są związane z rejonami szczególnie wrażliwymi na DNazę I. Wyspy CpG otaczają rejony promotorowe genów ulegających ekspresji prawie we wszystkich typach komórek, tak zwanych genów utrzymujących porządek w domu (housekeeping genes). Sekwencje te nigdy nie są zmetylowane.

27 Dziedziczenie epigenetyczne
Dziedziczenie epigenetyczne to dziedziczenie informacji, która nie jest zakodowana w sekwencji DNA. Informacja zawarta jest w formie chemicznych modyfikacji DNA lub białek histonowych, czyli fosforylacji, metylacji lub acetylacji.

28 Piętnowanie genomu

Piętnowanie genomu (genomic imprinting) jest to inaktywacja genu w wyniku metylacji allelu w jednym z chromosomów rodzicielskich.

29 Regulacja ekspresji genów u bakterii. Operonu laktozowy i tryptofanowy
Operon laktozowy
Operon laktozowy u E.coli zawiera geny lacZ, lacY, lacA, które kolejno kodują:

B-galaktozydazę, permeazę i transacetylazę. Permeaza laktozy transportuje laktozę do komórki, B-galaktozydaza i transacetylaza odpowiadają za rozkład laktozy do glukozy i galaktozy. Allolaktoza jest induktorem represora, który po przyłączeniu się do operatora blokuje transkrypcję - kontrola negatywna. cAMP jest induktorem aktywatora CAP, który po przyłączeniu się do CAP site zwiększa poziom transkrypcji - kontrola pozytywna.

Operon tryptofanowy

Operon trp zawiera pięć genów struktury uczestniczących w biosyntezie tryptofanu. Represor jest aktywowany do wiązania się z operatorem przez tryptofan (korepresor). Prezdwczesna terminacja transkrypcji może zachodzić poprzez utworzenie spinki teminacyjnej - ATENUACJA


30 Struktura transpozonów Ac/Dc u kukurydzy
- Ac element kodujący transpozazę

- Dc nieaktywny element kodujący transpozazę, w wyniku delecji utracił cześć genu kodującego transpozazę

- gen C kodujący enzym dający antocyjanowe zabarwienie ziarniaków

Brak transpozycji - normalne zabarwienie ziarniaka.

Transpozycja elementu Ds do genu C, gdy w genomie obecny jest element Ac - zabarwienie bezbarwne, Ac aktywuje przeniesienie Ds do genu C.

Jeśli element Ds zostanie wycięty z genu C, przy obecności Ac funkcja genu C zostanie przywrócona i powstaną plamy na ziarniaku, intensywność plam będzie zależeć od etapu podziałów komórkowych. Elementy Ds są częstymi miejscami pęknięć chromosomów.

31 Jaka role w ewolucji odgrywa obecność DNA niekodującego?

32 Model budowy nukleoidu E.coli
Nukleoid składa się z 4-50 pętli, które ulęgają superskręceniu o długości 100kb przytwierdzonych do rdzenia białkowego złożonego z gyrazy DNA, topoizomerazy I DNA, białka HU o funkcji zbliżonej do histonów.

33 Co jest podstawową jednostką budowy chromosomu u Eukariota?
-DNA 2nm

- Nukleosom (nić chromatynowa) 11nm

- Solenoid 30nm
- Włókno chromatyny (supersoleniod) 300nm
- Chromatda 700nm
- Chromosom 1 400nm

34 Genom człowieka
Ilość zasad: 3 200 Mbp
Liczba genów: 30 000 genów, najnowsze dane 25 000 genów, gdyż genom zawiera pseudogeny

Chromosomy: 23 pary chromosomów (22+XY lub 22+XX)


35 Na czym polega paradoks poziomu C DNA?
- brak bezpośredniej korelacji miedzy wielkością genomu a genetyczna złożonością organizmu,
- istnieje minimalna wielkość genomu potrzebna do osiągnięcia określonego stopnia rozwoju systematycznego.
- istnieje szeroki zakres wielkości genomów w obrębie niektórych gromad;

36 Ile zsekwencjonowano dotychczas genomów?
Realizowane projekty sekwencjonowania genomów: 2551
Opublikowane genomy: 558 gatunków, w tym Archea - 41, Bakterie - 468, Eukaryota - 49.

