 | Pobierz cały dokument kolokwium.3.technologia.zywnosci.i.zywienia.doc Rozmiar 916 KB |
Kolokwium 3. Magdalena Pawełkiewicz 18.01.2011 r.
Mapowanie i markery molekularne
Jak poznać strukturę genomu…?
Genomy składają się z regionów kodujących i nie kodujących
Regiony kodujące stanowią niewielki % całego genomu, są jak „wyspy” rozrzucone między sekwencjami nie podlegającymi transkrypcji. Dąży się do ustalenia:
- rozmieszczenia na chromosomach
- sekwencji w loci kodujących
- ich funkcji
- zmienności allelicznej
- wzajemnej interakcji
Poprzez poznanie sekwencji całych genomów
- PROJEKTY SEKWENCJONOWANIA
Arabusopsis thaliana - rzodkiewnik - dwuliścienny gatunek
Oryza sativa - ryż - jednoliścienny gatunek
Poprzez przyjęcie strategii badawczej
- PROJEKTY MAPOWANIA Z UŻYCIEM MARKERÓW MOLEKULARNYCH
Większość gatunków roślin
Mapy:
Schematyczne odwzorowanie genomu organizmu lub elementu genetycznego (np. plazmidu) przedstawiające wzajemne położenie poszczególnych genów i innych elementów genetycznych.
Geny ułożone są liniowo na chromosomach - mapy liniowe
GENETYCZNE:
Odległość genetyczna między genami (markerami) na chromosomie (grupa sprzężeń), wyrażana częstością zachodzenia rekombinacji mejotycznej między nimi
FIZYCZNE:
Fizyczna odległość między markerami wyrażona w tysiącach lub w milionach par zasad
Co to jest mapa genetyczna?
Mapy genetyczne wskazują na względne położenie specyficznych markerów wzdłuż chromosomu - informacja na temat struktury, funkcji i ewolucji genomu
Spokrewnione gatunki zazwyczaj mają podobną zawartość i lokalizację genów i markerów
Markery:
Potencjalnym markerem to jakakolwiek dziedziczna cecha fizyczna czy molekularna, różna pomiędzy osobnikami, łatwo wykrywalna
Markerem może być gen lub odcinek nie kodujący jeżeli jego dziedziczenie można prześledzić
Marker musi być polimorficzny co znaczy, że muszą istnieć alternatywne formy (allel) pomiędzy osobnikami w badanej populacji
Im bliżej markery leżą obok siebie, mniejsze jest prawdopodobieństwo rozdzielenia alleli podczas rekombinacji = będą dziedziczyć się razem
Odległość między dwoma punktami nie jest mierzona w jednostkach fizycznych ale w centymorganach
1 cM = 1% rekombniacji
Im dalej od siebie są markery 1 i 2 - tym częstsze rekombinacje
Jednostka mapowa nie równa się 1 stałej odległości fizycznej ponieważ crossing over zachodzi z różną częstością w różnych rejonach w obrębie chromosomów
telomery - c/o zachodzi częściej
centromery - c/o zachodzi rzadziej
 | Pobierz cały dokument kolokwium.3.technologia.zywnosci.i.zywienia.doc rozmiar 916 KB |