Mikrobiologia Ćwiczenia
Ziarenkowce Gram - dodatnie
Rodzaj Gronkowce :
- groniaste skupiska pojedynczych okrągłych komórek , powstają na skutek podziałów komórek w wielu płaszczyznach
- ziarenkowiec o jednakowych wymiarach w każdej płaszczyznę
-preferują środowisko tlenowe
- przetrwają w środowisku beztlenowym
- najlepiej rosną w obecności 7,5 % NaCl
-łatwe w hodowli i identyfikacji ( rosną w temp 37stC, przez zaledwie 18-24 godz .
- dla identyfikacji stasuje się metodą genetyczną opartej na elektroforezie w zmiennym polu elektrycznym .
Gronkowiec złocisty ( Staphylococcus aureus)
- szczególne cechy przystosowawcze do kolonizacji i szczególnie wysokiej zjadliwości
= tworzy mostki pentaglicynowe wspomagające w przyklejaniu się do powierzchni oraz do sztucznych cewników , protez tworząc biofilm
=czynniki determinujące chorobotwórczość umożliwiają wywołanie różnych postaci zakażeń , wykorzystując różne patomechanizmy - począwszy od inwazji i tworzenia ropni po działanie egzotoksyn np.:
. Egzotoksyny pirogenne - enterotoksyny , odpowiedzialne za większość zatruć pokarmowych
- Toksyna zespoły wstrząsu toksycznego , od gorączki niewydolność wielonarządową , wstrząs
Epidermolityczna - zmiany zapalne skóry ( od rumienia po złuszczające się pęcherze pod którymi znajduje się martwica )
Leukocydyna - toksyna ta niszczy wielojądrzaste leukocyty i makrofagi
Hemolizyny alfa, beta , gamma - liza tkanek , lizę erytrocytów
Białko A - wiąże się z IgG umożliwiając łączenie się przeciwciał z komórkami gronkowców i tym samym uaktywniając silna reakcję zapalną
Enzymy - Beta - laktamaza fibrynolizyna - modyfikują i inaktywują antybiotyk umożliwiają penetrację bakterii do tkanek
Zakażenia
1 zakażenia skórne :
- zapalenia mieszków włosowych - najbardziej ograniczone
-jęczmienie , małe czyraki umiejscowione na brzegach powiek
-czyraki , bardziej rozległe niż poprzednie
-ropnie i czyraki mnogie , obejmują mieszki włosowe gruczoły potowe, otaczające tkanki , szyja kark , wymagają antybiotykoterapii i opracowanie chirurgicznego
2 zakażenia głębokie :
- Krwiopochodne zakażenia szpiku kostnego i kości
- Zapalenia płuc i opłucnej z tendencja do tworzenia ropni , szczególnie dotyczy to chorych z osłabioną odpornością , po przechorowaniu grypy , po aspiracji ciała obcego
3.Choroby wywołane działaniem toksyn
- zatrucie pokarmowe , zakażenie 1-5 godzin od spożycia zatrutego , zainfekowanego pokarmu, pojawia się gwałtowna biegunka , wymioty , gorączka . Przede wszystkim leczenie objawowe z dużym naciskiem na nawodnienie . Samoistnie ustępuje po 24 -48 godzin
- gronkowcowe złuszczające zapalenie skóry , małe dzieci . Dwie postacie płonica gronkowcowa - rumień nie złuszczająca się wysypka .
- liszajec pęcherzowy ograniczona ilość pęcherzy , które pękają , odsłaniając skórę właściwą
- zespół wstrząsy toksycznego , jest choroba wielonarządową prowadząca do wstrząsu i śmierci . Rozpoczynać się może niewinnie , gorączką, wysypką na dłoniach , stopach , która później ulega złuszczeniu, bólami mięśniowymi kończyn , wymiotami , biegunką , hipotensją tachykardia , oligurią i anurią zgonem .
Epidemiologia :
- wyjątkowa łatwość w kolonizacji skóry i powierzchnię błon śluzowych , zwłaszcza uszkodzonych
- kolonizują przedsionek nosa i odbyt
- 60% personelu szpitalnego
- najczęstsza droga to brudna ręce
Gronkowiec skórny ( Staphylococcus epidermidis )
- wchodzi w skład fizjologicznej flory skóry człowieka
- może wywołać rozwój infekcji włącznie z zapaleniem wsierdzia i posocznicy u ludzi z obniżoną odpornością , z wszczepionym implantem i założonym cewnikiem centralnym lub dokomorowym .
-ma właściwości do tworzenia biofilmu .
Staphylococcus saprophyticus
- drobnoustrój oportunistyczny
- częsty czynnik zakażeń ukł moczowego - szczególnie u młodych kobiet
- wszystkie tkanki i płyny ustrojowe mogą Stanowic materiał do badań bakteriologicznych .
Rodzaj Paciorkowce Streptococcus :
- rodzaj obejmuje różne gatunki o odmiennych właściwościach genotypowych i genotypowych
- wywołują różnego rodzaju zakażenia o różnej lokalizacji i różnym stopniu ciężkości
- tworzą charakterystyczne łańcuszki - paciorki w trakcie hodowli
-względnie tlenowe
- do hodowli potrzebują agar z dodatkiem krwi
Podział opiera się na :
- morfologii kolonii i rodzaju hemolizy na agarze
- reakcjach biochemicznych , oporności na działanie czynników chemicznych i fizycznych
- swoistość serologiczną , którą określa swoistość węglowodanu ściany komórkowej wielocukru C . podział zalicz paciorkowce na grupy od A do R
Dla człowieka najbardziej istotne są z grupy A,B,C,D,G i S
Paciorkowiec beta -hemolizujacy gr A
Cechy :
- czynnik zjadliwości : cytotoksyczne białko M o właściwościach cytotoksycznych antyfagocytarnych, antykomplementarnych, białko F - adhezyjne, białko G hamujące fagocyty
- egzotoksyny , pirogenne odpowiedzialne za wysypkę w płonicy ,
- hemolizyny - czynniki rozprzestrzeniania np. streptokinaza, streptodornaza
Zakażenia : ropne, nieropne
Najczęstsze postacie to zapalenie gardła , migdałków , ropne zapalenie skóry, i liszajec
Róża - (rozlana infekcja śródskórna ), zapalenie tkanki podskórnej ( celulitis) ,zapalenie naczyń i węzłów chłonnych , płonica ( szkarlatyna ) , gorączka połogowa - posocznica u położnic, zapalenie zatok ucha środkowego, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych , zapalenie płuc, wsierdzia , stawów kości i szpiku , bakteriemia, martwicze zapalenie powięzi i tkanki podskórnej , gorączka reumatyczna ostre kłębuszkowe zapalenie mięśnia sercowego
Rezerwuarem jest człowiek , najczęściej miejsce kolonizacji to gardło , migdałki .
Zakażenia szpitalne dość częste w oddziałach oparzeniowych , położniczych i noworodkowych
Diagnostyka : hodowla , testy serologiczne p/antygenowi paciorkowcowemu - ( streptolizynie O ASO),
Streptococcus agalactiae- miejsce kolonizacji gardło, przewód pokarmowy , pochwa ( do 75%)
- jest przyczyną wrodzonych i okołoporodowych zakażeń, posocznic noworodkowych , wczesnych i późnych .
Postacie kliniczne zakażenia to zapalenie płuc, ,opon mózgowo-rdzeniowych , zapalenie kikuta pępowinowego, zapalenie kości i szpiku
U kobiet zakażenie okresu połogowego
Str bovis- zakażenie dróg moczopłciowych , wsierdzia i opon mózgowo-rdzeniowych
Str pneumonie- dwoinka zapalenie płuc ; zakażenie górnych i dolnych dróg oddechowych , również zapalenie spojówek i stawów
Kolonizacja - jamy nosowo gardłowej nosicielstwo 70% , sezonowość - okres zimowy, 3 x częściej u dzieci,
Profilaktyka szczepionką wieloważną,
Str viridans zieleniejący - zapalenie - próchnica zębów, zapalenie wsierdzie .
Rodzaj Enterococcus -paciorkowce gr D, paciorkowce kałowe
- są czynnikami etiologicznymi ciężkich zakażeń szpitalnych
- są składnikami flory fizjologicznej przewodu pokarmowego
- najczęstsze postacie kliniczne zakażeń : zakażenie w obrębie miednicy mniejszej , jamie brzusznej , zakażenie skóry i tkanek miękkich, zakażenie centralnego układu nerwowego.
- są to bakterie wykazujące naturalną oporność na wiele powszechnie stosowanych bakterii
Szczególny problem leczniczy stanowią szczepy HLAR który wykazuje oporność na wysokie dawki aminoglikozydów , oraz na vankomycynę szczepy VRE
.
Ziarenkowce gram - ujemne
Rodzaj Neisserie
- nerkowaty kształt , występuje jako dwoinka, ma otoczkę , SA urzęsione
- rosną w temp 37st C , na podłożach wzbogaconych
- wymagają CO2,
Neisseria meningitidis ( meningokok, - dwoinka zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, dwoinka zapalenia płuc)- sepsa
- wiele grup serologicznych - 13 -różnią się antygenowymi wielocukrami znajdującymi się w otoczce
Postacie zakażeń: nagminne zapalenie opon mózgowo- rdzeniowych , ropne zapalenie stawów, zapalenie płuc, zapalenie wsierdzia i osierdzia , posocznica , zapalenie spojówek , gardła i ucha
Nosicielem jest człowiek - 25% populacji w wieku 15-24 roku życia, najczęściej bakterie kolonizują się w jamie nosowo-gardłowej, przenoszone są drogą kropelkową .
Ogniska epidemiczne dotyczą środowisk zamkniętych : przedszkola , szkoły, akademików, koszar.
Śmiertelność 10-13% , w przebiegu wstrząsu septycznego wzrasta do 50%.
Diagnostyka :
Bada się płyn mózgowo rdzeniowy, krew, wymazy z nosa , płyn stawowy, treść z wybroczyn skórnych . Diagnostyka obejmuje bakterioskopię, , hodowlę, i identyfikację bakterii,
ZAKAŻENIE potwierdzone badaniami musi być zgłoszone do stacji sanitarno - epidemiologicznej
Profilaktyka - leczenie antybiotykoterapia , szczepionki dwu lub czteroskładnikowe
Neiseria gonorrhoeae ( gonokok, dwoinka rzeżączki)
- czynnik etiologiczny rzeżączki, 16 serotypów , czynniki determinujące zjadliwość to fimbrie, białka błonowe, otoczka, endotoksyna,
Zakażenia : błon śluzowych układu moczo-płciowych ,oka, odbytnica, gardła.
Bakterie wnikają do komórek nabłonka i są fagocytowane przez neutrofile , powodują proces ropny.
Zakażenia są zwykle miejscowe (zapalenie cewek moczowych , ale mogą rozprzestrzeniać się przez ciągłość lub drogą krwi. Rozsianemu zakażeniu gonokokowemu towarzyszy ropne zapalenie stawów , zmiany skórne , zapalenie wsierdzia, opon mózgowo- rdzeniowych , szpiku kostnego .
Szerzy się przez kontakty seksualne , rzeżączkowe infekcje dróg moczo-płciowych często są bezobjawowe i może być nie rozpoznane.
Diagnostyka - wymazy, hodowle , określenie lekowrażliwości.
Laseczki gram dodatnie niesporujące
Corynebacterium diphtheriae ( maczugowiec błonicy )
- laseczki układające się w kształcie X,Y,L , można wybarwiając uwidocznić ziarnistości
- wywołują ciężką chorobę - błonicę- najczęstszą ostrą formą zakażenia jest błonica gardła, krtani, tchawicy,
- najczęstszą przewlekłą jest błonica nosa, spojówek, ucha, narządów płciowych, błonica przyranna
Epidemiologia : choroba zakaźna , zaraźliwa ,
Przenoszona poprzez kontakt bezpośredni lub kropelkową
Cechą charakterystyczną jest lokalne umiejscowienie zakażenia , bakterie wywołują zmiany zwyrodnieniowo - martwicze w postaci błon
Mimo że mało zjadliwy wytwarza toksynę błoniczą , przenoszona jest droga krwi i uszkadza mięsień sercowy obwodowy oraz nerwy obwodowe.