37 Atenuacja
Jest to przedwczesna terminacja transkrypcji występująca u Prokariota. Zachodzi poprzez utworzenie spinki terminacyjnej. Jest to przykład regulacji transkrypcji bez udziału białek regulatorowych.

38 Od czego rozpoczyna się retrotranspozycja?
Retrotranspozycja rozpoczyna się od przepisania RNA na cDNA przy udziale odwrotnej transkryptazy RT.

39 Jakie są poziomy regulacji genu Eukariota?
JĄDRO:

-upakowanie chromatyny

-inicjacja transkrypcji

-dojrzewanie mRNA i składanie egzonów

-redagowanie mRNA

-transport do cytoplazmy

CYTOPLAZMA:

-degradacja mRNA (rola microRNA)

-inicjacja translacji
-zmiany potranslacyjne białka

-degradacja białka

40 Co jest podstawowym etapem regulacji aktywności genów u Pro- i Eukariota?
Inicjacja transkrypcji jest podstawowym etapem regulacji aktywności genów u Pro- i Eukariota.


41 Różnice między inicjacją transkrypcji i Pro i Eukariota
- u Eukariota trzy różne polimerazy RNA są odpowiedzialne za transkrypcję różnych typów genów,

- Eukariotyczne polimerazy nie mogą same rozpoczynać transkrypcji, współdziałają z ogólnymi czynnikami transkrypcji w łączeniu się z promotorem,

- miejsca wiązania białek regulatorowych ( aktywatorów i represorów transkrypcji) u Eukariota mogą znajdować się w odległości nawet kilkunastu tysięcy par nukleotydów od kontrolowanego genu

- dostępność genu do transkrypcji jest uwarunkowana stanem kondensacji chromatyny i związaniem z nukleosomami.


42 Charakterystyczne sekwencje w promotorach prokariota i eukariota
U Prokariota: UP-element (upstream element) występujący w niektórych silnych promotorach np. dla genów rRNA, rejon -35 TTGACA, rejon -10 bogaty w AT, i +1 start transkrypcji.

U Eukariota: rejon -75 kaseta CAAT występuje czasami, -25 kaseta TATA i +1 start transkrypcji.

43 Geny szoku cieplnego
Odpowiedz stresowa będąca odpowiedzą na szok cieplny polega na szybkiej indukcji syntezy białek stresowych. Białka szoku cieplnego mogą renaturować lub degradować zdenaturowane białko. Geny stresu cieplnego maja specyficzne promotory, które są rozpoznawane przez polimerazę RNA zawierającą podjednostkę sigma32, kodowana przez gen rpoH. Podjednostka sigma32 w warunkach standardowych ulega szybkiej proteolizie.


44 W jaki sposób(3 przykłady) aktywatory oddziaływają na ekspresję genów u Eukariota?
Związanie białka aktywatorowego z sekwencją wzmacniacza zwiększa wydajność transkrypcji 1 000 razy.

45 Jakie białka biorą udział w remodelowaniu chromatyny i modyfikacji histonów?
Aktywatory mogą wpływać na strukturę chromatyny przez werbowanie białek modyfikujących histony i kompleksu remodelującego chromatynę.

46 Gdzie występują specyficzne wiązania DNA-białko?
W domenach białkowych wiążących DNA

47 Budowa i występowanie domeny homeotycznej
Domena ta jest zbudowana z 60 aminokwasów, które składają się na 3 helisy alfa. Domena łączy się z DNA następująco: helisa 3 ułożona jest w większym rowku, a N-końcowa część helisy 1 oddziaływuje z mniejszym rowkiem DNA. Białka regulacji ekspresji genów w procesie rozwoju.

