BIOLOGIA MOLEKULARNA - GIEŁDA

1. Polimorfizm sekwencji tandemowych w populacji oznacza:

- różną liczbę powtórzeń sekwencji mikrosatelitarnych w danym locus u różnych osób odp. prawidłowa

2. Przypadkowe rozrywanie DNA, pęknięcie błony i uwolnienie hydrolaz z lizosomów prowadzące do degradacji białek DNA i RNA wzbudzające odpowie wiedź immunologiczną to:

- apoptoza

- programowana śmierć komórki podobna do apoptozy

- nekroza - odp. prawidłowa

- programowana śmierć komórki podobna do nekrozy

3. Dignostyka molekularna genów mutatorowych jest możliwa dzięki wykrywaniu:

- zmian długości sekwencji powtórzonych (coś w tym rodzaju) odp. prawidłowa

4. W pierwotnym glejaku wielopostaciowym wykrywa się:

- LOH TP53

- delecje EGFRvIII

- amplifikacje EGFRvIII - odp. Prawidłowa * we wtórnym - mutacje TP53

5. Niedobór hormonu wzrostu i IGF-1 sprzyja:

- wydłużeniu życia

- odkładaniu B-amyloidu

- tworzeniu blaszek miażdżycowych

6. Wybierz zdanie prawdziwe:

- PrP^SC ma więcej B-struktur niż PrP^C i dlatego jest oporne na działanie detergentów - odp. prawidłowa

7. Geny „samobójcze” mogą być wykorzystywane w:

- leczeniu hemofilii A i B

- selektywnym niszczeniu komórek nowotworowych - odp. prawidłowa

- leczeniu mukowiscydozy

8. Produktem aktywacji Kaspar wykonawczych w chorobie Alzheimera jest:

- tau - odp. prawidłowa

- B-amyloid

- PSEN 1

- PSEN 2

9. W chorobie Alzheimera APOε4:

- jest czynnikiem ryzyka - odp. prawidłowa

- warunkuje chorobę

- pełni funkcje ochronne

10. Wybierz zdanie prawidłowe. B-amyloid:

- jest białkiem rozgałęzionym o dł.8-10nm

- jest białkiem nierozgałęzionym o śr.8-10nm i nieokreślonej długości

- jest białkiem rozgałęzionym o śr.8-10nm

- jest białkiem nierozgałęzionym o dł.8-10nm - odp. prawidłowa

11. Białka wykryte u drożdzy, występujące także u człowieka, powodujące powstanie „cichej chromatyny” to:

- selenoaminy

- sirtuiny (coś w tym rodzaju) - odp. prawidłowa

- sinwaskuliny

12. Geny podstawowego metabolizmu:

- występują tylko u niższych organizmów

- są konserwatywne - odp. prawidłowa

- wykazują dużą zmienność gatunkową

- a i c prawidłowe

13. rRNA jest wykorzystywany:

- do szczegółowej diagnostyki drobnoustrojów - odp. prawidłowa

- do syntezy promotorów nieznanego DNA

- do syntezy promotorów nieznanego RNA

14. Pewna choroba jest spowodowana brakiem białka XYZ. Po wykonaniu badań u osoby chorej stwierdzono obecność tego białka. Przyczyną takiej sytuacji może być:

- delecja w obrębie promotora genu kodującego to białko

- mutacja w sekwencjach regulatorowych genu

- mutacja typu missens w dowolnym eksonie (coś w tym stylu) - odp. prawidłowa

15. Elektroforeza. U pacjenta 1 w pewnym miejscu widoczne są na jednym poziomie dwa prążki w słupku C i T. U pacjenta 2 na każdym poziomie widać po jednym prążku. Wybierz zdanie prawidłowe:

- pacjent 1 jest homozygotą a pacjent 2 - heterozygotą

- u pacjenta 1 występuje mutacja - zamiana C na T

- pacjent 1 jest heterozygotą posiadającą dwa różne allele C i T - odp. prawidłowa

