Rys. 6. Poziomy analiz organizmu (komórki), którego genom zostaf zsekwencjonowany, odpowiadające organizacji informacji biologicznej i jej ekspresji.
w regionach chromosomu, rozmieszczenia genów na chromosomie, organizacji genów w operony.
- Transkryptom - wszystkie sekwencje RNA syntetyzowane (transkrybowane) w organizmie. Analiza skupia się na regulacji ekspresji genów w różnorodnych warunkach i/lub tkankach. Badania są przeprowadzane za pomocą mikromatryc oligo-nukleotydowych i cDNA, popularnie zwanych chipami DNA. Duże nadzieje w zrozumieniu funkcjonowania komórki wiąże się ze stosunkowo niedawnym odkryciem zjawiska zwanego interferencją RNA (RNAi - RNA interference) i rolą różnych ni-skocząsteczkowych RNA w regulacji ekspresji genów, organizacji materiału genetycznego i ochronie przed pasożytami.
- Proteom - wszystkie białka wytwarzane w organizmie. Analizy dotyczą identyfikowania konserwatywnych regionów i motywów w sekwencjach, przewidywania struktur drugorzędowych oraz przestrzennych. Białka i ich struktury są klasyfikowane w różne grupy, np. rodziny i nadrodziny. Zidentyfikowanym białkom przypisywana jest kategoria funkcjonalna i określana jest ich rola w komórce.
BIOTECHNOLOGIA 3 (70) 7-21 2005 17