48 Co jest podstawa dzisiejszej nomenklatury plazmidów?

49 Do czego służy PCR?
Reakcja łańcuchowa polimerazy polega na przeprowadzenie wielu cykli syntezy DNA z wykorzystaniem termostabilnej polimerazy, nukleotydów oraz starterów komplementarnych do sekwencji flankujących powielany rejon. Reakcja przeprowadzana jest w termocyklerze.


50 Procentowy udział DNA powtórzonego?
43,7% lub ok. 50%

51 Procentowy udział DNA kodującego?
1,5%

52 Jakie oddziaływanie odpowiada za tworzenie struktury 30 nm?
Włókno chromatynowe utrzymywane jest dzięki oddziaływaniom N-końcowych ogonów histonów z rdzeniami sąsiadujacych nukleosomów. Nie zależy od histonu H1.

53 W jakim miejscu musi wstawić się transpozon aby gen był nieaktywny?
- w sekwencję kodującą
- w promotor lub inne odcinki regulatorowe

- w sekwencję styku egzon/intron

54 Jakie skutki ma acetylacja N końcowych ogonów histonów?
Acetylacja histonów czyli przyłączenie grupy acetylowej do reszty lizynowych w N-końcowym fragmencie każdego histonu rdzeniowego. Acetylacja zmniejsza powinowactwo histonów do DNA i osłabia oddziaływania między samymi histonami. DNA staje się dostępne transkrypcyjnie.


55 Podaj przykłady dla roślin sytuacji gdy wbudowanie się transpozonu powoduje wyłączenie genu?
- u kukurydzy zabarwienie ziarniaków, wbudowanie transpozonu powoduje wyłączenie funkcji genu,

- u lwiej paszczy zabarwienie kwiatów i liści, wbudowanie transpozonu do genu powoduje inaktywacje genu,

- u grochu pomarszczone nasiona, wbudowanie transpozonu do genu warunkującego enzym ze szlaku syntezy skrobi;


56 Na czym polega rola represora u Eukariota
Główną rola represora jest regulacja ekspresji genów, łącząc się z sekwencją wyciszacza, represor powoduje osłabienie transkrypcji.

57 Na jakim poziomie jest regulacja ekspresji białek rybosomalnych u Prokariota
Regulacja syntezy białek rbosomalnych przebiega na poziomie inicjacji translacji. Białka rybosomalne są represorami swej własnej syntezy. Jedno z białek rybosomalnych wiąże się ze swym mRNA w pobliżu miejsca inicjacji translacji, zapobiegając translacji całego operonu.

58 Na co mogą wpływać aktywatory?
Aktywatory mogą wpływać na poziom transkrypcji oraz na remodelowanie chromatyny i modyfikację białek histonowych.

59 Rola plazmidu pomocniczego w koniugacji trójskładnikowej

60 Mechanizmy powstawania nowych genów w genomie wymień
- duplikacja niektórych lub wszystkich genów

- nabywanie genów od innych gatunków, czyli horyzontalny transfer genów

61 Mechanizmy powstawania nowych genów przez duplikację grup genów lub fragmentów
- nierównomierny c/o

- nierównomierna wymiana siostrzanych chromatyd

- duplikacja eksonów

- tasowanie eksonów


62 Co powoduje utrzymanie funkcjonalnych genów w rodzinie wielogenowej
Ewolucja zespołowa oparta na wielokrotnej konwersji genów.

63 Co to ewolucja zespołowa?
Ewolucja zespołowa - wielokrotna konwersja genów może doprowadzić do utrzymania identyczności sekwencji poszczególnych członków rodziny wielogenowej. Brak kopii RNA z mutacjami wynika z naprawy RNA (konwersji) w replikacji.