16. W wykryciu sporadycznego vCJD nie przydatne są badania:

1.biopsja z migdałków podniebiennych +

2.wykrywanie białka 14-3-3 +

3.EEG -

4.rezonans magnetyczny +

5.wykrywanie mutacji w genie PRPN -

17. Przenośnia prof. Ratajczaka „Jedi that went over to the dark side" znaczy:

- komórki nowotworowe mogą powstać z prawidłowych komórek macierzystych - odp. prawidłowa

18. W przypadku leczenia choroby Alzheimera czy choroby Parkinsona istnieje większa szansa na zastosowanie komórek macierzystych:

- w chorobie Parkinsona bo dopamina jest syntezowana przez komórki istoty czarnej (coś w tym stylu) - odp. prawidłowa

- pozostałe odp. Alzheimerem są nieprawidłowe

19. Ostra białaczka promielocytarna jest spowodowana:

- translokacją genu RARα i jego połączeniem z jednym z genów palca cynkowego - odp. prawidłowa

20. Sporadyczna postać choroby Addisona jest spowodowana:

- obecnością przeciwciał przeciwko 17-hydroksylazie i 21-hydroksylazie - odp. prawidłowa

21. Mutacje receptora RET aktywujące i inaktywujące występują odpowiednio w:

- MEN2b; chorobie Hirsprunga - odp. prawidłowa

- MEN2a; MEN2b

- chorobie Hirsprunga; MEN2b i MEN2a

22. Mutacje w genie HFE powodują:

- niedobór żelaza

- odkładnie nadmiaru żelaza w organizmie - odp. Prawidłowa

23. cicha heterochromatyna" - sirtuiny

24. glejak wielopostaciowy - jaka mutacja - w sporadycznym amplifikacja EGFR , w rodzinnym p53

25. rRNA???

26. czynnik wzrostu i IGF-1 -> dłużej się żyje

27. diagnozowanie sCJD

$choroba definitywna - badanie autopsyjne mózgu

$ choroba możliwa :

- szybko postępujące otępienie

- co najmniej 2 z następujących objawów : *mioklonie

* zaburzenia widzenia lub zaburzenia móżdżkowe

* zaburzenia piramidowe / pozapiramidowe

* mutyzm akinetyczny( pacjent nie reaguje na

bodźce somatyczne )

$ choroba prawdopodobna : j.w. + typowy EEG i/lub dodatni test na białko 14-3-3 w płynie mózgowo-rdzeniowym (przy chorobie trwającej < 2 lata )

28. mikrosatelity tandemowe - roznice u ludzi - głównie liczba kopii w danym locus ale także nieznaczne różnice w sekwencji nukleotydów

29. metabolizm podstawowy - konserwatywny

30. ch. Addisona autoimmunologiczna - przeciwciała przeciwko hydroksylazom biorącym udział w syntezie hormonów

31. budowa amyloidu - nierozgałęziony o długości 8 - 10 nm

32. kom. macierzyste w Parkinsonie, bo dopamina uwalniana parakrynnie

33. tabelka z dwoma pacjentami - heterozygota A i C czy jakos tk

34. budowa PrP sc - 43% struktury beta

35. kaspazy w Alzheimerze  - kaspazy wykonawcze ( głównie 3 ) tną białko tau

36. geny mutatorowe - translokacja?

37. gen XYZ (jest białko, ale ono nie działa) - mutacja missens

38. opis nekrozy

Martwica = nekroza

- proces pasywny, niezależny od ATP

- proces regulowany i enzymatyczny

- przypadkowa i bierna śmierć komórki, przypadkowe cięcie DNA

- przypadkowa destrukcja komórki wywołana poważnymi uszkodzeniami

- niekorzystne działanie czynników zewnętrznych

- wywołana przez uszkadzające czynniki biologiczne, fizyczne i chemiczne (duże dawki)

- uwolnienie hydrolaz z lizosomów

- wywołanie odpowiedzi układu immunologicznego - rozwinięcie stanu zapalnego

- zaburzenia homeostazy grupy komórek, utrata selektywnej przepuszczalności błony oraz napływ wody i jonów (Na i Ca)

- pęcznienie komórki - cytoplazmy i organelli

- utrata zdolności do zachowania równowagi wodno - elektrolitowej

39. epsilon4 (E4) ApoE - zwieksza ryzyko Alzheimera

44. geny samobójcze w chorobach nowotworowych

45. RAR alfa + gen palca Zn

46. Jedi that went... - mutacja kom macierzystej

47. Choroba sprzężona z mutacją chromosomu X to

- mutacje dynamiczne, np. zespół łamliwego chromosomu X

- mutacje recesywne, np. dystrofia mięśniowa, daltonizm, hemofilia A i B

-mutacje dominujące, np. zespół Reta

48. Kolejność potencjalności komórek toti multi pluri unipotencjalna

51. zkodliwość poliglikozylacji białek chyba było do kolagenu ( polyglicosylation and ... ) ????!!