Diagnostyka : objawy kliniczne , badanie fragmentów błon rzekomych, hodowla , izolacja identyfikacja . Najlepiej wzrasta w środowisku tlenowym , w temp 34-37st C, na podłożu wzbogaconym w surowicę i glukozę dla identyfikacji hodowlanej jest konieczne wzbogacenie podłoża w krew
Ważne jest określenie zdolności do produkcji toksyn, która determinuje chorobowość maczugowca.
W leczeniu stosuje się immunoterapię neutralizując toksynę a następnie antybiotyk.
W profilaktyce stosuje się anatoksynę błoniczą w szczepionce skojarzonej DTP zgodnie z kalendarzem szczepień. Istotna jest izolacja chorego. Badanie osób z kontaktu a nawet szczepienie ich anatoksyną błoniczą - szczególnie gdy od ostatniego szczepienie minęło 5 lat .
Rodzaj Listeria monocytogenes:
- ruchliwe laseczki Gram (+)
- szeroki zakres temperatur 5-40 stC
-rozpowszechniony w środowisku
Listeria monocytogenes
Zjadliwość - polega na wytworzeniu enzymów listerionoza , fosfolipaza, które ułatwiają wnikanie bakterii do makrofagów , komórek śródbłonkowych, rozpuszczają błony komórkowe i ułatwiają zakażenie nowych komórek
- chorują najczęściej ludzie z zaburzeniami odporności
- może dojść drogą pokarmową po spożyciu skażonego nabiału , mięsa, surowych jarzyn.
- zdolność do przeżywania bakterii w lodówkach
- zakażenie łagodne z objawami paragrypowymi lub zapalenie opon mózgowo- rdzeniowych, rzadko posocznicy
- listerioza płodu i noworodka zależy od drogi zakażenia . Płodu - listerioza jako wynik wewnątrzmacicznego zakażenia przez łożysko , bywa przyczyną poronień. Postać późna jest spowodowana zakażeniem drogą wertykalną, podczas przechodzenia przez kanał rodny- dochodzi do zapalenie opon mózgowych lub posocznice.
Profilaktyka - posiewy z szyjki macicy w trzecim trymestrze ciąży, unikanie niepasteryzowanego nabiału , surowych jarzyn
Diagnostyka : izolacja bakterii z krwi , ropy, płyn mózgowo-rdzeniowy, płyn owodniowy, wymaz z pochwy, smółka ,
Listeria rośnie na podłożach agarowych z krwią w środowisku tlenowym lub względnie beztlenowych . Do identyfikacji bakterii wykorzystuje się testy biochemiczne oraz testy określające ruchomość bakterii ( największa w temp 20 stC w temp 37stC nieruchliwe ).
Laseczki Gram (+) sporujące
Rodzaj - Bacillus
- ponad 40 opisanych gatunków
- są duże , nie ruszają się, tworzą owalne przetrwalniki - spory
Laseczka wąglika : bakteria terrorystów
- namnażają się w organizmie - 37st C , poza organizmem żyją krótko
- bez kontaktu z powietrzem i bez składników odżywczych tworzą endospory, które mogą przetrwać kilkadziesiąt lat . W sprzyjających warunkach spory zaczynają kiełkować.
- Postacie zakażeń : skórna - po wniknięciu przez uszkodzoną skórę pojawiają się na niej czarne plamy
Jelitowa - po spożyciu skażonego pokarmu pojawjają się zmiany martwicze i krwotoczne w błonie śluzowej i węzłach chłonnych przewodu pokarmowego
Płucna - poprzez inhalację spor .Charakterystyczny gwałtowny przebieg
Spowodowany martwiczo - krwotocznymi zmianami w tkance płucnej, węzłach chłonnych śródpiersia , - zwykle kończy się zgonem
Profilaktyka - szczepienia głównie wojska , zwalczanie wąglika wśród zwierząt.
Rodzaj Clostridium :
- 60 bezwzględnie beztlenowych gatunków laseczek sporujacych , Gram (+),
- kształt cylindryczny , lub nitkowaty w układzie pojedynczym podwójnym lub w formie łańcuszków .
- są urzęsione
- wytwarzają toksyny
- spory są większe od samych laseczek
Zgorzel gazowa
-wszędobylska , beztlenowa,
- czynnikiem zjadliwym jest otoczka i 12 egzotoksyn
- toksyna alfa i inne enzymy rozkładają tkanki co ułatwia rozprzestrzenianie się drobnoustroju.
Postacie zakażeń - przyranne : zapalenie podskórnej tkanki łącznej i zgorzel gazowa
Zapalenie pęcherzyka , macicy, jajowodów oraz narząd
jamy brzusznej.
Leczenie - chirurgiczne opracowanie rany , antybiotykoterapia, tlenowa terapia hiperbaryczna , immunoterapia .
Laseczka tężca:
- nieinwazyjny, -wytwarza 3 toksyny
-Zakażenie przez uszkodzoną skórę, po wniknięciu do rany, gdy wytworzy się środowisko beztlenowe wytwarzają toksynę ,która przenika wzdłuż nerwów obwodowych do OUN , blokuje procesy hamowania pobudzenia nerwowego następstwem czego są napięcie i kurcze mięśni. Doprowadza to do zgonu . Leczenie w OITM
- Rezerwuarem jest przewód pokarmowy zwierząt oraz zabrudzona gleba .
- poród w środowisku naturalnym i zabrudzenie kikuta pępowinowego, dalszy rozwój zakażenia - opisywane jako tężec noworodkowy
Leczenie - respiratoroterapia , leki p/bólowe i zwiotczające , Profilaktyka -szczepienie
Laseczka jadu kiełbasianego
- wszędobylska- mają zdolność ruchu, odporna na wysokie temperatury 100st C, beztlenowiec
-szczególnie niebezpieczna nieświeża żywność lub jej skażone przetwory.
- wytwarza toksyny - niebezpieczna botulina - powoduje porażenie wiotkie przez hamowanie uwalniania acetylocholiny, - wrażliwa na wysokie temperatury - wystarczy gotować 20 min.
Botulizm jest wynikiem spożycia toksyn , postępujący paraliż, szczególnie mięśni oddechowych i serca , zatrzymanie krążenia .
Ćwiczenia z mikrobiologii
Promieniowce
- zróżnicowana grupa, znaczny polimorfizm komórkowy ( nitkowate, pałeczki , ziarenkowce)
- budowa nitkowata
- spokrewnione z prątkami
- wykazują powierzchniowe podobieństwo do grzybów
-nie wytwarzaję spor
- Gramm (+)
Rodzaj Actinomyces
- bezwzględny tlenowiec
- składnik fizjologicznej flory jamy ustnej , przewodu pokarmowego, dróg rodnych
Choroba - przewlekła , tworzenie się ropni i przetok zlokalizowanych w okolicy żuchwy , obszarów klatki piersiowej i brzucha .
Do zakażenia dochodzi po uszkodzeniu błony śluzowej np. w jamie ustnej po ekstrakcji zęba lub po urazie . Uczestniczą w infekcjach przyzębia , próchnicy w ropnych chorobach jamy ustnej
W diagnostyce wykorzystuje się badanie makroskopowe treści ropnej , oraz hodowla - nawet 2 tygodni.
Rodzaj Nocardia
- bezwzględny tlenowiec
- szczególne powinowactwo do układu oddechowego, skóry i tkanki podskórnej,
- zakażenie dotyczy szczególnie ludzi z zaburzoną odpornością
- diagnostyka bezpośrednie badanie makroskopowe z plwociny lub materiału biopsyjnego .
Prątki
- kształt pałeczkowaty, kwasoodporne ,
- wolno rosnące ,
- bezwzględne tlenowce
- bezwzględnie chorobotwórcze
Rodzaj Mycobacterium:
- drogą kropelkową , wywołują gruźlicę, ( infekcja rozpoczyna się namnożeniem się prątków w makrofagów pęcherzyków płucnych , skąd drogą krwi roznoszone są do innych narządów. Oprócz postaci płucnej wyróżnia postać jelitową , otrzewnową , nerkową , mózgowo - rdzeniową , kostną i stawową .
- choroba powszechna, równa zakaźność w każdym wieku , 1/3 populacji zakażona z tej grupy tylko 6% - do zachorowania dochodzi w okresie do 2 lat od zakażenia w chwili zaburzenia odporności . Zwiększone ryzyka dotyczy chorych na AIDS, pracowników medycznej , .
Diagnostyka oparta na hodowli prątków z plwociny, płynu z opłucnej , popłuczyn żołądkowych i płucnych , płynu mózgowo rdzeniowym , płyn stawowy , szpik kostny .
Identyfikacje prowadzi się metoda genetyczną- PCR .
Śródskórny test tuberkulinowy Mantoux- odczyn dodatni wykazuje na kontakt pacjenta z prątkami , które może wynikać z zakażeniem prątkami jak i przebytym szczepieniem . Nie jest to badanie przesiewowe ponieważ, dodatni świadczy zarówno o zakażeniu jak i o przebytym szczepieniu i aktywnej po nim odporności, ujemny wynik powyższego nie wyklucza.
Profilaktyka - szczepienie szczepionkami żywymi atenuowanymi ( odzjadliwionymi) prątkami.
Mycobacterium leprae - prątek trądu- choroby skóry, nerwów i błony śluzowej. Choroba krajów tropikalnych , szerzy się poprzez bliski kontakt.
Krętki:
- duża heterogenna grupa ,
- ruchliwe, spiralne bakterie
- chorobotwórcze
Rodzaj Trepanowa :
Treponema pallidum - wywołuje kiłę
- zakażenie przez kontakt bezpośredni, łożysko,
- wrotami są- błony śluzowe , uszkodzona skóra
- krętki namnażają się w miejscu wniknięcia lub też w sąsiednich węzłach chłonnych .
Diagnostyka - objawy kliniczne
- metody serologiczne dotyczą surowicy jak i płynu mózgowo-rdzeniowego
- wykrycie żywych ruchliwych krętków jest możliwe we wczesnym stadium kiły
- nie barwią się metodą Grama
Rodzaj Borelia
- czynnik etiologiczny boreliozy z Lome
- choroba odzwierzęca- kleszcze
- fazowy , przewlekły przebieg choroby, charakteryzujący się remisjami i zaostrzeniami objawów, typowe trzy stadia choroby: zmiany skórne w postaci wędrującego rumienia, zakażenia układowego, w tym centralnego układu nerwowego, układu sercowo- naczyniowego, układ kostno-stawowego oraz zanikowe zapalenie skóry neuropatia obwodowa
Diagnostyka - wykrycie bakterii w preparatach krwi i osadu płynu mózgowo-rdzeniowego- barwionych metodą Giemzy, możliwa hodowla ,oraz techniką PCR. Podstawą jest metoda serologiczna.
Rodzaj Leptospira
-gatunek obejmujący wiele serotypów wywołujących zakażenia o bardzo zróżnicowanych objawach
- Leptospiroza z żółtaczką ( zespół Weila )- postać z żółtaczką , zaburzeniami czynnościowymi wątroby, krwotokami wewnętrznymi, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych
Diagnostyka : - hodowla , izolacja bakterii, testy serologiczne .
Mykoplazmy
-Gram-ujemne
-najmniejsze drobnoustroje zdolne do samodzielnego życia
- komórki o uproszczonej budowie i ograniczonym metabolizmie o ogromnym polimorfizmie
- rosną w warunkach beztlenowych na podłożach wzbogaconych, przybierając kształt sadzonego jajka
- są pasożytami błon śluzowych najczęściej układu oddechowego oraz stawów,
- przebieg zakażenia ostry , przewlekły miejscowy, uogólniony
Mycoplasma pneumoniae odpowiedzialna za 20% zapaleń płuc pozaszpitalnych
Ureaplasma urealiticum - zakażenia dróg moczo-płciowych przyczyną infekcji przewlekłych , jajników jajowodów, zakażeń wrodzonych u noworodków
Chlamydie
- bezwzględne wewnątrzkomórkowe pasożyty ludzkie i zwierzęce
- niezdolne do samodzielnego rozmnażania ponieważ nie syntetyzują ATP , w cyklu rozwojowym wykorzystują szlaki metaboliczne komórki gospodarza
- formą zakaźną jest ciałko elementarne , które przyczepia się do komórek nabłonka jest przez nie fagocytowane i następnie w nich przekształcane od 100-1000 nowych ciałek elementarnych po około 48 godzinach są uwalniane z komórek gospodarza .