64 żadne wirusy nie wytwarzają rybosomów i ATP

65 Jak zachodzi integracja DNA bakteriofaga lambda do chromosomu E.coli

66 Poziomy regulacji genu u prokariota

67 Znaczenie metylacji DNA u Eukariota
- represja aktywności genów

- zachowanie tkankowej specyficzności ekspresji genów

- zapobieganie transpozycji ruchomych elementów

- hamowanie rekombinacji miedzy powtarzającymi się sekwencjami w genomie
- piętnowanie genomu

68 Genetyczne skutki transpozycji

- unieczynnianie genu przez wbudowanie elementu
- powstawanie niestabilnych mutacji w wyniku wycinania transpozonów

- zmiana poziomu ekspresji genu przez wbudowanie elementu w jego pobliżu, w tym uaktywnianie nieczynnych genów
- mutacje strukturalne chrmosomów w wyniku błędnie naprawionych pęknięć w miejscach wycinania transpozonów
- rearanżacje genomu na skutek c/o miedzy homologicznymi elementami
- tasowanie eksonów
-powiększanie genomu

  1. Wybierz prawidłową odp.

  1. Temp asocjacji startera w PCR zalezy od temp jego topnienia

  2. Polimeraza Tag wykazuje optymalna aktywność w temp 94st

  3. Koniec 5' startera jest bardzo istotny dla specyficzności reakcji PCR

  4. Efekt plataeu w reakcji PCR może być spowodowany pojawieniem się denaturowanych nici DNA

  1. Wybierz poprawna odp. Ligazy SA to enzymy które:

  1. Łącza ze soba 2 nici DNA w specyficznych sekwencjach

  2. Katalizuja reakcje wydłuzenia nici DNA

  3. Katalizuja tworzenie w. fosfodiestrowych miedzy hydroksylowym koncem 3' a fosforanowym koncem 5' dwóch nici DNA

  4. Katalizuja tworzenie wiazania fosfodiestrowego miedzy hydroksylowym koncem 5' a fosforanowym koncem 3' dwoch nici DNA

  1. Wybierz odp prawidłowa. Jakich efektów możemy się spodziewac …. przyłaczania starterów w reakcji PCR temperatura była zbyt wysoka?

  1. Powstana niespecyficzne produkty reakcji

  2. Powstanie produkt o niewłaściwej długości

  3. Powstanie zbyt mało produktu

  4. Polimeraza nie będzie dobudowywac nukleotydów do pasujących….

  1. Wybierz odp prawidłowa. Od czego zalezy czas trwania elongacji?

  1. Od długości startera

  2. Od temperatury denaturacji

  3. Od długości spodziewanego cyklu

  4. Od ilości cykli

  1. W zelu agarowym najszybciej porusza się forma:

  1. CCCplazmidu

  2. LIN plazmidu

  3. OC plazmidu

  4. Wszystkie formy plazmidu poruszaja się z taka sama szybkością

  1. Podczas izolacji DNA należy zapobiegac jego degradacji przez r… W tym celu stosuje się bufory zawierające :

  1. Jony magnezu

  2. EDTA lub CDTA

  3. Duze stezenie NaCl

  4. Etanol

  1. Lizozymy w metodach izolacji DNA z kom bakterii powoduja:

  1. Dezintegracje blony cytoplazmatycznej

  2. Rozklad peptydoglikany

  3. Degradacje DNA chromosomu, pozostawiając nietknięte…

  4. Rozklad blony zewnętrznej sciany kom.

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe? W jednym operonie u Prokariota zgrupowane SA geny:

  1. Znajdujące się pod kontrola 1promotora

  2. Kodujące enzym jednego szkalu metabolicznego

  3. Kodujące białka nie powiązane ze soba metabolicznie

  4. Których transkrypcja regulowana jest zawsze przez mechanizm sprzężenia zwrotnego

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe? Metylacja DNA u eukariota powoduje:

  1. Zahamowanie transkrypcji genów

  2. Ochrone sekwencji telomerowych przed skracaniem

  3. Zapobieganie transpozycji ruchomych elementow genetycznych

  4. Zachowanie tkankowej specyficzności ekspresji genów

  1. Wybierz poprawna odp. Sekwencje LINE i SINE występujące w genomie człowieka naleza do :

  1. Retroelementów

  2. Transpozonow złozonych

  3. Satelitarnego DNA

  4. Sekwencji mini satelitarnych

  1. Wybierz poprawna odp. Minisatelity powstaja w skutek:

  1. Symetrycznego crossing over miedzy powtarzalnymi sekwencjami

  2. Asymetrycznego crossing over miedzy powtarzalnymi sekwencjami

  3. Mutacji typu nonsens w obrebie któregoś mini satelitarnego powtorzenia

  4. Mutacji typu substytucji nukleotydowej

  1. Wybierz poprawna odp. Porównujac 50-kb odcinki genomow róznych organizmów, najmniej genow w 1 fragmencie można znaleźć u:

  1. Człowieka

  2. Drożdży

  3. Kukurydzy

  4. Nicienia

  1. Przecietna długosc eksonu w genie człowieka to:

  1. 1000bp

  2. 150bp

  3. 500bp

  4. 1500bp

  1. Wybierz poprawna odp. Nieautonomiczne elementy DS. systemie transpozonow Ac/Dcu kukurydzy powstały wskutek:

  1. Delecji czesci genu transpozazy w autonomicznym elemencie Ac

  2. Duplikacji odwrotnych powtórzeń flankujących element Ac

  3. Mutacji punktowych w sekwencjach odwrotnych powtórzeń flankujących element Ac

  4. Wzajemnej rekombinacji miedzy elementami Ac

  1. Wybierz poprawna odp. Zdolnosc do samodzielnego przemieszczania się w genomie w obrebie komorki jak i miedzy kom maja:

  1. Transpozony

  2. Plazmidy

  3. Retrotranspozony

  4. Sekwencje inercyjne

  1. Wybierz poprawna odp. Minimalnaliczba genow u pasożytniczych bakterii to:

  1. 1000

  2. 500

  3. 1500

  4. 15 000

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe: Tasowanie eksonów może być związane z procesem:

  1. Asymetrycznego c/o

  2. Rekombinacji

  3. Transpozycji

  4. Konwersji

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe: Do możliwych mechanizmow działania aktywatorow u Prokariota należy:

  1. Werbowanie polimerazy RNA do promotora

  2. Acetylacja polimerazy

  3. Indukowanie zmian allosterycznych w polimerazie

  4. Indukowanie zmian allosterycznych w promotorze

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe: Oddzialywanie miedzy Dna a białkami regulatorowymi odbywa się za pośrednictwem:

  1. Wiazan wodorowych

  2. Sil van der Walsa

  3. Wiazan kowalencyjnych

  4. Oddziaływań hydrofobowych

  1. Które z poniższych stwierdzen nie jest prawdziwe: Do domen bialek regulatorowych rozpoznających sekwencje DNA naleza domeny typu:

  1. Helisa-skret-helisa

  2. Palec cynkowy

  3. Poliglutaminowa

  4. Wstega-helisa-helisa

  1. Które z poniższych twierdzen nie jest prawdziwe: Transfer Southerna związany jest z :

  1. Przeniesieniem fragmentow DNA z zelu na membrane celulozowa

  2. Hybrydyzacja z sonda molekularna

  3. Z radioaktywnym znakowaniem sondy przed hybrydyzacja

  4. Z radioaktywnym znakowaniem sondy po hybrydyzacji

  1. W nieradioaktywnej metodzie znakowania sondy w hybrydyzacji Southern blotting uzywa się :

  1. Trizol

  2. Bromophenol blue

  3. Bromek etydyny

  4. Digoxygenie

  1. Wybierz poprawna odp:

  1. PCR jest metoda jednoczenej amplifikacji kilku wybranych fragmentów DNA

  2. Reakcje PCr prowadzi się z wykorzystaniem termo stabilnej polimerazy i… leukocytow krwi obwodowej ssaków

  3. Dla przeprowadzenia reakcji PCR konieczna jest obecność jednakowych oligonukleotydow od których wolnego konca 5' rozpoczyna się polimeryzacja