52. najczęstsza choroba otępienna krajów dalekiego wschodu - zmiany naczyniowe

w Europie: choroba Alzheimera - 50 - 60 %

przyczyny naczyniowe - 5 - 20 %

otępienie z ciałami Lewy'ego - 15- 20 %

otępienie czołowo - skroniowe - 10 %

53. Białko beta APP jest szkodliwe w formie dłuższej bo szyciej powoduje odkładanie amyloidu

54. Badanie sCVD potwierdza - definitywnie badanie pośmiertne mózgu

55. dekontaminacja prionow (poprawna odp- NaOH; pozostale odpowiedzi- zle- alkohol, autoklawowanie i cos jeszcze)

57. technika PCR pozwalajaca na badanie wielu genow na raz (multiplex PCR, to TRZEBA było wybrać:)

58. AD i jakie mutacje, jakie geny (poprawna odpowiedz to ta z gamma-sekretaza, te z APOE natomiast byly zle:)

59. anemia sierpowata (wybrac wykres- prawidlowa odpowiedz wygladala tak, ze w warunkach zmniejszonego cisnienia parcjalnego tlenu krwinki byly sierpowate, a normalnych warunkach byly normalne:)

60. mukowiscydoza, AD

61. pytanie o mtDNA

a) w efekcie pietnowania rodzicielskiego moze pochodzic od ojca (zle)

b) nie podega zmianom bo nie zachodzi crossing-over - poprawna odp.

c) umozliwiaja okreslenie jakie przebylo sie choroby (zle)

d) w wypadku uszkodzenia powoduja choroby, ktore ujawnia sie w pozniejszym wieku

62. E. coli coś tam (-> co wprowadzamy do E.coli, zeby produkowala ludzka insuline-

1. gen hormonu,

2. pro hormonu - prawidłowa odp.

3. czy tez moze preprohormonu:) ,

d) może z ziemniakiem

63. co wykrywamy, czy co wzrasta przy nasiolnej apoptozie (-> odp- dobra odpowiedzia bylo wzrost aktywnosci kaspaz; poza tym byly jeszcze odpowiedzi- abnizenie aktywnosci kaspaz, spadek ekspresji BAX, wzrost ekspresji BOL2 i one akurat byly zle)

64. dlaczego chromosomy sie skracaja przy kolejnych podzialach (odpowiedzi:

a) polimeraza nie potrafi uzupelnic luki po starterze na koncu chyba 5' - prawidłowa odp

b) telomeraza nie potrafi uzupelnic luki po starterze (...)

65. te nukleotydy, starter i kiedy mutacje wykryjemy

66. budowa bialka prionowego (procentowo- alfa felisy tyle %, beta struktur tyle...) 43% beta i 57% alfa

67. mutacje w glejaku

a) amplifikacja MDM2, mutacja TP53

b) amplifikacja EGFR mutacja TP53 - prawidłowa odp.

c) amplifikacja EGFR i amplifikacja MDM2

d)utrata heterozygotycznosci na chromosomie 10

68. tego z modelami chorob nie jestem w stanie odtworzyc i chyba tylko jeden autor wie o co w nim chodzilo

69. terapia genowa w mukowiscydozie

70. transgeniczna krowka (tzn jak zrobic zeby produkowala ludzkie mleko-> wprowadzamy gen do zarodka i musi nam z tego wyrosnac krowa- natomiast NIE wprowadzamy genu do wymion doroslej krowy:)

71. wynik elektroforezy- ustalic, czy tatus to tatus itp (tu akurat poprawna odpowiedzia bylo, ze tatus jest homozygota)

72. pytanie o teorie opisujace zmiany molekularne lezace u podloza nowotworow (trzeba bylo wiedziec co mowi teoria standartowa, zmodyfikowana standartowa i teoria pananeoploidii)

- teoria standardowa - 1. Kancerogeny zmieniają sekwencję DNA.