- trudne w hodowli tylko na zarodkach jaja kurzego
Chlamydia trachomatis - wywołuje- jaglice - będącą główną przyczyną ślepoty
- narządu moczo-płciwego
- zapalenie płuc i spojówek u noworodków
- ziarniak weneryczny
Chlamydia pneumoniae - atypowe zapalenie górnych i dolnych dróg oddechowych
- przewlekłe zapalenie zatok
- rola w rozwoju astmy oskrzelowej oraz zmian miażdżycowych a
następnie w rozwoju choroby niedokrwiennej serca
Diagnostyka - oparta na serologii , znalezieniu ciał elementarnych metodą fluorescencyjną oraz wykryciu RNA i DNA
Riketsje
- bezwzględne pasożyty wewnątrzkomórkowe
- nie rosną na podłożach sztucznych
-pałeczki lub okrągłe ,
- Gram - ujemne
- namnażają się na zarodkach ptasich
- roznoszone przez stawonogi
-jednostki chorobowe : dur wysypkowy, gorączki plamiste , atypowe zapalenie płuc , wątroby , zapalenie mózgu, chorobę kociego pazura
Diagnostyka - serologiczna
Rodzina Enterobacteriaceae
- największa i najważniejsza klinicznie
- wszędobylskie
- większość jest florą fizjologiczną jelit
Cechy:
- Gram ujemne
- fermentują glukozę
-nie wytwarzają spor
- ruchliwe lub nie , okołorzęse
-tlenowe lub beztlenowe
-rosną na prostych jak i złożonych podłożach
- Zjadliwość zależy od:
endotoksyny -egzotoksyny - czynnika adhezyjnego- otoczki
- mają ścianę komórkową z lipopolisacharydem - endotoksyną
-klasyfikuje się je w zależności od antygenów - somatycznego, otoczkowego i rzęskowego
- nosicielami są zwierzęta , ludzie chorzy i nosiciele
Escherichia coli
-tzw pałeczki jelitowe
-stwierdzenie ich w wodzie pitnej świadczy o zakażeniu jej kałem
- główny składnik flory fizjologicznej przewodu pokarmowego , może być w formie oportunistycznej czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych
-względnie beztlenowy, niesporujący , szybko rosnący, znaczna ruchliwość , fermentują laktozę, dobrze tolerują żółć
Główne czynniki zjadliwości :
1 . Fimbrie i białka adhezyjne ułatwiające dotarcie do nabłonka przewodu pokarmowego
2. Toksyny:
- enterotoksyny
- toksyny podobne do toksyn czerwonokrwinkowych
- werotoksyny- typ I i Ii powoduj niszczenie komórek nerek małp
- hemolizyna
3. Otoczka o właściwościach antyfagocytowych
4. Lipopolisacharyd
Typy zakażeń :
Zakażenia pozajelitowe :
-zakażenia układu moczowego ( zapalenia pęcherza , odmiedniczkowe zapalenie nerek)
-zakażenie ran szczególnie po zabiegach chirurgicznych
-zapalenie płuc noworodki , niemowlęta
-zapalenie opon zwykle poprzedzone posocznicą , noworodki , niemowlęta
-zakażenia krwi
Zakażenia jelitowe
- enterogenne biegunki, - z wydzielniczymi biegunkami
- enterotoksyczne biegunki - wynikające ze złej absorpcji
1 nieżyty żołądkowo - jelitowe
2 biegunki podróżnych
3 krwotoczne zapalenie okrężnicy
4 zespół hemolityczno mocznicowy
Rodzaj Yersinia
- beztlenowce , wzrastają w niskich temperaturach ,
- zakażenie dżuma - płucna ( 2-3 dni inkubacji , 90%), dymienicza ( 7 dni inkubacja , 75% ludzi umiera ), zapalenie jelita cienkiego- może imitować zapalenie wyrostka.
- odzwierzęce ( szczury, wiewiórki, króliki zwierzęta domowe), przenoszone przez pchły lub zakażenie droga kropelkową.
Rodzaj Klebsiella
-otoczki - odpowiedzialne za śluzowy wygląd kolonii
-wywołuje - pierwotne zakażenie płuc- prowadzi do uszkodzenia pęcherzyków płucnych i krwawo zabarwionej plwociny
- zakażenie ran i tkanek miękkich i układu moczowego
Rodzaj Acinetobacter:
-zróżnicowane , występują jako łańcuszki lub widoczne jako pary, mają rzęski, wytwarzają otoczki
- Gram- ujemne , niefermentujące
- mogą być przyczyną oportunistycznych zakażeń szpitalnych
Zakażenia najczęściej szpitalne - materiał pobrany z ran , krwi plwocinie ,płynie mózgowo-rdzeniowej
Rodzaj Helicobacter
- ruchliwy , mikroaerofilna, spiralna
-wyłącznie u ludzi - odpowiedzialny za wrzody żołądka i dwunastnicy 80-90 %
- zakażenie szerzy się droga feralno- oralną, i związany jest z brakiem higieny
-kolonizuje nabłonek żołądka
Zjadliwość :
-ureaza rozkłada mocznik a powstały amoniak chroni bakterie pokrywając je i neutralizując kwaśne środowisko
-wytwarza adchezyny przyczepiające je do śluzówki
- cytotoksyny uszkadzające śluzówkę żołądka
- produkują cytokiny rozwijające proces zapalny
Diagnostyka : hodowla , PCR, oznaczenie produktów ureazy- amoniak w świeżo pobranym wycinku.
Rodzina Haemophilus
- Gram - ujemne,
- beztlenowe,
-małe , nie wytwarzają spor , nieruchoma
- kolonizuje górne drogi oddechowe
- u noworodków powoduje posocznicę , zapalenie opon mózgowo- rdzeniowych , spojówek,
- Profilaktyka - szczepionka HIB
Diagnostyka : Hodowla w atmosferze wzbogaconej CO2, test aglutynacji lateksu opłaszczonego swoistymi przeciwciałami - ( szybki test w poszukiwaniu czynnika etiologicznego w zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych
Pałeczka gram ujemna niefermentująca- nie wytwarza spor
- powszechne w środowisku
- są komensalami , kolonizują cewniki , są tez bezwzględnie chorobotwórcze ( oportunistyczne zakażenia szpitalne )
-morfologicznie różne ( ziarenka , pałeczki, )
Pseudomonas aeruginosa - pałeczki ropy błękitnej
- przyczyna poważnych zakażeń szpitalnych
-rezerwuarem są miejsca wilgotne , zlewy , umywalki wanienki , butelki, respiratory
- tworzy biofilm na cewnikach
- jest powodem bakteriemii , posocznicy
- Zjadliwość determinowana jest chorobotwórczością :
Endotoksyna - odpowiedzialna za posocznicę ,egzotoksyna A- hamuje syntezę białek, egzotoksyna S - hamuje aktywność fagocytów , enterotoksyna -powoduje zapalenie jelit, leukocydyna - działa toksycznie na ludzkie leukocyty, hemolizyna - hamuje makrofagi, enzymy proteolityczne - niszczą tkanki gospodarza ,
- duża łatwość w nabywaniu oporności bakteryjnej ,
- najczęstsze zakażenia na OITM, OITN, chirurgii, transplantologii,
- podstawowymi czynnikami ryzyka infekcji są choroby o ciężkim przebiegu, wiążące się z długim pobytem w szpitalu, obniżeniem odporności , zabiegami chirurgicznymi i procedurami intensywnej terapii, rany pooparzeniowe , pooperacyjne , stosowanie w antybiotyków o szerokim spektrum.
- NIEPRZESTRZEGANIE zasad higieny rąk personelu szpitalnego
- Zakażenie szpitalne : od zakażenia rany, złamania , zapalenia kości, szpiku kostnego, stawów , zapalenie płuc, zapalenia opon mózgowo rdzeniowych, zapalenie wsierdzia , , bakteriemia , posocznice, wstrząs septyczny.
-Zakażenia pozaszpitalne: soczewki kontaktowe , kolczykowanie w niewłaściwych gabinetach , zapalenie uch zewnętrznego , środkowego .
- Zakażenie szczególnie groźne dla chorych z mukowiscydozą .
Diagnostyka : hodowla na wybiórczych podłożach, cecha przydatną do identyfikacji jest zdolność do wytwarzania barwników dyfundujących z kolonii do podłoża - niebiesko - zielony barwnik ( nazwa zwyczajowa), inne barwniki to zielony, czerwony, brązowy.
Zdolność wytwarzania zapachu-lipy bądź jaśminu
- małe wymagania wzrostowe, temp 25-42 st C, rosną w środowiskach z wysokimi stężeniami soli oraz środkami antyseptycznymi i antybiotykami
Rodzaj Legionella
-cienkie, trudno barwiące się pałeczki Gram- ujemne , ruchliwe
- szczególne wymagania wzrostowe .
Legionella pneumophila:
- tlenowa, wewnątrzkomórkowa gram- ujemna , ruchliwa, trudno barwliwa
-zakażenie legioneloza - ( choroba legionistów ), atypowe zapalenie płuc , goraczka Pontiak bez zajęcia płuc.
- rezerwuarem są instalacje wodne , klimatyzacyjne , nawilżacze , prysznice .
- infekcje hotelowe.
- do zakażenia dochodzi w wyniku wdychania aerozoli zawierających bakterie
- nie przechodzi z człowieka na człowieka
- w 20% kończy się śmiercią
Diagnostyka : makroskopia bezpośrednia, hodowli , oznaczeniu przeciwciał
Profilaktyka obejmuje odkażanie instalacji klimatycznych
Rodzaj Lactobacillus
- gram (+), niesporujące , względnie beztlenowe ,- laseczki
- wchodzi w skład flory przewodu pokarmowego, narządu rodnego , skóry , jamy ustnej .
- w mleku matki, kale niemowląt kilka dni po porodzie ,
- mają zdolność do fermentacji węglowodanów z wytworzeniem kwasu mlekowego, octowego ( bakterie kwasu mlekowego)
- wytwarzają aktywne substancje produkujące nadtlenek wodoru działający hamująco na wzrost większości bakterii chorobotwórczych . Stosowane jako probiotyki w celu normalizacji flory bakteryjnej przewodu pokarmowego i pochwy
Rodzaj Bifidobacterium ( bifidum, breve, longum)
-Gram(+), beztlenowe
- kolonizują przewód pokarmowy , pojawiają się kilka godzin po porodzie w jelicie noworodka , bytuja w jelicie grubym
- dostarczany jako suplement do żywności w celu odtwarzania prawidłowej mikroflory przewodu pokarmowego po przebytej kuracji antybiotykowej.
Mykologia - Ćwiczenia z mikrobiologii -
Cechy morfologiczne i fizjologiczne grzybów
- organizmy eukariotyczne z wyraźnie oddzielonym dwoma błonami jądrem i z wydzielonym jąderkiem i określoną dla każdego gatunku ilością chromosomów
- brak zróżnicowania tkanek
- nie mają chlorofilu
- odżywiają się heterotrofowi
- pobierają pokarm z martwej tkanki organicznej - saprofity, lub żywej - pasożyty
- bardzo liczna grupa - 150 tyś
- podział zależy od sposobu rozmnażania płciowego
Rozróżnia się :
- drożdże , jednokomórkowe , różnokształtne
- grzyby nitkowate ( dwa rodzaje grzybni - grzybnia wegetatywna , wnika do podłoża celem uzyskania pożywienia i grzybnia powierzchowna , która wytwarza spory i jest odpowiedzialna za podtrzymanie gatunku
Budowa
- zmienność morfologiczna uzależniona od środowiska i sposobu bytowania
-Pleomorfizm = utrata zdolności tworzenia owocników tj różnego rodzaju spor i narządów je wytwarzających , pozostaje tylko jednolita biała bawełniana grzybnia zwana jałową ,
Dymorfizm= występowanie danego gatunku grzyba w różnych formach morfologicznych w zależności od środowiska bytowania.
- jądro z jąderkiem i określoną , charakterystyczną ilością chromosomów
- w ścianie komórkowej grzybów - wielocukier chityna oraz mannan, glinka białka i lipidy
- dobrze zróżnicowane organelle, również spotkany aparat Golgiego
- gromadzony materiał zapasowy wolutyna , glikogen, lipidy w znacznie większych ilościach niż u bakterii.
