Aby rozpocząć prowadzenie gospodarstwa metodami ekologicznymi należy zapoznać się z zasadami dotyczącymi tej metody produkcji żywności. W tym celu producent powinien wziąć udział w kursach podstawowych rolnictwa ekologicznego organizowanych przez Ośrodki Doradztwa Rolniczego oraz zapoznać się z przepisami obowiązującymi w zakresie rolnictwa ekologicznego. Następnie rolnik powinien wypełnić formularz zgłoszeniowy (tzw. Zgłoszenie działalności w rolnictwie ekologicznym) i przesłać do wybranej upoważnionej jednostki certyfikującej i właściwego wojewódzkiego inspektora Jakości Handlowej Artykułów Rolno-Spożywczych.
Obowiązek zgłoszenia działalności w rolnictwie ekologicznym dotyczy podmiotów gospodarczych, które prowadzą lub zamierzają prowadzić działalność w rolnictwie ekologicznym w jednej lub więcej spośród następujących kategorii: - produkcja roślinna; - produkcja zwierzęca; - przetwórstwo artykułów rolno-spożywczych; - przetwórstwo pasz; - import; - obrót.
Obowiązek zgłoszenia dotyczy również rolników, którzy zamierzają przystąpić do programów rolnośrodowiskowych (pakiet - rolnictwo ekologiczne).
System kontroli i certyfikacji w rolnictwie ekologicznym stanowią:
1. minister właściwy do spraw rolnictwa, jako organ upoważniający jednostki certyfikujące do prowadzenia kontroli i wydawania certyfikatów,
2. Inspekcja Jakości Handlowej Artykułów Rolno-Spożywczych sprawująca nadzór nad upoważnionymi jednostkami certyfikującymi rolnictwo ekologiczne,
3. upoważnione jednostki certyfikujące akredytowane w zakresie rolnictwa ekologicznego, zgodnie z Normą PN-EN 45011 „Wymagania ogólne dotyczące działania jednostek prowadzących systemy certyfikacji wyrobów”.
Funkcjonowanie systemu kontroli i certyfikacji w rolnictwie ekologicznym jest podstawowym gwarantem dla konsumenta, że środki spożywcze znajdujące się na rynku wyprodukowane zostały zgodnie z obowiązującymi przepisami dotyczącymi rolnictwa ekologicznego i są wolne od zanieczyszczeń, takich jak: pozostałości środków ochrony roślin i hormonów, a podczas ich produkcji nie stosowano nawozów sztucznych i organizmów zmodyfikowanych genetycznie.
Na podstawie ustawy o rolnictwie ekologicznym Inspekcja Jakości Handlowej Artykułów Rolno-Spożywczych posiada następujące uprawnienia:
przyjmuje zgłoszenia producentów podejmujących działalność w rolnictwie ekologicznym;
upoważnia producentów do przywozu produktów rolnictwa ekologicznego z państw trzecich nie wymienionych we wspomnianym rozporządzeniu Komisji 94/92/EWG;
dokonuje kontroli produktów rolnictwa ekologicznego pochodzących z krajów trzecich, w tym kontroli granicznej;
gromadzi i przechowuje informacje o producentach;
dokonuje sprawdzenia u producentów prawidłowości kontroli wykonanych przez upoważnione jednostki certyfikujące.
W ramach nadzoru nad upoważnionymi jednostkami certyfikującymi Główny Inspektor:
przeprowadza analizy danych dostarczanych przez upoważnione jednostki certyfikujące;
dokonuje kontroli upoważnionych jednostek certyfikujących w zakresie stosowania przez nie procedur kontrolnych,
może żądać od upoważnionych jednostek certyfikujących wszelkich dodatkowych informacji i danych związanych z wykonywanym nadzorem.
W myśl przepisów ustawy z dnia 21 grudnia 2000 r. o jakości handlowej artykułów rolno - spożywczych (Dz. U. z 2001 r. Nr 5, poz. 44) wprowadzane do obrotu artykuły rolno-spożywcze powinny spełniać wymagania w zakresie jakości handlowej określone w przepisach o jakości handlowej oraz deklarowane przez producenta lub wprowadzającego do obrotu.
W 2004 roku na podstawie wyników kontroli przeprowadzonych przez 6 upoważnionych jednostek certyfikujących rolnictwo ekologiczne, opracowano informację: „Rolnictwo ekologiczne w Polsce w 2003 roku".