2. Mutacja genów supresorowych.

3. Mutacje onkogenów prowadzą do ich aktywacji.

4. Wzrost liczby zmutowanych komórek.

5. Inwazja i powstawanie przerzutów.

- teoria zmodyfikowana standardowa - 1. Kancerogen uszkadza wiele genów, w tym geny naprawy DNA

2. Nieusunięte zmutowane geny powielają się.

3. Mutacje genów supresorowych i aktywacja onkogenów.

4. Inwazja i powstawanie przerzutów.

- teoria paneuploidii - 1. Błąd w podziale komórkowym prowadzi do powstania komórek

aneuploidalnych.

2. Uszkodzone chromosomy zmieniają proporcje występowania

tysięcy genów (brak naprawy DNA).

3. Aneuploidalne komórki umierają, ale część przeżywa i daje

początek nowotworowi.

4. W wyniku ewolucji klonalnej dochodzi do inwazji tkanek sąsiednich

oraz powstawania przerzutów.

- teoria wczesnej niestabilności - 1. Kancerogen uszkadza kilka genów odpowiedzialnych za podział

komórek.

2. Komórki potomne otrzymują niewłaściwą liczbę chromosomów.

3. Mutacje genów supresorowych i aktywacja onkogenów.

4. Inwazja i powstawanie przerzutów.

73. mutacja spowodowala zamiane aminokwasu na inny w obrebie genu promotorowego. mutacja ta: prawidlowa odp- bedzie szkodliwa, jesli bialko bedzie produkowane w nieprawidlowej ilosci

74. protoonkogeny nie ulegaja przemianie w onkogen przez:

a) amplifikacje

b) delecję części lub całego genu - prawidłowa odp.

c) mutacje punktowa

d) integracje retro wirusa

75. MDM2/EGFR tu chyba chodzi o glejaka wielopostaciowego, że jest w nim amplifikacja MDM2 i EGFR

76. PrSC 43-beta-helikalna 30%

77. Huntington/antycypacja z każdym pokoleniem wzrasta liczba powtórek sekwencji CAG oraz są cięższe objawy i wcześniej

78. Multiplex PCR - amplifikacja wielu genów na raz

79. Ojcowstwo-homozygota

80. Mukowiscydoza

81. coś o jakimś promotorze- gzie mutacje?

82. Imatinib- inhibitor kinazy białkowo-tyrozynowej ( Glivec)

83. Insulina produkowana przez drożdże lub E. coli w postaci prohormonu

84. Anemia sierpowata - tam były jakieś cholerne wykresy w zależności od ciśparcjalnego O2 czy jakoś tak

85. priony - degradacja

86. Geny mutatorowe

87. 6 izoform, alternatywny splicing

zapewne chodzi o białko tau ( zależnie od obecności eksonów 2, 3, 10 )

- oznaczenia : 3r - gdy nie ma eksonu 10 i są tylko 3 fragmenty 30 aa z 4 występujących zwykle

4r - gdy jest 10 ekson i są 4 fragmenty 30aa

88. Trójkąciki w każdy trójkąt trzeba było umieścić odpowiednio różne schorzenia np cukrzyca miażdzyca , huntington itp w zależności od rodzaju etiogenezy np wieloczynnikowe, z przewagą wpływu środowiska , genetyczne, 1genowe wielogenowe

Choroba Huntingtona - genetyczna jednogenowa

Cukrzyca i miażdżyca - wieloczynnikowe z przewagą wpływu środowisk

89. Alzheimer - czynniki ryzyka genetycznego? izoforma epdilon4 apoE,

90. Co aktywuje protoonkogeny -> czynniki transkrypcyjne

91. szlak raka jelita grubego Vogelgram ...w odp byly te wszystkie zaburzenia na kazdym etapie do opisania

1. utrata genu APC

2. hipometylacja DNA

3. aktywacja Ki-RAS

4. utrata DCC ( Deleted In colon cancer - molekuła adhezyjna na 18 chromosomie )