Zwykle rosną w warunkach tlenowych , w temperaturze 20-45stC, ( pasożyty skóry w niższych temperaturach , pasożyty narządów wewnętrznych w wyższych), są takie które sosną w temp 0st C jak i ponad 60stC.
- raczej preferują środowisko kwaśne pH 2,2-8,0
- wymagają węglowodanów jako źródła węgla , białek jako źródła aminokwasów, mikroelementów , niektóre grzyby potrzebują do wzrostu Witamin z grupy B
Są szczególnie chorobotwórcze dla roślin i zwierząt ale również dla ludzi wywołując u nich różne postacie grzybic ale również alergie lub toksyny będące czynnikami współdziałającymi w nowotworzeni np. aflatoksyna.
Cztery grupy :
- grzyby drożdżopodobne
- grzyby pleśniowe
- grzyby dermatofitowe
- grzyby dymorficzne.
Podział grzybic na :
-endogenne , wywołane przez grzyby bytujące w organizmie człowieka np. Candida ( przewód pokarmowy, drogi rodne ), Pityrosporum- kolonizujące skórę
- egzogenne , które przedostały się do środowiska egzogennego np. bytujące w przewodzie pokarmowym ptaków drogą wziewną lub poprzez uszkodzoną skóre dostaja się do organizmu człowieka gdzie są patogenami, inne np. będące pleśniami w środowisku otaczającym , w powietrzu, w wodzie.
Inny podział grzybic z punktu widzenia lokalizacji : powierzchowne i głębokie ( narządowe), ogniskowe lub uogólnione - fungemia = obecność grzybów we krwi.
Wyróżnia się czynniki predysponujące oraz współdziałające z nimi mechanizmy zakażenia - tabela /////////
-Grzyby drożdżopodobne- początkowo przylegają do komórek gospodarza , potem je kolonizują jeżeli nie zostaną usunięte poprzez np. strumień moczu , dalej dochodzi do kolonizacji wstępującej do organizmu człowieka , przy obecności czynników predysponujących np. zaleganie moczu , zachwianie odporności, ciąża i zmiana odczynu w pochwie i dochodzi do zakażenia
Jeżeli jest uszkodzona skóra lub grzyby dostana się do organizmu drogą wziewną to również staną się one patogenami dopiero po pojawieniu się czynników sprzyjających .
- Grzyby pleśniowe - zakażenie dotyczy szczególnie ludzi z obniżona odpornością , obciążonych innymi chorobami. Do organizmu , drogą wziewną wnikają spory i przy uszkodzeniu tkanek lub zmienionych chorobowo wnikają do wnętrza organizmu . Do uogólnienie grzybicy dochodzi przy obecności wyżej wymienionych sprzyjających czynników
- dermatofity- zakażenie przechodzi z zakażonego, uszkodzonego naskórka na skórę właściwą. Dotyczy to szczególnie dużych zamkniętych środowisk ludzkich, w których korzysta się zbiorowo z urządzeń sanitarnych
Zapobieganie grzybicom:
- eliminowanie grzybów ze środowiska
-eliminowanie czynników predysponujących
-pacjentów o szczególnych predyspozycjach leczy się w sposób celowany, ogranicza się tz. szeroką antybiotykoterapię , zwiększa się ich odporność, prawidłowo leczy schorzenia podstawowe .
- szczególna profilaktyka i ograniczanie źródeł grzybiczych zakażeń szpitalnych poprzez właściwą sterylizację narzędzi i sprzętu .
- odpowiednia filtracja powietrza w salach operacyjnych ,OIT, itd.
Leczenie grzybic - tabela ///////
Leki przeciwgrzybiczne dzieli się na antybiotyki wyprodukowane z biosyntezy promieniowców i grzybów pleśniowych oraz syntetyczne leki przeciw grzybicze.
Najczęściej stosowane polienowe:
Nystatyna - grzybice drożdżopodobne przewodu pokarmowego ( nie wchłaniają się z przewodu pokarmowego) , zewnętrznych części narządu rodnego, skóra .
Pimarycyna - drożdżopodobne , dermatofity, pleśnie - nie wchłaniają się z przewodu pokarmowego, stosowane do grzybic skóry i błon śluzowych
Amfoteracyna B - najsilniejszy i najbardziej toksyczny , działa na drożdżopodobne , pleśnie oraz grzyby dymorficzne , podawana dożylnie
Syntetyczne :
-Klotrimazol, ketokonazol - grzybice powierzchowne skóry i błon śluzowych
-flukonazol - drożdżopodobne
Grzyby drożdżopodobne :
- różnorodność kształtu
-duża aktywność biochemiczna pomagająca w rozpoznaniu : zdolność fermentacji , przyswajaniu węglowodanów, węgla , azotu
- zdolność do tworzenia grubościennych form przetrwalnikowych .
Rodzaj Candida - C albicans
- zdolność przylegania , kolonizacji ,
- z materiału się izoluje hoduje , identyfikuje ,
- preparat bezpośredni barwi metodą Grama, bezpośrednio ogląda w mikroskopowo i makroskopowo grzybnie po przesianiu na podłożu Sabourauda
- próby biochemiczne - fermentacja i asymilacja = przyswajanie
- ocenia się wrażliwość na stosowane leki przeciwgrzybiczne.
Cryptococcus - bytują w przewodzie pokarmowym gołębi, człowiek zakaże się drogą wziewną lub po uszkodzeniu naskórka , może dojść do uogólnionej kryptokokozy lub kryptokokozu ośrodkowego układu nerwowego
W badaniu charakterystyczna obecność otoczki mukopolisacharydowej ( barwienie metodą Grama a następnie tuszem chińskim). W badaniu diagnostycznym charakterystyczne właściwości biochemiczne - rozkłada mocznik
W badaniu serologicznym ujawnienie antygenu - otoczka lub wytworzonym przeciwko niemu przeciwciał.
Rodzaj Pityrospory:
- litofilny,
- skóra owłosiona głowy ze skłonnością do łojotoku
- łupież pstry ( nadmierne pocenie się , gorący klimat)
- na tułowiu drobne łuszczące się zmiany
- pozostają długo odbarwione plamy
- rozpoznanie kliniczne , badanie w lampie Wooda ( ceglaste zabarwienie pod wpływem promieniu ultrafioletowych ), w preparacie bezpośrednim - blaspory, rośnie na podłożu Sabourauda
Grzyby pleśniowe
- powszechne
- wywołują wszystkie postacie grzybic w zależności od czynników sprzyjających ,
-wywołują alergie oskrzelowo - płucne
- wytwarzają mykotoksynę - aflatoksynę- działanie mutagenne i karcynogenne.
Rodzaj Aspergillus :
- grzybice - układu oddechowego, - masy grzybicze przypominające guz w klatce piersiowej ,- grzybice zatok bocznych nosa , zapalenie gałki ocznej, skóry gładkiej , paznokci, ośrodkowego układu nerwowego, posocznica
- diagnostyka - makroskopowo wygląd konidioforu czyli struktury utrzymującej spory
Diagnostyka serologiczna .
Grzybice o nazwach - akaulioza, fikomykoza, zygomykoza, mukormykoza
Grzyby dermatofitowe
- grzybice powierzchowne o różnym nasileniu odczynu zapalnego
- typowe infekcje egzogenne ( dermatofity antropofilne, zoofilne , geofilne)
- mogą wywoływać epidemie w dużych skupiskach ludzi
Zakażenia skóry i jej wytworów -różne postacie
Diagnostyka - obraz kliniczny , odpowiednio pobrany materiał do badania , preparat bezpośredni rozjaśniony 20% KOH , część materiału posiewa się na podłoże Sabourauda z dodatkiem antybiotyku , rosną bardzo wolno- kilka tygodni. Ogląda się i ocenia porosłe kolonie .
Grzybice to Trichophyton, Epidermophyton, Microsporum
Pneumocystis Carinii drobnoustrój zaliczany przez niektórych do pierwotniaków a innych do grzybów
Typowe zakażenia to atypowe pneumocystozowe zapalenie płuc u noworodków i/lub chorych na HIV
Do badania pobiera się wymaz z nagłośni, plwocinę popłuczyny oskrzelowe , tkankę płucną . Poszukuje się cyst i trofozoitów - bardzo trudne . W badaniu serologicznym stwierdza się obecność specyficznych przeciwciał
Leczy się pentamidyną lub sulfonamidami.
Ćwiczenia z Biofizyki //////////////
Fale sprężyste - szeroko wykorzystywane w medycynie to fale ultradźwiękowe ( wykorzystywane w diagnostyce) i uderzeniowe ( wykorzystywane w terapii lithotriptery - np. do rozbijania kamieni nerkowych )
Fale ultradźwiękowe są drganiami mechanicznymi o częstotliwościach większych niż 20 kHz, rozchodzącymi się w ośrodkach gazowych, ciekłych i stałych.
Wraz z przekazaniem ruchu drgającego następuje przekazanie energii . Odbywa się to nie na zasadzie przemieszczania substancji ,lecz poprzez
przemieszczenie deformacji danego ośrodka.
W diagnostyce USG wykorzystuje się fale o częstotliwościach od 2MHz do 15 MHz.
Fale rozchodzące się w wodzie i w tkankach miękkich są falami podłużnymi . W tkankach miękkich z niewielką sprężystością mogą rozchodzić się również fale poprzeczne .
W tkankach kostnych wytwarzane mogą być fale poprzeczne , podłużne lub powierzchniowe.
Wielkości opisujące stan zaburzenia ośrodka sprężystego to:
- ciśnienie akustyczne ,- natężenie dźwięku, - temperatura , - prędkość drgających cząstek
Wartości prędkości fali ultradźwiękowej w tkankach są do siebie zbliżone .
Wyjątkiem są tkanka kostna , tłuszczowa i tkanki oka .
W tkance kostnej ze względu na rozchodzenie się różnych typów fal sprężystych
( poprzecznych i podłużnych ) ich prędkości mogą się znacznie różnić.
Stwierdzono że na prędkość rozchodzenia się fal wpływa stan czynnościowy danej tkanki
( stopień ukrwienia, uwodnienia, różnice w składzie biochemicznym).
Zjawiska związane z oddziaływaniem fal ultradźwiękowych z materią .
- Zjawisko odbicia - fala płaska ,rozchodząca się w ośrodku jednorodnym akustycznie , padająca prostopadle na granicę dwóch ośrodków , dochodząc do granicy z ośrodkiem o innej oporności akustycznej właściwej, ulega odbiciu.
- Zjawisko załamania - fala przechodząc do drugiego ośrodka o innej oporności akustycznej właściwej , zmienia kierunek swojego biegu w zależności od wartości kata padania.
- Zjawisko ugięcia - fala ultradźwiękowa rozchodząca się w danym ośrodku , w pobliżu struktury o innej gęstości ulega ugięciu , jest ono tym silniejsze , im większa jest długość fali w porównaniu z wymiarami przeszkody.
- Zjawisko interferencji- Ze względu na niejednorodność tkanek poszczególne części wiązki ultradźwiękowej przechodzą przez nie z różną prędkością. Powstają zatem różnice faz pomiędzy poszczególnymi częściami wiązki a interferencja fal powoduje częściowe wygaszenie wiązki. Nałożenie się fal będących w fazach przeciwnych prowadzi do ich wzajemnego osłabienia , natomiast wzmocnienie następuje przy spotkaniu się fal zgodnych w fazie .
- Zjawisko rozproszenia - polega na przemianie fali pierwotnej w zbiór fal rozchodzących się we wszystkich możliwych kierunkach . Zachodzi w wyniku oddziaływania z napotkanymi po drodze różnego rodzaju przeszkodami . Rozpraszanie przyczynia się do osłabienia wiązki
- Zjawisko absorpcji - na skutek absorpcji energia mechaniczna fali ultradźwiękowej zamienia się na ciepło dzieje się tak bo ośrodek , w którym rozchodzi się fala nie jest doskonale sprężysty. Tarcie wewnętrzne , przewodnictwo cieplne i zjawiska molekularne prowadzą do wykładniczego zmniejszania amplitudy drgań wraz z odległością . Absorpcja jest głównym czynnikiem wpływającym na głębokość wnikania wiązki fali do danego ośrodka .
