Kariotyp człowieka - zasady zapisywania, podział chromosomów na grupy (A-G)
Kariotyp- zestaw chromosomów występujący w komórce somatycznej, właściwy każdemu organizmowi, o charakterystycznej liczbie i morfologii.
Oceny prawidłowego kariotypu człowieka dokonuje się w mikroskopie świetlnym. W celu wykonania dokładnej analizy kariotypu sporządza się kariogram.
Kariogram - inaczej ideogram jest to zestaw chromosomów przedstawionych graficznie..
Podział
Chromosomy człowieka zostały sklasyfikowane według:
Wielkości chromosomów
Położenia centromeru
Rozmieszczenia prążków w chromosomach (G, Q, R)
Na podstawie tych kryteriów wyodrębniono pary homologicznych chromosomów:
- somatycznych (autosomów) - oznaczone numerami od 1 do 22
- chromosomy płci (heterochromosomy) - oznaczone symbolami X i Y
Autosomy zostały podzielone na grupy od A do G.
Chromosom X, jako najbardziej podobny do chromosomów 6 pary zaliczono do grupy C, natomiast chromosom Y przyporządkowano do grupy G.
Grupa |
Para |
Cecha |
A |
1-3 |
Chromosom 1 i 3 są dużymi chromosomami metacentryczne, chromosom 2 jest submetacentryczny |
B |
4-5 |
Duże chromosomy submetacentryczne |
C |
6-12 oraz X |
Submetacentryczne, średniej wielkości |
D |
13-15 |
Duże chromosomy akrocentryczne, mogą posiadać satelity |
E |
16-18 |
16 para to chromosomy małe, prawie metacentryczne, 17 i 18 to małe chromosomy submetacentryczne |
F |
19-20 |
Najmniejsze chromosomy metacentryczne |
G |
21-22 oraz Y |
Para 21 i 22 są to małe chromosomy akrocentryczne, mogą posiadać satelity, para 21 jest mniejsza od 22, Y nigdy nie posiada satelitów |
Zapis kariotypu człowieka
Zapis kariotypu człowieka zawiera liczbę określającą całkowitą ilość chromosomów w komórce diploidalnej, przecinek, a następnie po przecinku litery oznaczające chromosomy płci.
Prawidłowy kariotyp żeński: 46, XX
Prawidłowy kariotyp męski: 46, XY
Prawidłowy kariotyp męski; 46, XY
W prawidłowym zapisie kariotypu uwzględnia się również obecność większej niż w granicach normy ilości heterochromatyny konstytuowanej lub satelitów ( nie jest to patologia lecz są to cechy polimorficzne chromosomów).
Np. zapis 46,XX, 1qh+ oznacza prawidłowy zapis kariotypu żeńskiego z obecnością większego odcinka heterochromatyny konstytuowanej (h+) w okolicy centromerowej ramienia długiego (q) chromosomu pary 1.
Zapis 46,XY, 15ps+ oznacza duże satelity (s+) na krótkich ramionach (p) chromosomu pary 15.
Zapis kariotypu z mutacją
Podczas analizy kariotypu człowieka napotykamy na zaburzenia (aberracje) chromosomowe, które dzielimy na liczbowe i strukturalne.
Aberracje liczbowe ( dotyczą komórek, które zawierają nieprawidłową liczbę prawidłowych chromosomów). Wyróżnia się:
- komórki poliploidalne (euploidalne) czyli takie które mają zwielokrotniony cały haploidalny garnitur chromosomowy ( takie zjawisko u człowieka występuje rzadko, natomiast jest częste u roślin). Np. kariotyp komórki triploidalnej zapisuje się : 69, XXX
- komórki aneuploidalne czyli takie w których brakuje jednego chromosomu lub jest obecny dodatkowy jeden, dwa lub więcej.
*gdy brakuje jednego chromosomu- komórki monosomiczne, gdy brakuje jakiejkolwiek pary chromosomów - komórki nullisomiczne
*gdy występuje dodatkowa liczba chromosomów- komórki polisemiczne
Aneuploidie możemy podzielić na aneuploidie:
- chromosomów płciowych
Np. 45,X - monosomia X, brakuje jednego chromosomu X
47,XXX - polisomia X, kariotyp w którym występują 3 chromosomy X
47, XYY - polisemia Y, jednen chromosom X i dwa chromosomy Y
- autosomów
Np. 47, XY+21 lub 47, XX+ 21 - trisomia 21, kariotyp w którym obecny jest dodatkowy chromosom pary 21.
kariotyp kobiety z Zespołem Turnera, pojedynczy chromosom X zaznaczono strzałką; 45,X
Aberracje strukturalne (dotyczą komórek, w których może być prawidłowa liczba chromosomów, ale nastąpiły w nich różne rodzaje nieprawidłowości np.: translokacje, delecje, duplikacje, inwersje, insercje, izochromosomy. Są dwa sposoby zapisywania tego typu aberracji: skrócone i rozszerzone.
Np. 46,XY,del(5)(q13) zapis skrócony
46,XY,del(5)(pter -> q13:) zapis rozszerzony
Ten zapis oznacza, że delecji uległ końcowy fragment ramion długich chromosomu pary 5 od prążka q13, co obrazuje pojedynczy dwukropek.
Skróty
Do opisu kariotypu z aberracją stosuje się skróty, np.:
p - krótkie ramie chromosomu
q - długie ramie chromosomu
+ (plus) - nadmiar, dodatek
- (minus) - niedobór, ubytek
: (dwukropek) - pęknięcie
(strzałka) - od do (określa zakres regionu chromosomu)
t - translokacja
del - delecja (deficjencja)
dup - duplikacja
ins - insercja
inv - inwersja
s - satelity
r - chromosom kolisty (ang. ring)
pter - koniec krótkiego ramienia chromosomu
qter - koniec długiego ramienia chromosomu
cen - centromer
h - heteromorfizm
der - wynik rearanżacji chromosomalnej
i - izochromosom
mat - pochodzenia matczynego
pat - pochodzenia ojcowskiego