5. utrata TP53

92. cos ze smiercia komorki...odpowiedzi były: autofagia...apoptoza...nekroza i cos jeszcze

93. rak drobnokomorkowy pluc i chodzilo o odp z tm POMC

94. choroba sprzezona z plcia....agammaglobulinemia brutona

95. westerne blotting- badanie ciezaru bialka

96. rysunek byl z chromosomami- chodzilo o cos , ze po mutacji bedzie na 1chromosomie gen aktywny non stop a na 2 cos tam=>zmian nowotworowej

97. virusa HIV jak wykrywamy

przeciwciała anty- HIV ( 2-3 miesiąc - po okienku serologicznym )

poszukiwanie białka p24 metodą Westerm btotting ( 2 tydz.)

poszukiwanie RNA metodą PCR ( 1-2 tyg. )

98. cos ze szkodliwością Poliglikozylacji białek chyba było do kolagenu (polyglicosylation and ... ) ????!!

(teoria sieciowania starzenia ?? )

99. KIT ??,hipermetylacja ...

100. Białko beta APP jest szkodliwe w formie dłuższej bo szyciej powoduje odkładanie amyloidu

101. rRNA do rozróżniania drobnoustrojów

102. czynnik wzrostu i IGF-1 -> dłużej się żyje

103. mikrosatelity tandemowe - roznice u ludzi

104. pytanie:terapia genowa- selektywne niszczenie komórek nowotworowych

105. charakterystyczne zaburzenie genetyczne w chłoniaku Burkitta translokacja c-Myc do promotora immunoglobulinowego IgH

106. co to jest efekt sąsiedztwa w terapii genowej - wkłada się do komórki za pomocą wektora jakiś enzym, a następnie podaje się lek przeciwnowotworowy w postaci pro leku aktywowanego przez ten enzym. Jeżeli lek dyfunduje do przestrzeni międzykomórkowej to działa także na sąsiednie komórki nowotworowe, które nie dostały genu enzymu.

107. vCJD i jego cechy charakterystyczne (EEG, u młodszych czy starszych, przebieg długi czy krótki, otępienie jest czy nie, zaburzenia psychotyczne są czy nie)

- brak typowego EEG

-długi przebieg ok. 13 mies.

- u młodych - średni wiek chorych 28 lat

-otępienie rzadko, jeżeli tak to na końcu

-objawy psychiczne, czuciowe, mioklonie - często

- dyzestezje i bóle kończyn dolnych przez cały okres choroby

108. Mutacje w kodonie 129 jaki choroby powstaną - GSS, FFI, fCJD

109. zespół łamliwego chr. X (zaznaczyłem odp. Z lionizacją , pionizacja to jest przy chorobach recesywnych sprzężonych z X ) - mutacja dynamiczna w promotorze genu kodującego białko FMR1, niezbędne do rozwoju synaps

110. odhamowanie seksualne u pacjentki z choroba Picka - tauopatia

111. Powstawanie amyloidu w szlaku amyloidogennym (sekretazy beta i gamma itd.)

112. Szczepionka podjednostkowa (… epitopy toksyny cholery w rzęskach bakterii)

113. Antygeny HbsAg w drożdżach jak to uzyskać? wkleić pod promotor jakiegoś konstutywnego genu DNA dla antygenu Hbs

114. gen XYZ nastąpiła zamiana guaniny na adeninę i co będzie w białku … (zaznaczyłem że jest zmiana 1 aminokwasu w białku) - zmiana 1 aminokwasu lub nie ma zmiany gdy kodon pasuje dla tego samego tRNA

115. co trzeba zrobić żeby naprawić powyższa mutację w XYZ -

116. rysunek prążków po RFLP który badał chyba ojcostwo…

117. jakie badania zrobić trzeba na HCV (6tydz - serologia, 1-2 tydz PCR z odwrotną transkrypcją, Westernblotting)

A. odwrotna restrykcja i RT PCR

B. odwrotna restrykcja i PCR z przeciwciałami

C. badania serologiczne z zastrzeżeniami - wybrałem C ?

D. odwrotna transkrypcja i Western blotting ?

118. funkcje w cyklu komórkowym hipofosforylowanego białka pRB

forma hipofosforylowana:

- zapobiega proliferacji komórki

- występuje w fazie G1

- kompleks z innymi białkami

forma hiperufosforylowana:

- sprzyja proliferacji

- w fazie S, G1, M

- uwalnia czynniki transkrypcyjne

119. działanie białka p53 gdy Dna jest uszkodzony - zatrzymuje cykl w punkcie G1/S - aktywuje mechanizmy naprawy DNA lub indukuje apoptozę

120. telomery w komórkach ich funkcja w kom - zapobiegają sklejaniu się chromosomów, odpowiadają za właściwe umiejscowienie chromosomów w jądrze, zapobiegają skracaniu

121. rysunek z prążkami matka ojciec dziecko i były odp. A: dziecko jest chore B:rodzice są heterozygotami C: dziecko przekaże cechę potomstwu D:wszyscy powinni kontrolować poziom enzymu)

122. roznica miedzy vCJD a forma sporadyczna

sporadyczna CJD - brak mutacji, brak zmian w sekwencji aminokwasowych, śr. 66 lat, rzadko objawy psychiatryczne i objawy czuciowe, często mioklonie i postępujące otępienie, białko 14.3.3 u 90%, typowe EEG - periodyczne fale wolne i ostre, MRI - hiperintensywny sygnał w obrębie skorupy, jądra ogoniastego i okołokomorowego, ostateczna diagnoza - po śmierci

wariant CJD - od krów chorych na BSE, dotyczy osób śr 28 lat, często objawy czuciowe, psychiatryczne i mioklonie, rzadko postępujące otępienie, nieprawidlowe białko nie tylko w mózgu, badanie potwierdzające - wycinek z migdałków podniebiennych, wszystkie przypadki to MetMet, brak typowego EEG

123. elektroforeza: ktora sekw. Powtarzająca jest dluższa elektroforeza: ojciec, matka, dziecko, enzym restrykc. trawi sekwencje prawidlowa trzeba bylo zaznaczyc czy rodzice są heterozyg. albo czy dziecko

jest chore a rodzice zdrowi itp

124. objawy choroby Picka

- faza wczesna: zaburzenia zachowania, językowe

- faza pośrednia: deficyt pamieci

- faza w pełni rozwiniętej choroby: ogniskowe deficyty poznawcze

- zanik płatów czołowych i skroniowych, ciężar mózgu 750-900g, większy zanik w półkuli dominującej

125. lionizacja u kobiet (odpowiada za roznorodność objawow chorob sprzęż z X)

126. PrPsc ile procent 43% struktury beta

127. mDNA

Choroby mitochondrialne - choroby genetyczne wynikające z zaburzeń w funkcjonowaniu i strukturze mitochondriów. Objawy chorób mitochondrialnych związane są zwykle z tkankami o wysokim zapotrzebowaniu energetycznym np. mięśniami szkieletowymi lub układem nerwowym, i zazwyczaj obejmują miopatie, encefalopatie oraz neuropatie. Szacuje się, że na choroby mitochondrialne zapada 1 na 15 000 osób.

Choroby mitochondrialne mogą być spowodowane:

• mutacjami w genomie mitochondrialnym (mtDNA)

• mutacjami w jądrowym DNA kodującym białka specyficzne dla mitochondriów oraz związane z regulacją ich funkcjonowania.

Mitochondria dziedziczone są niemal wyłącznie w linii matczynej, ponieważ wszystkie lub niemal wszystkie pochodzą z oocytu, a bardzo nieliczne (jeśli w ogóle) są przekazywane w plemniku, a w zygocie te pochodzące od ojca są niszczone. Zatem choroby mitochondrialne spowodowane mutacjami w genomie mitochondrialnym dziedziczą się po matce, natomiast zapada na nie potomstwo obu płci.