- Zjawisko tłumienia - Absorpcja , rozproszenie fali, oraz w niewielkim stopniu odbicie , załamanie i ugięcie są mechanizmami odpowiedzialnymi za tłumienie fali w ośrodku.
Pojecie tłumienia jest szersze niż pojęcie absorpcji . Współczynnik tłumienia jest sumą współczynników absorpcji i rozpraszania. Dla tkanek miękkich współczynnik tłumienia fal poprzecznych jest około 3 x większy niż współczynnik tłumienia fal podłużnych.
- Zjawisko Dopplera - polega na zmianie częstotliwości fali , występuje wszędzie tam , gdzie źródło fal znajduje się w ruchu względem obserwatora . Zjawisko występuje niezależnie od tego czy porusza się źródło czy obserwator
Jeżeli wiązka ultradźwiękowa jest odbita od ruchomego obiektu jakim może być krwinka , obiekt ten można traktować jako ruchome źródło . W konsekwencji rejestruje się falę , której częstotliwość jest zmieniona względem częstotliwości fali nadanej. Zbliżanie się krwinki powoduje zwiększanie częstotliwości a oddalanie zmniejszanie częstotliwości.
Fizyczne efekty oddziaływania fal ultradźwiękowych z materią
- Efekt termiczny - pojawienie się go związane jest z pochłanianiem energii fali ultradźwiękowej przechodzącej przez ośrodek lepko - sprężysty. , w którym następuje przekształcenie energii kinetycznej na energię cieplną . Wartość wytwarzanej energii cieplnej jest zależna od natężenia fali oraz od czasu jej działania .
- Efekt mechaniczny - największe znaczenie mają zjawiska kawitacji i fala uderzeniowa . Zjawisko kawitacji polega na pojawieniu się w ośrodku pęcherzyków , które ulegają zapadaniu . Pęcherzyk kawitacyjny powstaje w wyniku chwilowego obniżenia ciśnienia w określonej objętości . Kawitacja trwała - pęcherzyki mają tendencję do wzrostu i po osiągnięciu pewnych rozmiarów stają się pęcherzykami rezonansowymi . Drgania ich mogą utrzymywać się bardzo długo a ich amplituda może przekraczać amplitudę fali ultradźwiękowej przechodzącej przez ośrodek.
Kawitacja przejściowa zachodzić może przy średnich i dużych natężeniach fali gdzie pęcherzyki powiększają się , wykonują drgania nieliniowe a gdy ciśnienie środowiska jest większe niż 1 atmosfera to zapadają się .
Wytwarzanie i odbiór fal ultradźwiękowych
Do wytwarzania ultradźwięków dla celów diagnostycznych stosuje się przetworniki piezoelektryczne , umieszczane w głowicach . jeden przetrwalnik spełnia funkcję nadawczą drugi odbiorczą .
Wiązkę ultradźwiękową emitowaną przez głowice dzieli się na dwa obszary : pole bliskie i pole dalekie . Pole bliskie ma w przybliżeniu kształt cylindryczny o podstawie odpowiadającej przetrwalnikowi . Pole dalekie ma kształt stożka . Rozbieżność wiązki zmniejsza się ze wzrostem średnicy przetrwalnika .
Ogniskowanie wiązki - w celu poprawienia jakości odwzorowania i powiększenia kątowej zdolności rozdzielczej , używa się wiązek zogniskowanych . Zogniskowania dokonuje się za pomocą układów elektronicznych , soczewek i zwierciadeł akustycznych bądź poprzez nadanie przetwornikowi odpowiedniego kształtu .
Zdolność rozdzielcza - im lepsza ,tym lepsza jakość obrazu, lepsze odwzorowanie badanych struktur, ostrość oglądanych struktur . Zdolność rozdzielcza liniowa - pozwala na rozróżnienie dwóch punktów leżących w osi wiązki , kątowa- daje rozróżnienie dwóch punktów leżących w jednakowej odległości osiowej od przetwornika lecz usytuowanych w różnych kierunkach.
Rodzaje prezentacji obrazu :
Wizualizacja statyczna - obraz uzyskuje się przez ręczne prowadzenie głowicy ultradźwiękowej
Metoda dopplerowska - metoda ta oprócz powyższego obrazu , wykorzystuje dodatkowa informację zakodowaną w postaci zmian częstotliwości fali odbitej względem nadanej - zjawisko Dopplera .
Efekty biologiczne oddziaływania ultradźwięków
- nie został jeszcze dobrze poznany ale stwierdzone że zależne są :
Od czasu trwania ekspozycji
Od wartości natężenia fali ultradźwiękowej
Ze względów medycznych ultradźwięki dzieli się w zależności od natężenia na :
- małe -powodujące przyspieszenie procesów wymiany , niewielkie nagrzanie i mikromasaż - USG i terapia ultradźwiękowa
- średnie - odwracalne procesy ucisku , szczególnie tkanki nerwowej , czas powrotu do stanu normalnego zależy od natężenia i czasu ekspozycji
- duże - procesy nieodwracalne doprowadzające do całkowitego zniszczenia tkanki , cele doświadczalne i lecznicze - chirurgia ultradźwiękowa.
Efekty biologiczne działania fali ultradźwiękowej następują po etapie zmian właściwości fizykochemicznych ośrodka takich jak:
- depolimeryzacji dużych biomolekuł takich jak polisacharydy, poliglikole , białka , DNA znajdujący się pozakomórkowo , kolagen
- zjawiska tiksotropowego tj przejscia żel - zol np. w miozynie , wodnych roztworach skrobii w koloidach protoplazmy.
- wzrostu przewodnictwa elektrycznego
- katalizowania reakcji chemicznych
- zwiększenia pęcznienia np. kolagenu
- przesunięcie pH w stronę zasadową
- inaktywacja enzymów
- wzrost dyfuzji
- tworzenie emulsji
- tworzenie makrorodników
Ultradźwięki powodują śmierć małych zwierząt żyjących w wodzie wpływają również na izolowane komórki , tkanki i bakterie .
Niekorzystna na wzrost populacji komórek jest ich ekspozycja na ultradźwięki w zakresie 1-4 Hz. A przy większych natężeniach powoduje ich cytolizę i śmierć.
Małe , terapeutyczne natężenia powodują uszkodzenie lizosomów komórek naskórka , zmianę przepuszczalności błon komórkowych i wzrost szybkości dyfuzji.( korzystne są one w terapii , w diagnostyce nie ).
Reakcje poszczególnych tkanek mogą być zróżnicowane np. w wątrobie ciepło nie powoduje żadnych zmian , natomiast w tkance kostnej prowadzi do ograniczenia przepływu krwi .
W badaniach na zarodkach kurzych okazało się że ultradźwięki działające w trakcie organogenezy mogą być przyczyna zniekształceń płodów .Po ukończonej organogenezie fale ultradźwiękowe nie mają już powyższego niekorzystnego wpływu .
Działanie fali ultradźwiękowej może wywołać następujące skutki biologiczne :
- zahamowanie rozwoju płodu
- zmniejszenie odporności
- obumieranie komórki
- działanie teratogenne
- zmniejszenie możliwości reprodukcji
- wymianę chromatyd siostrzanych i wynikające stąd konsekwencje genetyczne .
Powyższe skutki odnoszą się do warunków in vitro i często nie znajdują odniesienia do wyników uzyskanych w doświadczeniach in vivo . U ludzi nie stwierdzono działania ubocznego.
Rezonans magnetyczny
Ćwiczenia transport przez błony
Każda komórka otoczona jest błoną komórkową - rodzajem granicy , która pozwala na zachowanie integralności komórki przez zachowanie charakterystycznego dla niej składu chemicznego , różniącego się często w sposób istotny od składu chemicznego jej otoczenia. Błona jest z tzw rodzaju błon o wybiórczej przepuszczalności określonych substancji . Ponadto przepuszczalność błony podlega procesom regulacji i może ulegać zmianom pod wpływem określonych bodźców chemicznych bądź elektrycznych.
Skład chemiczny błon to w 40% białka i 60 % li[idy. Proporcje te są różne i zależą od pełnionej przez komórkę a tym samym błonę komórkową funkcji ( w błonie mielinowej jest np. 25% białek suchej jej masy , w innych dochodzi do 75%). Charakterystycznym elementem budowy błony komórkowej są widoczne w mikroskopie elektronowym dwie gęste warstwy silnie oddziaływujące na elektrony , przedzielone mniej gęstą ,która słabiej rozprasza elektrony. Lipidy budujące błonę to pochodne cząsteczki glicerolu. Charakterystyczna cechą związków lipidowych jest amfofilność czyli dwojaki sposób wiązania się z wodą. Najbardziej liczne są fosfolipidy które w środowisku wodnym spontanicznie tworzą warstwę podwójną lipidową a jej cząstki pojedyncze swobodnie mogą poruszać się wzdłuż błony , wirują dookoła swoich długich osi a ich łańcuchy węglowodorowe wykazują dużą giętkość stąd błona podlega licznym fluktuacją. Płynność błony zależy od jej składu i temperatury otoczenia .
Obniżenie temperatury powoduje przejście w stan żelu lub stan krystaliczny. Temperatura zmiany fazy błony zależy od długości łańcuchów węglowodorowych , jest niższa gdy łańcuchy są krótsze i wyższa gdy łańcuchy są dłuższe. Na płynność, usztywnienie i przepuszczalność błony wpływa ilość cząsteczek cholesterolu.
Opisuje się że błona komórkowa ma charakterystyczny model mozaikowy Podwójna warstwa lipidowa o charakterystycznej dla niej strukturze wyróżnia polarne łańcuchy lipidowe ( hydrofobowe ogony) skierowane do wnętrza błony tworząc jej hydrofobowe wnętrze , natomiast fragmenty posiadające elektryczny model dipolowy ( hydrofilowe główki ) skierowane są na zewnątrz błony w kierunku środowiska wodnego. Z tak utworzoną matrycą związane są białka - błonowe .
Dzielą się one na białka - peryferyjne - powierzchniowe i
-integralne - transbłonowe , przenikające poprzez błonę .
Białka błonowe pełnia kluczową rolę w funkcjonowaniu komórki : są odpowiedzialne za -wybiórczy transport , tworząc system kanałów jonowych i system transportu wbrew istniejącym bodźcom termodynamicznym ( pompa sodowo-potasowa) pełnią też rolę
-receptorów neuroprzekaźników i
- antygenów
O przepuszczalności bony komórkowej oprócz struktury samej błony , decydują właściwości fizyczne dyfundujących przez nie cząsteczek w głównej mierze właściwości elektryczne i oraz ich rozmiary .
Czastki pozbawione momentu dipolowego - polarne dyfundują znacznie łatwiej ( O2, CO2, ) - błona jest dla nich przepuszczalna , podobnie małe polarne cząstki jak woda etanol, mocznik Cząstki naładowane niezależnie od wielkości przenikają znacznie gorzej W odróżnieniu od błon sztucznych , błony komórkowe muszą mieć zdolność do przepuszczania ( i to w sposób wybiórczy ) również cząstki związków polarnych takich jak cukry , aminokwasy, nukleotydy, oraz jony organiczne.
Transport ten jest dokonywany za pomocą wyspecjalizowanych struktur białkowych , z których każda jest odpowiedzialna za transport określonych jonów i cząsteczek.
Klasyfikacja procesów transportu
Transport wymaga zadziałania bodźców termodynamicznych :
- różnica stężeń
- różnica potencjałów elektrycznych wewnątrz i na zewnątrz błony komórkowej
- różnica ciśnień hydrostatycznych
- różnica ciśnień osmotycznych
Mogą występować samodzielnie bądź łącznie tworząc bodziec wypadkowy np. różnica potencjałów elektrochemicznych . Sama różnica bodźców nie decyduje o przenikaniu cząsteczek , ale różnica w odniesieniu do grubości przestrzennej bariery - błony komórkowej i zależność nazywa się gradientem.
Jeżeli transport odbywa się zgodnie z istniejącym gradientem bez nakładu energii wówczas jest to transport bierny w jego wyniku entropia układu rośnie - zanika bodiec termodynamiczny , co w rezultacie prowadzi do śmierci komórki . Muszą istnieć sposoby podtrzymania bodźców , to znaczy transport substancji w kierunku przeciwnym niż kierunek narzucony przez istniejące bodźce.