  4. Prawidlowa temperatura dla asocjacji starterow w rakkcji PCR zalezy od temperatury dysocjacji

  1. Zaznacz prawidlowa odp: co przedstawia ponizszy schemat:

(wykres)

  1. Zalezny od temp. Wzrost efektywnosci dzialania

  1. Polimerazy w reakcji PCR

  1. Zalezny od temp wzrost efektywności hybrydyzacji

  1. Z sonda w hybrydyzacji typu Southern blotting

  1. Przyrost liczby kopii określonego fragmentu DNA w czasie trwania reakcji PCR

  2. Wzrost liczby fragmentow restrykcyjnych w reakcji ciecia DNA

  1. Eukariotycznego kolejno za pomoca dwoch enzymow

  2. Restrykcyjnych

  1. Znajdz twierdzenie nieprawdziwe dotyczące sekwencjonowania metoda cyklicznej germinacji lancucha:

  1. W metodzie tej dwuniciowy DNA zostaje potraktowany związkami chemicznymi rozszczepiającymi DNA w specyficznych pozycjach nukleotydow

  2. Roklad produktow sekwencjonowania prowadzony jest w zelach poliakrylamidowych w automatycznym sekwentatorze

  3. Sekwencja jednoniciowego DNA ustalona zostaje na podstawie syntezy za pomoca PCR komplementarnych łańcuchów polinikleotydowych zatrzymywanych losowo

  4. Terminacja lancucha zachodzi po wbudowaniu do niego odpowiednich dideoksynukleotydow

  1. W koniugacji trójskładnikowej rola plazmidu kom pomocniczej polega na:

  1. Ograniczeniu zdolności koniugacyjnej kom dawcy

  2. Mobilizowaniu plazmidu kom dawcy

  3. Indukcji operonu tra w kom biorcy

  4. Plazmid ten nie odgrywa zadnej roli w koniugacji trójskładnikowej

  1. POlazmid F nie koduje informacji genetyczniej dotyczącej :

  1. Syntezy piliny i formowania pilusów płciowych

  2. Autonomicznej replikacji

  3. Miejscowo-specyficznej rekombinacji

  4. Oporności na ampiciline

  1. Typem F' okreslamy plazmid który:

  1. Jest wbudowany do chromosomu kom bakteryjnej

  2. Posiada zduplikowany operon tra

  3. Nie zawiera sekwencji inercyjnej IS2

  4. Zawiera fragment chromosomu bakteryjnego

  1. Wybierz poprawna odpowiedz: Molekularne techniki analizy genomu za których odkrycie/stworzenie autorzy otrzymali nagrody Nobla to:

  1. Ekstrakcja RNA; uzycie endonukleaz restrykcyjnych; reakcja PCR

  2. Hybrydyzacja typu Southern blotting; reakcja PCR; elektroforeza agarozowa

  3. Sekwencjonowanie Dna metoda germinacji łancucha; reakcja PCR; uzycie endonukleotydow restrykcyjnych

  4. Ekstrakcja dna; elektroforeza poliakrylamidowa; sekwencjonowanie DNA metoda terminalizacji łancucha

EGZAMIN Z GENETYKI MOLEKULARNEJ gr D

  1. Co powstaje po połączeniu szczepów F- i Hfr

  2. PCR

  3. Rola ligaz

  4. Podane są warunki PCR i sekwencja starterów, reakcja trwała przez 30 rund. Pytanie: dlaczego reakcja nie zaszła?

  5. Cechy starterów w PCR

  6. Do jakiej grupy należą sekwencje LINE i SINE

  7. Budowa transpozonu złożonego

  8. Etapy transpozycji konserwatywnej

  9. Transpozycja replikatywna

  10. Rola plazmidu pomocniczego

  11. Cechy wspólne między retrowirusami i retrotranspozonami

  12. Skutki transpozycji

  13. Rearanżacje genomu wywołane homologiczną rekombinacją między elementami transpozonowymi

  14. Mechanizmy zabezpieczające przed przemieszczaniem się transpozonów

  15. Minimalna liczba genów u bakterii pasożytniczych i wolnożyjących

  16. Długość eksonów: 100-200bp

  17. Retropseudogeny

  18. Jak tworzy się rodzina genów

  19. Co to jest satelitarne DNA

  20. Mechanizmy nabywania nowych genów w genomie

  21. Przykład tasowanie eksonów: plazminogen

  22. Homeodomena

  23. Domena receptorów hormonów sterydowych: palec cynkowy

  24. Poziomy regulacji genu u Eukariota

  25. Wyspy CpG i ich funkcja w genach aktywnych konstytutywnie

  26. Acetylacja histonów

  27. Mediator

  28. Wzmacniacz, wyciszacz, izolator

  29. Aktywator, represor

  30. Na czym polega edytowanie mRNA

  31. Kofaktor endonukleaz typu II

  32. Hybrydyzacja typu Southern

  33. Polylinker

  34. Biblioteka cDNA

  35. Mapy genetyczne

  36. W jakich procesach obowiązuje zasada komplementacji

  37. Izoschizo………

Grupa C

1. retrotranspozon to:

2. rodzina genów to:

3. duplikacje segmentalne

4. dlaczego retrowirusy i retrotranspozony są zaliczane do tej samej grupy?

5. co to jest mediator?

6. jakie znasz sekwencje regulatorowe u eukariota

7. czy różni się działanie represorów u eukariota od prokariota

8. podaj przykład genu powstałego na drodze tasowania egzonów

9. ile genów mają bakterie pasożytnicze (to samo w testowym) i wolno żyjące

10. Jak powstają wyspy CpG i dlaczego akurat w genach aktywnych konstytutywnie?

11. wymień najważniejsze etapy transpozycji konstytutywnej

12. wymien różnice w transpozycji replikatywnej i retrotranspozycji.

13. testowe: ile ma przeciętny egzon człowieka (150bp)

14. mechanizmy ochrony przed transpozycją

15. Jakie białka biorą udział w remodelowaniu chromatyny i modyfikacji histonów?

16. bud i występowanie domeny homeotycznej

17. jakie skutki ma acetylacja N końcowych ogonów histonów?

18. testowe: rola plazmidu pomocniczego w koniugacji trójskładnikowej

19. mechanizmy powstawania nowych genów w gonomie wymień.

20. testowe: jakie jest prawdopodobieństwo przekazania genów w transdukcji ogólnej (takie same dla wszystkich genów - chyba)

21. testowe: o southern blotting - czy DNA jednoniciowy i sona jednoniciowa

22. testowe: PCR - zaznacz prawdziwe: że w pcr na początku dłuższe sekwencje powstają.

23. testowe: durne o fagu lambda

24. testowe: masz rozpiske temperatur w PCR i startery i czy podana temp. Annelingu :80C i 3min to: za niska i za krótko, za wysoka i za długo, za wysoka, za krótka ja dałam za wysoka i za długo.

25. testowe: masz szczep F- i Hfr co powstanie po koniugacji.

26. testowe: jaka domena białkowa w receptorach steroidowych palec cynkowy

27. testowe: LINE i SINE to : a) retroelementy .. i coś tam. Ja zaznaczyłam a

28. co to jest redagowanie mRNA (albo edytowanie teraz już nie pamiętam)

29. testowe: jak wpływa aktywator u Prokariota zaznaczyc nieprawdziwe: na polimerazę przez zmiany allosteryczne, zmiany w promotorze i werbowanie polimerazy i 4 te nieprawdziwe.

30. czemu transpozony wpływają na rearanżacje genomu.

31. które ruchome elementy odpowiedzialne są za powiększanie gonomu.

32. testowe: Czego potrzebują enzymy restrykcyjne: Mg2+ i ATP

33. testowe: Ligaza łączy wiązania 3\-OH z 5'-P



Wyszukiwarka