Komórka zawiera kilka tysięcy mitochondriów, a w każdym z nich znajduje się kilka cząsteczek mtDNA. Cząsteczki te nie zawsze są identyczne. Zjawisko to nazywa się heteroplazmia. Przy podziałach komórki mitochondria rozdzielane są do komórek potomnych losowo. Zatem objawy choroby zależą od stosunku prawidłowego mtDNA do mtDNA niosącego mutację i pojawiają się po przekroczeniu pewnej wartości progowej. Wartość progowa jest różna dla różnych tkanek (przy czym jest niższa dla tkanek o wysokim zapotrzebowaniu energetycznym, takich, jak mięśnie czy mózg) i dla różnych mutacji. Powoduje to, że objawy kliniczne chorób mitochondrialnych i ich nasilenie mogą się znacznie różnić u różnych pacjentów.

1. schemat-ojcostwo

2. cytozyna->tymina co się dzieje

3. geny w rodzinnej ch.Alzhajmera - PS1, PS2, APP

4. protoonkogeny->onkogeny

mechanizm aktywacji protoonkogenenów:

• mutacja punktowa

• amplifikacja

• translokacja chromosomowa

• integracja retrowirusowa

1. schemat ze sporadyczna miazdzyca i ch.Alhajmera miażdżyca -> nadciśnienie -> większe ryzyko Alzheimera?

2. leczenie mukowiscydozy - wprowadzenie genu CFTR

3. cos z apoptoza (wzrost aktywnosci BAC-1)

4. geny mutatorowe - geny naprawy DNA, aktywowane gdy nieprawidłowe sprawanie zasad, mutacja tych genów - zespoły niestabilności chromosomowej (zespół Luis - Bar i zespół Nijmegen), charakter recesywny mutacji

5. GLIVEC-opd. Prawidlowa:hamuje kinaze tyrozynowa (Glivec = imatinib)

6. anemia sierpowata-rysunek

7. bialko MAP-tau

8. glejak pierwotny -mutacja EGRF, wiek 55 lat

9. plasawica Huntingtina (były podane jakies liczby np.764)

• < 26 - zdrowy

• 27-35 - premutacja

• 36-39 - niepełna penetracja

• > 40 penetracja 100%

• > 50 wczesny wiek zachorowania

1. ile izoform(2wystepuja z 3...)

2. mutacja (20 par zasad i starter94)obliczyc

3. znaczenie rRNA w bad. nad wirusami

4. pytania o szczepionki genetyczne (drożdże z wbud. genem kodujacym jakis antygen i odzjadliwiona bakteria z epitopem Vibrio cholerae)

5. terapia genowa w chorobie spowod. mutację punktową (mukowiscydoza?)

6. czynniki sprzyjające rozwojowi raka piersi

• dieta bogatokaloryczna

• wczesna pierwsza miesiączka, bolesność, późny wiek pierwszej ciąży, późny wiek menopauzalny

• zaburzenia równowagi hormonalnej (pigułki, HTZ)

• otyłość

1. translokacja w chłoniaku Burkitta - tranlokacja c-Myc do promotora immunoglobulin IgH [t(8,14)(q24,q32)]

2. kiedy ma miejsce skracanie końców chromosomów - po podziałach gdy nie ma telomerazy

3. substrat dla sekretazy gamma - gdy działała wcześniej sekretaza alfa - fragment zewnątrzkomórkowy C83, gdy sekretaza beta - fragment zewnątrzkomórkowy C99

4. coś o RT-PCR

Real - Time PCR

• wykorzystując techniki fluorescencyjne, pozwala na monitorowanie ilości produktu reakcji w każdym cyklu prowadzonej reakcji PCR

• pozwala na oszacowanie ilości produktu na początku reakcji, co jest niemożliwe w konwencjonalnej metodzie PCR.

• Oprócz starterów są fragmenty komplementarne do badanego genu na sondzie - na jednym końcu jest wygaszacz na drugim wzmacniacz. Podczas PCR wygaszacz jest odłączany - pozostaje wzmacniacz - emituje światło

RT - PCR

• Synteza DNA na matrycy mRNA odbywa się przy użyciu odwrotnej transkryptazy (RT). Następnie DNA namnaża się za pomocą zwykłej reakcji PCR. Metoda ta pozwala na amplifikację wyłącznie sekwencji zawartej w dojrzałym mRNA, a więc tylko egzonów. Powstały DNA określany jest jako cDNA - komplementarny DNA.