Proces taki nie może istnieć samoistnie i wymaga nakładu energii i pośrednictwa białek transportujących . Transport wbrew bodźcom nazywa się transportem aktywnym .
Transport aktywny dzieli się na transport aktywny pierwszego rodzaju - potrzebna jest hydroliza ATP
Transport aktywny drugiego rodzaju gdy wykorzystana jest hydroliza ATP oraz nośnik białkowy
Białka pośredniczące w transporcie przez błonę:
- białka przenoszące - nośniki - transport na nośnikach - dochodzi do zmiany konformacji przestrzennej białka , co wymaga energii, transport czynny
- białka tworzące kanały lub pory - ułatwiające przechodzenie - zwany też dyfuzją ułatwioną . Przez kanały te substancje przechodzą w sposób bierny zgodnie z zadziałaniem odpowiednich bodźców , nie wymaga energii.
Bardzo istotne jest w jakim polu elektrycznym i o jakim nasileniu znajdzie się białko i na ile pole to zmieni jego konformacje, wydolność transportu . Źródłem pola elektrycznego zmieniającego konformacje białka transportującego jest różnica potencjałów elektrycznych występujących wewnątrz i na zewnątrz komórki wynikająca z rozkładu jonów wewnątrz i zewnątrzkomórkowych . .
Charakterystyka transportu biernego i aktywnego
Transport bierny :
-prosta dyfuzja , nie wymaga energii i białka transportującego, strumień przenoszonej substancji jest wprost proporcjonalny do gradientu stężenia
- dyfuzja ułatwiona - za pośrednictwem białek tworzących kanały i pory i ich ilość jest ograniczona stąd ilość transportowanych substancji jest również ograniczona .
Transport aktywny :
Podstawowy model aktywnego transportu za pomocą nośników zakłada że związanie przez białko przenoszące transportowanej substancji powoduje zmianie konformacji ośnika w taki sposób że początkowo wiążące miejsce na nośniku znajduje się po jednej stronie błony , a następnie po zmianie konformacji , po jej drugiej stronie.
Ponadto powinowactwo chemiczne miejsca wiążącego na nośniku dla wiązanej substancji jest inne gdy miejsce to ma kontakt ze środowiskiem wewnątrzkomórkowym i inne gdy ma ono kontakt ze środowiskiem zewnątrzkomórkowym . Powinowactwo nadaje kierunek przenoszenia bo odbywa się ono z obszaru gdzie powinowactwo chemiczne nośnika do przenoszenia molekuły jest wyższe do obszaru gdzie jest ono niższe . Rolą energii w tym procesie jest utrzymanie różnicy powinowactwa chemicznego nośnika po obu stronach błony. Jeśli źródłem energii jest rozpad ATP to proces jest kwalifikowany jako aktywny pierwszego rodzaju np. - pompa Na/K .
Cykl rozpoczyna się
1.- przyłączeniem do fragmentu Na-K-ATPazy , znajdującego się wewnątrz komórki 3 x Na oraz ATP.
2- ATP ulega rozpadowi na ADP i grupę fosforanową pozostającą związaną z fragmentemNa-K-ATPazy = fosforylacja .
3- W wyniku tej reakcji ATPaza ulega konformacji
4- i dzięki temu Na zostaje przeniesiony na zewnątrz komórki i tam uwolniony
5 - następny etap to przyłączenie K do fragmentu Na-K-ATPazy
( K znajduje się na zewnątrz komórki ), towarzyszy temu odłączenie grupy fosforanowej = defosforylacja
6 -Na-K-ATPaza ulega konformacji czego efektem jest przeniesienie K z zewnątrz komórki do wewnątrz komórki i tam uwolniony.
7- Na-K-ATPaza przyjmuje swój pierwotny kształt i staje się gotowa do rozpoczęcia następnego cyklu..
Transport aktywny drugiego rodzaju
Utrzymywanie gradientu stężeń wbrew zmniejszającej go dyfuzji wymaga nakładu energii . Zatem w wyniku transportu aktywnego pierwszego rodzaju energia jest gromadzona w formie różnicy stężeń i może zostać uwolniona , gdy strumień substancji przepływa w kierunku od stężenia większego do mniejszego. W tym sensie gradient stężenia określonych jonów stanowić może źródło energii.
Jeśli z biernym przepływem jonów ( uprzednie aktywnie przetransportowanych) sprzężony zostanie transport innej substancji w kierunku od obszaru , gdzie jej stężenia jest mniejsze do obszaru gdzie jest większe to tego rodzaju transport klasyfikowany jest jako transport aktywny drugiego rodzaju. Przykładem jest transport cukrów i kwasów nukleinowych z Na ze światła jelita do komórek nabłonka jelitowego . Transport glukozy ze światła jelita do komórek nabłonka jelitowego rośnie wraz ze stężeniem Na w świetle jelita .
Białko transportujące glukozę ma miejsca wiążące zarówno dla glukozy jak i dla Na.
Czy dojdzie do konformacji białka nośnika tak by przyłączyć glukozę zależy od stężenia Na i czy Na i glukoza zostaną przyłączone równocześnie.
Rola transportu aktywnego w regulacji ciśnienia osmotycznego
Pompa Na/K wyprowadza z wnętrza komórki 3 jony Na i wprowadza do komórki 2 jony K. Powoduje wypadkowy przepływ prądu w błonie komórkowej wytwarzając różnicę potencjałów elektrycznych między wewnętrzną a zewnętrzną częścią błony komórkowej.
Jest to jednak niewielki wpływ na powstanie potencjału błonowego.
Pompa odgrywa zasadnicze znaczenie w utrzymaniu odpowiedniej wartości ciśnienia osmotycznego poprzez wprowadzanie i wyprowadzanie jonów Na i K . Ciśnienie osmotyczne decyduje o rozmiarach komórki o ich pęcznieniu i ewentualnym rozrywaniu błon komórkowych .
Dynamika procesów transportowych
O szybkości transporty decyduje
- budowa,
-rodzaj błony komórkowej ,
- wielkość przepuszczalności dla danej substancji,
- wartość bodźców wywołujących transport,
-ilość nośników białkowych.
Gdy przepuszczalność jest duża to wyrównywanie stężeń zachodzi szybko.
Na szybkość transportu błonowego wpływają antybiotyki , znacznie ograniczając lub całkowicie blokując go niszczą drobnoustroje .
Potencjał spoczynkowy
Cytoplazma , podobnie jak płyn pozakomórkowy , jest w swojej objętości elektrycznie obojętna, to znaczy zawiera jednakową ilość jonów dodatnich i ujemnych . Tylko w obszarze o grubości 1 mikrona wokół błony komórkowej istnieje wyraźna warstwa ładunków ujemnych wewnątrz komórki i warstwa ładunków dodatnich na zewnątrz. Ten nieznaczny nadmiar ładunków po jednej i po drugiej stronie wytwarza różnice potencjałów elektrycznych w poprzek błony komórkowej. Na zewnątrz komórki Na i Cl wewnątrz komórki K i aniony organiczne A.W utrzymaniu potencjału spoczynkowego błony komórkowej konkurują: gradient stężeń napędzający dyfuzje jonów K z komórki i różnica potencjałów elektrycznych hamująca ją. Potencjał elektryczny wzrasta do chwili wyrównania jego wpływu z wpływem gradientu stężenia . zatrzymanie dyfuzji jest gdy potencjał elektryczny błony wynosi -75nV. Jest to potencjał równowagi a tym samym potencjał spoczynkowy tej komórki. Aby komórka zachowała stałą wartość potencjału spoczynkowego , musi utrzymać niezmienne stężenie jonów w jej wnętrzu i i stały rozkład ładunków po obu stronach błony.
Oznacza to że strumień jonów wpływających i wypływających musza być dokładnie zrównoważone W przeciwnym razie zanikł by gradient stężeń. Zapobiega temu pompa jonowa Na/K Wykorzystując energię z hydrolizy ATP , pompuje jony zgodnie z ich gradientami. Zatrzymanie pompy Na/K prowadzi do powolnego zaniku potencjału spoczynkowego.
Można stwierdzić że potencjał spoczynkowy jest uzależniony od 3 jonów K,Na, Cl. Jony Cl SA w stanie równowagi , ponieważ jednakowe strumienie ich wpływają i wypływają z komórki co oznacza że nie wpływają na wartość potencjału spoczynkowego. Jony Na i K na zewnątrz i wewnątrz komórki są odpowiednio blisko siebie co do wartości to jony K wywierają największy wpływ na potencjał spoczynkowy , ponieważ dla nich błona komórkowa ma największą przepuszczalność. .
Ćwiczenia z biofizyki 12.12.2008. Termodynamika
Pojęcia i definicje
Reakcja o ujemnym bilansie energetycznym (w której układ reagujący pochłania energię z otoczenia) jest nazywana reakcją endoenergetyczną.
Reakcja o dodatnim bilansie energetycznym (w której układ reagujący wydziela energię do otoczenia) nazywa się reakcją egzo-energetyczną.
Układ reagujący oznacza dowolny wyodrębniony zbiór substancji,których przemiany badamy. W skład układu wchodzi także przestrzeń, w której znajduje się ten układ. Otoczeniem jest wszystko,co nie należy do układu.
Praca i ciepło to formy przekazywania energii. Praca polega na przekazywaniu uporządkowanego ruchu między obiektami materialnymi. Ciepło polega na wymianie energii między chaotycznie zderzającymi się cząstkami. Przepływ ciepła wymaga różnicy tem
peratur.
Energia wewnętrzna U stanowi sumę wszystkich rodzajów energii wszystkich cząstek wchodzących w skład układu.
Pierwsza zasada termodynamiki przedstawiona w formie prawa zachowania energii: W układzie izolowanym energia może przechodzić z jednej formy w inną, ale jej całkowita ilość jest stała.
Pierwsza zasada termodynamiki w odniesieniu do zmian energii wewnętrznej: Zmiana energii wewnętrznej układu AU jest sumą ilości energii wymienianej z otoczeniem w postaci ciepła Q i pracy W: AU = Q + W.
Entalpia H jest funkcją stanu definiowaną jako suma energii wewnętrznej układu oraz iloczynu jego ciśnienia i objętości. Zmiana entalpii AH odpowiada ciepłu przemiany zachodzącej w układzie, np. ciepłu reakcji chemicznej.
Przyjęto umownie, że entalpia wszystkich pierwiastków w warunkach standardowych jest równa zeru. Zmiana entalpii (czyli efekt cieplny), która towarzyszy syntezie jednego mola związku z pierwiastków w warunkach standardowych, nazywa się ciepłem tworzenia lub standardową entalpią tworzenia związku chemicznego i jest oznaczana symbolem AH%98.
10. Prawo Hessa:
Efekt cieplny procesu izobarycznego nie zależy od tego, czy proces przebiega bezpośrednio od stanu początkowego do końcowego, czy przez dowolną liczbę stanów pośrednich. Praktyczne zastosowanie prawa Hessa umożliwia obliczenie ciepła tworzenia właściwie każdego związku chemicznego, czyli obliczenie ciepła każdej reakcji chemicznej.
Ciepło molowe substancji to iloczyn jej ciepła właściwego i masy molowej. Liczbowo jest to ilość ciepła potrzebna do ogrzania jednego mola tej substancji o jeden stopień. Ciepło nie jest funkcją stanu (zależy od sposobu przemiany). Rozróżniamy więc ciepło molowe w stałej objętości Cv i ciepło molowe pod stałym ciśnieniem C w zależności od tego, czy ogrzewanie substancji zachodzi w warunkach izochorycznych, czy w warunkach izobarycznych.
Reguła Lavoisiera-Laplace'a:
Ciepło rozkładu związku na prostsze składniki jest równe ciepłu tworzenia związku z tych składników.
Efekt cieplny reakcji spalania (czyli entalpia spalania lub ciepło spalania) jest równy różnicy między ciepłem tworzenia produktów a ciepłem tworzenia substratów reakcji.
Entropia jest miarą nieuporządkowania układu albo miarą stopnia uśrednienia układu. Pośrednio charakteryzuje strukturę układu.
Druga zasada termodynamiki:
W układach izolowanych (czyli w układach o stałej energii) procesy samorzutne są nieodwracalne i związane ze wzrostem entropii. We wszechświecie jako całości entropia zawsze rośnie.