Poszukiwanie wirusów RNA

1. U kogo wcześniej pojawią się objawy choroby Kennedy'ego - zależy od ilości kopii genu im więcej kopii genu tym wcześniej

2. Piętnowanie matczyne/piętnowanie ojcowskie

Piętnowanie matczyne IGF2

Piętnowanie ojcowskie IGF2R

IGF tylko z allelu ojcowskiego a IGF2R tylko z allelu matczynego

epigenetyczne wyciszanie-metylacja dna, sekwencja taka sama,ale chromosom ojcowski inaczej zmetylowany

3. cicha mutacja MDR - nie ma zmiany sekwencji aminokwasowych, zmienia się konformacja białka -

zmienia się tRNA, białko czeka na rybosomie dłużej->zmiana fałdowania już na rybosomie-różne stęż. t RNA-różny czas przenoszenia aminokwasu

4. klasyfikacja kom. macierzystych

totipotencjalna komórka macierzysta- komórka zdolna do przeobrażenia się w dowolne komórki organizmu, dzięki niej mogą powstać wszystkie listki zarodkowe, a także pępowina i łożysko.

pluripotencjalna komórka macierzysta- komórka multipotencjalna jest w stanie różnicować się do komórek wszystkich listków zarodkowych, nie mogą powstać dzięki różnicowaniu tej komórki pępowina i łożysko.

multipotencjalna komórka macierzysta- komórka umożliwiająca otrzymanie kilku rodzajów komórek, należących do tego samego listka zarodkowego, lub tej samej tkanki np. hematopoetyczna komórka pnia (HSC), neuropoetyczna komórka pnia (NSC).

5. jaki mechanizm zapewnia kom. macierzystym nieśmiertelność: telomeraza, podział asymetryczny i samoodnowa

6. jakie metody zastosowania kom. macierzystych należą do strategii biotechnologicznej a jakie do fizjologicznej

fizjologiczne: koncepcja ratajczaka, nisze komórek macierzystych, krew pępowinowa

biotechnologiczne: klonowanie, reprogramowanie

7. czym różni sie klonowanie terapeutyczne od reprodukcyjnego - reprodukcyjne: wytworzenie osobnika dorosłego, będącego kopią ge-netyczną osobnika, od którego pobrano materiał genetyczny;

terapeutyczne: polega na trwającej do dwóch tygodni hodowli zarodków w celu uzyskania komórek macierzystych, miałyby one służyć „wyhodowaniu” tkanek lub narządów potrzebnych do przeszczepów

Co to jest reprogramowanie w odniesieniu do terapii kom - prowadzi do powstania komórki pluripotencjalnej, wykorzystuje się znajomość genów komórki jajowej dzięki którym ta komórka może owdrócić zmiany epigenetyczne DNA np komórki fibroblastów. Zastąpi klonowanie terapeutyczne

8. które z metodoligii stosowanej w terapii kom. umożliwiają wykonanie przeszczepu autologicznego

- nisze komórek macierzystych

- reprogramowanie

- plastyczność (metody fizjologiczno - biochemiczne)

- koncepcja Ratajczaka

9. dlaczego terapia kom. ma większe szanse być zastosowana w leczeniu osób z chorobą Parkinsona niż z chorobą Alzheimera - zmiany w chorobie Parkinsona są dobrze zlokalizowane: istota czarna, natomiast w chorobia Alzheimera zmiany są rozsiane w mózgu

10. czy prawidłowe kom. GFAP-pozytywne to zawsze typowe astrocyty - mogą być dojrzałymi astrocytami lub komórkami macierzystymi astrocytów

11. dlaczego terapia gen. w której zastosowane są kom. macierzyste może być skuteczniejsza od terapii genowej w której wykorzystywane są kom. Dojrzałe - jest trwalsza

12. czy możliwe jest otrzymanie zwierząt chimerowych - tak np. Myszy produkujące ludzkie komórki jajowe, kozy z ludzkimi sercami

13. jak obecność nowotworowych kom. macierzystych próbuje się wykorzystać w terapii przecienowotworowej - komórki macierzyste nowotworów odpowiadają za jego odnową, dlatego próbuje się eliminować komórki macierzyste

Vogelgram kolejność mutacji w torze mutatorowym jelita grubego były
m in takie ale nie po kolei LOH 5 q , LOH Tp 53

---