Entalpia swobodna jest funkcją stanu definiowaną jako suma efektu energetycznego i efektu entropowego reakcji. Znak zmiany entalpii swobodnej pozwala wnioskować o możliwościach zajścia przemiany.
Energia aktywacji to ilość energii potrzebna do wytworzenia z substratów kompleksu aktywnego zdolnego do przejścia w produkty.
Układy składające się z jednej fazy, w których wszystkie substraty i produkty mają jednakowy stan skupienia, nazywamy układami jednorodnymi (homogenicznymi). Układy składające się z co najmniej dwóch faz przedzielonych wyraźnie widoczną granicą
nazywamy niejednorodnymi (heterogenicznymi).
Katalizatory to substancje, które zmieniają szybkość reakcji chemicznych i same się przy tym nie zmieniają. Działanie katalizatora polega na zmianie wartości energii aktywacji reakcji.
21. Katalizator dodatni obniża energię aktywacji i sprawia, że większa liczba cząsteczek jest zdolna do wejścia w reakcję. Wzrasta więc szybkość reakcji. Katalizator ujemny (inhibitor) podwyższa energię aktywacji i zmniejsza szybkość reakcji.
21. Autokataliza polega na tym, że jeden z powstających produktów pełni rolę katalizatora zachodzących reakcji
Pierwsza zasada termodynamiki jako zasada zachowania energii , powinna być zachowana także w procesach biologicznych .
Organizm żywy do utrzymania procesów życiowych potrzebuje energii .
Energia jest konieczna zarówno do zachowania struktury substancji żywej, jak i do wykonywania wielorakich czynności .
W organizmach wyżej zorganizowanych energia wyzwala się w procesach utleniania produktów pokarmowych . Procesy te zachodzą w przybliżeniu w stałej temperaturze i przy stałym ciśnieniu , więc miarą energii , którą organizm dysponuje do wykonywania wielorakich czynności , jest w zasadzie - zmiana entalpii swobodnej. , pochodząca z utlenienia produktów pokarmowych
Biotermodynamika jest dyscypliną naukową wykorzystującą rozważania termodynamiki fenomenologicznej lub termodynamiki statystycznej do opisu procesów albo zjawisk zachodzących w żywych układach biologicznych .
Termodynamika fenomenologiczna ( TF) zajmuje się badaniem zjawisk i właściwości układów makroskopowych , jednakże bez wnikania w strukturę mikroskopową tych układów . W opisie termodynamicznym ogromnych ilości oddziaływujących mikrocząsteczek uwzględnia się właściwości , które można zaobserwować na poziomie makroskopowym .
Termodynamika statystyczna ( TS) zajmuje się opisem właściwości struktur ikroskopowych , stanowiący układ makroskopowy. W ten sposób uzupełnia i uzasadnia termodynamikę fenomenologiczną .
TS wiąże parametry makroskopowe układu z jego strukturą mikroskopową . Jednak identyczne makroskopowo układy mogą być istotnie różne w opisie mikroskopowym .
Biotermodynamika umożliwia lepsze poznanie zjawisk życiowych zarówno w stanie zdrowia jak i w stania chorobowym .
Organizmy żywe w znaczeniu termodynamicznym są układami otwartymi , w których zachodzą procesy nieodwracalne . Towarzyszą im transporty substancji , energii, i ładunków elektrycznych stanowiących podstawę procesów życiowych .
Układ żywy dąży do znalezienia się w tak zwanym stanie stacjonarnym sprzyjającym życiu.
Biotermodynamika pozwala na zrozumienie takich istotnych funkcji organizmu żywego jak : transport aktywny i bierny, powstawanie potencjałów bioelektrycznych , transport sprzężony, transport energii w procesach metabolicznych itd.
Biotermodynamika jest w kręgu nauk podstawowych w kształceniu biofizyków , biologów , medyków , chemików , fizyków medycznych.
Pojęcia podstawowe dotyczące układów i procesów termodynamicznych
- Układ termodynamiczny stanowi część przestrzeni materialnej , będącej przedmiotem rozważań . pozostała część przestrzeni to otoczenie .
Układ termodynamiczny jest oddzielony od otoczenia rzeczywistą lub abstrakcyjną przestrzenia materialną. Ze względu na brzeg przestrzeni materialnej rozróżnia się 3 typy ukł term-dyn:
1. układ izolowany - brzeg układy ma takie właściwości , że uniemożliwia wymianę materii i energii pomiędzy układem a otoczeniem
2. układ zamknięty - następuje wymiana energii pomiędzy układem a otoczeniem , nie występuje wymiana materii
3. układ otwarty - dochodzi wymiana materii jak i energii między układem a otoczeniem.
Dzieli się na : - pierwszego typu dotyczy układów w stanach zbliżonych do stanów równowagi term-dy, i układ podległy tzw prawom liniowej termodynamiki procesów nie odwracalnych.
- drugiego typu charakteryzuje się tym że prędkość dopływającej do układu całkowitej energii nie jest większa od prędkości rozpraszania ( termodynamika nieliniowa)
- trzeciego typu prędkość dopływu całkowitej energii jest większa od prędkości dyssypacji energii ( termodynamika liniowa lub nieliniowa)
Układ termodynamiczny może być homogeniczny ( jednofazowy) , jeżeli makroskopowe właściwości fizykochemiczne w różnych miejscach układu są jednakowe lub heterogeniczny ( wielofazowy ), jeżeli w pewnych częściach układu ( faz) następuje nieciągła zmiana wartości przynajmniej jednej właściwości fizykochemicznej układu.
Stan układu określają pewne wielkości fizyczne nazywane funkcjami stanu
Funkcje stanu maja te właściwość , że ich zmiana równa się różnicy wartości funkcji w stanie końcowym i początkowym , nie zależy natomiast od sposobu w jaki zmiana została wykonana .
Do funkcji stanu zalicza się : energię wewnętrzną , entalpię, entropię, energię swobodną , entalpie swobodną , ,potencjał chemiczny.
-Funkcje stanu powiązane są różnymi zależnościami z wielkościami fizycznymi nazywanymi parametrami stanu : temperatura , objętość , ciśnienie , masę .
Warunków nałożonych na funkcje stanów nie spełnia zarówno praca , jak ciepło
Parametry termodynamiczne układu to : parametry stanu + funkcji stanu
Parametry termodynamiczne dzieli się na :
- parametry intensywne - niezależne od wielkości układu term-dyn
- parametry ekstensywne - zależą od wielkości układu
Układ termodynamiczny jest w stanie równowagi jeżeli parametry termodynamiczne określające jego stan nie zmieniają się w czasie.
Zmiana parametrów powoduje że układ z jednego stanu równowagi może przejść do innego stanu równowagi i jest to proces termodynamiczny.
Rodzaje procesów termodynamicznych :
Odwracalne - jeżeli może zachodzić zarówno w pewnym kierunku jak i w kierunku przeciwnym , a wracając do stanu wyjściowego nie pozostawia zmian w otoczeniu np. ( proces kołowy , quasi- statyczne)
Po procesie kołowym układ wraca do stanu wyjściowego , wartość funkcji stanu się nie zmienia . Jedną z funkcji stanu jest energia wewnętrzna , związana jest z nieuporządkowanym ruchem elementów strukturalnych układu . równa jest sumie energii kinetycznej oraz potencjalnej wzajemnego oddziaływania składowych elementów układu . Układ mając energię może jej część w odpowiednich warunkach przekazać innemu układowi albo przez wykonanie pracy albo przez przekazanie ciepła .
Określenie tych warunków jest jednym z zadań termodynamiki
W odróżnieniu od energii ani praca ani ciepło nie są funkcjami stanu
O pracy mówimy wtedy gdy ciało , ulega przemieszczeniu pod działaniem siły , wszystkie cząstki ciała odbywają wtedy ruch uporządkowany w kierunku przemieszczenia
O cieple mówimy , jeżeli jedno ciało przekazuje drugiemu energię nieuporządkowanego ruchu cząsteczkowego. Bodźcem do przekazywania energii jest wtedy w zasadzie różnica temperatur . Ilość ciepła mierzy się ilością energii przekazanej w postaci ruchu cząsteczkowego .- mówimy przekazywaniu ciepła.
Praca i ciepło , nie będąc funkcjami stanu , nie charakteryzują stanu układu , lecz charakteryzują przebieg procesu - sposób przekazywania energii . Wartość pracy lub ilość ciepła zależą od sposobu przeprowadzenia układu z jednego stanu do drugiego.
Energia wewnętrzna , praca , ciepło wyrażają się w tych samych jednostkach - dżulach (J)
Proces jest statyczny , jeżeli odchylenie układu od stanu równowagi jest bardzo małe , tak że nie zostaje naruszona równowaga z otoczeniem .Może on być w każdej chwili odwrócony , przebiega nieskończenie powoli i ma głównie znaczenie teoretyczne.
Procesy makroskopowe zachodzące w biologicznych układach termodynamicznych są procesami nieodwracalnymi .Polegają one głównie na przemieszczeniu się materii , energii i ładunków elektrycznych , czyli polegają na przepływach .
Transport w układzie możliwy jest dzięki istnieniu tak zwanych bodźców termodynamicznych . - różnica ciśnień powoduje przepływ gazu i cieczy, różnica temperatury warunkuje przepływ ciepła , różnica potencjałów elektrycznych odpowiedzialna jest za przepływ ładunków elektrycznych.
Istniejące w układzie termodynamicznym bodźce tworzą pewien rodzaj uporządkowania charakteryzujący stan tego układu.
Można stwierdzić , że przepływy działają samoniszcząco , ponieważ niszczą bodźce , które są ich przyczyną . Procesy nieodwracalne prowadzą układ od stanu bardziej zorganizowanego do mniej zorganizowanego tak długo , aż znajdzie się on w stanie równowagi ( przepływy ustaną ).
Stan równowagi dla układów biologicznych oznacza stan ich śmierci . Stan życia jest związany ze stanem stacjonarnym w jakim powinien się znajdować dany układ biotermodynamiczny.
Energia wewnętrzna może być przekazywana od jednego układu do drugiego w procesie wykonywania pracy lub przekazywania ciepła . Proces ten musi przebiegać zgodnie z zasadą zachowania energii - wyraża to I zasada termodynamiki przyrost energii wewnętrznej układu jest równy sumie dostarczonego mu ciepła Q i dostarczonej W
Przy dostarczeniu układowi ciepła przyrost energii wewnętrznej może być różny , w zależności od tego czy procesowi towarzyszy wykonywanie pracy , czy też nie .
Jeżeli do gazu doprowadzi się ilość ciepła Q , przy stałej objętości , izochorycznie, nie wykonuje on pracy .
Podczas izobarycznego ogrzewania gazu , przy stałym ciśnieniu , temperatura gazu wzrosła , zwiększyła się jego objętość i gaz wykonał pracę objętościową .
Podczas procesu izobarycznego ciepło dostarczone układowi zużywa się na powiększenie jego energii wewnętrznej , orz na wykonanie pracy objętościowej - proces ten zwany jest entalpią.
Przyrost entalpii jest równy ilości ciepła dostarczonego układowi w procesie izobarycznym . Tak jak przyrost energii wewnętrznej jest równy ilości ciepła dostarczonego układowi w procesie izochorycznym.
Ciepło które układ wymienia z otoczeniem , odgrywa szczególna rolę w reakcjach chemicznych . Ciepło to zależy od tego czy reakcja zachodzi izochoryczne czy izobarycznie
Reakcja egzotermiczna - układ oddaje energie do otoczenia
Reakcja endotermiczna - układ pobiera energie z otoczenia .
Pierwsza zasada termodynamiki w procesach biologicznych,
jako zasada zachowania energii , powinna być zachowana także w procesach biologicznych . Organizm żywy do utrzymania procesów życiowych potrzebuje energii. Energia jest konieczna zarówno do zachowania struktury substancji żywej jak i do wykonania wielorakich czynności .
W organizmach wyżej zorganizowanych ( heterotrofach) energia wyzwala się w procesach utleniania produktów pokarmowych procesy te przebiegaja w przybliżeniu w stałej temperaturze i przy stały ciśnieniu , więc miara energii , którą organizm dysponuje do wykonania wielorakich czynności jest w zasadzie zmiana entalpii swobodnej ( pochodząca z utleniania procesów pokarmowych , jeżeli procesy zachodzą odwracalnie .
Tak jednak nie jest . Kosztem entalpii pochodzącej z utlenienia substancji odżywczych organizm wykonuje prace wewnętrzna i zewnętrzną . Praca zewnętrzna jest równa pracy wykonanej kosztem wysiłku mięśniowego . Na prace wewnętrzna składają się wielorakie składniki , takie jak procesy chemiczne , prace związane z transportem przez błony wbrew gradiantom stężeniowym i elektrycznym , z krążeniem , z oddychaniem , trawieniem , fikcją , defekacja .
Praca wewnętrzna wiąże się z pokonywaniem oporów ( tarcie ), i w końcowym efekcie przemienia się w ciepło W=Q zwane ciepłem metabolicznym .
Jeżeli organizm nie wykonuje pracy zewnętrznej cała pobrana energia jest równa ciepłu produkowanemu w organiźmie.
Aby uniknąć przegrzania ciepło to musi być oddane otoczeniu . Organizm utrzymuje stałą temperaturę ( homojotermia ) , jeżeli ilość ciepła oddawanego w jednostce czasu , czyli moc jest równa ilości ciepła oddawanego w jednostce czasu do otoczenia . czyli moc oddawanej w formie ciepła .
Ciepło oddawane przez organizm do otoczenia można zmierzyć kalorymetrem. Obiekt badany jest w komorze o możliwie dokładnej izolacji . Ilość ciepła wytwarzaną w komorze mierzy się ilościa ciepła pobraną przez wodę przepływajaca przez system rur . Pomiaru można dokonać dla organizmu będącego zarówno w stanie spoczynku jak i podczas wykonywania pracy fizycznej . Ilość wykonannej pracy można zmierzyć za pomocą cykloergometru - urządzenie przypominające rower ////////
Za pomocą pedałowania wprowadza się w ruch obrotowy okrągłą płytę metalową . Płyta obraca się między biegunami elektromagnesu , w płycie tej zostaje indukowane prądy Foucaulta , to wiąże się z powstaniem sił elektrodynamicznych , hamujących ruch tarczy . Pokonanie tych sił wymaga wykonanie pracy. Odpowiednio wycechowany cykloergometr pozwala zmierzyć pracę wykonaną podczas pedałowania.
Aby zmierzyć energię , którą organizm otrzymuje , należy zmierzyć energię którą organizm pobrał w procesach metabolizmu produktów pokarmowych . ciepło spalania produktów pokarmowych mierzy się za pomocą bomb kalorymetrycznych
Kalorymetr - respiracyjny pozwala zmierzyć zarówno ilość zużytego przez organizm tlenu jak i ilość wydalonego CO2 . Wiedząc ile tlenu zużywa się na spalanie określonej ilości węglowodanów , białek i tłuszczów , względnie ile w tych procesach powinno powstać CO2 , można obliczyć ciepło metabolizmu. . Porównując wyniki otrzymane w pomiarach kalorymetrycznych ( kalorymetria bezpośrednia ) z wynikami uzyskanymi z obliczeń ciepła spalania , otrzymuje się wyniki zgodne .
Badania porównawcze , pozwoliły wykazać że organizmy żywe wykorzystuja całkowicie ciepło spalania węglowodanów i tłuszczów . Natomiast białka nie są całkowicie wykorzystane , białka w organizmie nie spalają się bez reszty . Część energii jest wydalana z substancjami nie będącymi końcowymi produktami utleniania , np. z mocznikiem .
Pomiar ciepła za pomocą kalorymetrii bezpośredniej jest trudny , dlatego preferowany jest pomiar ciepła kalorymetrią pośrednią polegającą na pomiarze ilości pobieranego ciepła i wydalanego CO2 . Badany oddycha przez ustnik lub maskę z odpowiednimi zaworami , pozwalającymi oddzielić powietrze wdychane od wydychanego . Obliczanie na tej podstawie ilości ciepła wymaga znajomości składu pokarmu który został poddany trawieniu i spaleniu. Pewną orientację daje tzw iloraz oddechowy ( stosunek objętości wydalonego CO2 do pobranego O2. Dla węglowodanów wynosi 1 , dla tłuszczów 0,7, dla białek 0,83 .
Pomiary kalorymetryczne ( bezpośrednie i pośrednie ) pozwalają zmierzyć podstawową przemianę materii. - najmniejszą moc energii jaką organizm potrzebuje do utrzymania procesów życiowych , będąc całkowicie w spoczynku.
Przemiana podstawowa określana jest jako podstawowa prędkość metabolizmu. Ma miejsce wówczas gdy żywy organizm , pozbawiony pokarmu przebywa w temperaturze zewnętrznej , mieszczącej się w strefie termonaturalnej. Ilość ciepła wydzielona w przemianie podstawowej służy do podtrzymania procesów życiowych organizmu oraz wiąże się ze spoczynkową czynnością wszystkich komórek i narządów .
Przemiana materii u człowieka i u zwierząt zależy od rozmiarów ciała , wieku, rodzaju wykonywanych czynności i odżywiania . Podstawowa prędkość metabolizmu u zwierząt o podobnych kształtach jest proporcjonalna do pola powierzchni ich ciał .
Pomiary kalorymetryczne pozwalają także na wyznaczenie wydajności z jaką organizm człowieka przekształca energię chemiczną w pracę mechaniczną . Wydajność organizmu wyraża się stosunkiem wykonanej pracy zewnętrznej do zużytej na ten cel energii . Otrzymuje się w ten sposób wydajność w granicach 20-25% . Wydajność wyraziłaby się znacznie mniejszą wartością , gdyby ją obliczyć w stosunku do całkowitej pobranej energii .
Organizm jako maszyna ma tę wyższość nad silnikami cieplnymi , że pracuje przy stosunkowo małej różnicy temperatur. Organizm nie pracuje na zasadzie zmiany na pracę energii przekazywanej na sposób ciepła . Zachodzi w nim przemiana energii chemicznej ( w postaci entalpii swobodnej ) bezpośrednio w pracę , Ciepło jest produktem ubocznym , jako wynik towarzyszących procesów nieodwracalnych.
Druga zasada termodynamiki w procesach biologicznych :
Organizm żywy stanowi układ o bardzo złożonej i wysoko zorganizowanej strukturze .
W okresie rozwoju organizm żywy przyswaja sobie materię i energię z otoczenia oraz potrafi im nadać formę organizacyjną o mniejszej entropii i większej entalpii swobodnej .
Nawet w okresie dojrzałości organizm potrafi utrzymać czy odnawiać wysoką organizację materii i energii . Gdyby organizm żywy był układem zamkniętym jego entropia rosłaby. Jednak szybkość tworzenia się entropii maleje , aż stanie się zerem , kiedy entropia przyjmuje wartość maksymalną układ pozostanie w równowadze statycznej co równoważne jest ze śmiercią . W stanie stacjonarnym stale czynne są procesy nieodwracalne , destrukcyjne , powodujące psucie porządku - tworzące entropię. Tym procesom przeciwstawiają się procesy konstruktywne , związane z wymianą entropii z otoczeniem - zmniejszające entropię. Tak jest bo organizm jest układem otwartym i wymienia entropię z otoczeniem . Np. Pobierając z otoczenia pokarm , substancje wyżej zorganizowane , o mniejszej entropii , a oddając wraz z degradowaną materią i energię więcej entropii do otoczenia , organizm jest w stanie skompensować tworzącą się w nim w procesach nieodwracalnych entropię . Można więc powiedzieć , że życie polega na nieustannej walce z tworzącą się entropią , wrogiem życia .
Stwierdza się doświadczalnie , że młode organizmy w stanie rozwoju oddają więcej ciepła do otoczenia , czyli odznaczają się większą dyssypacją energii niż organizmy dojrzałe . Znaczy to że w stanie rozwoju szybkość tworzenia entropii jest duża , jest wię to miara żywotności organizmu . Stąd wniosek że w celu utrzymania większej żywotności organizmu , , w celu zachowana młodości należy zwiększyć procesy metabolizmu , powodujące zwiększenie produkcji entropii , prowokujące zarazem organizm do zwalczania entropii . Można to uzyskać przede wszystkim przez aktywność fizyczną . Wysiłek fizyczny wzmaga procesy transportu , zwiększając z jednej strony źródło entropii a z drugiej zwiększając zapotrzebowanie na energię i materię w postaci pokarmu .
Utrzymanie organizmu przy życiu jest jednak okupione wzrostem entropii otoczenia . Jeżeli za układ uważać organizm wraz z otoczeniem , będzie to układ izolowany jako całość . Zgodnie z drugą zasadą termodynamiki entropia w takim układzie może tylko rosnąć - życie tak jak każdy inny proces - zwiększa entropię przyrody .
Więc - w metabolizmie istotne jest to żeby organizmowi udało się uwolnić od tej całej entropii , którą w ciągu swego życia jest zmuszony wyprodukować.
Zasada termodynamiki nierównowagowej .
Organizmy żywe są układami otwartymi i zachodzą w nich procesy nieodwracalne w stanie nierównowagi . Towarzyszą im transporty substancji , energii , ładunku elektrycznego stanowiące podstawę życia.. W układach złożonych , a do takich należą organizmy żywe , transporty są również złożone. Przepływy substancji , energii, ładunku nie są niezależne . Z przepływem substancji może być sprzężony zarówno transport energii , jak i transport ładunku elektrycznego . W ten sposób tworzą się nowe bodźce., zmniejszające entropię dzięki temu układ otwarty może uniknąć znalezienia się w stanie równowagi ( oznaczającym śmierć ) , a znaleźć się w stanie stacjonarnym ( sprzyjającym życiu). Poznawanie tych procesów jest konieczne do zrozumienia wielu fynkci organizmu żywego , takich jak : wymiana substancji między krwią a płynem tkankowym, czynność nerek ( filtracja , ultrafiltracja) powstawanie potencjałów bioelektrycznych, wykorzystywanie energii w procesach metabolicznych i innych ,
W układzie izolowanym za wzrost entropii odpowiedzialne są wyłącznie zachodzące w nim procesy nieodwracalne czyli tworzące entropię.
W układzie otwartym zmiana jego entropii może być spowodowana procesami nieodwracalnymi oraz wymianą entropii z otoczeniem , związanej z wymiana energii czy substancji . Entropia jest wówczas zależna od czasu. Zatem szybkość tworzenia się entropii nie może być ujemna, jest zerem dla procesów odwracalnych , a dodatnia dla nieodwracalnych . Szybkość zmian entropii układu może być dodatnia ( entropia układu zwiększa się ) ujemna ( entropia zmniejsza się ) równa zeru ( entropia nie zmienia się ). Entropie równa zeru jest w układzie stacjonarnym - wówczas rośnie entropia otoczenia .
W stanie stacjonarnym funkcje termodynamiczne układu zachowują stałą wartość w czasie - nie zmienia się ani entropia , ani energia , ani entalpia swobodna .
Funkcje te są również stałe w układzie izolowanym w stanie równowagi.
Różnica między układem stanem stacjonarnym układu otwartego a stanem równowagi układu izolowanego.
W stanie równowagi entropia przyjmuje wartość maksymalną ( energia swobodna minimalną) , a szybkość tworzenia się entropii jest równa zeru
W stanie stacjonarnym w układzie zachodzą procesy tworzące entropię, szybkość tworzenia entropii jest stała i przyjmuje wartość najmniejszą .
Stan stacjonarny wyróżnia się pewną stabilnością .
W układzie znajdującym się w stanie stacjonarnym przy minimum produkcji entropii, przeciwstawiają się sobie dwa rodzaje czynników : destruktywne , wprowadzające nieporządek , drugie konstruktywne związane z procesami wymiany energii i materii .
Tworzą się przepływy sprzężone istniejących bodźców , kompensując w ten sposób tworzącą się entropię . Przykładem tych zjawisk są termodyfuzja (nie tylko różnica stężeń ale również różnica temperatur ma wpływ na kierunek i prędkość ruchu cząstek) i ultrafiltracja ( istnieje błona przepuszczająca wybiórczo cząstki ze względu na różnicę potencjałów chemicznych po obu jej stronach , przemieszczają się one nie tylko ze względu na różnice stężeń ale również różnicę ciśnień hydrostatycznych oraz różnicę ciśnień osmotycznych ).
Oba powyższe zjawiska wykorzystane w hemodializie.
19